More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_3444 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010682  Rpic_3444  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 		 153 aa  305  2.0000000000000002e-82  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3097  transcriptional regulator, MarR family  99.35 
 
 		 153 aa  303  4.0000000000000004e-82  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02614  putative transcription regulator protein  73.86 
 
 		 153 aa  226  9e-59  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.532202  normal  0.750512 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0623  MarR family transcriptional regulator  58.78 
 
 		 151 aa  174  4e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0483  MarR family transcriptional regulator  57.52 
 
 		 151 aa  173  9e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0397178 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0129  MarR family transcriptional regulator  57.05 
 
 		 154 aa  170  6.999999999999999e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0474  transcriptional regulator, MarR family  56.58 
 
 		 155 aa  169  1e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0573  MarR family transcriptional regulator  60.42 
 
 		 151 aa  167  3e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.256198  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0519  transcriptional regulator, MarR family  55.77 
 
 		 157 aa  168  3e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1196  MarR family transcriptional regulator  59.44 
 
 		 155 aa  166  1e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03887  transcriptional regulator MarR family  59.73 
 
 		 152 aa  166  1e-40  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0057  MarR family transcriptional regulator  58.96 
 
 		 185 aa  165  2e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.584189  normal  0.103539 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4966  transcriptional regulator, MarR family  58.57 
 
 		 153 aa  164  5.9999999999999996e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.345847  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0519  MarR family transcriptional regulator  61.24 
 
 		 150 aa  161  3e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00587381 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4271  MarR family transcriptional regulator  56.83 
 
 		 156 aa  160  4.0000000000000004e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0653897  normal  0.661065 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2950  transcriptional regulator, MarR family  57.66 
 
 		 149 aa  160  5.0000000000000005e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3619  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  54.79 
 
 		 162 aa  160  6e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0401  transcriptional regulator, MarR family  54.42 
 
 		 156 aa  160  7e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1641  transcriptional regulator, MarR family  59.85 
 
 		 157 aa  157  4e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.176874  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1328  transcriptional regulator, MarR family  56.2 
 
 		 149 aa  157  4e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5560  MarR family transcriptional regulator  56.62 
 
 		 170 aa  153  7e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.813118  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0108  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  55.63 
 
 		 152 aa  153  1e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.879191 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1189  transcriptional regulator MarR family  53.96 
 
 		 158 aa  152  1e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.622384  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27230  MarR family transcriptional regulator  52.74 
 
 		 151 aa  152  2e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2306  putative transcriptional regulator  52.74 
 
 		 151 aa  151  4e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0960  MarR family transcriptional regulator  60 
 
 		 146 aa  151  4e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.305429  normal  0.461467 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3291  MarR family transcriptional regulator  56.2 
 
 		 152 aa  151  4e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.570613  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1670  transcriptional regulator, MarR family  53.73 
 
 		 161 aa  150  5.9999999999999996e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.428433  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2842  MarR family transcriptional regulator  58.82 
 
 		 150 aa  150  8e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1742  MarR family transcriptional regulator  57.69 
 
 		 149 aa  150  8e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2325  transcriptional regulator, MarR family  54.81 
 
 		 162 aa  149  2e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0434242 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4256  MarR family transcriptional regulator  51.02 
 
 		 166 aa  148  3e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.973283 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2629  MarR family transcriptional regulator  54.74 
 
 		 160 aa  147  4e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.8863  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0830  MarR family transcriptional regulator  54.05 
 
 		 151 aa  147  4e-35  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6797  transcriptional regulator, MarR family  58.09 
 
 		 150 aa  147  5e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000341321  decreased coverage  0.0000000109708 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3996  MarR family transcriptional regulator  52.41 
 
 		 154 aa  147  5e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000674162  normal  0.401287 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0896  transcriptional regulator, MarR family  58.94 
 
 		 156 aa  145  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0886  MarR family transcriptional regulator  53.38 
 
 		 151 aa  145  2.0000000000000003e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2231  MarR family transcriptional regulator  58.21 
 
 		 150 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.106154  normal  0.474897 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4591  MarR family transcriptional regulator  56.69 
 
 		 182 aa  145  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.539807 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4499  MarR family transcriptional regulator  58.21 
 
 		 150 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.148368  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15300  transcriptional regulator, MarR family  53.57 
 
 		 162 aa  145  2.0000000000000003e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.408936  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3662  MarR family transcriptional regulator  58.21 
 
 		 150 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.485543  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3865  MarR family transcriptional regulator  58.21 
 
 		 150 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0792032  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1470  MarR family transcriptional regulator  52.86 
 
 		 151 aa  145  3e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3854  MarR family transcriptional regulator  52.14 
 
 		 151 aa  144  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.113287  normal  0.119098 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1808  MarR family transcriptional regulator  53.9 
 
 		 159 aa  144  4.0000000000000006e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4880  MarR family transcriptional regulator  58.21 
 
 		 157 aa  144  6e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.368926  hitchhiker  0.00140951 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3762  MarR family transcriptional regulator  57.46 
 
 		 150 aa  143  8.000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.425599  hitchhiker  0.00135953 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1768  transcriptional regulator, MarR family  52.21 
 
