More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_4137 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010676  Bphyt_4137  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 		 153 aa  312  9e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5662  MarR family transcriptional regulator  81.21 
 
 		 153 aa  256  1e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.49927  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1671  MarR family transcriptional regulator  80 
 
 		 151 aa  253  6e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.787972  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1608  MarR family transcriptional regulator  80.54 
 
 		 151 aa  252  1.0000000000000001e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.457422  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1219  MarR family transcriptional regulator  79.33 
 
 		 151 aa  251  2.0000000000000002e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.318492  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1698  MarR family transcriptional regulator  79.33 
 
 		 151 aa  251  2.0000000000000002e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.547698  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1631  MarR family transcriptional regulator  80.54 
 
 		 151 aa  251  3e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.813551 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4873  MarR family transcriptional regulator  79.73 
 
 		 151 aa  249  6e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.846475  normal  0.145685 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1547  MarR family transcriptional regulator  77.63 
 
 		 148 aa  239  1e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.187738 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2456  transcriptional regulator, MarR family  62.18 
 
 		 168 aa  192  1e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.768302  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2174  transcriptional regulator, MarR family  61.49 
 
 		 165 aa  187  4e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.789823  normal  0.527206 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2845  transcriptional regulator, MarR family  50.36 
 
 		 145 aa  150  5e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.648486  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4256  MarR family transcriptional regulator  49.65 
 
 		 166 aa  150  5.9999999999999996e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.973283 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4766  transcriptional regulator, MarR family  48.28 
 
 		 166 aa  150  7e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.462626  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2956  MarR family transcriptional regulator  48.03 
 
 		 153 aa  145  2.0000000000000003e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.119179 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0061  MarR family transcriptional regulator  48.61 
 
 		 171 aa  145  2.0000000000000003e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.310818 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4966  transcriptional regulator, MarR family  49.34 
 
 		 153 aa  141  3e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.345847  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0830  MarR family transcriptional regulator  48.55 
 
 		 151 aa  140  5e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1670  transcriptional regulator, MarR family  48.91 
 
 		 161 aa  140  5e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.428433  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0886  MarR family transcriptional regulator  48.55 
 
 		 151 aa  140  6e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0483  MarR family transcriptional regulator  48.25 
 
 		 151 aa  138  3e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0397178 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0057  MarR family transcriptional regulator  50.77 
 
 		 185 aa  136  7.999999999999999e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.584189  normal  0.103539 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3291  MarR family transcriptional regulator  45.03 
 
 		 152 aa  136  1e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.570613  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2280  MarR family transcriptional regulator  55.24 
 
 		 170 aa  136  1e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.421231  normal  0.627337 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0576  transcriptional regulator, TrmB  47.22 
 
 		 158 aa  135  2e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0950259  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3619  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  45.51 
 
 		 162 aa  134  3.0000000000000003e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0474  transcriptional regulator, MarR family  57.94 
 
 		 155 aa  134  5e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2738  transcriptional regulator, MarR family  46 
 
 		 156 aa  134  5e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.708856 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3444  transcriptional regulator, MarR family  46.31 
 
 		 153 aa  133  7.000000000000001e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4271  MarR family transcriptional regulator  44.16 
 
 		 156 aa  133  7.000000000000001e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0653897  normal  0.661065 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1189  transcriptional regulator MarR family  47.18 
 
 		 158 aa  132  9.999999999999999e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.622384  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2251  MarR family transcriptional regulator  45.64 
 
 		 145 aa  132  9.999999999999999e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.344689  normal  0.255238 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3097  transcriptional regulator, MarR family  46.31 
 
 		 153 aa  132  9.999999999999999e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0623  MarR family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 151 aa  132  1.9999999999999998e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2325  transcriptional regulator, MarR family  47.33 
 
 		 162 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0434242 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0129  MarR family transcriptional regulator  45.64 
 
 		 154 aa  131  3e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5560  MarR family transcriptional regulator  47.02 
 
 		 170 aa  131  3e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.813118  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3114  transcriptional regulator, MarR family  50.71 
 
 		 145 aa  131  3e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3240  MarR family transcriptional regulator  46.1 
 
 		 158 aa  131  3.9999999999999996e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.715513  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1203  transcriptional regulator, TrmB  47.1 
 
 		 146 aa  130  9e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.529625  normal  0.0362733 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1176  transcriptional regulator, TrmB  47.1 
 
 		 146 aa  129  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.713709  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2483  transcriptional regulator, MarR family  44 
 
 		 156 aa  129  1.0000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.758038  normal  0.560924 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1193  transcriptional regulator, TrmB  47.1 
 
 		 146 aa  129  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0573  MarR family transcriptional regulator  46.27 
 
 		 151 aa  129  2.0000000000000002e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.256198  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2950  transcriptional regulator, MarR family  47.79 
 
 		 149 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0108  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  44.68 
 
 		 152 aa  128  4.0000000000000003e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.879191 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0960  MarR family transcriptional regulator  47.29 
 
 		 146 aa  127  5.0000000000000004e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.305429  normal  0.461467 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2928  MarR family transcriptional regulator  44.06 
 
