More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_2251 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_2251  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 145 aa  285  2e-76  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.344689  normal  0.255238 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0573  MarR family transcriptional regulator  62.41 
 
 		 151 aa  177  2.9999999999999997e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.256198  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3619  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  63.38 
 
 		 162 aa  177  4.999999999999999e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5560  MarR family transcriptional regulator  63.57 
 
 		 170 aa  174  5e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.813118  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0623  MarR family transcriptional regulator  62.14 
 
 		 151 aa  172  1.9999999999999998e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0474  transcriptional regulator, MarR family  65.94 
 
 		 155 aa  170  6.999999999999999e-42  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4966  transcriptional regulator, MarR family  60.14 
 
 		 153 aa  167  5e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.345847  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1470  MarR family transcriptional regulator  58.57 
 
 		 151 aa  165  2e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4271  MarR family transcriptional regulator  60.74 
 
 		 156 aa  165  2e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0653897  normal  0.661065 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0483  MarR family transcriptional regulator  64.49 
 
 		 151 aa  164  2.9999999999999998e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0397178 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0057  MarR family transcriptional regulator  64.12 
 
 		 185 aa  164  5e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.584189  normal  0.103539 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3854  MarR family transcriptional regulator  57.86 
 
 		 151 aa  163  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.113287  normal  0.119098 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1768  transcriptional regulator, MarR family  55 
 
 		 157 aa  163  9e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0129  MarR family transcriptional regulator  57.14 
 
 		 154 aa  162  1.0000000000000001e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2950  transcriptional regulator, MarR family  57.86 
 
 		 149 aa  162  2.0000000000000002e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1328  transcriptional regulator, MarR family  58.57 
 
 		 149 aa  161  2.0000000000000002e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0108  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  58.87 
 
 		 152 aa  159  8.000000000000001e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.879191 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27230  MarR family transcriptional regulator  58.82 
 
 		 151 aa  158  2e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0401  transcriptional regulator, MarR family  55 
 
 		 156 aa  157  4e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3626  regulatory protein, MarR  54.29 
 
 		 157 aa  157  5e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.0000000021465  normal  0.0936579 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2629  MarR family transcriptional regulator  56.52 
 
 		 160 aa  157  6e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.8863  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6797  transcriptional regulator, MarR family  59.71 
 
 		 150 aa  157  6e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000341321  decreased coverage  0.0000000109708 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2306  putative transcriptional regulator  58.21 
 
 		 151 aa  155  1e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1435  MarR family transcriptional regulator  61.67 
 
 		 151 aa  155  2e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.209441 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0519  MarR family transcriptional regulator  63.48 
 
 		 150 aa  155  2e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00587381 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3996  MarR family transcriptional regulator  57.25 
 
 		 154 aa  155  2e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000674162  normal  0.401287 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15300  transcriptional regulator, MarR family  58.82 
 
 		 162 aa  155  2e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.408936  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1860  MarR family transcriptional regulator  61.67 
 
 		 151 aa  154  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0519  transcriptional regulator, MarR family  55.15 
 
 		 157 aa  154  6e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03887  transcriptional regulator MarR family  55.8 
 
 		 152 aa  153  6e-37  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2452  transcriptional regulator, MarR family  53.96 
 
 		 154 aa  153  7e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.126734  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1189  transcriptional regulator MarR family  55.94 
 
 		 158 aa  153  8e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.622384  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1196  MarR family transcriptional regulator  59.44 
 
 		 155 aa  153  9e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0886  MarR family transcriptional regulator  51.06 
 
 		 151 aa  153  9e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2842  MarR family transcriptional regulator  58.27 
 
 		 150 aa  153  9e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4410  MarR family transcriptional regulator  56.12 
 
 		 176 aa  152  1e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2174  regulatory protein MarR  53.96 
 
 		 154 aa  152  1e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.363681 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0830  MarR family transcriptional regulator  51.06 
 
 		 151 aa  152  1e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3291  MarR family transcriptional regulator  50.35 
 
 		 152 aa  152  2e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.570613  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3141  transcriptional regulator, MarR family  56.52 
 
 		 146 aa  151  2e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.566984  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4766  transcriptional regulator, MarR family  53.68 
 
 		 166 aa  152  2e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.462626  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1808  MarR family transcriptional regulator  57.25 
 
 		 159 aa  152  2e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4256  MarR family transcriptional regulator  52.82 
 
 		 166 aa  151  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.973283 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2137  transcriptional regulator, MarR family  51.8 
 
 		 154 aa  150  4e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.727084 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2845  transcriptional regulator, MarR family  52.17 
 
 		 145 aa  151  4e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.648486  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1176  transcriptional regulator, TrmB  55.15 
 
 		 146 aa  150  5e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.713709  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1193  transcriptional regulator, TrmB  55.15 
 
 		 146 aa  150  5e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02614  putative transcription regulator protein  55.88 
 
 		 153 aa  149  1e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.532202  normal  0.750512 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1113  transcriptional regulator, TrmB  53.96 
 
 		 167 aa  148  2e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1203  transcriptional regulator, TrmB  54.41 
 
