More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_0705 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009719  Plav_0705  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 
156 aa  315  2e-85  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.186956  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0369  MarR family transcriptional regulator  51.08 
 
 
155 aa  136  8.999999999999999e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1068  MarR family transcriptional regulator  48.53 
 
 
147 aa  136  1e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4137  transcriptional regulator, MarR family  42.57 
 
 
153 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5662  MarR family transcriptional regulator  42.36 
 
 
153 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.49927  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4873  MarR family transcriptional regulator  44.37 
 
 
151 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.846475  normal  0.145685 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1219  MarR family transcriptional regulator  44.76 
 
 
151 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.318492  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1698  MarR family transcriptional regulator  44.76 
 
 
151 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.547698  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1671  MarR family transcriptional regulator  45.26 
 
 
151 aa  124  4.0000000000000003e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.787972  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1608  MarR family transcriptional regulator  44.06 
 
 
151 aa  122  2e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.457422  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1631  MarR family transcriptional regulator  43.36 
 
 
151 aa  120  8e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.813551 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1547  MarR family transcriptional regulator  42.66 
 
 
148 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.187738 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03887  transcriptional regulator MarR family  45.52 
 
 
152 aa  118  3e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1670  transcriptional regulator, MarR family  43.57 
 
 
161 aa  117  4.9999999999999996e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.428433  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3240  MarR family transcriptional regulator  41.22 
 
 
158 aa  117  7.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.715513  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2280  MarR family transcriptional regulator  48.57 
 
 
170 aa  117  7.999999999999999e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.421231  normal  0.627337 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0830  MarR family transcriptional regulator  44.85 
 
 
151 aa  116  9.999999999999999e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0886  MarR family transcriptional regulator  44.85 
 
 
151 aa  115  1.9999999999999998e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0623  MarR family transcriptional regulator  41.91 
 
 
151 aa  114  6e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2306  putative transcriptional regulator  42.34 
 
 
151 aa  113  7.999999999999999e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2928  MarR family transcriptional regulator  40.88 
 
 
143 aa  113  7.999999999999999e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.442252 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3597  MarR family transcriptional regulator  41.79 
 
 
153 aa  113  1.0000000000000001e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1306  MarR family transcriptional regulator  47.24 
 
 
149 aa  112  2.0000000000000002e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.335381  normal  0.344824 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4312  MarR family transcriptional regulator  40.56 
 
 
150 aa  112  3e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4410  MarR family transcriptional regulator  40.71 
 
 
176 aa  110  5e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27230  MarR family transcriptional regulator  41.61 
 
 
151 aa  110  5e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0598  MarR family transcriptional regulator  42.55 
 
 
267 aa  110  7.000000000000001e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0573  MarR family transcriptional regulator  41.18 
 
 
151 aa  110  8.000000000000001e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.256198  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2738  transcriptional regulator, MarR family  41.18 
 
 
156 aa  109  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.708856 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0862  MarR family transcriptional regulator  42.55 
 
 
158 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.182256  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4603  transcriptional regulator, MarR family  41.79 
 
 
150 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.221434  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3619  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  42.54 
 
 
162 aa  110  1.0000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2559  transcriptional regulator  42.55 
 
 
150 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.970675  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0335  MarR family transcriptional regulator  42.55 
 
 
158 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.663008  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2422  MarR family transcriptional regulator  42.55 
 
 
150 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.934023  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0304  MarR family transcriptional regulator  42.55 
 
 
150 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4966  transcriptional regulator, MarR family  44.78 
 
 
153 aa  108  2.0000000000000002e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.345847  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1679  MarR family transcriptional regulator  42.55 
 
 
150 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0649  transcriptional regulator, MarR family  42.28 
 
 
150 aa  108  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1641  transcriptional regulator, MarR family  40 
 
 
157 aa  108  2.0000000000000002e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.176874  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1483  MarR family transcriptional regulator  42.55 
 
 
150 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.553037  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4364  MarR family transcriptional regulator  41.04 
 
 
150 aa  108  3e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4200  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  41.04 
 
 
150 aa  108  3e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4211  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  41.04 
 
 
150 aa  108  3e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.151141  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0061  MarR family transcriptional regulator  42.22 
 
 
171 aa  108  3e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.310818 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2231  MarR family transcriptional regulator  42.25 
 
 
150 aa  108  3e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.106154  normal  0.474897 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4699  MarR family transcriptional regulator  41.04 
 
 
150 aa  108  3e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4554  transcriptional regulator, MarR family  41.04 
 
 
150 aa  108  3e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1742  MarR family transcriptional regulator  40 
 
 
149 aa  108  3e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2456  transcriptional regulator, MarR family  39.6 
 
 
168 aa  108  3e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.768302  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3626  regulatory protein, MarR  38.36 
 
 
157 aa  107  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.0000000021465  normal  0.0936579 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1203  transcriptional regulator, TrmB  44.44 
 
