More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_1219 on replicon NC_008060
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008060  Bcen_1219  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 151 aa  310  4.999999999999999e-84  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.318492  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1698  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 151 aa  310  4.999999999999999e-84  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.547698  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1671  MarR family transcriptional regulator  99.34 
 
 		 151 aa  307  2.9999999999999997e-83  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.787972  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4873  MarR family transcriptional regulator  95.33 
 
 		 151 aa  295  1e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.846475  normal  0.145685 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1608  MarR family transcriptional regulator  92 
 
 		 151 aa  286  5.0000000000000004e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.457422  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1631  MarR family transcriptional regulator  92 
 
 		 151 aa  285  1e-76  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.813551 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1547  MarR family transcriptional regulator  87.33 
 
 		 148 aa  261  3e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.187738 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4137  transcriptional regulator, MarR family  79.33 
 
 		 153 aa  251  2.0000000000000002e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5662  MarR family transcriptional regulator  71.62 
 
 		 153 aa  233  5.0000000000000005e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.49927  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2456  transcriptional regulator, MarR family  63.69 
 
 		 168 aa  199  9.999999999999999e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.768302  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2174  transcriptional regulator, MarR family  61.84 
 
 		 165 aa  189  9e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.789823  normal  0.527206 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1670  transcriptional regulator, MarR family  51.08 
 
 		 161 aa  147  4e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.428433  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2845  transcriptional regulator, MarR family  48.92 
 
 		 145 aa  147  5e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.648486  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0061  MarR family transcriptional regulator  46.9 
 
 		 171 aa  146  8e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.310818 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2956  MarR family transcriptional regulator  49.66 
 
 		 153 aa  142  1e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.119179 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2280  MarR family transcriptional regulator  60 
 
 		 170 aa  140  7e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.421231  normal  0.627337 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0576  transcriptional regulator, TrmB  47.48 
 
 		 158 aa  137  6e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0950259  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2738  transcriptional regulator, MarR family  46.72 
 
 		 156 aa  137  6e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.708856 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0057  MarR family transcriptional regulator  49.63 
 
 		 185 aa  137  6e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.584189  normal  0.103539 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4271  MarR family transcriptional regulator  46.62 
 
 		 156 aa  136  1e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0653897  normal  0.661065 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4966  transcriptional regulator, MarR family  47.59 
 
 		 153 aa  134  4e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.345847  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4256  MarR family transcriptional regulator  45.07 
 
 		 166 aa  134  5e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.973283 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0129  MarR family transcriptional regulator  45.7 
 
 		 154 aa  133  8e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2483  transcriptional regulator, MarR family  44.68 
 
 		 156 aa  133  9.999999999999999e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.758038  normal  0.560924 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3178  MarR family transcriptional regulator  44.9 
 
 		 154 aa  132  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.137994  normal  0.81725 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0483  MarR family transcriptional regulator  47.55 
 
 		 151 aa  132  1.9999999999999998e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0397178 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3114  transcriptional regulator, MarR family  51.08 
 
 		 145 aa  132  1.9999999999999998e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2251  MarR family transcriptional regulator  49.23 
 
 		 145 aa  131  3e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.344689  normal  0.255238 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4766  transcriptional regulator, MarR family  43.97 
 
 		 166 aa  131  3e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.462626  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2928  MarR family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 143 aa  130  5e-30  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.442252 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3240  MarR family transcriptional regulator  43.45 
 
 		 158 aa  130  7.999999999999999e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.715513  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3619  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  45.1 
 
 		 162 aa  130  7.999999999999999e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0474  transcriptional regulator, MarR family  57.94 
 
 		 155 aa  130  9e-30  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3444  transcriptional regulator, MarR family  44.3 
 
 		 153 aa  129  1.0000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3291  MarR family transcriptional regulator  47.01 
 
 		 152 aa  128  2.0000000000000002e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.570613  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3097  transcriptional regulator, MarR family  44.3 
 
 		 153 aa  128  2.0000000000000002e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0108  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  46.32 
 
 		 152 aa  128  2.0000000000000002e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.879191 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5560  MarR family transcriptional regulator  47.76 
 
 		 170 aa  128  3e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.813118  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1203  transcriptional regulator, TrmB  46.15 
 
 		 146 aa  128  3e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.529625  normal  0.0362733 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1176  transcriptional regulator, TrmB  46.15 
 
 		 146 aa  127  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.713709  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1193  transcriptional regulator, TrmB  46.15 
 
 		 146 aa  127  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4792  transcriptional regulator, MarR family  46.27 
 
 		 147 aa  127  7.000000000000001e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0729618  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2325  transcriptional regulator, MarR family  44.68 
 
 		 162 aa  127  7.000000000000001e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0434242 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1808  MarR family transcriptional regulator  41.06 
 
 		 159 aa  127  7.000000000000001e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0369  MarR family transcriptional regulator  46.32 
 
 		 155 aa  126  8.000000000000001e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0830  MarR family transcriptional regulator  44.78 
 
 		 151 aa  125  1.0000000000000001e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2950  transcriptional regulator, MarR family  44.44 
 
 		 149 aa  126  1.0000000000000001e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0623  MarR family transcriptional regulator  42.28 
 