 		 157 aa  143  9e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2251  MarR family transcriptional regulator  52.94 
 
 		 145 aa  142  1e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.344689  normal  0.255238 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0598  MarR family transcriptional regulator  57.89 
 
 		 267 aa  143  1e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1207  transcriptional regulator, MarR family  55.38 
 
 		 146 aa  142  2e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000193075 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3233  MarR family transcriptional regulator  56.72 
 
 		 150 aa  141  3e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.550723  normal  0.0343876 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4410  MarR family transcriptional regulator  54.41 
 
 		 176 aa  141  3e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2845  transcriptional regulator, MarR family  50.35 
 
 		 145 aa  141  4e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.648486  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2559  transcriptional regulator  57.35 
 
 		 150 aa  140  5e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.970675  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0862  MarR family transcriptional regulator  57.35 
 
 		 158 aa  140  5e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.182256  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0335  MarR family transcriptional regulator  57.35 
 
 		 158 aa  140  5e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.663008  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4766  transcriptional regulator, MarR family  50.69 
 
 		 166 aa  140  6e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.462626  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0304  MarR family transcriptional regulator  57.35 
 
 		 150 aa  140  6e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4603  transcriptional regulator, MarR family  51.52 
 
 		 150 aa  140  6e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.221434  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1483  MarR family transcriptional regulator  57.35 
 
 		 150 aa  140  6e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.553037  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1679  MarR family transcriptional regulator  57.35 
 
 		 150 aa  140  6e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2422  MarR family transcriptional regulator  57.35 
 
 		 150 aa  140  6e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.934023  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4364  MarR family transcriptional regulator  51.52 
 
 		 150 aa  140  7e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4200  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  51.52 
 
 		 150 aa  140  7e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4211  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  51.52 
 
 		 150 aa  140  7e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.151141  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4699  MarR family transcriptional regulator  51.52 
 
 		 150 aa  140  7e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4554  transcriptional regulator, MarR family  51.52 
 
 		 150 aa  140  8e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4312  MarR family transcriptional regulator  51.52 
 
 		 150 aa  139  9.999999999999999e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4558  MarR family transcriptional regulator  51.52 
 
 		 150 aa  139  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3626  regulatory protein, MarR  49.32 
 
 		 157 aa  139  9.999999999999999e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.0000000021465  normal  0.0936579 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1176  transcriptional regulator, TrmB  52.9 
 
 		 146 aa  139  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.713709  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1435  MarR family transcriptional regulator  56.52 
 
 		 151 aa  139  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.209441 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1193  transcriptional regulator, TrmB  52.9 
 
 		 146 aa  139  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1860  MarR family transcriptional regulator  56.52 
 
 		 151 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0576  transcriptional regulator, TrmB  52.94 
 
 		 158 aa  138  1.9999999999999998e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0950259  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1203  transcriptional regulator, TrmB  52.9 
 
 		 146 aa  138  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.529625  normal  0.0362733 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3178  MarR family transcriptional regulator  49.64 
 
 		 154 aa  139  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.137994  normal  0.81725 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4137  transcriptional regulator, MarR family  45.64 
 
 		 153 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1134  MarR family transcriptional regulator  55.38 
 
 		 144 aa  139  1.9999999999999998e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3498  MarR family transcriptional regulator  52.27 
 
 		 165 aa  138  3e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4585  transcriptional regulator, MarR family  50.76 
 
 		 150 aa  138  3e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0866  MarR family transcriptional regulator  52.27 
 
 		 165 aa  137  3.9999999999999997e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21070  transcriptional regulator  54.89 
 
 		 143 aa  137  3.9999999999999997e-32  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3426  transcriptional regulator, MarR family  52.27 
 
 		 165 aa  137  3.9999999999999997e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0649  transcriptional regulator, MarR family  50.76 
 
 		 150 aa  137  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4792  transcriptional regulator, MarR family  49.64 
 
 		 147 aa  137  4.999999999999999e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0729618  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4873  MarR family transcriptional regulator  44.67 
 
 		 151 aa  136  1e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.846475  normal  0.145685 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1306  MarR family transcriptional regulator  56.06 
 
 		 149 aa  136  1e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.335381  normal  0.344824 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0815  MarR family transcriptional regulator  51.8 
 
 		 165 aa  136  1e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000550088 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3621  MarR family transcriptional regulator  51.52 
 
 		 165 aa  136  1e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.597701 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04763  hypothetical protein  51.8 
 
 		 143 aa  135  2e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3240  MarR family transcriptional regulator  49.25 
 
 		 158 aa  135  2e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.715513  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00880  transcriptional regulator, MarR family  51.61 
 
 		 148 aa  135  2e-31  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1671  MarR family transcriptional regulator  44.67 
 
 		 151 aa  134  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.787972  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2452  transcriptional regulator, MarR family  51.85 
 
 		 154 aa  134  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.126734  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3311  MarR family transcriptional regulator  49.28 
 
 		 165 aa  135  3.0000000000000003e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3141  transcriptional regulator, MarR family  50 
 
 		 146 aa  135  3.0000000000000003e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.566984  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>