More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_4271 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008752  Aave_4271  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 
156 aa  309  6.999999999999999e-84  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0653897  normal  0.661065 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1196  MarR family transcriptional regulator  70.39 
 
 
155 aa  211  1.9999999999999998e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0474  transcriptional regulator, MarR family  71.24 
 
 
155 aa  208  2e-53  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0483  MarR family transcriptional regulator  73.43 
 
 
151 aa  205  2e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0397178 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0623  MarR family transcriptional regulator  66.89 
 
 
151 aa  204  3e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4966  transcriptional regulator, MarR family  60.93 
 
 
153 aa  190  5e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.345847  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3619  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  64.18 
 
 
162 aa  175  2e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0573  MarR family transcriptional regulator  60.74 
 
 
151 aa  172  1.9999999999999998e-42  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.256198  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0057  MarR family transcriptional regulator  66.41 
 
 
185 aa  171  5e-42  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.584189  normal  0.103539 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5560  MarR family transcriptional regulator  62.04 
 
 
170 aa  170  7.999999999999999e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.813118  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0519  transcriptional regulator, MarR family  57.05 
 
 
157 aa  166  8e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2251  MarR family transcriptional regulator  60.74 
 
 
145 aa  165  2e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.344689  normal  0.255238 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0401  transcriptional regulator, MarR family  59.42 
 
 
156 aa  163  6.9999999999999995e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2306  putative transcriptional regulator  59.26 
 
 
151 aa  161  3e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0061  MarR family transcriptional regulator  52.03 
 
 
171 aa  159  9e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.310818 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27230  MarR family transcriptional regulator  58.52 
 
 
151 aa  159  1e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3854  MarR family transcriptional regulator  55.47 
 
 
151 aa  158  2e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.113287  normal  0.119098 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2950  transcriptional regulator, MarR family  57.04 
 
 
149 aa  159  2e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1328  transcriptional regulator, MarR family  57.04 
 
 
149 aa  158  3e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0108  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  54.61 
 
 
152 aa  158  3e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.879191 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1470  MarR family transcriptional regulator  55.47 
 
 
151 aa  158  3e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS02614  putative transcription regulator protein  53.79 
 
 
153 aa  157  4e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.532202  normal  0.750512 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3626  regulatory protein, MarR  55.47 
 
 
157 aa  156  9e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.0000000021465  normal  0.0936579 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2629  MarR family transcriptional regulator  53.21 
 
 
160 aa  156  9e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.8863  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1670  transcriptional regulator, MarR family  51.75 
 
 
161 aa  155  1e-37  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.428433  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1768  transcriptional regulator, MarR family  54.01 
 
 
157 aa  154  3e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4256  MarR family transcriptional regulator  53.33 
 
 
166 aa  154  3e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.973283 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0129  MarR family transcriptional regulator  53.79 
 
 
154 aa  154  5.0000000000000005e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1808  MarR family transcriptional regulator  56 
 
 
159 aa  154  5.0000000000000005e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2174  regulatory protein MarR  56.3 
 
 
154 aa  153  7e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.363681 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2452  transcriptional regulator, MarR family  56.3 
 
 
154 aa  153  7e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.126734  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15300  transcriptional regulator, MarR family  56.93 
 
 
162 aa  153  9e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.408936  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3996  MarR family transcriptional regulator  55.47 
 
 
154 aa  153  1e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000674162  normal  0.401287 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3097  transcriptional regulator, MarR family  57.66 
 
 
153 aa  153  1e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0519  MarR family transcriptional regulator  55.4 
 
 
150 aa  152  2e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00587381 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2137  transcriptional regulator, MarR family  55.56 
 
 
154 aa  152  2e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.727084 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3444  transcriptional regulator, MarR family  57.66 
 
 
153 aa  152  2e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1189  transcriptional regulator MarR family  54.07 
 
 
158 aa  149  1e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.622384  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2845  transcriptional regulator, MarR family  52.17 
 
 
145 aa  149  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.648486  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2325  transcriptional regulator, MarR family  54.01 
 
 
162 aa  148  3e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0434242 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3291  MarR family transcriptional regulator  54.74 
 
 
152 aa  148  3e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.570613  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1435  MarR family transcriptional regulator  60.18 
 
 
151 aa  147  5e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.209441 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4766  transcriptional regulator, MarR family  52 
 
 
166 aa  147  7e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.462626  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03887  transcriptional regulator MarR family  57.34 
 
 
152 aa  147  7e-35  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1860  MarR family transcriptional regulator  60.18 
 
 
151 aa  145  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0803  transcriptional regulator, MarR family protein  51.49 
 
 
148 aa  145  2.0000000000000003e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4792  transcriptional regulator, MarR family  54.07 
 
 
147 aa  144  4.0000000000000006e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0729618  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5144  MarR family transcriptional regulator  52.05 
 
 
156 aa  144  5e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0021  MarR family transcriptional regulator  52.15 
 
 
178 aa  143  1e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6797  transcriptional regulator, MarR family  56.3 
 
 
150 aa  142  1e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000341321  decreased coverage  0.0000000109708 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1306  MarR family transcriptional regulator  53.29 
 
