More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_1631 on replicon NC_010551
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010551  BamMC406_1631  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 151 aa  309  7.999999999999999e-84  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.813551 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1608  MarR family transcriptional regulator  98.68 
 
 		 151 aa  304  2.0000000000000002e-82  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.457422  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4873  MarR family transcriptional regulator  94.7 
 
 		 151 aa  293  4e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.846475  normal  0.145685 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1219  MarR family transcriptional regulator  92 
 
 		 151 aa  285  1e-76  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.318492  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1698  MarR family transcriptional regulator  92 
 
 		 151 aa  285  1e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.547698  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1671  MarR family transcriptional regulator  91.33 
 
 		 151 aa  283  7e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.787972  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1547  MarR family transcriptional regulator  91.39 
 
 		 148 aa  275  2e-73  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.187738 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4137  transcriptional regulator, MarR family  80.54 
 
 		 153 aa  251  3e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5662  MarR family transcriptional regulator  72.19 
 
 		 153 aa  237  5e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.49927  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2456  transcriptional regulator, MarR family  62.34 
 
 		 168 aa  187  2.9999999999999997e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.768302  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2174  transcriptional regulator, MarR family  59.31 
 
 		 165 aa  175  2e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.789823  normal  0.527206 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1670  transcriptional regulator, MarR family  48.92 
 
 		 161 aa  141  3e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.428433  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0061  MarR family transcriptional regulator  44.83 
 
 		 171 aa  140  5e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.310818 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2845  transcriptional regulator, MarR family  47.73 
 
 		 145 aa  139  9.999999999999999e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.648486  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2956  MarR family transcriptional regulator  47.33 
 
 		 153 aa  136  1e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.119179 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1203  transcriptional regulator, TrmB  48.2 
 
 		 146 aa  133  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.529625  normal  0.0362733 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0576  transcriptional regulator, TrmB  46.04 
 
 		 158 aa  132  1.9999999999999998e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0950259  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1176  transcriptional regulator, TrmB  48.2 
 
 		 146 aa  132  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.713709  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1193  transcriptional regulator, TrmB  48.2 
 
 		 146 aa  132  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4256  MarR family transcriptional regulator  44.37 
 
 		 166 aa  131  3e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.973283 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2280  MarR family transcriptional regulator  56.19 
 
 		 170 aa  131  3e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.421231  normal  0.627337 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3291  MarR family transcriptional regulator  47.1 
 
 		 152 aa  131  3e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.570613  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2738  transcriptional regulator, MarR family  45.59 
 
 		 156 aa  130  3.9999999999999996e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.708856 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2251  MarR family transcriptional regulator  48.48 
 
 		 145 aa  130  7.999999999999999e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.344689  normal  0.255238 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3619  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  47.22 
 
 		 162 aa  130  7.999999999999999e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4966  transcriptional regulator, MarR family  46.21 
 
 		 153 aa  129  1.0000000000000001e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.345847  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0129  MarR family transcriptional regulator  43.51 
 
 		 154 aa  129  1.0000000000000001e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4766  transcriptional regulator, MarR family  42.55 
 
 		 166 aa  128  3e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.462626  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4410  MarR family transcriptional regulator  47.59 
 
 		 176 aa  128  3e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0057  MarR family transcriptional regulator  47.69 
 
 		 185 aa  128  3e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.584189  normal  0.103539 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2928  MarR family transcriptional regulator  45.93 
 
 		 143 aa  127  5.0000000000000004e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.442252 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4271  MarR family transcriptional regulator  51.33 
 
 		 156 aa  127  6e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0653897  normal  0.661065 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2325  transcriptional regulator, MarR family  45.26 
 
 		 162 aa  127  8.000000000000001e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0434242 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3444  transcriptional regulator, MarR family  43.62 
 
 		 153 aa  126  8.000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1524  MarR family transcriptional regulator  48.18 
 
 		 149 aa  126  9.000000000000001e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.26569  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5560  MarR family transcriptional regulator  47.76 
 
 		 170 aa  125  1.0000000000000001e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.813118  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3097  transcriptional regulator, MarR family  43.62 
 
 		 153 aa  125  1.0000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2483  transcriptional regulator, MarR family  44.12 
 
 		 156 aa  125  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.758038  normal  0.560924 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0830  MarR family transcriptional regulator  44.78 
 
 		 151 aa  125  2.0000000000000002e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0108  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  45.59 
 
 		 152 aa  125  2.0000000000000002e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.879191 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0483  MarR family transcriptional regulator  45.77 
 
 		 151 aa  124  3e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0397178 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0886  MarR family transcriptional regulator  44.03 
 
 		 151 aa  124  4.0000000000000003e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1808  MarR family transcriptional regulator  40.4 
 
 		 159 aa  124  4.0000000000000003e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3240  MarR family transcriptional regulator  42.55 
 
 		 158 aa  123  8.000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.715513  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0369  MarR family transcriptional regulator  45.71 
 
 		 155 aa  123  8.000000000000001e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3114  transcriptional regulator, MarR family  47.48 
 
 		 145 aa  122  1e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0960  MarR family transcriptional regulator  45.31 
 
 		 146 aa  122  1e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.305429  normal  0.461467 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0926  transcriptional regulator, MarR family  47.83 
 
 		 158 aa  122  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.493079  normal  0.487426 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0474  transcriptional regulator, MarR family  55.14 
 
