More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_5662 on replicon NC_010625
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010625  Bphy_5662  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 153 aa  315  2e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.49927  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4137  transcriptional regulator, MarR family  81.21 
 
 		 153 aa  256  1e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1608  MarR family transcriptional regulator  72.85 
 
 		 151 aa  239  1e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.457422  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1631  MarR family transcriptional regulator  72.19 
 
 		 151 aa  237  5e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.813551 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4873  MarR family transcriptional regulator  71.52 
 
 		 151 aa  236  1e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.846475  normal  0.145685 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1671  MarR family transcriptional regulator  71.62 
 
 		 151 aa  234  3e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.787972  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1219  MarR family transcriptional regulator  71.62 
 
 		 151 aa  233  5.0000000000000005e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.318492  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1698  MarR family transcriptional regulator  71.62 
 
 		 151 aa  233  5.0000000000000005e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.547698  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1547  MarR family transcriptional regulator  74.29 
 
 		 148 aa  231  2.0000000000000002e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.187738 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2456  transcriptional regulator, MarR family  67.15 
 
 		 168 aa  188  2e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.768302  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2174  transcriptional regulator, MarR family  65.25 
 
 		 165 aa  188  2.9999999999999997e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.789823  normal  0.527206 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2845  transcriptional regulator, MarR family  50.71 
 
 		 145 aa  152  1e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.648486  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0061  MarR family transcriptional regulator  48.91 
 
 		 171 aa  145  3e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.310818 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2956  MarR family transcriptional regulator  46.36 
 
 		 153 aa  143  1e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.119179 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4966  transcriptional regulator, MarR family  49.66 
 
 		 153 aa  142  2e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.345847  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4256  MarR family transcriptional regulator  48.89 
 
 		 166 aa  142  2e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.973283 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1670  transcriptional regulator, MarR family  48.2 
 
 		 161 aa  141  4e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.428433  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0830  MarR family transcriptional regulator  48.59 
 
 		 151 aa  140  5e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0886  MarR family transcriptional regulator  48.59 
 
 		 151 aa  140  7e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0057  MarR family transcriptional regulator  50.77 
 
 		 185 aa  140  7e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.584189  normal  0.103539 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4766  transcriptional regulator, MarR family  47.41 
 
 		 166 aa  138  3e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.462626  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2738  transcriptional regulator, MarR family  45.65 
 
 		 156 aa  137  3.9999999999999997e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.708856 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0576  transcriptional regulator, TrmB  46.48 
 
 		 158 aa  137  7e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0950259  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2251  MarR family transcriptional regulator  49.3 
 
 		 145 aa  136  8.999999999999999e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.344689  normal  0.255238 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2325  transcriptional regulator, MarR family  45.07 
 
 		 162 aa  135  1e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0434242 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3291  MarR family transcriptional regulator  44.14 
 
 		 152 aa  136  1e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.570613  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3114  transcriptional regulator, MarR family  51.8 
 
 		 145 aa  134  3.0000000000000003e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5560  MarR family transcriptional regulator  50.37 
 
 		 170 aa  133  7.000000000000001e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.813118  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0623  MarR family transcriptional regulator  46.98 
 
 		 151 aa  132  9.999999999999999e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0483  MarR family transcriptional regulator  50.37 
 
 		 151 aa  132  9.999999999999999e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0397178 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0474  transcriptional regulator, MarR family  50.75 
 
 		 155 aa  132  3e-30  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2483  transcriptional regulator, MarR family  41.96 
 
 		 156 aa  131  3e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.758038  normal  0.560924 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4271  MarR family transcriptional regulator  56.31 
 
 		 156 aa  131  3.9999999999999996e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0653897  normal  0.661065 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1189  transcriptional regulator MarR family  43.33 
 
 		 158 aa  130  6.999999999999999e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.622384  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2280  MarR family transcriptional regulator  53.33 
 
 		 170 aa  130  7.999999999999999e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.421231  normal  0.627337 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3178  MarR family transcriptional regulator  40.82 
 
 		 154 aa  129  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.137994  normal  0.81725 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3240  MarR family transcriptional regulator  43.38 
 
 		 158 aa  129  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.715513  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3444  transcriptional regulator, MarR family  47.73 
 
 		 153 aa  128  3e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3619  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  48.12 
 
 		 162 aa  128  4.0000000000000003e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3097  transcriptional regulator, MarR family  47.73 
 
 		 153 aa  127  6e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1742  MarR family transcriptional regulator  48.76 
 
 		 149 aa  126  1.0000000000000001e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1196  MarR family transcriptional regulator  45.83 
 
 		 155 aa  126  1.0000000000000001e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1203  transcriptional regulator, TrmB  45.26 
 
 		 146 aa  125  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.529625  normal  0.0362733 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0573  MarR family transcriptional regulator  42.18 
 
 		 151 aa  125  2.0000000000000002e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.256198  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0401  transcriptional regulator, MarR family  43.87 
 
 		 156 aa  125  2.0000000000000002e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1176  transcriptional regulator, TrmB  45.26 
 
 		 146 aa  125  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.713709  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0705  MarR family transcriptional regulator  42.36 
 
 		 156 aa  125  2.0000000000000002e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.186956  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1193  transcriptional regulator, TrmB  45.26 
 
 		 146 aa  125  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0960  MarR family transcriptional regulator  55.34 
 