 
149 aa  142  1e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.335381  normal  0.344824 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1134  MarR family transcriptional regulator  55.47 
 
 
144 aa  142  2e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0866  MarR family transcriptional regulator  53.28 
 
 
165 aa  141  3e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3426  transcriptional regulator, MarR family  53.28 
 
 
165 aa  141  3e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3331  MarR family transcriptional regulator  49.26 
 
 
155 aa  141  3e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.376124  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0960  MarR family transcriptional regulator  56.3 
 
 
146 aa  141  3e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.305429  normal  0.461467 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3498  MarR family transcriptional regulator  53.28 
 
 
165 aa  141  3e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0886  MarR family transcriptional regulator  50.37 
 
 
151 aa  141  4e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0576  transcriptional regulator, TrmB  51.11 
 
 
158 aa  141  4e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0950259  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0813  transcriptional regulator, MarR family  46.1 
 
 
159 aa  140  5e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.800363  normal  0.25148 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3178  MarR family transcriptional regulator  45.81 
 
 
154 aa  140  5e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.137994  normal  0.81725 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0886  transcriptional regulator, MarR family  50.35 
 
 
161 aa  140  5e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.541526  normal  0.759862 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3762  MarR family transcriptional regulator  54.93 
 
 
150 aa  140  6e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.425599  hitchhiker  0.00135953 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2842  MarR family transcriptional regulator  56.3 
 
 
150 aa  140  6e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0830  MarR family transcriptional regulator  49.63 
 
 
151 aa  140  7e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0925  regulatory protein MarR  50.35 
 
 
195 aa  140  8e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.101489  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2231  MarR family transcriptional regulator  54.23 
 
 
150 aa  139  9.999999999999999e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.106154  normal  0.474897 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3621  MarR family transcriptional regulator  52.55 
 
 
165 aa  140  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.597701 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3233  MarR family transcriptional regulator  54.23 
 
 
150 aa  139  9.999999999999999e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.550723  normal  0.0343876 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1641  transcriptional regulator, MarR family  52.11 
 
 
157 aa  139  9.999999999999999e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.176874  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4554  transcriptional regulator, MarR family  49.26 
 
 
150 aa  138  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4364  MarR family transcriptional regulator  49.26 
 
 
150 aa  139  1.9999999999999998e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4200  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  49.26 
 
 
150 aa  139  1.9999999999999998e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4211  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  49.26 
 
 
150 aa  139  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.151141  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4699  MarR family transcriptional regulator  49.26 
 
 
150 aa  139  1.9999999999999998e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4499  MarR family transcriptional regulator  54.23 
 
 
150 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.148368  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0815  MarR family transcriptional regulator  52.8 
 
 
165 aa  139  1.9999999999999998e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000550088 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4603  transcriptional regulator, MarR family  49.26 
 
 
150 aa  139  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.221434  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0926  transcriptional regulator, MarR family  48.2 
 
 
158 aa  139  1.9999999999999998e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.493079  normal  0.487426 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3865  MarR family transcriptional regulator  54.23 
 
 
150 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0792032  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3311  MarR family transcriptional regulator  52.8 
 
 
165 aa  139  1.9999999999999998e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3662  MarR family transcriptional regulator  54.23 
 
 
150 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.485543  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0304  MarR family transcriptional regulator  52.52 
 
 
150 aa  138  3e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0335  MarR family transcriptional regulator  52.52 
 
 
158 aa  138  3e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.663008  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0862  MarR family transcriptional regulator  52.52 
 
 
158 aa  138  3e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.182256  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1176  transcriptional regulator, TrmB  51.11 
 
 
146 aa  138  3e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.713709  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2422  MarR family transcriptional regulator  52.52 
 
 
150 aa  138  3e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.934023  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1193  transcriptional regulator, TrmB  51.11 
 
 
146 aa  138  3e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1483  MarR family transcriptional regulator  52.52 
 
 
150 aa  138  3e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.553037  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1679  MarR family transcriptional regulator  52.52 
 
 
150 aa  138  3e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4558  MarR family transcriptional regulator  49.26 
 
 
150 aa  137  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1203  transcriptional regulator, TrmB  51.11 
 
 
146 aa  137  4.999999999999999e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.529625  normal  0.0362733 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3208  MarR family transcriptional regulator  52.85 
 
 
165 aa  137  4.999999999999999e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.469767 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0649  transcriptional regulator, MarR family  48.53 
 
 
150 aa  136  8.999999999999999e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4312  MarR family transcriptional regulator  48.91 
 
 
150 aa  136  1e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0977  MarR family transcriptional regulator  52.8 
 
 
165 aa  136  1e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3240  MarR family transcriptional regulator  47.48 
 
 
158 aa  136  1e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.715513  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1219  MarR family transcriptional regulator  46.62 
 
 
151 aa  136  1e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.318492  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1207  transcriptional regulator, MarR family  54.2 
 
 
146 aa  136  1e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000193075 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4585  transcriptional regulator, MarR family  49.62 
 
 
150 aa  136  1e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>