 		 155 aa  122  2e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3178  MarR family transcriptional regulator  42.14 
 
 		 154 aa  122  2e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.137994  normal  0.81725 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1742  MarR family transcriptional regulator  44.8 
 
 		 149 aa  121  3e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1189  transcriptional regulator MarR family  46.27 
 
 		 158 aa  121  4e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.622384  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2842  MarR family transcriptional regulator  43.84 
 
 		 150 aa  121  4e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0573  MarR family transcriptional regulator  45.38 
 
 		 151 aa  120  5e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.256198  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4792  transcriptional regulator, MarR family  44.03 
 
 		 147 aa  120  6e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0729618  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0705  MarR family transcriptional regulator  43.36 
 
 		 156 aa  120  7e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.186956  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0623  MarR family transcriptional regulator  42.75 
 
 		 151 aa  120  9e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02614  putative transcription regulator protein  40.94 
 
 		 153 aa  119  9.999999999999999e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.532202  normal  0.750512 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1641  transcriptional regulator, MarR family  56.7 
 
 		 157 aa  119  9.999999999999999e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.176874  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0813  transcriptional regulator, MarR family  47.1 
 
 		 159 aa  119  9.999999999999999e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.800363  normal  0.25148 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0598  MarR family transcriptional regulator  43.06 
 
 		 267 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6797  transcriptional regulator, MarR family  43.15 
 
 		 150 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000341321  decreased coverage  0.0000000109708 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2559  transcriptional regulator  42.47 
 
 		 150 aa  118  3e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.970675  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03887  transcriptional regulator MarR family  42.36 
 
 		 152 aa  118  3e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0862  MarR family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 158 aa  117  4.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.182256  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0335  MarR family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 158 aa  117  4.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.663008  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2950  transcriptional regulator, MarR family  42.45 
 
 		 149 aa  117  6e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27230  MarR family transcriptional regulator  41.96 
 
 		 151 aa  117  7e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0304  MarR family transcriptional regulator  42.36 
 
 		 150 aa  117  7.999999999999999e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15300  transcriptional regulator, MarR family  44.03 
 
 		 162 aa  116  7.999999999999999e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.408936  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2422  MarR family transcriptional regulator  42.36 
 
 		 150 aa  117  7.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.934023  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1483  MarR family transcriptional regulator  42.36 
 
 		 150 aa  117  7.999999999999999e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.553037  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1679  MarR family transcriptional regulator  42.36 
 
 		 150 aa  117  7.999999999999999e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1207  transcriptional regulator, MarR family  41.13 
 
 		 146 aa  117  7.999999999999999e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000193075 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2306  putative transcriptional regulator  41.96 
 
 		 151 aa  115  9.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1134  MarR family transcriptional regulator  42.45 
 
 		 144 aa  115  1.9999999999999998e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1328  transcriptional regulator, MarR family  42.45 
 
 		 149 aa  114  3e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0401  transcriptional regulator, MarR family  44.03 
 
 		 156 aa  114  3.9999999999999997e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1768  transcriptional regulator, MarR family  40.3 
 
 		 157 aa  114  5e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3626  regulatory protein, MarR  37.58 
 
 		 157 aa  114  5e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.0000000021465  normal  0.0936579 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1196  MarR family transcriptional regulator  48.67 
 
 		 155 aa  114  6e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0519  MarR family transcriptional regulator  47.01 
 
 		 150 aa  114  6.9999999999999995e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00587381 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3662  MarR family transcriptional regulator  42.25 
 
 		 150 aa  113  8.999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.485543  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4499  MarR family transcriptional regulator  42.25 
 
 		 150 aa  113  8.999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.148368  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3865  MarR family transcriptional regulator  42.25 
 
 		 150 aa  113  8.999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0792032  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3854  MarR family transcriptional regulator  40.3 
 
 		 151 aa  112  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.113287  normal  0.119098 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0050  transcriptional regulator, MarR family  42.47 
 
 		 164 aa  112  1.0000000000000001e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00479818 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2231  MarR family transcriptional regulator  43.26 
 
 		 150 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.106154  normal  0.474897 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2629  MarR family transcriptional regulator  39.86 
 
 		 160 aa  112  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.8863  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1306  MarR family transcriptional regulator  49.51 
 
 		 149 aa  112  1.0000000000000001e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.335381  normal  0.344824 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3762  MarR family transcriptional regulator  42.55 
 
 		 150 aa  112  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.425599  hitchhiker  0.00135953 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4585  transcriptional regulator, MarR family  45.87 
 
 		 150 aa  112  3e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3597  MarR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 153 aa  111  3e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2751  transcriptional regulator, MarR family  47.83 
 
 		 141 aa  111  3e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.290738  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3141  transcriptional regulator, MarR family  39.86 
 
 		 146 aa  111  4.0000000000000004e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.566984  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3233  MarR family transcriptional regulator  42.96 
 
 		 150 aa  110  5e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.550723  normal  0.0343876 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0519  transcriptional regulator, MarR family  50 
 
 		 157 aa  110  7.000000000000001e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0649  transcriptional regulator, MarR family  44.95 
 
 		 150 aa  110  8.000000000000001e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0861  transcriptional regulator, MarR family  42.54 
 
 		 161 aa  109  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.440211 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4312  MarR family transcriptional regulator  44.95 
 
 		 150 aa  109  1.0000000000000001e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>