More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_3141 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_3141  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 		 146 aa  285  1e-76  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.566984  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2251  MarR family transcriptional regulator  56.52 
 
 		 145 aa  151  2e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.344689  normal  0.255238 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4312  MarR family transcriptional regulator  51.43 
 
 		 150 aa  146  8e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0649  transcriptional regulator, MarR family  51.47 
 
 		 150 aa  145  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4792  transcriptional regulator, MarR family  56.25 
 
 		 147 aa  145  2.0000000000000003e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0729618  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4966  transcriptional regulator, MarR family  55.4 
 
 		 153 aa  145  2.0000000000000003e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.345847  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1770  MarR family transcriptional regulator  53.47 
 
 		 155 aa  145  2.0000000000000003e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4603  transcriptional regulator, MarR family  51.47 
 
 		 150 aa  145  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.221434  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4585  transcriptional regulator, MarR family  51.47 
 
 		 150 aa  145  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4364  MarR family transcriptional regulator  51.47 
 
 		 150 aa  144  3e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4200  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  51.47 
 
 		 150 aa  144  3e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4211  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  51.47 
 
 		 150 aa  144  3e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.151141  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4554  transcriptional regulator, MarR family  51.47 
 
 		 150 aa  144  3e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4699  MarR family transcriptional regulator  51.47 
 
 		 150 aa  144  3e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4558  MarR family transcriptional regulator  51.09 
 
 		 150 aa  144  5e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0960  MarR family transcriptional regulator  54.41 
 
 		 146 aa  143  6e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.305429  normal  0.461467 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2137  transcriptional regulator, MarR family  51.43 
 
 		 154 aa  143  8.000000000000001e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.727084 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1742  MarR family transcriptional regulator  53.12 
 
 		 149 aa  143  9e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1113  transcriptional regulator, TrmB  54.01 
 
 		 167 aa  142  1e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2452  transcriptional regulator, MarR family  51.09 
 
 		 154 aa  141  3e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.126734  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2174  regulatory protein MarR  51.09 
 
 		 154 aa  141  3e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.363681 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2151  MarR family transcriptional regulator  52.94 
 
 		 153 aa  140  6e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.680053 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27230  MarR family transcriptional regulator  51.41 
 
 		 151 aa  140  7e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2738  transcriptional regulator, MarR family  50 
 
 		 156 aa  140  8e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.708856 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2306  putative transcriptional regulator  51.41 
 
 		 151 aa  138  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1203  transcriptional regulator, TrmB  57.14 
 
 		 146 aa  139  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.529625  normal  0.0362733 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3240  MarR family transcriptional regulator  47.76 
 
 		 158 aa  138  3e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.715513  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3619  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  61.26 
 
 		 162 aa  138  3e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1189  transcriptional regulator MarR family  52.94 
 
 		 158 aa  137  3.9999999999999997e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.622384  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5560  MarR family transcriptional regulator  60.36 
 
 		 170 aa  137  3.9999999999999997e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.813118  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0021  MarR family transcriptional regulator  52.55 
 
 		 178 aa  137  3.9999999999999997e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03887  transcriptional regulator MarR family  63.06 
 
 		 152 aa  137  3.9999999999999997e-32  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1176  transcriptional regulator, TrmB  57.14 
 
 		 146 aa  137  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.713709  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1193  transcriptional regulator, TrmB  57.14 
 
 		 146 aa  137  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0129  MarR family transcriptional regulator  53.68 
 
 		 154 aa  136  8.999999999999999e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0573  MarR family transcriptional regulator  51.45 
 
 		 151 aa  136  8.999999999999999e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.256198  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0057  MarR family transcriptional regulator  54.03 
 
 		 185 aa  135  1e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.584189  normal  0.103539 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5144  MarR family transcriptional regulator  52.14 
 
 		 156 aa  136  1e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1207  transcriptional regulator, MarR family  52.24 
 
 		 146 aa  135  2e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000193075 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0623  MarR family transcriptional regulator  63.89 
 
 		 151 aa  135  2e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0519  MarR family transcriptional regulator  55.28 
 
 		 150 aa  135  2e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00587381 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15300  transcriptional regulator, MarR family  51.06 
 
 		 162 aa  134  3.0000000000000003e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.408936  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04763  hypothetical protein  50.72 
 
 		 143 aa  134  5e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1306  MarR family transcriptional regulator  54.81 
 
 		 149 aa  134  6.0000000000000005e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.335381  normal  0.344824 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4271  MarR family transcriptional regulator  50.36 
 
 		 156 aa  134  6.0000000000000005e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0653897  normal  0.661065 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3178  MarR family transcriptional regulator  47.73 
 
 		 154 aa  134  6.0000000000000005e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.137994  normal  0.81725 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1808  MarR family transcriptional regulator  54.55 
 
 		 159 aa  133  7.000000000000001e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3291  MarR family transcriptional regulator  46.81 
 
 		 152 aa  133  8e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.570613  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0108  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  50 
 
 		 152 aa  132  9.999999999999999e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.879191 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1134  MarR family transcriptional regulator  50.36 
 
 		 144 aa  132  9.999999999999999e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1768  transcriptional regulator, MarR family  45 
 
 		 157 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0483  MarR family transcriptional regulator  53.96 
 
