More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_2456 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_2456  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 		 168 aa  342  1e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.768302  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2174  transcriptional regulator, MarR family  80.36 
 
 		 165 aa  277  5e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.789823  normal  0.527206 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1219  MarR family transcriptional regulator  63.69 
 
 		 151 aa  199  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.318492  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1698  MarR family transcriptional regulator  63.69 
 
 		 151 aa  199  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.547698  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1671  MarR family transcriptional regulator  63.06 
 
 		 151 aa  196  1.0000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.787972  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4137  transcriptional regulator, MarR family  62.18 
 
 		 153 aa  192  2e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1608  MarR family transcriptional regulator  62.99 
 
 		 151 aa  190  1e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.457422  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4873  MarR family transcriptional regulator  61.29 
 
 		 151 aa  189  2e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.846475  normal  0.145685 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5662  MarR family transcriptional regulator  67.15 
 
 		 153 aa  188  2.9999999999999997e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.49927  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1631  MarR family transcriptional regulator  62.34 
 
 		 151 aa  187  5e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.813551 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1547  MarR family transcriptional regulator  62.91 
 
 		 148 aa  187  5.999999999999999e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.187738 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0061  MarR family transcriptional regulator  50.93 
 
 		 171 aa  143  1e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.310818 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2956  MarR family transcriptional regulator  51.77 
 
 		 153 aa  137  7e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.119179 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2845  transcriptional regulator, MarR family  51.45 
 
 		 145 aa  135  3.0000000000000003e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.648486  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2280  MarR family transcriptional regulator  57.27 
 
 		 170 aa  132  1.9999999999999998e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.421231  normal  0.627337 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4966  transcriptional regulator, MarR family  46.98 
 
 		 153 aa  130  6e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.345847  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0623  MarR family transcriptional regulator  53.98 
 
 		 151 aa  130  6e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4271  MarR family transcriptional regulator  46.05 
 
 		 156 aa  129  2.0000000000000002e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0653897  normal  0.661065 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2251  MarR family transcriptional regulator  50.75 
 
 		 145 aa  129  2.0000000000000002e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.344689  normal  0.255238 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2483  transcriptional regulator, MarR family  44.08 
 
 		 156 aa  127  5.0000000000000004e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.758038  normal  0.560924 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0474  transcriptional regulator, MarR family  48.34 
 
 		 155 aa  125  3e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2738  transcriptional regulator, MarR family  45.83 
 
 		 156 aa  125  3e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.708856 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1670  transcriptional regulator, MarR family  58.16 
 
 		 161 aa  124  5e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.428433  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0576  transcriptional regulator, TrmB  49.29 
 
 		 158 aa  122  2e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0950259  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4256  MarR family transcriptional regulator  55.56 
 
 		 166 aa  123  2e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.973283 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0483  MarR family transcriptional regulator  56.36 
 
 		 151 aa  122  3e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0397178 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3291  MarR family transcriptional regulator  57.14 
 
 		 152 aa  121  4e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.570613  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3240  MarR family transcriptional regulator  41.83 
 
 		 158 aa  121  4e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.715513  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0057  MarR family transcriptional regulator  58.51 
 
 		 185 aa  121  5e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.584189  normal  0.103539 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3178  MarR family transcriptional regulator  42.38 
 
 		 154 aa  121  6e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.137994  normal  0.81725 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3114  transcriptional regulator, MarR family  50.35 
 
 		 145 aa  119  9.999999999999999e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2325  transcriptional regulator, MarR family  45.99 
 
 		 162 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0434242 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1203  transcriptional regulator, TrmB  47.79 
 
 		 146 aa  119  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.529625  normal  0.0362733 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0830  MarR family transcriptional regulator  58 
 
 		 151 aa  119  1.9999999999999998e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1176  transcriptional regulator, TrmB  47.79 
 
 		 146 aa  119  3e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.713709  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1193  transcriptional regulator, TrmB  47.79 
 
 		 146 aa  119  3e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0886  MarR family transcriptional regulator  57 
 
 		 151 aa  118  3.9999999999999996e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1196  MarR family transcriptional regulator  51.33 
 
 		 155 aa  118  4.9999999999999996e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0573  MarR family transcriptional regulator  53.06 
 
 		 151 aa  118  4.9999999999999996e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.256198  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4766  transcriptional regulator, MarR family  50 
 
 		 166 aa  117  6e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.462626  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0519  transcriptional regulator, MarR family  52.25 
 
 		 157 aa  115  3e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0960  MarR family transcriptional regulator  43.7 
 
 		 146 aa  115  3e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.305429  normal  0.461467 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0519  MarR family transcriptional regulator  56.12 
 
 		 150 aa  115  3.9999999999999997e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00587381 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1189  transcriptional regulator MarR family  46.56 
 
 		 158 aa  115  3.9999999999999997e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.622384  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1808  MarR family transcriptional regulator  50 
 
 		 159 aa  114  5e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3444  transcriptional regulator, MarR family  48.6 
 
 		 153 aa  114  6e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5560  MarR family transcriptional regulator  46.72 
 
 		 170 aa  114  6.9999999999999995e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.813118  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2928  MarR family transcriptional regulator  52.48 
 
 		 143 aa  114  6.9999999999999995e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.442252 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3097  transcriptional regulator, MarR family  48.6 
 
