More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_1742 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009972  Haur_1742  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 149 aa  298  2e-80  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1203  transcriptional regulator, TrmB  59.85 
 
 		 146 aa  160  6e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.529625  normal  0.0362733 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4792  transcriptional regulator, MarR family  57.97 
 
 		 147 aa  160  7e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0729618  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1176  transcriptional regulator, TrmB  59.85 
 
 		 146 aa  158  2e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.713709  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1193  transcriptional regulator, TrmB  59.85 
 
 		 146 aa  158  2e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3873  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  56.2 
 
 		 141 aa  156  8e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0504878 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0960  MarR family transcriptional regulator  58.33 
 
 		 146 aa  154  3e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.305429  normal  0.461467 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1134  MarR family transcriptional regulator  53.28 
 
 		 144 aa  150  4e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5144  MarR family transcriptional regulator  56.12 
 
 		 156 aa  149  1e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3619  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  52.82 
 
 		 162 aa  149  1e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0057  MarR family transcriptional regulator  56.69 
 
 		 185 aa  149  1e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.584189  normal  0.103539 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0573  MarR family transcriptional regulator  58.4 
 
 		 151 aa  148  2e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.256198  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04763  hypothetical protein  51.08 
 
 		 143 aa  149  2e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5560  MarR family transcriptional regulator  60.53 
 
 		 170 aa  147  4e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.813118  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1113  transcriptional regulator, TrmB  54.29 
 
 		 167 aa  147  5e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2137  transcriptional regulator, MarR family  57.02 
 
 		 154 aa  147  5e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.727084 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2251  MarR family transcriptional regulator  51.8 
 
 		 145 aa  147  5e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.344689  normal  0.255238 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2174  regulatory protein MarR  57.02 
 
 		 154 aa  147  5e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.363681 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1207  transcriptional regulator, MarR family  52.99 
 
 		 146 aa  147  5e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000193075 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2452  transcriptional regulator, MarR family  57.02 
 
 		 154 aa  147  5e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.126734  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3415  MarR family transcriptional regulator  52.14 
 
 		 149 aa  147  6e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0058743 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0129  MarR family transcriptional regulator  56.06 
 
 		 154 aa  146  7e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001045  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  51.08 
 
 		 152 aa  146  7e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06220  transcriptional regulator, MarR family  50 
 
 		 169 aa  145  1.0000000000000001e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4585  regulatory protein MarR  52.59 
 
 		 159 aa  146  1.0000000000000001e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3444  transcriptional regulator, MarR family  63.39 
 
 		 153 aa  145  2.0000000000000003e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3097  transcriptional regulator, MarR family  63.39 
 
 		 153 aa  145  2.0000000000000003e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1770  MarR family transcriptional regulator  50.68 
 
 		 155 aa  144  3e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0623  MarR family transcriptional regulator  53.44 
 
 		 151 aa  144  3e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4256  MarR family transcriptional regulator  55.2 
 
 		 166 aa  144  3e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.973283 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0576  transcriptional regulator, TrmB  50.74 
 
 		 158 aa  144  3e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0950259  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4585  transcriptional regulator, MarR family  46.15 
 
 		 150 aa  144  5e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1189  transcriptional regulator MarR family  52.52 
 
 		 158 aa  144  6e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.622384  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0519  transcriptional regulator, MarR family  60.5 
 
 		 157 aa  143  6e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1328  transcriptional regulator, MarR family  63.39 
 
 		 149 aa  143  7.0000000000000006e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0200  transcriptional regulator, MarR family  50.72 
 
 		 159 aa  143  7.0000000000000006e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4966  transcriptional regulator, MarR family  53.49 
 
 		 153 aa  143  7.0000000000000006e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.345847  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1196  MarR family transcriptional regulator  57.02 
 
 		 155 aa  143  8.000000000000001e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0799  MarR family transcriptional regulator  51.39 
 
 		 161 aa  143  9e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3141  transcriptional regulator, MarR family  53.12 
 
 		 146 aa  143  9e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.566984  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4603  transcriptional regulator, MarR family  45.45 
 
 		 150 aa  142  1e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.221434  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0866  MarR family transcriptional regulator  51.05 
 
 		 165 aa  142  1e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4766  transcriptional regulator, MarR family  56.56 
 
 		 166 aa  142  1e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.462626  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3189  regulatory protein, MarR  51.08 
 
 		 144 aa  143  1e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.637369 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3498  MarR family transcriptional regulator  51.05 
 
 		 165 aa  142  1e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3426  transcriptional regulator, MarR family  51.05 
 
 		 165 aa  142  1e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1670  transcriptional regulator, MarR family  53.23 
 
 		 161 aa  142  1e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.428433  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0830  MarR family transcriptional regulator  48.59 
 
 		 151 aa  142  2e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0886  MarR family transcriptional regulator  48.59 
 
 		 151 aa  142  2e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0649  transcriptional regulator, MarR family  47.69 
 
 		 150 aa  142  2e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4364  MarR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 150 aa  142  2e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4200  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  45.45 
 
