More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_2280 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_2280  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 170 aa  347  4e-95  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.421231  normal  0.627337 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0061  MarR family transcriptional regulator  62.04 
 
 		 171 aa  171  2.9999999999999996e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.310818 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2845  transcriptional regulator, MarR family  57.97 
 
 		 145 aa  163  1.0000000000000001e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.648486  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1670  transcriptional regulator, MarR family  55.63 
 
 		 161 aa  159  2e-38  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.428433  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2738  transcriptional regulator, MarR family  55.3 
 
 		 156 aa  158  3e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.708856 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2483  transcriptional regulator, MarR family  54.55 
 
 		 156 aa  155  3e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.758038  normal  0.560924 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4256  MarR family transcriptional regulator  52.08 
 
 		 166 aa  150  1e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.973283 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1671  MarR family transcriptional regulator  49.32 
 
 		 151 aa  149  2e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.787972  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3178  MarR family transcriptional regulator  52.9 
 
 		 154 aa  149  2e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.137994  normal  0.81725 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1219  MarR family transcriptional regulator  49.32 
 
 		 151 aa  148  3e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.318492  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0830  MarR family transcriptional regulator  52.14 
 
 		 151 aa  148  3e-35  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1698  MarR family transcriptional regulator  49.32 
 
 		 151 aa  148  3e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.547698  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0886  MarR family transcriptional regulator  51.43 
 
 		 151 aa  147  8e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4873  MarR family transcriptional regulator  47.95 
 
 		 151 aa  146  1.0000000000000001e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.846475  normal  0.145685 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0474  transcriptional regulator, MarR family  53.85 
 
 		 155 aa  146  1.0000000000000001e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3114  transcriptional regulator, MarR family  57.25 
 
 		 145 aa  146  1.0000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0483  MarR family transcriptional regulator  55.8 
 
 		 151 aa  146  1.0000000000000001e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0397178 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4766  transcriptional regulator, MarR family  50.69 
 
 		 166 aa  146  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.462626  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4966  transcriptional regulator, MarR family  54.14 
 
 		 153 aa  146  2.0000000000000003e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.345847  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4137  transcriptional regulator, MarR family  46.58 
 
 		 153 aa  146  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3240  MarR family transcriptional regulator  51.75 
 
 		 158 aa  145  3e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.715513  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2956  MarR family transcriptional regulator  57.69 
 
 		 153 aa  144  4.0000000000000006e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.119179 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0573  MarR family transcriptional regulator  51.45 
 
 		 151 aa  144  8.000000000000001e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.256198  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5662  MarR family transcriptional regulator  47.26 
 
 		 153 aa  143  9e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.49927  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1641  transcriptional regulator, MarR family  51.33 
 
 		 157 aa  143  1e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.176874  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1742  MarR family transcriptional regulator  56.91 
 
 		 149 aa  142  2e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2325  transcriptional regulator, MarR family  51.11 
 
 		 162 aa  142  2e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0434242 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1608  MarR family transcriptional regulator  47.26 
 
 		 151 aa  142  2e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.457422  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3291  MarR family transcriptional regulator  48.28 
 
 		 152 aa  142  2e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.570613  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0108  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  52.52 
 
 		 152 aa  141  6e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.879191 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0519  transcriptional regulator, MarR family  53.33 
 
 		 157 aa  140  6e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0623  MarR family transcriptional regulator  49.66 
 
 		 151 aa  140  6e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0401  transcriptional regulator, MarR family  53.33 
 
 		 156 aa  140  6e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1547  MarR family transcriptional regulator  47.65 
 
 		 148 aa  140  7e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.187738 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0861  transcriptional regulator, MarR family  50 
 
 		 161 aa  140  7e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.440211 
 
 
-
 
NC_003296  RS02614  putative transcription regulator protein  50.72 
 
 		 153 aa  140  8e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.532202  normal  0.750512 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1631  MarR family transcriptional regulator  46.58 
 
 		 151 aa  140  9e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.813551 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0886  transcriptional regulator, MarR family  49.3 
 
 		 161 aa  140  9.999999999999999e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.541526  normal  0.759862 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0925  regulatory protein MarR  49.3 
 
 		 195 aa  140  9.999999999999999e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.101489  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3619  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  46.75 
 
 		 162 aa  139  9.999999999999999e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0129  MarR family transcriptional regulator  48.65 
 
 		 154 aa  139  1.9999999999999998e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2950  transcriptional regulator, MarR family  51.11 
 
 		 149 aa  139  3e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4271  MarR family transcriptional regulator  50 
 
 		 156 aa  138  3.9999999999999997e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0653897  normal  0.661065 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03887  transcriptional regulator MarR family  49.26 
 
 		 152 aa  137  4.999999999999999e-32  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1328  transcriptional regulator, MarR family  50.37 
 
 		 149 aa  137  8.999999999999999e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2456  transcriptional regulator, MarR family  56.9 
 
 		 168 aa  136  1e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.768302  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2928  MarR family transcriptional regulator  46.21 
 
 		 143 aa  136  1e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.442252 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0519  MarR family transcriptional regulator  55.75 
 
 		 150 aa  135  3.0000000000000003e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00587381 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1196  MarR family transcriptional regulator  49.65 
 
 		 155 aa  134  4e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1306  MarR family transcriptional regulator  61.11 
 
