More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_1470 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010501  PputW619_1470  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 
151 aa  299  9e-81  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3854  MarR family transcriptional regulator  93.38 
 
 
151 aa  283  5.999999999999999e-76  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.113287  normal  0.119098 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1860  MarR family transcriptional regulator  94.04 
 
 
151 aa  259  1e-68  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1435  MarR family transcriptional regulator  93.38 
 
 
151 aa  258  2e-68  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.209441 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3996  MarR family transcriptional regulator  76.87 
 
 
154 aa  226  9e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000674162  normal  0.401287 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1768  transcriptional regulator, MarR family  69.43 
 
 
157 aa  219  9.999999999999999e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3626  regulatory protein, MarR  72.41 
 
 
157 aa  218  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.0000000021465  normal  0.0936579 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2629  MarR family transcriptional regulator  73.43 
 
 
160 aa  214  2e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.8863  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27230  MarR family transcriptional regulator  73.57 
 
 
151 aa  208  2e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15300  transcriptional regulator, MarR family  68.97 
 
 
162 aa  204  2e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.408936  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2306  putative transcriptional regulator  72.14 
 
 
151 aa  203  7e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2251  MarR family transcriptional regulator  58.57 
 
 
145 aa  165  2e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.344689  normal  0.255238 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0623  MarR family transcriptional regulator  58.5 
 
 
151 aa  162  1.0000000000000001e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0474  transcriptional regulator, MarR family  56.76 
 
 
155 aa  159  1e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0573  MarR family transcriptional regulator  57.66 
 
 
151 aa  159  1e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.256198  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4271  MarR family transcriptional regulator  55.47 
 
 
156 aa  158  3e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0653897  normal  0.661065 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2845  transcriptional regulator, MarR family  51.06 
 
 
145 aa  158  3e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.648486  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3619  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  57.34 
 
 
162 aa  157  4e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1670  transcriptional regulator, MarR family  55.88 
 
 
161 aa  156  7e-38  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.428433  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5560  MarR family transcriptional regulator  56.76 
 
 
170 aa  156  8e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.813118  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0483  MarR family transcriptional regulator  57.34 
 
 
151 aa  156  8e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0397178 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1196  MarR family transcriptional regulator  56.16 
 
 
155 aa  156  1e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03887  transcriptional regulator MarR family  55.86 
 
 
152 aa  154  3e-37  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2950  transcriptional regulator, MarR family  56.52 
 
 
149 aa  152  1e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6797  transcriptional regulator, MarR family  55.56 
 
 
150 aa  152  2e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000341321  decreased coverage  0.0000000109708 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0401  transcriptional regulator, MarR family  51.33 
 
 
156 aa  151  2.9999999999999998e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0108  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  58.09 
 
 
152 aa  150  5e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.879191 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0519  transcriptional regulator, MarR family  56.72 
 
 
157 aa  150  8e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1328  transcriptional regulator, MarR family  55.07 
 
 
149 aa  150  8e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2842  MarR family transcriptional regulator  53.06 
 
 
150 aa  150  8.999999999999999e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0519  MarR family transcriptional regulator  58.2 
 
 
150 aa  148  2e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00587381 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4499  MarR family transcriptional regulator  56.72 
 
 
150 aa  148  3e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.148368  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3662  MarR family transcriptional regulator  56.72 
 
 
150 aa  148  3e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.485543  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3865  MarR family transcriptional regulator  56.72 
 
 
150 aa  148  3e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0792032  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3233  MarR family transcriptional regulator  56.72 
 
 
150 aa  147  4e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.550723  normal  0.0343876 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4256  MarR family transcriptional regulator  48.95 
 
 
166 aa  147  6e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.973283 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2137  transcriptional regulator, MarR family  50 
 
 
154 aa  146  9e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.727084 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2231  MarR family transcriptional regulator  55.97 
 
 
150 aa  146  1.0000000000000001e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.106154  normal  0.474897 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2174  regulatory protein MarR  50 
 
 
154 aa  145  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.363681 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1641  transcriptional regulator, MarR family  53.57 
 
 
157 aa  145  2.0000000000000003e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.176874  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3762  MarR family transcriptional regulator  55.97 
 
 
150 aa  145  3e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.425599  hitchhiker  0.00135953 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0061  MarR family transcriptional regulator  50.74 
 
 
171 aa  144  3e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.310818 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4880  MarR family transcriptional regulator  55.22 
 
 
157 aa  144  3e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.368926  hitchhiker  0.00140951 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4766  transcriptional regulator, MarR family  48.25 
 
 
166 aa  144  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.462626  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4966  transcriptional regulator, MarR family  52.41 
 
 
153 aa  144  4.0000000000000006e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.345847  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2452  transcriptional regulator, MarR family  50 
 
 
154 aa  144  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.126734  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4410  MarR family transcriptional regulator  51.05 
 
 
176 aa  143  7.0000000000000006e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0862  MarR family transcriptional regulator  52.94 
 
 
158 aa  141  2e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.182256  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0598  MarR family transcriptional regulator  53.28 
 