 		 143 aa  127  8.000000000000001e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.442252 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1742  MarR family transcriptional regulator  45.11 
 
 		 149 aa  127  8.000000000000001e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0519  MarR family transcriptional regulator  50.79 
 
 		 150 aa  126  9.000000000000001e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00587381 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1328  transcriptional regulator, MarR family  47.06 
 
 		 149 aa  126  9.000000000000001e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0705  MarR family transcriptional regulator  42.57 
 
 		 156 aa  126  1.0000000000000001e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.186956  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3178  MarR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 154 aa  126  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.137994  normal  0.81725 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0401  transcriptional regulator, MarR family  45.27 
 
 		 156 aa  125  2.0000000000000002e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15300  transcriptional regulator, MarR family  42.95 
 
 		 162 aa  124  6e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.408936  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1524  MarR family transcriptional regulator  46.04 
 
 		 149 aa  123  7e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.26569  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0519  transcriptional regulator, MarR family  56.31 
 
 		 157 aa  122  1e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4792  transcriptional regulator, MarR family  47.01 
 
 		 147 aa  122  1e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0729618  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1196  MarR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 155 aa  123  1e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1641  transcriptional regulator, MarR family  58 
 
 		 157 aa  123  1e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.176874  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02614  putative transcription regulator protein  43.88 
 
 		 153 aa  122  2e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.532202  normal  0.750512 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0925  regulatory protein MarR  44.52 
 
 		 195 aa  122  2e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.101489  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4410  MarR family transcriptional regulator  44.9 
 
 		 176 aa  122  2e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0886  transcriptional regulator, MarR family  44.52 
 
 		 161 aa  122  2e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.541526  normal  0.759862 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0369  MarR family transcriptional regulator  43.66 
 
 		 155 aa  122  3e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2629  MarR family transcriptional regulator  39.07 
 
 		 160 aa  120  5e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.8863  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1808  MarR family transcriptional regulator  42.36 
 
 		 159 aa  120  6e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1768  transcriptional regulator, MarR family  39.22 
 
 		 157 aa  120  6e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0862  MarR family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 158 aa  120  6e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.182256  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0335  MarR family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 158 aa  120  6e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.663008  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0861  transcriptional regulator, MarR family  45.52 
 
 		 161 aa  120  6e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.440211 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03887  transcriptional regulator MarR family  43.17 
 
 		 152 aa  120  6e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0598  MarR family transcriptional regulator  43.15 
 
 		 267 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4635  MarR family transcriptional regulator  46.62 
 
 		 153 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.472747  normal  0.0529683 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1207  transcriptional regulator, MarR family  43.05 
 
 		 146 aa  119  1.9999999999999998e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000193075 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2559  transcriptional regulator  43.17 
 
 		 150 aa  118  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.970675  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0304  MarR family transcriptional regulator  43.17 
 
 		 150 aa  118  3e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1679  MarR family transcriptional regulator  43.17 
 
 		 150 aa  118  3e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2422  MarR family transcriptional regulator  43.17 
 
 		 150 aa  118  3e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.934023  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1134  MarR family transcriptional regulator  45.26 
 
 		 144 aa  118  3e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1483  MarR family transcriptional regulator  43.17 
 
 		 150 aa  118  3e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.553037  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3626  regulatory protein, MarR  39.73 
 
 		 157 aa  117  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.0000000021465  normal  0.0936579 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4585  transcriptional regulator, MarR family  45.38 
 
 		 150 aa  117  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0649  transcriptional regulator, MarR family  45.38 
 
 		 150 aa  117  6e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2751  transcriptional regulator, MarR family  50.43 
 
 		 141 aa  117  7e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.290738  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2842  MarR family transcriptional regulator  52.88 
 
 		 154 aa  117  7e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4312  MarR family transcriptional regulator  45.38 
 
 		 150 aa  117  7.999999999999999e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4364  MarR family transcriptional regulator  44.54 
 
 		 150 aa  116  9.999999999999999e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4200  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  44.54 
 
 		 150 aa  116  9.999999999999999e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4211  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  44.54 
 
 		 150 aa  116  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.151141  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4554  transcriptional regulator, MarR family  44.54 
 
 		 150 aa  116  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4699  MarR family transcriptional regulator  44.54 
 
 		 150 aa  116  9.999999999999999e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4603  transcriptional regulator, MarR family  44.54 
 
 		 150 aa  116  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.221434  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0813  transcriptional regulator, MarR family  41.96 
 
 		 159 aa  116  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.800363  normal  0.25148 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4558  MarR family transcriptional regulator  44.54 
 
 		 150 aa  115  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1306  MarR family transcriptional regulator  49.58 
 
 		 149 aa  115  1.9999999999999998e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.335381  normal  0.344824 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3854  MarR family transcriptional regulator  38.26 
 
 		 151 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.113287  normal  0.119098 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3415  MarR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 149 aa  115  3e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0058743 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06220  transcriptional regulator, MarR family  42.95 
 
 		 169 aa  115  3e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0926  transcriptional regulator, MarR family  41.55 
 
 		 158 aa  115  3e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.493079  normal  0.487426 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>