 		 149 aa  133  9e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.335381  normal  0.344824 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3626  regulatory protein, MarR  48.57 
 
 		 157 aa  133  9.999999999999999e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.0000000021465  normal  0.0936579 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1203  transcriptional regulator, TrmB  50 
 
 		 146 aa  133  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.529625  normal  0.0362733 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4880  MarR family transcriptional regulator  48.67 
 
 		 157 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.368926  hitchhiker  0.00140951 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1134  MarR family transcriptional regulator  48.59 
 
 		 144 aa  132  1.9999999999999998e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1176  transcriptional regulator, TrmB  50 
 
 		 146 aa  131  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.713709  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1193  transcriptional regulator, TrmB  50 
 
 		 146 aa  131  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0576  transcriptional regulator, TrmB  52.03 
 
 		 158 aa  131  5e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0950259  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0021  MarR family transcriptional regulator  50.35 
 
 		 178 aa  130  6.999999999999999e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1189  transcriptional regulator MarR family  49.3 
 
 		 158 aa  130  6.999999999999999e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.622384  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2174  transcriptional regulator, MarR family  55.17 
 
 		 165 aa  130  9e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.789823  normal  0.527206 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5560  MarR family transcriptional regulator  48.89 
 
 		 170 aa  130  1.0000000000000001e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.813118  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3444  transcriptional regulator, MarR family  52.55 
 
 		 153 aa  130  1.0000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3097  transcriptional regulator, MarR family  52.55 
 
 		 153 aa  130  1.0000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2251  MarR family transcriptional regulator  46.53 
 
 		 145 aa  129  3e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.344689  normal  0.255238 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3662  MarR family transcriptional regulator  48.28 
 
 		 150 aa  128  3e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.485543  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4499  MarR family transcriptional regulator  48.28 
 
 		 150 aa  128  3e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.148368  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0926  transcriptional regulator, MarR family  46.58 
 
 		 158 aa  129  3e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.493079  normal  0.487426 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3865  MarR family transcriptional regulator  48.28 
 
 		 150 aa  128  3e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0792032  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3762  MarR family transcriptional regulator  47.62 
 
 		 150 aa  128  4.0000000000000003e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.425599  hitchhiker  0.00135953 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0813  transcriptional regulator, MarR family  47.26 
 
 		 159 aa  128  4.0000000000000003e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.800363  normal  0.25148 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1207  transcriptional regulator, MarR family  48.57 
 
 		 146 aa  128  4.0000000000000003e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000193075 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3141  transcriptional regulator, MarR family  52.1 
 
 		 146 aa  128  5.0000000000000004e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.566984  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6797  transcriptional regulator, MarR family  49.32 
 
 		 150 aa  127  5.0000000000000004e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000341321  decreased coverage  0.0000000109708 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0862  MarR family transcriptional regulator  48.68 
 
 		 158 aa  127  6e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.182256  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0335  MarR family transcriptional regulator  48.68 
 
 		 158 aa  127  6e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.663008  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2842  MarR family transcriptional regulator  49.32 
 
 		 150 aa  127  7.000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0598  MarR family transcriptional regulator  50 
 
 		 267 aa  127  9.000000000000001e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4792  transcriptional regulator, MarR family  51.94 
 
 		 147 aa  126  1.0000000000000001e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0729618  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3233  MarR family transcriptional regulator  47.59 
 
 		 150 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.550723  normal  0.0343876 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27230  MarR family transcriptional regulator  46.04 
 
 		 151 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0705  MarR family transcriptional regulator  48.57 
 
 		 156 aa  126  1.0000000000000001e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.186956  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0649  transcriptional regulator, MarR family  44.7 
 
 		 150 aa  126  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4603  transcriptional regulator, MarR family  44.7 
 
 		 150 aa  126  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.221434  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1768  transcriptional regulator, MarR family  45.71 
 
 		 157 aa  126  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4364  MarR family transcriptional regulator  44.7 
 
 		 150 aa  126  2.0000000000000002e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4200  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  44.7 
 
 		 150 aa  126  2.0000000000000002e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4211  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  44.7 
 
 		 150 aa  126  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.151141  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2231  MarR family transcriptional regulator  46.94 
 
 		 150 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.106154  normal  0.474897 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4699  MarR family transcriptional regulator  44.7 
 
 		 150 aa  126  2.0000000000000002e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4554  transcriptional regulator, MarR family  44.7 
 
 		 150 aa  126  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2559  transcriptional regulator  49.65 
 
 		 150 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.970675  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0057  MarR family transcriptional regulator  48.85 
 
 		 185 aa  125  3e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.584189  normal  0.103539 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4558  MarR family transcriptional regulator  44.7 
 
 		 150 aa  125  3e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5144  MarR family transcriptional regulator  48.09 
 
 		 156 aa  125  3e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0676  MarR family transcriptional regulator  51.82 
 
 		 172 aa  125  3e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0304  MarR family transcriptional regulator  49.65 
 
 		 150 aa  125  3e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1679  MarR family transcriptional regulator  49.65 
 
 		 150 aa  125  3e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1483  MarR family transcriptional regulator  49.65 
 
 		 150 aa  125  3e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.553037  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2306  putative transcriptional regulator  46.04 
 
 		 151 aa  125  3e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4585  transcriptional regulator, MarR family  43.94 
 
 		 150 aa  125  3e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>