 
267 aa  142  2e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0335  MarR family transcriptional regulator  52.94 
 
 
158 aa  141  2e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.663008  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2559  transcriptional regulator  52.94 
 
 
150 aa  141  3e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.970675  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1483  MarR family transcriptional regulator  52.94 
 
 
150 aa  141  3e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.553037  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0304  MarR family transcriptional regulator  52.94 
 
 
150 aa  141  3e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1679  MarR family transcriptional regulator  52.94 
 
 
150 aa  141  3e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0129  MarR family transcriptional regulator  49.32 
 
 
154 aa  141  3e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2422  MarR family transcriptional regulator  52.94 
 
 
150 aa  141  3e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.934023  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2325  transcriptional regulator, MarR family  53.96 
 
 
162 aa  141  4e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0434242 
 
 
-
 
NC_003296  RS02614  putative transcription regulator protein  50.68 
 
 
153 aa  140  5e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.532202  normal  0.750512 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0803  transcriptional regulator, MarR family protein  50.35 
 
 
148 aa  139  9.999999999999999e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5144  MarR family transcriptional regulator  50.34 
 
 
156 aa  139  9.999999999999999e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3331  MarR family transcriptional regulator  51.05 
 
 
155 aa  139  1.9999999999999998e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.376124  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3097  transcriptional regulator, MarR family  50.99 
 
 
153 aa  139  1.9999999999999998e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3444  transcriptional regulator, MarR family  50.99 
 
 
153 aa  138  1.9999999999999998e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3291  MarR family transcriptional regulator  47.02 
 
 
152 aa  138  3e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.570613  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0421  MarR family transcriptional regulator  47.86 
 
 
150 aa  138  3e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0670441  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0057  MarR family transcriptional regulator  52.24 
 
 
185 aa  138  3e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.584189  normal  0.103539 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4603  transcriptional regulator, MarR family  55.45 
 
 
150 aa  137  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.221434  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3114  transcriptional regulator, MarR family  51.41 
 
 
145 aa  137  3.9999999999999997e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4364  MarR family transcriptional regulator  54.55 
 
 
150 aa  136  1e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4200  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  54.55 
 
 
150 aa  136  1e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4211  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  54.55 
 
 
150 aa  136  1e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.151141  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4699  MarR family transcriptional regulator  54.55 
 
 
150 aa  136  1e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4554  transcriptional regulator, MarR family  54.55 
 
 
150 aa  136  1e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4558  MarR family transcriptional regulator  54.55 
 
 
150 aa  135  2e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1742  MarR family transcriptional regulator  50.36 
 
 
149 aa  135  2e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0649  transcriptional regulator, MarR family  45.32 
 
 
150 aa  135  2e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0799  MarR family transcriptional regulator  52.31 
 
 
161 aa  135  3.0000000000000003e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1808  MarR family transcriptional regulator  49.01 
 
 
159 aa  135  3.0000000000000003e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4585  transcriptional regulator, MarR family  45.32 
 
 
150 aa  134  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1203  transcriptional regulator, TrmB  48.53 
 
 
146 aa  135  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.529625  normal  0.0362733 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0628  MarR family transcriptional regulator  51.56 
 
 
144 aa  135  3.0000000000000003e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0815  MarR family transcriptional regulator  48.53 
 
 
165 aa  134  4e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000550088 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1113  transcriptional regulator, TrmB  48.94 
 
 
167 aa  134  5e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0934  MarR family transcriptional regulator  55.36 
 
 
163 aa  134  6.0000000000000005e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0830  MarR family transcriptional regulator  48.51 
 
 
151 aa  133  8e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3498  MarR family transcriptional regulator  49.26 
 
 
165 aa  133  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0886  MarR family transcriptional regulator  48.51 
 
 
151 aa  132  9.999999999999999e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1189  transcriptional regulator MarR family  50.35 
 
 
158 aa  132  9.999999999999999e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.622384  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0960  MarR family transcriptional regulator  50.36 
 
 
146 aa  132  9.999999999999999e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.305429  normal  0.461467 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0835  transcriptional regulator, MarR family protein  48.51 
 
 
150 aa  132  9.999999999999999e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1936  transcriptional regulator, MarR family  52.9 
 
 
155 aa  131  1.9999999999999998e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.13089 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1176  transcriptional regulator, TrmB  47.79 
 
 
146 aa  132  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.713709  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2151  MarR family transcriptional regulator  50 
 
 
153 aa  131  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.680053 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1134  MarR family transcriptional regulator  52.55 
 
 
144 aa  132  1.9999999999999998e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1193  transcriptional regulator, TrmB  47.79 
 
 
146 aa  132  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0866  MarR family transcriptional regulator  48.53 
 
 
165 aa  131  3e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3426  transcriptional regulator, MarR family  48.53 
 
 
165 aa  131  3e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3668  transcriptional regulator, MarR family  53.98 
 
 
147 aa  131  3e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.400003  normal  0.620653 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4745  transcriptional regulator, MarR family  53.98 
 
 
147 aa  131  3e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.427221 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3311  MarR family transcriptional regulator  48.15 
 
 
165 aa  130  5e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>