More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_2956 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_2956  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 153 aa  306  5e-83  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.119179 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2845  transcriptional regulator, MarR family  54.74 
 
 		 145 aa  156  9e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.648486  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0061  MarR family transcriptional regulator  56.12 
 
 		 171 aa  152  1e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.310818 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4766  transcriptional regulator, MarR family  55.4 
 
 		 166 aa  151  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.462626  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0108  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  56.93 
 
 		 152 aa  147  4e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.879191 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4256  MarR family transcriptional regulator  55.07 
 
 		 166 aa  147  8e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.973283 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1670  transcriptional regulator, MarR family  52.9 
 
 		 161 aa  146  1.0000000000000001e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.428433  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4137  transcriptional regulator, MarR family  48.03 
 
 		 153 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1671  MarR family transcriptional regulator  49.66 
 
 		 151 aa  144  6e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.787972  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5662  MarR family transcriptional regulator  46.36 
 
 		 153 aa  143  1e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.49927  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1219  MarR family transcriptional regulator  49.66 
 
 		 151 aa  142  2e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.318492  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1698  MarR family transcriptional regulator  49.66 
 
 		 151 aa  142  2e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.547698  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2251  MarR family transcriptional regulator  52.99 
 
 		 145 aa  140  6e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.344689  normal  0.255238 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4873  MarR family transcriptional regulator  47.33 
 
 		 151 aa  139  9.999999999999999e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.846475  normal  0.145685 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4966  transcriptional regulator, MarR family  50.68 
 
 		 153 aa  139  9.999999999999999e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.345847  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2928  MarR family transcriptional regulator  51.09 
 
 		 143 aa  139  1.9999999999999998e-32  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.442252 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2280  MarR family transcriptional regulator  57.69 
 
 		 170 aa  138  1.9999999999999998e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.421231  normal  0.627337 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1608  MarR family transcriptional regulator  48 
 
 		 151 aa  138  3e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.457422  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5560  MarR family transcriptional regulator  53.28 
 
 		 170 aa  137  4.999999999999999e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.813118  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1742  MarR family transcriptional regulator  52.76 
 
 		 149 aa  137  4.999999999999999e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2456  transcriptional regulator, MarR family  51.77 
 
 		 168 aa  137  4.999999999999999e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.768302  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2483  transcriptional regulator, MarR family  47.48 
 
 		 156 aa  137  6e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.758038  normal  0.560924 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0483  MarR family transcriptional regulator  55.97 
 
 		 151 aa  136  8.999999999999999e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0397178 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2174  transcriptional regulator, MarR family  51.77 
 
 		 165 aa  136  1e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.789823  normal  0.527206 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3114  transcriptional regulator, MarR family  54.35 
 
 		 145 aa  135  1e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1631  MarR family transcriptional regulator  47.33 
 
 		 151 aa  136  1e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.813551 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3291  MarR family transcriptional regulator  44.59 
 
 		 152 aa  136  1e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.570613  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3178  MarR family transcriptional regulator  48.51 
 
 		 154 aa  135  2e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.137994  normal  0.81725 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0474  transcriptional regulator, MarR family  54.48 
 
 		 155 aa  134  4e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1196  MarR family transcriptional regulator  50 
 
 		 155 aa  134  5e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0573  MarR family transcriptional regulator  50 
 
 		 151 aa  134  7.000000000000001e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.256198  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1547  MarR family transcriptional regulator  47.86 
 
 		 148 aa  133  9e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.187738 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1306  MarR family transcriptional regulator  51.39 
 
 		 149 aa  133  9e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.335381  normal  0.344824 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3240  MarR family transcriptional regulator  49.24 
 
 		 158 aa  132  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.715513  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0960  MarR family transcriptional regulator  51.49 
 
 		 146 aa  131  3e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.305429  normal  0.461467 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3619  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  51.49 
 
 		 162 aa  131  3.9999999999999996e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2738  transcriptional regulator, MarR family  47.06 
 
 		 156 aa  131  3.9999999999999996e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.708856 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0576  transcriptional regulator, TrmB  54.62 
 
 		 158 aa  130  6e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0950259  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3854  MarR family transcriptional regulator  45.99 
 
 		 151 aa  130  6.999999999999999e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.113287  normal  0.119098 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0830  MarR family transcriptional regulator  44.83 
 
 		 151 aa  129  1.0000000000000001e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0886  MarR family transcriptional regulator  44.83 
 
 		 151 aa  129  2.0000000000000002e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2137  transcriptional regulator, MarR family  45.52 
 
 		 154 aa  128  3e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.727084 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0623  MarR family transcriptional regulator  49.25 
 
 		 151 aa  128  3e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15300  transcriptional regulator, MarR family  44.3 
 
 		 162 aa  128  3e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.408936  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2174  regulatory protein MarR  46.27 
 
 		 154 aa  127  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.363681 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2452  transcriptional regulator, MarR family  46.27 
 
 		 154 aa  127  5.0000000000000004e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.126734  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1641  transcriptional regulator, MarR family  49.61 
 
 		 157 aa  127  7.000000000000001e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.176874  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27230  MarR family transcriptional regulator  45.93 
 
 		 151 aa  126  9.000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1113  transcriptional regulator, TrmB  49.61 
 