 
146 aa  107  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.529625  normal  0.0362733 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0576  transcriptional regulator, TrmB  37.67 
 
 
158 aa  108  4.0000000000000004e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0950259  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2325  transcriptional regulator, MarR family  36.96 
 
 
162 aa  107  4.0000000000000004e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0434242 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4558  MarR family transcriptional regulator  41.54 
 
 
150 aa  107  5e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5560  MarR family transcriptional regulator  42.75 
 
 
170 aa  107  5e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.813118  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3291  MarR family transcriptional regulator  43.9 
 
 
152 aa  107  5e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.570613  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4585  transcriptional regulator, MarR family  39.55 
 
 
150 aa  107  5e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4792  transcriptional regulator, MarR family  43.08 
 
 
147 aa  107  8.000000000000001e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0729618  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3668  transcriptional regulator, MarR family  42.66 
 
 
147 aa  107  9.000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.400003  normal  0.620653 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4745  transcriptional regulator, MarR family  42.66 
 
 
147 aa  107  9.000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.427221 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0483  MarR family transcriptional regulator  40.69 
 
 
151 aa  106  9.000000000000001e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0397178 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3178  MarR family transcriptional regulator  38.97 
 
 
154 aa  106  1e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.137994  normal  0.81725 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0129  MarR family transcriptional regulator  40.74 
 
 
154 aa  106  1e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0401  transcriptional regulator, MarR family  41.67 
 
 
156 aa  105  2e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4499  MarR family transcriptional regulator  40.71 
 
 
150 aa  105  2e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.148368  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3233  MarR family transcriptional regulator  40.85 
 
 
150 aa  105  2e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.550723  normal  0.0343876 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3662  MarR family transcriptional regulator  40.71 
 
 
150 aa  105  2e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.485543  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3865  MarR family transcriptional regulator  40.71 
 
 
150 aa  105  2e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0792032  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1176  transcriptional regulator, TrmB  43.7 
 
 
146 aa  105  3e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.713709  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1193  transcriptional regulator, TrmB  43.7 
 
 
146 aa  105  3e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2483  transcriptional regulator, MarR family  38.46 
 
 
156 aa  104  4e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.758038  normal  0.560924 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2842  MarR family transcriptional regulator  40.71 
 
 
150 aa  104  4e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1189  transcriptional regulator MarR family  41.91 
 
 
158 aa  104  5e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.622384  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04763  hypothetical protein  41.04 
 
 
143 aa  103  6e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0474  transcriptional regulator, MarR family  40 
 
 
155 aa  104  6e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2174  transcriptional regulator, MarR family  38.22 
 
 
165 aa  103  7e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.789823  normal  0.527206 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0519  transcriptional regulator, MarR family  40.74 
 
 
157 aa  103  8e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2950  transcriptional regulator, MarR family  39.71 
 
 
149 aa  103  8e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2251  MarR family transcriptional regulator  39.46 
 
 
145 aa  103  8e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.344689  normal  0.255238 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3762  MarR family transcriptional regulator  40.14 
 
 
150 aa  103  9e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.425599  hitchhiker  0.00135953 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0057  MarR family transcriptional regulator  41.98 
 
 
185 aa  103  9e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.584189  normal  0.103539 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001045  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  41.04 
 
 
152 aa  103  1e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0108  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  41.55 
 
 
152 aa  102  1e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.879191 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6797  transcriptional regulator, MarR family  40 
 
 
150 aa  103  1e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000341321  decreased coverage  0.0000000109708 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1207  transcriptional regulator, MarR family  41.91 
 
 
146 aa  103  1e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000193075 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1328  transcriptional regulator, MarR family  40 
 
 
149 aa  103  1e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1196  MarR family transcriptional regulator  39.55 
 
 
155 aa  102  2e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1134  MarR family transcriptional regulator  42.65 
 
 
144 aa  102  2e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1808  MarR family transcriptional regulator  36.49 
 
 
159 aa  102  2e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2845  transcriptional regulator, MarR family  41.67 
 
 
145 aa  102  3e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.648486  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4880  MarR family transcriptional regulator  40.14 
 
 
157 aa  102  3e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.368926  hitchhiker  0.00140951 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2956  MarR family transcriptional regulator  39.22 
 
 
153 aa  100  6e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.119179 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3444  transcriptional regulator, MarR family  41.3 
 
 
153 aa  100  6e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15300  transcriptional regulator, MarR family  41.79 
 
 
162 aa  100  6e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.408936  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0050  transcriptional regulator, MarR family  37.5 
 
 
164 aa  100  7e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00479818 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3097  transcriptional regulator, MarR family  41.3 
 
 
153 aa  100  7e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3139  transcriptional regulator, MarR family  41.18 
 
 
183 aa  100  8e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2661  MarR family transcriptional regulator  35.66 
 
 
145 aa  99.4  1e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00131118  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2137  transcriptional regulator, MarR family  37.96 
 
 
154 aa  99.4  1e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.727084 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>