More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_03887 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010717  PXO_03887  transcriptional regulator MarR family  100 
 
 
152 aa  303  4.0000000000000004e-82  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0401  transcriptional regulator, MarR family  64.86 
 
 
156 aa  191  4e-48  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0129  MarR family transcriptional regulator  67.38 
 
 
154 aa  190  7e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0519  transcriptional regulator, MarR family  68.57 
 
 
157 aa  189  1e-47  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2950  transcriptional regulator, MarR family  65.71 
 
 
149 aa  184  3e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1328  transcriptional regulator, MarR family  65.94 
 
 
149 aa  184  3e-46  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1641  transcriptional regulator, MarR family  65.22 
 
 
157 aa  179  9.000000000000001e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.176874  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5560  MarR family transcriptional regulator  58.74 
 
 
170 aa  164  2.9999999999999998e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.813118  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3619  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  57.43 
 
 
162 aa  164  5.9999999999999996e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3097  transcriptional regulator, MarR family  59.73 
 
 
153 aa  163  6.9999999999999995e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3444  transcriptional regulator, MarR family  59.73 
 
 
153 aa  163  8e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0519  MarR family transcriptional regulator  65.52 
 
 
150 aa  162  1.0000000000000001e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00587381 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4966  transcriptional regulator, MarR family  56.85 
 
 
153 aa  162  2.0000000000000002e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.345847  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0623  MarR family transcriptional regulator  55.7 
 
 
151 aa  161  3e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0573  MarR family transcriptional regulator  60.29 
 
 
151 aa  159  1e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.256198  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02614  putative transcription regulator protein  57.05 
 
 
153 aa  159  2e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.532202  normal  0.750512 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1808  MarR family transcriptional regulator  57.45 
 
 
159 aa  158  3e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0057  MarR family transcriptional regulator  61.83 
 
 
185 aa  157  7e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.584189  normal  0.103539 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3291  MarR family transcriptional regulator  55.88 
 
 
152 aa  155  2e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.570613  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0335  MarR family transcriptional regulator  53.38 
 
 
158 aa  155  2e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.663008  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0862  MarR family transcriptional regulator  53.38 
 
 
158 aa  155  2e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.182256  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0830  MarR family transcriptional regulator  56.62 
 
 
151 aa  155  2e-37  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1470  MarR family transcriptional regulator  55.86 
 
 
151 aa  154  3e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0886  MarR family transcriptional regulator  56.62 
 
 
151 aa  154  4e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2251  MarR family transcriptional regulator  55.8 
 
 
145 aa  153  6e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.344689  normal  0.255238 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0108  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  58.04 
 
 
152 aa  152  1e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.879191 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2325  transcriptional regulator, MarR family  54.07 
 
 
162 aa  152  2e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0434242 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2559  transcriptional regulator  53.47 
 
 
150 aa  151  2.9999999999999998e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.970675  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0304  MarR family transcriptional regulator  53.47 
 
 
150 aa  151  4e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2422  MarR family transcriptional regulator  53.47 
 
 
150 aa  151  4e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.934023  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1679  MarR family transcriptional regulator  53.47 
 
 
150 aa  151  4e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4766  transcriptional regulator, MarR family  50 
 
 
166 aa  151  4e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.462626  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1483  MarR family transcriptional regulator  53.47 
 
 
150 aa  151  4e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.553037  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0598  MarR family transcriptional regulator  52.41 
 
 
267 aa  150  8e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3854  MarR family transcriptional regulator  53.79 
 
 
151 aa  149  1e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.113287  normal  0.119098 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1768  transcriptional regulator, MarR family  52.78 
 
 
157 aa  149  1e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1196  MarR family transcriptional regulator  54.67 
 
 
155 aa  149  1e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2842  MarR family transcriptional regulator  56.3 
 
 
150 aa  149  1e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0474  transcriptional regulator, MarR family  56.25 
 
 
155 aa  149  1e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0483  MarR family transcriptional regulator  56.64 
 
 
151 aa  148  3e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0397178 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3996  MarR family transcriptional regulator  53.02 
 
 
154 aa  148  3e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000674162  normal  0.401287 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1207  transcriptional regulator, MarR family  53.24 
 
 
146 aa  147  6e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000193075 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15300  transcriptional regulator, MarR family  54.05 
 
 
162 aa  147  6e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.408936  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4271  MarR family transcriptional regulator  57.34 
 
 
156 aa  147  6e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0653897  normal  0.661065 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2231  MarR family transcriptional regulator  54.74 
 
 
150 aa  147  7e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.106154  normal  0.474897 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6797  transcriptional regulator, MarR family  54.81 
 
 
150 aa  146  8e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000341321  decreased coverage  0.0000000109708 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3626  regulatory protein, MarR  52.9 
 
 
157 aa  145  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.0000000021465  normal  0.0936579 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1134  MarR family transcriptional regulator  54.68 
 
 
144 aa  146  1.0000000000000001e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4410  MarR family transcriptional regulator  52.99 
 
 
176 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4256  MarR family transcriptional regulator  52.21 
 