 		 151 aa  131  1.9999999999999998e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0397178 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0474  transcriptional regulator, MarR family  53.96 
 
 		 155 aa  132  1.9999999999999998e-30  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3668  transcriptional regulator, MarR family  50.71 
 
 		 147 aa  132  1.9999999999999998e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.400003  normal  0.620653 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0830  MarR family transcriptional regulator  49.63 
 
 		 151 aa  131  1.9999999999999998e-30  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4745  transcriptional regulator, MarR family  50.71 
 
 		 147 aa  132  1.9999999999999998e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.427221 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2483  transcriptional regulator, MarR family  46.32 
 
 		 156 aa  131  3e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.758038  normal  0.560924 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00880  transcriptional regulator, MarR family  46.94 
 
 		 148 aa  131  3e-30  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0886  MarR family transcriptional regulator  49.63 
 
 		 151 aa  131  3.9999999999999996e-30  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001045  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  52.76 
 
 		 152 aa  130  3.9999999999999996e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3626  regulatory protein, MarR  47.86 
 
 		 157 aa  130  5e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.0000000021465  normal  0.0936579 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20780  transcriptional regulator, MarR family  48.53 
 
 		 152 aa  130  5e-30  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1032  MarR family transcriptional regulator  49.62 
 
 		 143 aa  130  6e-30  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.119572  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3097  transcriptional regulator, MarR family  50 
 
 		 153 aa  130  6e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2950  transcriptional regulator, MarR family  64.15 
 
 		 149 aa  130  6.999999999999999e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3444  transcriptional regulator, MarR family  50 
 
 		 153 aa  130  6.999999999999999e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1208  MarR family transcriptional regulator  49.62 
 
 		 143 aa  130  6.999999999999999e-30  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0011677  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1524  MarR family transcriptional regulator  48.63 
 
 		 149 aa  130  7.999999999999999e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.26569  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2845  transcriptional regulator, MarR family  45.71 
 
 		 145 aa  129  9e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.648486  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02614  putative transcription regulator protein  50.72 
 
 		 153 aa  129  9e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.532202  normal  0.750512 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0061  MarR family transcriptional regulator  48.18 
 
 		 171 aa  129  9e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.310818 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1670  transcriptional regulator, MarR family  48.51 
 
 		 161 aa  129  1.0000000000000001e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.428433  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21070  transcriptional regulator  59.82 
 
 		 143 aa  129  2.0000000000000002e-29  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0519  transcriptional regulator, MarR family  61.32 
 
 		 157 aa  128  2.0000000000000002e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3415  MarR family transcriptional regulator  48.46 
 
 		 149 aa  129  2.0000000000000002e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0058743 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0628  MarR family transcriptional regulator  58.93 
 
 		 144 aa  128  2.0000000000000002e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2325  transcriptional regulator, MarR family  48.51 
 
 		 162 aa  128  3e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0434242 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3426  transcriptional regulator, MarR family  48.2 
 
 		 165 aa  128  3e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1328  transcriptional regulator, MarR family  62.26 
 
 		 149 aa  128  3e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0866  MarR family transcriptional regulator  48.2 
 
 		 165 aa  128  3e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3498  MarR family transcriptional regulator  48.2 
 
 		 165 aa  128  3e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2629  MarR family transcriptional regulator  49.64 
 
 		 160 aa  128  3e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.8863  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3621  MarR family transcriptional regulator  48.2 
 
 		 165 aa  127  4.0000000000000003e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.597701 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0799  MarR family transcriptional regulator  53.17 
 
 		 161 aa  127  4.0000000000000003e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0050  transcriptional regulator, MarR family  52.76 
 
 		 164 aa  127  4.0000000000000003e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00479818 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2661  MarR family transcriptional regulator  44.93 
 
 		 145 aa  127  4.0000000000000003e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00131118  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2330  MarR family transcriptional regulator  51.75 
 
 		 163 aa  127  6e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.282714  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1641  transcriptional regulator, MarR family  53.49 
 
 		 157 aa  127  6e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.176874  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3854  MarR family transcriptional regulator  48.57 
 
 		 151 aa  127  7.000000000000001e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.113287  normal  0.119098 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1196  MarR family transcriptional regulator  60.55 
 
 		 155 aa  127  7.000000000000001e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0861  transcriptional regulator, MarR family  54.03 
 
 		 161 aa  127  7.000000000000001e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.440211 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1860  MarR family transcriptional regulator  56.88 
 
 		 151 aa  125  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06220  transcriptional regulator, MarR family  50 
 
 		 169 aa  126  1.0000000000000001e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0401  transcriptional regulator, MarR family  60.38 
 
 		 156 aa  125  1.0000000000000001e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1470  MarR family transcriptional regulator  56.88 
 
 		 151 aa  126  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27530  MarR family transcriptional regulator  51.05 
 
 		 163 aa  126  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.037283 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3597  MarR family transcriptional regulator  48.78 
 
 		 153 aa  125  2.0000000000000002e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2956  MarR family transcriptional regulator  45.26 
 
 		 153 aa  125  2.0000000000000002e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.119179 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4256  MarR family transcriptional regulator  46.32 
 
 		 166 aa  124  3e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.973283 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3311  MarR family transcriptional regulator  54.63 
 
 		 165 aa  124  4.0000000000000003e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>