More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_1936 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_1936  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 		 155 aa  306  1.0000000000000001e-82  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.13089 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0835  transcriptional regulator, MarR family protein  54.81 
 
 		 150 aa  148  3e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3873  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  58.27 
 
 		 141 aa  148  3e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0504878 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0960  MarR family transcriptional regulator  57.86 
 
 		 146 aa  145  3e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.305429  normal  0.461467 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0021  MarR family transcriptional regulator  58.99 
 
 		 178 aa  144  4.0000000000000006e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0934  MarR family transcriptional regulator  53.33 
 
 		 163 aa  144  5e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2950  transcriptional regulator, MarR family  50.34 
 
 		 149 aa  142  1e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2803  transcriptional regulator, MarR family  55.73 
 
 		 170 aa  142  2e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5144  MarR family transcriptional regulator  56.72 
 
 		 156 aa  142  2e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1328  transcriptional regulator, MarR family  49.66 
 
 		 149 aa  142  2e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3331  MarR family transcriptional regulator  52.59 
 
 		 155 aa  141  4e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.376124  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1203  transcriptional regulator, TrmB  55.04 
 
 		 146 aa  140  6e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.529625  normal  0.0362733 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0129  MarR family transcriptional regulator  58.97 
 
 		 154 aa  140  7e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1176  transcriptional regulator, TrmB  55.04 
 
 		 146 aa  140  8e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.713709  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1193  transcriptional regulator, TrmB  55.04 
 
 		 146 aa  140  8e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3619  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  52.45 
 
 		 162 aa  140  9e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0815  MarR family transcriptional regulator  50.68 
 
 		 165 aa  139  9.999999999999999e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000550088 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0578  transcriptional regulator, MarR family protein  51.91 
 
 		 163 aa  139  9.999999999999999e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0519  transcriptional regulator, MarR family  52.94 
 
 		 157 aa  138  1.9999999999999998e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1742  MarR family transcriptional regulator  53.19 
 
 		 149 aa  138  1.9999999999999998e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2251  MarR family transcriptional regulator  55.28 
 
 		 145 aa  138  3e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.344689  normal  0.255238 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0519  MarR family transcriptional regulator  55.65 
 
 		 150 aa  137  7e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00587381 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03887  transcriptional regulator MarR family  50.35 
 
 		 152 aa  137  7e-32  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5560  MarR family transcriptional regulator  52.82 
 
 		 170 aa  136  8.999999999999999e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.813118  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2452  transcriptional regulator, MarR family  49.65 
 
 		 154 aa  136  1e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.126734  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2137  transcriptional regulator, MarR family  48.25 
 
 		 154 aa  136  1e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.727084 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1134  MarR family transcriptional regulator  53.28 
 
 		 144 aa  135  1e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3311  MarR family transcriptional regulator  49.32 
 
 		 165 aa  136  1e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3291  MarR family transcriptional regulator  48.53 
 
 		 152 aa  135  2e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.570613  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4792  transcriptional regulator, MarR family  52.21 
 
 		 147 aa  135  2e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0729618  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0401  transcriptional regulator, MarR family  52.27 
 
 		 156 aa  135  2e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3208  MarR family transcriptional regulator  49.32 
 
 		 165 aa  135  2e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.469767 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3498  MarR family transcriptional regulator  53.38 
 
 		 165 aa  135  3.0000000000000003e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0866  MarR family transcriptional regulator  54.47 
 
 		 165 aa  134  3.0000000000000003e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1196  MarR family transcriptional regulator  56.06 
 
 		 155 aa  135  3.0000000000000003e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3426  transcriptional regulator, MarR family  54.47 
 
 		 165 aa  134  3.0000000000000003e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2174  regulatory protein MarR  48.94 
 
 		 154 aa  134  4e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.363681 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3415  MarR family transcriptional regulator  51.01 
 
 		 149 aa  134  4e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0058743 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1524  MarR family transcriptional regulator  51.82 
 
 		 149 aa  134  4e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.26569  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0050  transcriptional regulator, MarR family  55.56 
 
 		 164 aa  133  7.000000000000001e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00479818 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0880  regulatory protein, MarR  47.62 
 
 		 162 aa  133  8e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2313  MarR family transcriptional regulator  45.39 
 
 		 147 aa  133  8e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.708353  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0830  MarR family transcriptional regulator  47.83 
 
 		 151 aa  133  9.999999999999999e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0977  MarR family transcriptional regulator  54.62 
 
 		 165 aa  132  9.999999999999999e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0573  MarR family transcriptional regulator  54.69 
 
 		 151 aa  133  9.999999999999999e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.256198  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1032  MarR family transcriptional regulator  48.85 
 
 		 143 aa  132  9.999999999999999e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.119572  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0232  MarR family transcriptional regulator  52.85 
 
 		 152 aa  132  9.999999999999999e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3621  MarR family transcriptional regulator  53.66 
 
 		 165 aa  133  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.597701 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3056  MarR family transcriptional regulator  52.85 
 
 		 168 aa  133  9.999999999999999e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0474  transcriptional regulator, MarR family  61.74 
 
 		 155 aa  132  1.9999999999999998e-30  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0886  MarR family transcriptional regulator  47.1 
 
