More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A0057 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A0057  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 185 aa  352  1e-96  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.584189  normal  0.103539 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4271  MarR family transcriptional regulator  65.97 
 
 		 156 aa  179  1e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0653897  normal  0.661065 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4966  transcriptional regulator, MarR family  64.08 
 
 		 153 aa  176  2e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.345847  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0573  MarR family transcriptional regulator  65.22 
 
 		 151 aa  176  3e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.256198  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0483  MarR family transcriptional regulator  68.15 
 
 		 151 aa  174  7e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0397178 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0474  transcriptional regulator, MarR family  68.15 
 
 		 155 aa  174  8e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5560  MarR family transcriptional regulator  62.5 
 
 		 170 aa  173  9.999999999999999e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.813118  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0623  MarR family transcriptional regulator  60.81 
 
 		 151 aa  173  9.999999999999999e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1808  MarR family transcriptional regulator  61.69 
 
 		 159 aa  172  2.9999999999999996e-42  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0519  transcriptional regulator, MarR family  58.5 
 
 		 157 aa  168  4e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2950  transcriptional regulator, MarR family  60.58 
 
 		 149 aa  167  8e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3619  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  62.24 
 
 		 162 aa  167  1e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1196  MarR family transcriptional regulator  63.97 
 
 		 155 aa  167  1e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2251  MarR family transcriptional regulator  63.24 
 
 		 145 aa  166  2e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.344689  normal  0.255238 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0401  transcriptional regulator, MarR family  60.58 
 
 		 156 aa  166  2e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0129  MarR family transcriptional regulator  58.04 
 
 		 154 aa  165  2.9999999999999998e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1328  transcriptional regulator, MarR family  59.85 
 
 		 149 aa  165  4e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03887  transcriptional regulator MarR family  60.42 
 
 		 152 aa  165  4e-40  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3097  transcriptional regulator, MarR family  59.71 
 
 		 153 aa  162  2.0000000000000002e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1189  transcriptional regulator MarR family  59.12 
 
 		 158 aa  162  3e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.622384  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02614  putative transcription regulator protein  55.86 
 
 		 153 aa  161  4.0000000000000004e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.532202  normal  0.750512 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3444  transcriptional regulator, MarR family  59.71 
 
 		 153 aa  161  6e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1207  transcriptional regulator, MarR family  62.22 
 
 		 146 aa  159  1e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000193075 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2845  transcriptional regulator, MarR family  55.8 
 
 		 145 aa  159  2e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.648486  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0519  MarR family transcriptional regulator  61.29 
 
 		 150 aa  155  3e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00587381 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1641  transcriptional regulator, MarR family  55.17 
 
 		 157 aa  154  8e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.176874  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0108  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  57.43 
 
 		 152 aa  153  1e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.879191 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4792  transcriptional regulator, MarR family  58.96 
 
 		 147 aa  153  2e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0729618  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1768  transcriptional regulator, MarR family  52.05 
 
 		 157 aa  152  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1134  MarR family transcriptional regulator  61.48 
 
 		 144 aa  152  2.9999999999999998e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0960  MarR family transcriptional regulator  58.39 
 
 		 146 aa  151  4e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.305429  normal  0.461467 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1742  MarR family transcriptional regulator  55.64 
 
 		 149 aa  151  4e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3626  regulatory protein, MarR  49.67 
 
 		 157 aa  148  3e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.0000000021465  normal  0.0936579 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21070  transcriptional regulator  57.97 
 
 		 143 aa  148  4e-35  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27230  MarR family transcriptional regulator  53.19 
 
 		 151 aa  147  6e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0977  MarR family transcriptional regulator  49.67 
 
 		 165 aa  147  8e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3621  MarR family transcriptional regulator  55.8 
 
 		 165 aa  147  8e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.597701 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2629  MarR family transcriptional regulator  53.9 
 
 		 160 aa  146  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.8863  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3498  MarR family transcriptional regulator  55.07 
 
 		 165 aa  145  3e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2306  putative transcriptional regulator  53.19 
 
 		 151 aa  145  3e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0866  MarR family transcriptional regulator  55.07 
 
 		 165 aa  145  3e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3426  transcriptional regulator, MarR family  55.07 
 
 		 165 aa  145  3e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0628  MarR family transcriptional regulator  61.6 
 
 		 144 aa  145  5e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2842  MarR family transcriptional regulator  54.93 
 
 		 150 aa  144  6e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0815  MarR family transcriptional regulator  60.55 
 
 		 165 aa  144  6e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000550088 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0576  transcriptional regulator, TrmB  52.45 
 
 		 158 aa  144  8.000000000000001e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0950259  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6797  transcriptional regulator, MarR family  55.32 
 
 		 150 aa  144  8.000000000000001e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000341321  decreased coverage  0.0000000109708 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3854  MarR family transcriptional regulator  51.39 
 
 		 151 aa  144  1e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.113287  normal  0.119098 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3056  MarR family transcriptional regulator  53.02 
 
 		 168 aa  143  1e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1470  MarR family transcriptional regulator  51.39 
 