 		 146 aa  148  2e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.529625  normal  0.0362733 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0576  transcriptional regulator, TrmB  53.9 
 
 		 158 aa  147  4e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0950259  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0960  MarR family transcriptional regulator  58.14 
 
 		 146 aa  147  4e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.305429  normal  0.461467 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1742  MarR family transcriptional regulator  51.8 
 
 		 149 aa  147  5e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0815  MarR family transcriptional regulator  53.44 
 
 		 165 aa  146  7e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000550088 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3208  MarR family transcriptional regulator  53.79 
 
 		 165 aa  147  7e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.469767 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0934  MarR family transcriptional regulator  60.18 
 
 		 163 aa  147  7e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5144  MarR family transcriptional regulator  53.96 
 
 		 156 aa  147  7e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0061  MarR family transcriptional regulator  53.73 
 
 		 171 aa  146  8e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.310818 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3056  MarR family transcriptional regulator  54.55 
 
 		 168 aa  146  9e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4312  MarR family transcriptional regulator  48.2 
 
 		 150 aa  146  9e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3426  transcriptional regulator, MarR family  54.62 
 
 		 165 aa  145  1.0000000000000001e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0835  transcriptional regulator, MarR family protein  49.3 
 
 		 150 aa  146  1.0000000000000001e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0866  MarR family transcriptional regulator  54.62 
 
 		 165 aa  145  1.0000000000000001e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3498  MarR family transcriptional regulator  54.62 
 
 		 165 aa  145  1.0000000000000001e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1670  transcriptional regulator, MarR family  54.41 
 
 		 161 aa  146  1.0000000000000001e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.428433  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4792  transcriptional regulator, MarR family  57.03 
 
 		 147 aa  146  1.0000000000000001e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0729618  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3415  MarR family transcriptional regulator  51.75 
 
 		 149 aa  145  2.0000000000000003e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0058743 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4585  transcriptional regulator, MarR family  47.14 
 
 		 150 aa  145  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0578  transcriptional regulator, MarR family protein  50 
 
 		 163 aa  145  2.0000000000000003e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3311  MarR family transcriptional regulator  53.44 
 
 		 165 aa  145  2.0000000000000003e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3189  regulatory protein, MarR  52.14 
 
 		 144 aa  145  2.0000000000000003e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.637369 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0799  MarR family transcriptional regulator  55.64 
 
 		 161 aa  145  2.0000000000000003e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4745  transcriptional regulator, MarR family  52.14 
 
 		 147 aa  144  3e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.427221 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4558  MarR family transcriptional regulator  47.48 
 
 		 150 aa  144  3e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3668  transcriptional regulator, MarR family  52.14 
 
 		 147 aa  144  3e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.400003  normal  0.620653 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3621  MarR family transcriptional regulator  53.85 
 
 		 165 aa  144  4.0000000000000006e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.597701 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2325  transcriptional regulator, MarR family  53.73 
 
 		 162 aa  143  6e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0434242 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0021  MarR family transcriptional regulator  52.78 
 
 		 178 aa  143  6e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0977  MarR family transcriptional regulator  53.49 
 
 		 165 aa  143  7.0000000000000006e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1641  transcriptional regulator, MarR family  52.11 
 
 		 157 aa  143  8.000000000000001e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.176874  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3597  MarR family transcriptional regulator  47.22 
 
 		 153 aa  143  9e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0649  transcriptional regulator, MarR family  46.43 
 
 		 150 aa  142  1e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1524  MarR family transcriptional regulator  51.08 
 
 		 149 aa  142  1e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.26569  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4364  MarR family transcriptional regulator  45.71 
 
 		 150 aa  141  2e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4200  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  45.71 
 
 		 150 aa  141  2e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4211  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  45.71 
 
 		 150 aa  141  2e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.151141  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2483  transcriptional regulator, MarR family  50 
 
 		 156 aa  142  2e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.758038  normal  0.560924 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4699  MarR family transcriptional regulator  45.71 
 
 		 150 aa  141  2e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4603  transcriptional regulator, MarR family  45.71 
 
 		 150 aa  142  2e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.221434  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2151  MarR family transcriptional regulator  51.45 
 
 		 153 aa  141  3e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.680053 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4554  transcriptional regulator, MarR family  46.04 
 
 		 150 aa  141  3e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0628  MarR family transcriptional regulator  54.14 
 
 		 144 aa  141  3e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2559  transcriptional regulator  52.52 
 
 		 150 aa  140  4e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.970675  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0598  MarR family transcriptional regulator  52.52 
 
 		 267 aa  140  4e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2738  transcriptional regulator, MarR family  50 
 
 		 156 aa  140  4e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.708856 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0862  MarR family transcriptional regulator  52.52 
 
 		 158 aa  140  5e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.182256  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0335  MarR family transcriptional regulator  52.52 
 
 		 158 aa  140  5e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.663008  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2956  MarR family transcriptional regulator  52.99 
 
 		 153 aa  140  6e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.119179 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2422  MarR family transcriptional regulator  52.52 
 
 		 150 aa  140  6e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.934023  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1483  MarR family transcriptional regulator  52.52 
 
 		 150 aa  140  6e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.553037  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>