 
166 aa  145  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.973283 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1189  transcriptional regulator MarR family  53.24 
 
 
158 aa  145  3e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.622384  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1306  MarR family transcriptional regulator  55.94 
 
 
149 aa  144  5e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.335381  normal  0.344824 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2306  putative transcriptional regulator  53.62 
 
 
151 aa  144  5e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4499  MarR family transcriptional regulator  53.28 
 
 
150 aa  143  7.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.148368  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2137  transcriptional regulator, MarR family  54.29 
 
 
154 aa  143  7.0000000000000006e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.727084 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3865  MarR family transcriptional regulator  53.28 
 
 
150 aa  143  7.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0792032  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3662  MarR family transcriptional regulator  53.28 
 
 
150 aa  143  7.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.485543  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1670  transcriptional regulator, MarR family  52.55 
 
 
161 aa  143  1e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.428433  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27230  MarR family transcriptional regulator  52.9 
 
 
151 aa  142  1e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2452  transcriptional regulator, MarR family  54.61 
 
 
154 aa  143  1e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.126734  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2629  MarR family transcriptional regulator  53.68 
 
 
160 aa  142  2e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.8863  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2174  regulatory protein MarR  55.07 
 
 
154 aa  141  3e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.363681 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3233  MarR family transcriptional regulator  52.55 
 
 
150 aa  141  3e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.550723  normal  0.0343876 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3762  MarR family transcriptional regulator  52.55 
 
 
150 aa  141  4e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.425599  hitchhiker  0.00135953 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1203  transcriptional regulator, TrmB  53.68 
 
 
146 aa  140  6e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.529625  normal  0.0362733 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1435  MarR family transcriptional regulator  55.91 
 
 
151 aa  140  7e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.209441 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0578  transcriptional regulator, MarR family protein  48.61 
 
 
163 aa  140  7e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3331  MarR family transcriptional regulator  47.68 
 
 
155 aa  140  8e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.376124  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3426  transcriptional regulator, MarR family  50.33 
 
 
165 aa  139  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0866  MarR family transcriptional regulator  50.33 
 
 
165 aa  139  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0861  transcriptional regulator, MarR family  52.41 
 
 
161 aa  139  9.999999999999999e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.440211 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5144  MarR family transcriptional regulator  57.58 
 
 
156 aa  139  9.999999999999999e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1860  MarR family transcriptional regulator  55.91 
 
 
151 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3498  MarR family transcriptional regulator  50.33 
 
 
165 aa  138  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1176  transcriptional regulator, TrmB  53.68 
 
 
146 aa  139  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.713709  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4792  transcriptional regulator, MarR family  55.12 
 
 
147 aa  139  1.9999999999999998e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0729618  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0835  transcriptional regulator, MarR family protein  51.88 
 
 
150 aa  139  1.9999999999999998e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1193  transcriptional regulator, TrmB  53.68 
 
 
146 aa  139  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4880  MarR family transcriptional regulator  51.09 
 
 
157 aa  138  3e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.368926  hitchhiker  0.00140951 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0576  transcriptional regulator, TrmB  50.35 
 
 
158 aa  138  3e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0950259  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3208  MarR family transcriptional regulator  50.33 
 
 
165 aa  138  3e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.469767 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0925  regulatory protein MarR  52.17 
 
 
195 aa  138  3e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.101489  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2151  MarR family transcriptional regulator  52.82 
 
 
153 aa  137  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.680053 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3141  transcriptional regulator, MarR family  63.06 
 
 
146 aa  137  3.9999999999999997e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.566984  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0815  MarR family transcriptional regulator  50.35 
 
 
165 aa  137  3.9999999999999997e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000550088 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0649  transcriptional regulator, MarR family  47.14 
 
 
150 aa  137  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0886  transcriptional regulator, MarR family  52.17 
 
 
161 aa  137  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.541526  normal  0.759862 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3621  MarR family transcriptional regulator  49.67 
 
 
165 aa  137  4.999999999999999e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.597701 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3311  MarR family transcriptional regulator  49.65 
 
 
165 aa  137  6e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1936  transcriptional regulator, MarR family  50.35 
 
 
155 aa  137  7e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.13089 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3668  transcriptional regulator, MarR family  50 
 
 
147 aa  136  7.999999999999999e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.400003  normal  0.620653 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0960  MarR family transcriptional regulator  50.72 
 
 
146 aa  136  7.999999999999999e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.305429  normal  0.461467 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4745  transcriptional regulator, MarR family  50 
 
 
147 aa  136  7.999999999999999e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.427221 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3056  MarR family transcriptional regulator  53.62 
 
 
168 aa  136  7.999999999999999e-32  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1742  MarR family transcriptional regulator  52.24 
 
 
149 aa  136  1e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4364  MarR family transcriptional regulator  46.43 
 
 
150 aa  136  1e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4200  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  46.43 
 
 
150 aa  136  1e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4211  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  46.43 
 
 
150 aa  136  1e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.151141  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4699  MarR family transcriptional regulator  46.43 
 
 
150 aa  136  1e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4554  transcriptional regulator, MarR family  46.43 
 
 
150 aa  136  1e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>