 		 151 aa  132  3e-30  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2231  MarR family transcriptional regulator  54.78 
 
 		 150 aa  131  3e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.106154  normal  0.474897 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0483  MarR family transcriptional regulator  62.5 
 
 		 151 aa  131  3e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0397178 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1470  MarR family transcriptional regulator  52.9 
 
 		 151 aa  131  3e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3189  regulatory protein, MarR  52.17 
 
 		 144 aa  131  3.9999999999999996e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.637369 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1207  transcriptional regulator, MarR family  52.55 
 
 		 146 aa  131  3.9999999999999996e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000193075 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3854  MarR family transcriptional regulator  52.9 
 
 		 151 aa  130  5e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.113287  normal  0.119098 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3161  regulatory protein, MarR  54.55 
 
 		 158 aa  130  5e-30  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0336123  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0799  MarR family transcriptional regulator  49.65 
 
 		 161 aa  130  5e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0628  MarR family transcriptional regulator  55.04 
 
 		 144 aa  130  5e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1770  MarR family transcriptional regulator  52.38 
 
 		 155 aa  130  6.999999999999999e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3662  MarR family transcriptional regulator  54.78 
 
 		 150 aa  130  6.999999999999999e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.485543  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4499  MarR family transcriptional regulator  54.78 
 
 		 150 aa  130  6.999999999999999e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.148368  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3865  MarR family transcriptional regulator  54.78 
 
 		 150 aa  130  6.999999999999999e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0792032  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1966  transcriptional regulator, MarR family  49.66 
 
 		 151 aa  129  1.0000000000000001e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000123545  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1208  MarR family transcriptional regulator  48.09 
 
 		 143 aa  129  1.0000000000000001e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0011677  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2629  MarR family transcriptional regulator  49.64 
 
 		 160 aa  128  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.8863  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0623  MarR family transcriptional regulator  54.78 
 
 		 151 aa  128  2.0000000000000002e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3233  MarR family transcriptional regulator  53.91 
 
 		 150 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.550723  normal  0.0343876 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32610  transcriptional regulator  47.14 
 
 		 166 aa  128  3e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0590673  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15300  transcriptional regulator, MarR family  49.32 
 
 		 162 aa  128  3e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.408936  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3762  MarR family transcriptional regulator  53.91 
 
 		 150 aa  128  3e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.425599  hitchhiker  0.00135953 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1860  MarR family transcriptional regulator  55.2 
 
 		 151 aa  127  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20780  transcriptional regulator, MarR family  46.85 
 
 		 152 aa  127  5.0000000000000004e-29  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04763  hypothetical protein  48.87 
 
 		 143 aa  127  6e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1435  MarR family transcriptional regulator  55.08 
 
 		 151 aa  127  6e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.209441 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27230  MarR family transcriptional regulator  57.26 
 
 		 151 aa  127  6e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4766  transcriptional regulator, MarR family  46.51 
 
 		 166 aa  127  6e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.462626  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1641  transcriptional regulator, MarR family  53.45 
 
 		 157 aa  127  8.000000000000001e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.176874  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3626  regulatory protein, MarR  51.15 
 
 		 157 aa  126  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.0000000021465  normal  0.0936579 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1113  transcriptional regulator, TrmB  60.36 
 
 		 167 aa  126  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3996  MarR family transcriptional regulator  51.94 
 
 		 154 aa  126  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000674162  normal  0.401287 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6797  transcriptional regulator, MarR family  53.91 
 
 		 150 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000341321  decreased coverage  0.0000000109708 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4603  transcriptional regulator, MarR family  44.83 
 
 		 150 aa  126  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.221434  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4966  transcriptional regulator, MarR family  57.39 
 
 		 153 aa  126  1.0000000000000001e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.345847  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2617  MarR family transcriptional regulator  47.95 
 
 		 160 aa  126  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.279233  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3668  transcriptional regulator, MarR family  48.97 
 
 		 147 aa  125  2.0000000000000002e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.400003  normal  0.620653 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0108  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  54.24 
 
 		 152 aa  125  2.0000000000000002e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.879191 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4745  transcriptional regulator, MarR family  48.97 
 
 		 147 aa  125  2.0000000000000002e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.427221 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0061  MarR family transcriptional regulator  47.14 
 
 		 171 aa  125  2.0000000000000002e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.310818 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001045  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  48.12 
 
 		 152 aa  125  2.0000000000000002e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02614  putative transcription regulator protein  59.26 
 
 		 153 aa  125  3e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.532202  normal  0.750512 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4364  MarR family transcriptional regulator  44.14 
 
 		 150 aa  125  3e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4200  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  44.14 
 
 		 150 aa  125  3e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4211  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  44.14 
 
 		 150 aa  125  3e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.151141  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4554  transcriptional regulator, MarR family  44.14 
 
 		 150 aa  124  3e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4699  MarR family transcriptional regulator  44.14 
 
 		 150 aa  125  3e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2578  MarR family transcriptional regulator  47.26 
 
 		 160 aa  124  3e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.856924  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4312  MarR family transcriptional regulator  44.14 
 
 		 150 aa  124  3e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06220  transcriptional regulator, MarR family  50.68 
 
 		 169 aa  124  3e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>