More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_4966 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012791  Vapar_4966  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 
153 aa  308  2e-83  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.345847  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0623  MarR family transcriptional regulator  73.76 
 
 
151 aa  223  8e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4271  MarR family transcriptional regulator  60.93 
 
 
156 aa  190  5e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0653897  normal  0.661065 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0474  transcriptional regulator, MarR family  67.13 
 
 
155 aa  189  1e-47  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0483  MarR family transcriptional regulator  67.13 
 
 
151 aa  188  2e-47  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0397178 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1196  MarR family transcriptional regulator  63.77 
 
 
155 aa  187  5e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0573  MarR family transcriptional regulator  61.07 
 
 
151 aa  184  3e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.256198  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5560  MarR family transcriptional regulator  61.22 
 
 
170 aa  182  1.0000000000000001e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.813118  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3619  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  60.4 
 
 
162 aa  179  1e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0057  MarR family transcriptional regulator  67.19 
 
 
185 aa  170  7.999999999999999e-42  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.584189  normal  0.103539 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2251  MarR family transcriptional regulator  60.14 
 
 
145 aa  167  5e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.344689  normal  0.255238 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0519  transcriptional regulator, MarR family  56.76 
 
 
157 aa  165  2e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0401  transcriptional regulator, MarR family  55.78 
 
 
156 aa  162  1.0000000000000001e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03887  transcriptional regulator MarR family  56.85 
 
 
152 aa  162  2.0000000000000002e-39  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0129  MarR family transcriptional regulator  52 
 
 
154 aa  160  8.000000000000001e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2845  transcriptional regulator, MarR family  54.93 
 
 
145 aa  159  1e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.648486  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0576  transcriptional regulator, TrmB  53.38 
 
 
158 aa  159  2e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0950259  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2950  transcriptional regulator, MarR family  56.93 
 
 
149 aa  159  2e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1189  transcriptional regulator MarR family  58.39 
 
 
158 aa  159  2e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.622384  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02614  putative transcription regulator protein  56.43 
 
 
153 aa  156  1e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.532202  normal  0.750512 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1328  transcriptional regulator, MarR family  55.47 
 
 
149 aa  155  2e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1808  MarR family transcriptional regulator  58.7 
 
 
159 aa  155  2e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1768  transcriptional regulator, MarR family  50.33 
 
 
157 aa  154  4e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0108  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  54.79 
 
 
152 aa  153  7e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.879191 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0886  MarR family transcriptional regulator  56.12 
 
 
151 aa  152  2e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1670  transcriptional regulator, MarR family  52.17 
 
 
161 aa  152  2e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.428433  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0061  MarR family transcriptional regulator  48.67 
 
 
171 aa  151  2.9999999999999998e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.310818 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0830  MarR family transcriptional regulator  55.4 
 
 
151 aa  150  4e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15300  transcriptional regulator, MarR family  53.74 
 
 
162 aa  151  4e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.408936  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2306  putative transcriptional regulator  50.67 
 
 
151 aa  150  4e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3233  MarR family transcriptional regulator  55.47 
 
 
150 aa  150  5.9999999999999996e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.550723  normal  0.0343876 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2559  transcriptional regulator  54.79 
 
 
150 aa  150  7e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.970675  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0862  MarR family transcriptional regulator  54.79 
 
 
158 aa  150  8e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.182256  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0335  MarR family transcriptional regulator  54.79 
 
 
158 aa  150  8e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.663008  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2422  MarR family transcriptional regulator  54.79 
 
 
150 aa  150  8.999999999999999e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.934023  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0304  MarR family transcriptional regulator  54.79 
 
 
150 aa  150  8.999999999999999e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1483  MarR family transcriptional regulator  54.79 
 
 
150 aa  150  8.999999999999999e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.553037  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1679  MarR family transcriptional regulator  54.79 
 
 
150 aa  150  8.999999999999999e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0598  MarR family transcriptional regulator  57.14 
 
 
267 aa  149  1e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27230  MarR family transcriptional regulator  50 
 
 
151 aa  149  1e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4499  MarR family transcriptional regulator  57.58 
 
 
150 aa  149  2e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.148368  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0519  MarR family transcriptional regulator  58.06 
 
 
150 aa  148  2e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00587381 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3097  transcriptional regulator, MarR family  58.57 
 
 
153 aa  148  2e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3865  MarR family transcriptional regulator  57.58 
 
 
150 aa  149  2e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0792032  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3662  MarR family transcriptional regulator  57.58 
 
 
150 aa  149  2e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.485543  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3626  regulatory protein, MarR  49.01 
 
 
157 aa  148  3e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.0000000021465  normal  0.0936579 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3291  MarR family transcriptional regulator  53.68 
 
 
152 aa  148  3e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.570613  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3444  transcriptional regulator, MarR family  58.57 
 
 
153 aa  148  3e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5144  MarR family transcriptional regulator  52.35 
 
 
156 aa  148  3e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2231  MarR family transcriptional regulator  55.47 
 