 		 146 aa  125  3e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.305429  normal  0.461467 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2950  transcriptional regulator, MarR family  45 
 
 		 149 aa  124  5e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1207  transcriptional regulator, MarR family  44.29 
 
 		 146 aa  124  6e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000193075 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0129  MarR family transcriptional regulator  48.09 
 
 		 154 aa  123  7e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1328  transcriptional regulator, MarR family  45 
 
 		 149 aa  123  8.000000000000001e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0108  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  43.66 
 
 		 152 aa  122  1e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.879191 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0519  MarR family transcriptional regulator  48.82 
 
 		 150 aa  123  1e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00587381 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0519  transcriptional regulator, MarR family  49.61 
 
 		 157 aa  122  2e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4792  transcriptional regulator, MarR family  46.46 
 
 		 147 aa  122  2e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0729618  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2928  MarR family transcriptional regulator  43.17 
 
 		 143 aa  122  2e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.442252 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0369  MarR family transcriptional regulator  41.1 
 
 		 155 aa  122  2e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1768  transcriptional regulator, MarR family  39.33 
 
 		 157 aa  121  4e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0598  MarR family transcriptional regulator  42.34 
 
 		 267 aa  121  4e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0862  MarR family transcriptional regulator  40.79 
 
 		 158 aa  120  5e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.182256  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0335  MarR family transcriptional regulator  40.79 
 
 		 158 aa  120  5e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.663008  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2559  transcriptional regulator  42.34 
 
 		 150 aa  120  6e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.970675  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1134  MarR family transcriptional regulator  45.74 
 
 		 144 aa  120  6e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0304  MarR family transcriptional regulator  42.34 
 
 		 150 aa  120  8e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1679  MarR family transcriptional regulator  42.34 
 
 		 150 aa  120  8e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2422  MarR family transcriptional regulator  42.34 
 
 		 150 aa  120  8e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.934023  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4410  MarR family transcriptional regulator  46.56 
 
 		 176 aa  120  8e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1483  MarR family transcriptional regulator  42.34 
 
 		 150 aa  120  8e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.553037  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02614  putative transcription regulator protein  42.57 
 
 		 153 aa  120  9e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.532202  normal  0.750512 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1808  MarR family transcriptional regulator  44.54 
 
 		 159 aa  119  9.999999999999999e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15300  transcriptional regulator, MarR family  44.03 
 
 		 162 aa  119  9.999999999999999e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.408936  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03887  transcriptional regulator MarR family  42.96 
 
 		 152 aa  119  1.9999999999999998e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5144  MarR family transcriptional regulator  45.14 
 
 		 156 aa  117  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1641  transcriptional regulator, MarR family  50 
 
 		 157 aa  117  4.9999999999999996e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.176874  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2452  transcriptional regulator, MarR family  44.37 
 
 		 154 aa  117  6e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.126734  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06220  transcriptional regulator, MarR family  43.61 
 
 		 169 aa  117  7e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2137  transcriptional regulator, MarR family  44.6 
 
 		 154 aa  117  7.999999999999999e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.727084 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3626  regulatory protein, MarR  40.3 
 
 		 157 aa  116  9.999999999999999e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.0000000021465  normal  0.0936579 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2174  regulatory protein MarR  44.37 
 
 		 154 aa  116  9.999999999999999e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.363681 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0926  transcriptional regulator, MarR family  43.48 
 
 		 158 aa  116  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.493079  normal  0.487426 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4635  MarR family transcriptional regulator  46.04 
 
 		 153 aa  116  9.999999999999999e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.472747  normal  0.0529683 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0861  transcriptional regulator, MarR family  42.03 
 
 		 161 aa  116  9.999999999999999e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.440211 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2751  transcriptional regulator, MarR family  47.83 
 
 		 141 aa  115  1.9999999999999998e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.290738  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04763  hypothetical protein  43.57 
 
 		 143 aa  115  1.9999999999999998e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6797  transcriptional regulator, MarR family  44.62 
 
 		 150 aa  115  3e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000341321  decreased coverage  0.0000000109708 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1306  MarR family transcriptional regulator  50 
 
 		 149 aa  115  3e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.335381  normal  0.344824 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1524  MarR family transcriptional regulator  43.07 
 
 		 149 aa  115  3e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.26569  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0886  transcriptional regulator, MarR family  40.58 
 
 		 161 aa  114  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.541526  normal  0.759862 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2629  MarR family transcriptional regulator  40.3 
 
 		 160 aa  114  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.8863  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2306  putative transcriptional regulator  41.48 
 
 		 151 aa  114  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27230  MarR family transcriptional regulator  41.48 
 
 		 151 aa  114  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4312  MarR family transcriptional regulator  45.3 
 
 		 150 aa  114  3.9999999999999997e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1770  MarR family transcriptional regulator  46.92 
 
 		 155 aa  114  3.9999999999999997e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4558  MarR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 150 aa  114  5e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4585  transcriptional regulator, MarR family  39.86 
 
 		 150 aa  114  5e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0799  MarR family transcriptional regulator  41.3 
 
 		 161 aa  114  5e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0649  transcriptional regulator, MarR family  39.86 
 
 		 150 aa  114  6e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0421  MarR family transcriptional regulator  40 
 
 		 150 aa  114  6.9999999999999995e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0670441  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>