 		 153 aa  114  7.999999999999999e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0129  MarR family transcriptional regulator  50.93 
 
 		 154 aa  113  1.0000000000000001e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2950  transcriptional regulator, MarR family  43.38 
 
 		 149 aa  113  1.0000000000000001e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0926  transcriptional regulator, MarR family  43.92 
 
 		 158 aa  113  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.493079  normal  0.487426 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4792  transcriptional regulator, MarR family  48.67 
 
 		 147 aa  113  1.0000000000000001e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0729618  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1742  MarR family transcriptional regulator  45.9 
 
 		 149 aa  112  2.0000000000000002e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1306  MarR family transcriptional regulator  52.88 
 
 		 149 aa  112  2.0000000000000002e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.335381  normal  0.344824 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3619  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  56.38 
 
 		 162 aa  113  2.0000000000000002e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0369  MarR family transcriptional regulator  53.06 
 
 		 155 aa  112  2.0000000000000002e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00880  transcriptional regulator, MarR family  53.92 
 
 		 148 aa  112  3e-24  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0108  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  53.54 
 
 		 152 aa  112  3e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.879191 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03887  transcriptional regulator MarR family  46.02 
 
 		 152 aa  111  4.0000000000000004e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1641  transcriptional regulator, MarR family  52.53 
 
 		 157 aa  111  4.0000000000000004e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.176874  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0401  transcriptional regulator, MarR family  41.1 
 
 		 156 aa  111  4.0000000000000004e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1328  transcriptional regulator, MarR family  42.65 
 
 		 149 aa  111  5e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3597  MarR family transcriptional regulator  41.3 
 
 		 153 aa  110  9e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0813  transcriptional regulator, MarR family  44.93 
 
 		 159 aa  110  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.800363  normal  0.25148 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1910  MarR family transcriptional regulator  48.8 
 
 		 152 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0578168  normal  0.331204 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1524  MarR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 149 aa  109  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.26569  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0705  MarR family transcriptional regulator  39.6 
 
 		 156 aa  108  4.0000000000000004e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.186956  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0815  MarR family transcriptional regulator  53.06 
 
 		 165 aa  108  4.0000000000000004e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000550088 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04763  hypothetical protein  44.03 
 
 		 143 aa  107  8.000000000000001e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0977  MarR family transcriptional regulator  52.04 
 
 		 165 aa  106  1e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3626  regulatory protein, MarR  41.89 
 
 		 157 aa  106  1e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.0000000021465  normal  0.0936579 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1113  transcriptional regulator, TrmB  47.06 
 
 		 167 aa  107  1e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27230  MarR family transcriptional regulator  45.14 
 
 		 151 aa  107  1e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0861  transcriptional regulator, MarR family  52.04 
 
 		 161 aa  105  2e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.440211 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0799  MarR family transcriptional regulator  53.06 
 
 		 161 aa  106  2e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3621  MarR family transcriptional regulator  53.68 
 
 		 165 aa  105  2e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.597701 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0866  MarR family transcriptional regulator  53.68 
 
 		 165 aa  105  2e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3208  MarR family transcriptional regulator  44.35 
 
 		 165 aa  105  2e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.469767 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3426  transcriptional regulator, MarR family  53.68 
 
 		 165 aa  105  2e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3498  MarR family transcriptional regulator  53.68 
 
 		 165 aa  105  2e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3141  transcriptional regulator, MarR family  50 
 
 		 146 aa  105  3e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.566984  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0578  transcriptional regulator, MarR family protein  45.08 
 
 		 163 aa  105  3e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3311  MarR family transcriptional regulator  52.04 
 
 		 165 aa  105  3e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2306  putative transcriptional regulator  50.47 
 
 		 151 aa  105  3e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02614  putative transcription regulator protein  52.04 
 
 		 153 aa  104  6e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.532202  normal  0.750512 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001045  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  43.28 
 
 		 152 aa  104  6e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2661  MarR family transcriptional regulator  49.49 
 
 		 145 aa  103  7e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00131118  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1768  transcriptional regulator, MarR family  40.76 
 
 		 157 aa  104  7e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2452  transcriptional regulator, MarR family  45.92 
 
 		 154 aa  104  7e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.126734  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3415  MarR family transcriptional regulator  43.26 
 
 		 149 aa  104  7e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0058743 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0925  regulatory protein MarR  51.02 
 
 		 195 aa  104  7e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.101489  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0133  regulatory protein MarR  55.21 
 
 		 168 aa  103  8e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5144  MarR family transcriptional regulator  48.42 
 
 		 156 aa  103  9e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0803  transcriptional regulator, MarR family protein  47.96 
 
 		 148 aa  103  9e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0886  transcriptional regulator, MarR family  50 
 
 		 161 aa  103  9e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.541526  normal  0.759862 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6797  transcriptional regulator, MarR family  53.19 
 
 		 150 aa  103  1e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000341321  decreased coverage  0.0000000109708 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4410  MarR family transcriptional regulator  43.42 
 
 		 176 aa  103  1e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2842  MarR family transcriptional regulator  52.04 
 
 		 150 aa  102  2e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3668  transcriptional regulator, MarR family  49 
 
 		 147 aa  102  2e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.400003  normal  0.620653 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>