 
150 aa  147  4e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.106154  normal  0.474897 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4880  MarR family transcriptional regulator  56.2 
 
 
157 aa  147  5e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.368926  hitchhiker  0.00140951 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3762  MarR family transcriptional regulator  54.74 
 
 
150 aa  147  6e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.425599  hitchhiker  0.00135953 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1770  MarR family transcriptional regulator  55 
 
 
155 aa  145  2.0000000000000003e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1176  transcriptional regulator, TrmB  56.72 
 
 
146 aa  145  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.713709  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1193  transcriptional regulator, TrmB  56.72 
 
 
146 aa  145  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3597  MarR family transcriptional regulator  50 
 
 
153 aa  144  3e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3141  transcriptional regulator, MarR family  55.4 
 
 
146 aa  145  3e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.566984  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1203  transcriptional regulator, TrmB  56.72 
 
 
146 aa  144  4.0000000000000006e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.529625  normal  0.0362733 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0960  MarR family transcriptional regulator  53.28 
 
 
146 aa  144  4.0000000000000006e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.305429  normal  0.461467 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1470  MarR family transcriptional regulator  52.41 
 
 
151 aa  144  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2738  transcriptional regulator, MarR family  53.28 
 
 
156 aa  144  5e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.708856 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4256  MarR family transcriptional regulator  51.32 
 
 
166 aa  144  6e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.973283 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1742  MarR family transcriptional regulator  53.49 
 
 
149 aa  143  7.0000000000000006e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3854  MarR family transcriptional regulator  51.03 
 
 
151 aa  142  1e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.113287  normal  0.119098 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0021  MarR family transcriptional regulator  51.02 
 
 
178 aa  143  1e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3178  MarR family transcriptional regulator  48.67 
 
 
154 aa  142  1e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.137994  normal  0.81725 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2137  transcriptional regulator, MarR family  52.14 
 
 
154 aa  142  1e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.727084 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4312  MarR family transcriptional regulator  50 
 
 
150 aa  142  2e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1641  transcriptional regulator, MarR family  51.68 
 
 
157 aa  142  2e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.176874  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4766  transcriptional regulator, MarR family  52.14 
 
 
166 aa  142  2e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.462626  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5662  MarR family transcriptional regulator  49.66 
 
 
153 aa  142  2e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.49927  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2452  transcriptional regulator, MarR family  50.71 
 
 
154 aa  142  2e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.126734  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0649  transcriptional regulator, MarR family  48.23 
 
 
150 aa  142  2e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3114  transcriptional regulator, MarR family  53.9 
 
 
145 aa  142  2e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4558  MarR family transcriptional regulator  48.57 
 
 
150 aa  141  3e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4585  transcriptional regulator, MarR family  47.52 
 
 
150 aa  141  3e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2174  regulatory protein MarR  50.71 
 
 
154 aa  141  3e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.363681 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2629  MarR family transcriptional regulator  51.8 
 
 
160 aa  141  3e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.8863  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4410  MarR family transcriptional regulator  51.37 
 
 
176 aa  141  3e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4137  transcriptional regulator, MarR family  49.34 
 
 
153 aa  141  3e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4364  MarR family transcriptional regulator  47.52 
 
 
150 aa  141  4e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4200  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  47.52 
 
 
150 aa  141  4e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4211  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  47.52 
 
 
150 aa  141  4e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.151141  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4603  transcriptional regulator, MarR family  47.52 
 
 
150 aa  141  4e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.221434  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4699  MarR family transcriptional regulator  47.52 
 
 
150 aa  141  4e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1113  transcriptional regulator, TrmB  52.99 
 
 
167 aa  140  4e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04763  hypothetical protein  53.44 
 
 
143 aa  140  5e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4554  transcriptional regulator, MarR family  47.86 
 
 
150 aa  140  6e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3996  MarR family transcriptional regulator  48.03 
 
 
154 aa  140  7e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000674162  normal  0.401287 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2842  MarR family transcriptional regulator  55.64 
 
 
150 aa  140  7e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001045  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  48.3 
 
 
152 aa  140  9e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2483  transcriptional regulator, MarR family  51.09 
 
 
156 aa  139  9.999999999999999e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.758038  normal  0.560924 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2956  MarR family transcriptional regulator  50.68 
 
 
153 aa  139  9.999999999999999e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.119179 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3240  MarR family transcriptional regulator  51.13 
 
 
158 aa  139  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.715513  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2325  transcriptional regulator, MarR family  49.64 
 
 
162 aa  139  1.9999999999999998e-32  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0434242 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6797  transcriptional regulator, MarR family  54.89 
 
 
150 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000341321  decreased coverage  0.0000000109708 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00880  transcriptional regulator, MarR family  56.3 
 
 
148 aa  138  1.9999999999999998e-32  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1134  MarR family transcriptional regulator  54.96 
 
 
144 aa  138  3e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3498  MarR family transcriptional regulator  49.68 
 
 
165 aa  137  4.999999999999999e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0813  transcriptional regulator, MarR family  45.95 
 
 
159 aa  137  7e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.800363  normal  0.25148 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>