 		 167 aa  126  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1768  transcriptional regulator, MarR family  45.26 
 
 		 157 aa  126  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1203  transcriptional regulator, TrmB  50 
 
 		 146 aa  126  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.529625  normal  0.0362733 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2151  MarR family transcriptional regulator  48.03 
 
 		 153 aa  126  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.680053 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3597  MarR family transcriptional regulator  45.77 
 
 		 153 aa  125  2.0000000000000002e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0886  transcriptional regulator, MarR family  49.28 
 
 		 161 aa  125  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.541526  normal  0.759862 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0861  transcriptional regulator, MarR family  50 
 
 		 161 aa  125  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.440211 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2325  transcriptional regulator, MarR family  49.61 
 
 		 162 aa  125  2.0000000000000002e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0434242 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5144  MarR family transcriptional regulator  47.26 
 
 		 156 aa  125  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1134  MarR family transcriptional regulator  50.39 
 
 		 144 aa  125  2.0000000000000002e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0925  regulatory protein MarR  50 
 
 		 195 aa  125  3e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.101489  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3141  transcriptional regulator, MarR family  45.26 
 
 		 146 aa  125  3e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.566984  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4271  MarR family transcriptional regulator  48.18 
 
 		 156 aa  125  3e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0653897  normal  0.661065 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3626  regulatory protein, MarR  45.26 
 
 		 157 aa  124  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.0000000021465  normal  0.0936579 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4603  transcriptional regulator, MarR family  39.44 
 
 		 150 aa  124  5e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.221434  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2306  putative transcriptional regulator  44.44 
 
 		 151 aa  124  6e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1470  MarR family transcriptional regulator  44.53 
 
 		 151 aa  124  6e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4364  MarR family transcriptional regulator  39.44 
 
 		 150 aa  123  7e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4200  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  39.44 
 
 		 150 aa  123  7e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4211  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  39.44 
 
 		 150 aa  123  7e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.151141  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4699  MarR family transcriptional regulator  39.44 
 
 		 150 aa  123  7e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4554  transcriptional regulator, MarR family  39.44 
 
 		 150 aa  123  8.000000000000001e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0519  transcriptional regulator, MarR family  49.23 
 
 		 157 aa  123  8.000000000000001e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4558  MarR family transcriptional regulator  39.44 
 
 		 150 aa  122  1e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4745  transcriptional regulator, MarR family  49.3 
 
 		 147 aa  122  1e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.427221 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3668  transcriptional regulator, MarR family  49.3 
 
 		 147 aa  122  1e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.400003  normal  0.620653 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1176  transcriptional regulator, TrmB  49.25 
 
 		 146 aa  123  1e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.713709  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4312  MarR family transcriptional regulator  39.44 
 
 		 150 aa  123  1e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2629  MarR family transcriptional regulator  42.22 
 
 		 160 aa  122  1e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.8863  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1193  transcriptional regulator, TrmB  49.25 
 
 		 146 aa  123  1e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4585  transcriptional regulator, MarR family  39.44 
 
 		 150 aa  122  2e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1860  MarR family transcriptional regulator  50 
 
 		 151 aa  122  2e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0057  MarR family transcriptional regulator  50.37 
 
 		 185 aa  122  2e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.584189  normal  0.103539 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0401  transcriptional regulator, MarR family  48.53 
 
 		 156 aa  122  2e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0021  MarR family transcriptional regulator  47.52 
 
 		 178 aa  122  3e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0369  MarR family transcriptional regulator  48.15 
 
 		 155 aa  121  3e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1435  MarR family transcriptional regulator  50 
 
 		 151 aa  121  3e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.209441 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4792  transcriptional regulator, MarR family  48.46 
 
 		 147 aa  120  5e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0729618  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1207  transcriptional regulator, MarR family  49.23 
 
 		 146 aa  120  7e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000193075 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0649  transcriptional regulator, MarR family  38.73 
 
 		 150 aa  120  8e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0129  MarR family transcriptional regulator  48.46 
 
 		 154 aa  119  9.999999999999999e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04763  hypothetical protein  44.78 
 
 		 143 aa  119  1.9999999999999998e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0813  transcriptional regulator, MarR family  45.77 
 
 		 159 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.800363  normal  0.25148 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1189  transcriptional regulator MarR family  48.18 
 
 		 158 aa  118  1.9999999999999998e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.622384  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3097  transcriptional regulator, MarR family  46.38 
 
 		 153 aa  118  3e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3662  MarR family transcriptional regulator  52.73 
 
 		 150 aa  118  3e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.485543  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4499  MarR family transcriptional regulator  52.73 
 
 		 150 aa  118  3e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.148368  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3865  MarR family transcriptional regulator  52.73 
 
 		 150 aa  118  3e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0792032  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3444  transcriptional regulator, MarR family  46.38 
 
 		 153 aa  118  3e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1068  MarR family transcriptional regulator  48.03 
 
 		 147 aa  118  3.9999999999999996e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1808  MarR family transcriptional regulator  57.29 
 
 		 159 aa  117  4.9999999999999996e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0578  transcriptional regulator, MarR family protein  46.4 
 
 		 163 aa  116  9e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>