 		 150 aa  142  2e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4211  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  45.45 
 
 		 150 aa  142  2e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.151141  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0232  MarR family transcriptional regulator  51.82 
 
 		 152 aa  142  2e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4699  MarR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 150 aa  142  2e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2151  MarR family transcriptional regulator  52.17 
 
 		 153 aa  142  2e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.680053 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0519  MarR family transcriptional regulator  57.5 
 
 		 150 aa  141  3e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00587381 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2629  MarR family transcriptional regulator  53.17 
 
 		 160 aa  141  3e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.8863  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0021  MarR family transcriptional regulator  52.63 
 
 		 178 aa  141  3e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3621  MarR family transcriptional regulator  50.35 
 
 		 165 aa  141  3e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.597701 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4554  transcriptional regulator, MarR family  45.45 
 
 		 150 aa  141  3e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2950  transcriptional regulator, MarR family  62.5 
 
 		 149 aa  141  3e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1910  MarR family transcriptional regulator  47.86 
 
 		 159 aa  141  4e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.852737  normal  0.275089 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4558  MarR family transcriptional regulator  44.76 
 
 		 150 aa  140  5e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3056  MarR family transcriptional regulator  50.34 
 
 		 168 aa  140  5e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2325  transcriptional regulator, MarR family  49.25 
 
 		 162 aa  140  5e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0434242 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1910  MarR family transcriptional regulator  58.2 
 
 		 152 aa  140  6e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0578168  normal  0.331204 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0108  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  54.62 
 
 		 152 aa  140  6e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.879191 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4312  MarR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 150 aa  139  9.999999999999999e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5325  transcriptional regulator, MarR family  52.52 
 
 		 147 aa  139  9.999999999999999e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0578  transcriptional regulator, MarR family protein  49.65 
 
 		 163 aa  139  9.999999999999999e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0474  transcriptional regulator, MarR family  61.61 
 
 		 155 aa  139  9.999999999999999e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1936  transcriptional regulator, MarR family  53.19 
 
 		 155 aa  138  1.9999999999999998e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.13089 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1524  MarR family transcriptional regulator  52.38 
 
 		 149 aa  138  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.26569  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0815  MarR family transcriptional regulator  49.66 
 
 		 165 aa  139  1.9999999999999998e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000550088 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0926  transcriptional regulator, MarR family  48.2 
 
 		 158 aa  137  3e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.493079  normal  0.487426 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1641  transcriptional regulator, MarR family  52.48 
 
 		 157 aa  137  3e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.176874  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0483  MarR family transcriptional regulator  57.02 
 
 		 151 aa  137  3e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0397178 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0401  transcriptional regulator, MarR family  49.65 
 
 		 156 aa  138  3e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3291  MarR family transcriptional regulator  46.38 
 
 		 152 aa  138  3e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.570613  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3311  MarR family transcriptional regulator  48.97 
 
 		 165 aa  137  3e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0835  transcriptional regulator, MarR family protein  50.76 
 
 		 150 aa  137  3.9999999999999997e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2483  transcriptional regulator, MarR family  47.45 
 
 		 156 aa  137  3.9999999999999997e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.758038  normal  0.560924 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3208  MarR family transcriptional regulator  49.66 
 
 		 165 aa  137  4.999999999999999e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.469767 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2956  MarR family transcriptional regulator  52.76 
 
 		 153 aa  137  4.999999999999999e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.119179 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2005  MarR family transcriptional regulator  49.28 
 
 		 143 aa  137  6e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3331  MarR family transcriptional regulator  54.76 
 
 		 155 aa  137  6e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.376124  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0934  MarR family transcriptional regulator  50 
 
 		 163 aa  137  6e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2738  transcriptional regulator, MarR family  54.7 
 
 		 156 aa  137  7e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.708856 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3240  MarR family transcriptional regulator  51.61 
 
 		 158 aa  136  7e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.715513  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0628  MarR family transcriptional regulator  52.34 
 
 		 144 aa  136  7.999999999999999e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2845  transcriptional regulator, MarR family  50.79 
 
 		 145 aa  136  8.999999999999999e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.648486  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03887  transcriptional regulator MarR family  52.24 
 
 		 152 aa  136  8.999999999999999e-32  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4880  MarR family transcriptional regulator  48.53 
 
 		 157 aa  136  1e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.368926  hitchhiker  0.00140951 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6797  transcriptional regulator, MarR family  58.93 
 
 		 150 aa  136  1e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000341321  decreased coverage  0.0000000109708 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1768  transcriptional regulator, MarR family  52.38 
 
 		 157 aa  135  1e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3854  MarR family transcriptional regulator  49.64 
 
 		 151 aa  135  1e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.113287  normal  0.119098 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0813  transcriptional regulator, MarR family  47.48 
 
 		 159 aa  136  1e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.800363  normal  0.25148 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4499  MarR family transcriptional regulator  49.23 
 
 		 150 aa  135  1e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.148368  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3662  MarR family transcriptional regulator  49.23 
 
 		 150 aa  135  1e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.485543  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>