 		 151 aa  126  1.0000000000000001e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4410  MarR family transcriptional regulator  48.25 
 
 		 176 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0705  MarR family transcriptional regulator  44.76 
 
 		 156 aa  125  2.0000000000000002e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.186956  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0886  MarR family transcriptional regulator  44.03 
 
 		 151 aa  125  3e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1189  transcriptional regulator MarR family  47.01 
 
 		 158 aa  124  3e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.622384  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0401  transcriptional regulator, MarR family  45.14 
 
 		 156 aa  124  6e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0960  MarR family transcriptional regulator  44.53 
 
 		 146 aa  124  6e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.305429  normal  0.461467 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1328  transcriptional regulator, MarR family  43.75 
 
 		 149 aa  123  1e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0519  MarR family transcriptional regulator  49.15 
 
 		 150 aa  122  1e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00587381 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1742  MarR family transcriptional regulator  44.8 
 
 		 149 aa  122  1e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1524  MarR family transcriptional regulator  46.43 
 
 		 149 aa  122  1e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.26569  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0573  MarR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 151 aa  122  2e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.256198  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02614  putative transcription regulator protein  40.94 
 
 		 153 aa  121  4e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.532202  normal  0.750512 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1196  MarR family transcriptional regulator  52.25 
 
 		 155 aa  120  4e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1641  transcriptional regulator, MarR family  56.7 
 
 		 157 aa  120  5e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.176874  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2842  MarR family transcriptional regulator  44.76 
 
 		 150 aa  120  7e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0926  transcriptional regulator, MarR family  46.38 
 
 		 158 aa  120  9.999999999999999e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.493079  normal  0.487426 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0598  MarR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 267 aa  118  1.9999999999999998e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3597  MarR family transcriptional regulator  40.28 
 
 		 153 aa  119  1.9999999999999998e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1134  MarR family transcriptional regulator  43.8 
 
 		 144 aa  119  1.9999999999999998e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6797  transcriptional regulator, MarR family  44.06 
 
 		 150 aa  117  3.9999999999999996e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000341321  decreased coverage  0.0000000109708 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0519  transcriptional regulator, MarR family  41.29 
 
 		 157 aa  117  3.9999999999999996e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03887  transcriptional regulator MarR family  42.34 
 
 		 152 aa  118  3.9999999999999996e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3626  regulatory protein, MarR  38.46 
 
 		 157 aa  117  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.0000000021465  normal  0.0936579 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2559  transcriptional regulator  42.18 
 
 		 150 aa  117  6e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.970675  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1207  transcriptional regulator, MarR family  43.36 
 
 		 146 aa  117  6e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000193075 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0813  transcriptional regulator, MarR family  44 
 
 		 159 aa  117  6e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.800363  normal  0.25148 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15300  transcriptional regulator, MarR family  45.38 
 
 		 162 aa  117  6e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.408936  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27230  MarR family transcriptional regulator  42.22 
 
 		 151 aa  117  7.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1306  MarR family transcriptional regulator  51.43 
 
 		 149 aa  116  9.999999999999999e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.335381  normal  0.344824 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2751  transcriptional regulator, MarR family  49.57 
 
 		 141 aa  115  1.9999999999999998e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.290738  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1768  transcriptional regulator, MarR family  37.82 
 
 		 157 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0304  MarR family transcriptional regulator  43.26 
 
 		 150 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2422  MarR family transcriptional regulator  43.26 
 
 		 150 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.934023  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0862  MarR family transcriptional regulator  43.26 
 
 		 158 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.182256  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1679  MarR family transcriptional regulator  43.26 
 
 		 150 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2306  putative transcriptional regulator  43.7 
 
 		 151 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00880  transcriptional regulator, MarR family  47.86 
 
 		 148 aa  115  1.9999999999999998e-25  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1483  MarR family transcriptional regulator  43.26 
 
 		 150 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.553037  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0335  MarR family transcriptional regulator  43.26 
 
 		 158 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.663008  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4585  transcriptional regulator, MarR family  46.79 
 
 		 150 aa  115  3e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0649  transcriptional regulator, MarR family  45.87 
 
 		 150 aa  114  6e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0050  transcriptional regulator, MarR family  42.18 
 
 		 164 aa  114  6e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00479818 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2231  MarR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 150 aa  113  7.999999999999999e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.106154  normal  0.474897 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4312  MarR family transcriptional regulator  45.87 
 
 		 150 aa  113  1.0000000000000001e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3662  MarR family transcriptional regulator  41.43 
 
 		 150 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.485543  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4211  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  44.95 
 
 		 150 aa  112  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.151141  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4603  transcriptional regulator, MarR family  44.95 
 
 		 150 aa  112  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.221434  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4499  MarR family transcriptional regulator  41.43 
 
 		 150 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.148368  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04763  hypothetical protein  51.02 
 
 		 143 aa  112  1.0000000000000001e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4554  transcriptional regulator, MarR family  44.95 
 
 		 150 aa  112  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3762  MarR family transcriptional regulator  40.97 
 
 		 150 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.425599  hitchhiker  0.00135953 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3865  MarR family transcriptional regulator  41.43 
 
 		 150 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0792032  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>