More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_1134 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_1134  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 144 aa  283  7e-76  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1207  transcriptional regulator, MarR family  77.62 
 
 		 146 aa  226  9e-59  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000193075 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0960  MarR family transcriptional regulator  61.31 
 
 		 146 aa  165  2e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.305429  normal  0.461467 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3415  MarR family transcriptional regulator  59.86 
 
 		 149 aa  164  4e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0058743 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1203  transcriptional regulator, TrmB  60.74 
 
 		 146 aa  159  1e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.529625  normal  0.0362733 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5325  transcriptional regulator, MarR family  61.97 
 
 		 147 aa  159  2e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3189  regulatory protein, MarR  59.57 
 
 		 144 aa  157  4e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.637369 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1176  transcriptional regulator, TrmB  60 
 
 		 146 aa  156  1e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.713709  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1193  transcriptional regulator, TrmB  60 
 
 		 146 aa  156  1e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5560  MarR family transcriptional regulator  59.42 
 
 		 170 aa  152  1e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.813118  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3619  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  58.7 
 
 		 162 aa  151  2.9999999999999998e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0057  MarR family transcriptional regulator  62.12 
 
 		 185 aa  151  2.9999999999999998e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.584189  normal  0.103539 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1742  MarR family transcriptional regulator  53.28 
 
 		 149 aa  150  4e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3873  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  59.12 
 
 		 141 aa  147  5e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0504878 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03887  transcriptional regulator MarR family  54.68 
 
 		 152 aa  146  9e-35  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2738  transcriptional regulator, MarR family  48.23 
 
 		 156 aa  145  2.0000000000000003e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.708856 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2483  transcriptional regulator, MarR family  47.22 
 
 		 156 aa  144  4.0000000000000006e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.758038  normal  0.560924 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1196  MarR family transcriptional regulator  54.79 
 
 		 155 aa  143  7.0000000000000006e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1306  MarR family transcriptional regulator  56.3 
 
 		 149 aa  143  7.0000000000000006e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.335381  normal  0.344824 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0576  transcriptional regulator, TrmB  53.73 
 
 		 158 aa  143  8.000000000000001e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0950259  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0108  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  55.94 
 
 		 152 aa  143  8.000000000000001e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.879191 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1189  transcriptional regulator MarR family  53.62 
 
 		 158 aa  143  9e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.622384  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3498  MarR family transcriptional regulator  54.61 
 
 		 165 aa  142  1e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3426  transcriptional regulator, MarR family  55.47 
 
 		 165 aa  142  1e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4792  transcriptional regulator, MarR family  56.49 
 
 		 147 aa  142  1e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0729618  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0866  MarR family transcriptional regulator  55.47 
 
 		 165 aa  142  1e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4271  MarR family transcriptional regulator  55.47 
 
 		 156 aa  142  2e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0653897  normal  0.661065 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3621  MarR family transcriptional regulator  53.9 
 
 		 165 aa  141  3e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.597701 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1524  MarR family transcriptional regulator  56.52 
 
 		 149 aa  141  3e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.26569  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2325  transcriptional regulator, MarR family  52.86 
 
 		 162 aa  140  4e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0434242 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0573  MarR family transcriptional regulator  59.17 
 
 		 151 aa  141  4e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.256198  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0977  MarR family transcriptional regulator  54.74 
 
 		 165 aa  140  5e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4745  transcriptional regulator, MarR family  51.05 
 
 		 147 aa  140  5e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.427221 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3668  transcriptional regulator, MarR family  51.05 
 
 		 147 aa  140  5e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.400003  normal  0.620653 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0623  MarR family transcriptional regulator  55.91 
 
 		 151 aa  140  6e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4603  transcriptional regulator, MarR family  45.71 
 
 		 150 aa  140  7e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.221434  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4364  MarR family transcriptional regulator  45.71 
 
 		 150 aa  140  8e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4200  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  45.71 
 
 		 150 aa  140  8e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4211  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  45.71 
 
 		 150 aa  140  8e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.151141  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4699  MarR family transcriptional regulator  45.71 
 
 		 150 aa  140  8e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3311  MarR family transcriptional regulator  53.19 
 
 		 165 aa  140  8e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4554  transcriptional regulator, MarR family  45.71 
 
 		 150 aa  139  9e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3056  MarR family transcriptional regulator  54.74 
 
 		 168 aa  139  9.999999999999999e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20780  transcriptional regulator, MarR family  50.75 
 
 		 152 aa  139  9.999999999999999e-33  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0649  transcriptional regulator, MarR family  45.71 
 
 		 150 aa  139  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4585  regulatory protein MarR  52.63 
 
 		 159 aa  139  9.999999999999999e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4256  MarR family transcriptional regulator  48.55 
 
 		 166 aa  139  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.973283 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2251  MarR family transcriptional regulator  56.15 
 
 		 145 aa  138  1.9999999999999998e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.344689  normal  0.255238 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2617  MarR family transcriptional regulator  53.62 
 
 		 160 aa  139  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.279233  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3291  MarR family transcriptional regulator  51.09 
 
 		 152 aa  139  1.9999999999999998e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.570613  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0815  MarR family transcriptional regulator  53.28 
 
 		 165 aa  139  1.9999999999999998e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000550088 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0578  transcriptional regulator, MarR family protein  52.94 
 