 		 151 aa  143  1e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3415  MarR family transcriptional regulator  53.47 
 
 		 149 aa  144  1e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0058743 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15300  transcriptional regulator, MarR family  56.2 
 
 		 162 aa  143  1e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.408936  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4410  MarR family transcriptional regulator  53.79 
 
 		 176 aa  144  1e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4256  MarR family transcriptional regulator  52.08 
 
 		 166 aa  143  2e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.973283 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2137  transcriptional regulator, MarR family  53.03 
 
 		 154 aa  142  3e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.727084 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2231  MarR family transcriptional regulator  56.83 
 
 		 150 aa  142  3e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.106154  normal  0.474897 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3331  MarR family transcriptional regulator  49.65 
 
 		 155 aa  142  4e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.376124  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2174  regulatory protein MarR  53.03 
 
 		 154 aa  142  4e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.363681 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4745  transcriptional regulator, MarR family  55.47 
 
 		 147 aa  141  5e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.427221 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4766  transcriptional regulator, MarR family  52.55 
 
 		 166 aa  141  5e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.462626  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06220  transcriptional regulator, MarR family  55.07 
 
 		 169 aa  141  5e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3668  transcriptional regulator, MarR family  55.47 
 
 		 147 aa  141  5e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.400003  normal  0.620653 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2452  transcriptional regulator, MarR family  53.03 
 
 		 154 aa  141  5e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.126734  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5662  MarR family transcriptional regulator  50.77 
 
 		 153 aa  140  8e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.49927  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0835  transcriptional regulator, MarR family protein  49.66 
 
 		 150 aa  140  9e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1203  transcriptional regulator, TrmB  53.9 
 
 		 146 aa  140  9e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.529625  normal  0.0362733 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0649  transcriptional regulator, MarR family  45.86 
 
 		 150 aa  140  9e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1670  transcriptional regulator, MarR family  54.41 
 
 		 161 aa  140  9.999999999999999e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.428433  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2325  transcriptional regulator, MarR family  54.48 
 
 		 162 aa  140  9.999999999999999e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0434242 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4364  MarR family transcriptional regulator  45.86 
 
 		 150 aa  140  9.999999999999999e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4200  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  45.86 
 
 		 150 aa  140  9.999999999999999e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4211  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  45.86 
 
 		 150 aa  140  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.151141  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4585  transcriptional regulator, MarR family  45.86 
 
 		 150 aa  140  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4699  MarR family transcriptional regulator  45.86 
 
 		 150 aa  140  9.999999999999999e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3141  transcriptional regulator, MarR family  53.85 
 
 		 146 aa  140  9.999999999999999e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.566984  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4499  MarR family transcriptional regulator  57.46 
 
 		 150 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.148368  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1176  transcriptional regulator, TrmB  53.9 
 
 		 146 aa  140  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.713709  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3662  MarR family transcriptional regulator  57.46 
 
 		 150 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.485543  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1671  MarR family transcriptional regulator  48 
 
 		 151 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.787972  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4603  transcriptional regulator, MarR family  45.86 
 
 		 150 aa  140  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.221434  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4554  transcriptional regulator, MarR family  45.86 
 
 		 150 aa  140  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3865  MarR family transcriptional regulator  57.46 
 
 		 150 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0792032  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3311  MarR family transcriptional regulator  60.55 
 
 		 165 aa  140  9.999999999999999e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1193  transcriptional regulator, TrmB  53.9 
 
 		 146 aa  140  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4558  MarR family transcriptional regulator  45.86 
 
 		 150 aa  139  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0926  transcriptional regulator, MarR family  49.29 
 
 		 158 aa  139  1.9999999999999998e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.493079  normal  0.487426 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1219  MarR family transcriptional regulator  48.63 
 
 		 151 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.318492  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1113  transcriptional regulator, TrmB  51.72 
 
 		 167 aa  139  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3208  MarR family transcriptional regulator  59.63 
 
 		 165 aa  139  1.9999999999999998e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.469767 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1698  MarR family transcriptional regulator  48.63 
 
 		 151 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.547698  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4873  MarR family transcriptional regulator  45.7 
 
 		 151 aa  138  4.999999999999999e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.846475  normal  0.145685 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0578  transcriptional regulator, MarR family protein  53.52 
 
 		 163 aa  137  6e-32  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4312  MarR family transcriptional regulator  46.21 
 
 		 150 aa  137  8.999999999999999e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1860  MarR family transcriptional regulator  55 
 
 		 151 aa  136  1e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3597  MarR family transcriptional regulator  51.49 
 
 		 153 aa  137  1e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2483  transcriptional regulator, MarR family  47.48 
 
 		 156 aa  137  1e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.758038  normal  0.560924 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3996  MarR family transcriptional regulator  52.55 
 
 		 154 aa  137  1e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000674162  normal  0.401287 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1435  MarR family transcriptional regulator  55 
 
 		 151 aa  137  1e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.209441 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4137  transcriptional regulator, MarR family  50.77 
 
 		 153 aa  137  1e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5144  MarR family transcriptional regulator  62.62 
 
 		 156 aa  136  2e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>