 		 163 aa  138  1.9999999999999998e-32  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0200  transcriptional regulator, MarR family  53.79 
 
 		 159 aa  138  1.9999999999999998e-32  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1808  MarR family transcriptional regulator  54.74 
 
 		 159 aa  139  1.9999999999999998e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0628  MarR family transcriptional regulator  57.69 
 
 		 144 aa  139  1.9999999999999998e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3208  MarR family transcriptional regulator  52.48 
 
 		 165 aa  138  3e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.469767 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4585  transcriptional regulator, MarR family  45 
 
 		 150 aa  138  3e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0474  transcriptional regulator, MarR family  55.8 
 
 		 155 aa  138  3e-32  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4966  transcriptional regulator, MarR family  54.96 
 
 		 153 aa  138  3e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.345847  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0519  transcriptional regulator, MarR family  53.24 
 
 		 157 aa  137  3.9999999999999997e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3738  transcriptional regulator, MarR family  53.38 
 
 		 153 aa  137  3.9999999999999997e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000310515  hitchhiker  0.00461263 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4558  MarR family transcriptional regulator  45 
 
 		 150 aa  137  4.999999999999999e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3331  MarR family transcriptional regulator  51.11 
 
 		 155 aa  137  4.999999999999999e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.376124  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4823  MarR family transcriptional regulator  48.94 
 
 		 163 aa  137  4.999999999999999e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.477223  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1910  MarR family transcriptional regulator  48.94 
 
 		 159 aa  137  7e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.852737  normal  0.275089 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2578  MarR family transcriptional regulator  52.9 
 
 		 160 aa  136  7.999999999999999e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.856924  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2623  MarR family transcriptional regulator  52.9 
 
 		 160 aa  136  7.999999999999999e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0922619  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0926  transcriptional regulator, MarR family  51.11 
 
 		 158 aa  135  1e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.493079  normal  0.487426 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0021  MarR family transcriptional regulator  58.62 
 
 		 178 aa  135  1e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1966  transcriptional regulator, MarR family  53.62 
 
 		 151 aa  136  1e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000123545  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1936  transcriptional regulator, MarR family  53.28 
 
 		 155 aa  135  1e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.13089 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0401  transcriptional regulator, MarR family  52.9 
 
 		 156 aa  136  1e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2330  MarR family transcriptional regulator  54.41 
 
 		 163 aa  136  1e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.282714  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2845  transcriptional regulator, MarR family  48.25 
 
 		 145 aa  135  2e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.648486  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0813  transcriptional regulator, MarR family  51.11 
 
 		 159 aa  135  2e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.800363  normal  0.25148 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21070  transcriptional regulator  54.07 
 
 		 143 aa  135  2e-31  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3097  transcriptional regulator, MarR family  53.28 
 
 		 153 aa  135  2e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27530  MarR family transcriptional regulator  53.68 
 
 		 163 aa  135  2e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.037283 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4312  MarR family transcriptional regulator  45.52 
 
 		 150 aa  135  2e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0483  MarR family transcriptional regulator  54.35 
 
 		 151 aa  135  2e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0397178 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3444  transcriptional regulator, MarR family  55.38 
 
 		 153 aa  134  3.0000000000000003e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3980  MarR family transcriptional regulator  50.68 
 
 		 153 aa  134  4e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.436486  normal  0.638371 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0232  MarR family transcriptional regulator  50.75 
 
 		 152 aa  134  4e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4766  transcriptional regulator, MarR family  48.91 
 
 		 166 aa  134  5e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.462626  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1328  transcriptional regulator, MarR family  51.45 
 
 		 149 aa  134  6.0000000000000005e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2629  MarR family transcriptional regulator  52.76 
 
 		 160 aa  133  7.000000000000001e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.8863  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1641  transcriptional regulator, MarR family  52.14 
 
 		 157 aa  133  7.000000000000001e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.176874  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1670  transcriptional regulator, MarR family  51.54 
 
 		 161 aa  132  9.999999999999999e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.428433  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3141  transcriptional regulator, MarR family  50.36 
 
 		 146 aa  132  9.999999999999999e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.566984  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6797  transcriptional regulator, MarR family  50.74 
 
 		 150 aa  133  9.999999999999999e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000341321  decreased coverage  0.0000000109708 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2452  transcriptional regulator, MarR family  48.91 
 
 		 154 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.126734  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0880  regulatory protein, MarR  51.82 
 
 		 162 aa  132  1.9999999999999998e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2174  regulatory protein MarR  50 
 
 		 154 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.363681 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001045  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  49.65 
 
 		 152 aa  132  1.9999999999999998e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1470  MarR family transcriptional regulator  52.55 
 
 		 151 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2137  transcriptional regulator, MarR family  48.91 
 
 		 154 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.727084 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0335  MarR family transcriptional regulator  50 
 
 		 158 aa  131  3.9999999999999996e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.663008  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0304  MarR family transcriptional regulator  50 
 
 		 150 aa  130  3.9999999999999996e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0862  MarR family transcriptional regulator  50 
 
 		 158 aa  131  3.9999999999999996e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.182256  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2842  MarR family transcriptional regulator  50 
 
 		 150 aa  130  3.9999999999999996e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>