More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_0835 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_0835  transcriptional regulator, MarR family protein  100 
 
 		 150 aa  306  5e-83  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0934  MarR family transcriptional regulator  73.79 
 
 		 163 aa  225  2e-58  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0578  transcriptional regulator, MarR family protein  74.07 
 
 		 163 aa  217  3.9999999999999997e-56  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0815  MarR family transcriptional regulator  71.01 
 
 		 165 aa  213  9.999999999999999e-55  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000550088 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3311  MarR family transcriptional regulator  70.14 
 
 		 165 aa  211  1.9999999999999998e-54  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3498  MarR family transcriptional regulator  73.19 
 
 		 165 aa  210  5.999999999999999e-54  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3426  transcriptional regulator, MarR family  73.19 
 
 		 165 aa  210  5.999999999999999e-54  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0866  MarR family transcriptional regulator  73.19 
 
 		 165 aa  210  5.999999999999999e-54  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3621  MarR family transcriptional regulator  73.19 
 
 		 165 aa  210  5.999999999999999e-54  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.597701 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3208  MarR family transcriptional regulator  70.29 
 
 		 165 aa  208  2e-53  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.469767 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0977  MarR family transcriptional regulator  70.29 
 
 		 165 aa  206  6e-53  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0799  MarR family transcriptional regulator  70.29 
 
 		 161 aa  203  5e-52  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3056  MarR family transcriptional regulator  71.01 
 
 		 168 aa  202  1e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0628  MarR family transcriptional regulator  69.4 
 
 		 144 aa  199  7e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3161  regulatory protein, MarR  68.61 
 
 		 158 aa  193  9e-49  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0336123  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04763  hypothetical protein  60.28 
 
 		 143 aa  183  8e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001045  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  59.72 
 
 		 152 aa  182  2.0000000000000003e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0232  MarR family transcriptional regulator  60.14 
 
 		 152 aa  175  2e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2313  MarR family transcriptional regulator  56.12 
 
 		 147 aa  174  5e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.708353  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3331  MarR family transcriptional regulator  56.38 
 
 		 155 aa  169  1e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.376124  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5560  MarR family transcriptional regulator  55.3 
 
 		 170 aa  151  4e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.813118  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1936  transcriptional regulator, MarR family  54.81 
 
 		 155 aa  148  3e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.13089 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3291  MarR family transcriptional regulator  52.63 
 
 		 152 aa  147  6e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.570613  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2251  MarR family transcriptional regulator  49.3 
 
 		 145 aa  146  1.0000000000000001e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.344689  normal  0.255238 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1768  transcriptional regulator, MarR family  51.15 
 
 		 157 aa  142  1e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4410  MarR family transcriptional regulator  46.62 
 
 		 176 aa  141  3e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20780  transcriptional regulator, MarR family  47.97 
 
 		 152 aa  140  6e-33  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0960  MarR family transcriptional regulator  52.48 
 
 		 146 aa  140  7e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.305429  normal  0.461467 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4766  transcriptional regulator, MarR family  49.63 
 
 		 166 aa  139  9e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.462626  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21070  transcriptional regulator  51.09 
 
 		 143 aa  139  9e-33  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3626  regulatory protein, MarR  51.15 
 
 		 157 aa  139  9e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.0000000021465  normal  0.0936579 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0886  MarR family transcriptional regulator  45.95 
 
 		 151 aa  139  1.9999999999999998e-32  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0830  MarR family transcriptional regulator  45.95 
 
 		 151 aa  139  1.9999999999999998e-32  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03887  transcriptional regulator MarR family  51.88 
 
 		 152 aa  139  1.9999999999999998e-32  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2842  MarR family transcriptional regulator  48.12 
 
 		 150 aa  138  1.9999999999999998e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1208  MarR family transcriptional regulator  44.78 
 
 		 143 aa  138  1.9999999999999998e-32  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0011677  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1032  MarR family transcriptional regulator  44.78 
 
 		 143 aa  139  1.9999999999999998e-32  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.119572  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6797  transcriptional regulator, MarR family  48.87 
 
 		 150 aa  138  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000341321  decreased coverage  0.0000000109708 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3762  MarR family transcriptional regulator  48.2 
 
 		 150 aa  138  3e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.425599  hitchhiker  0.00135953 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2629  MarR family transcriptional regulator  52.21 
 
 		 160 aa  138  3e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.8863  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4499  MarR family transcriptional regulator  47.48 
 
 		 150 aa  138  3e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.148368  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3662  MarR family transcriptional regulator  47.48 
 
 		 150 aa  138  3e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.485543  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3233  MarR family transcriptional regulator  48.92 
 
 		 150 aa  138  3e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.550723  normal  0.0343876 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3865  MarR family transcriptional regulator  47.48 
 
 		 150 aa  138  3e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0792032  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1742  MarR family transcriptional regulator  50.76 
 
 		 149 aa  137  3.9999999999999997e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00880  transcriptional regulator, MarR family  57.66 
 
 		 148 aa  137  6e-32  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3619  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  52.59 
 
 		 162 aa  137  7e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0129  MarR family transcriptional regulator  50.78 
 
 		 154 aa  136  7.999999999999999e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4880  MarR family transcriptional regulator  47.48 
 
 		 157 aa  136  1e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.368926  hitchhiker  0.00140951 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1328  transcriptional regulator, MarR family  48.89 
 
 		 149 aa  136  1e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2306  putative transcriptional regulator  51.59 
 
 		 151 aa  135  2e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1306  MarR family transcriptional regulator  51.59 
 
 		 149 aa  135  2e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.335381  normal  0.344824 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0519  MarR family transcriptional regulator  50 
 
 		 150 aa  135  2e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00587381 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4256  MarR family transcriptional regulator  48.87 
 
 		 166 aa  135  2e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.973283 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2231  MarR family transcriptional regulator  46.76 
 
 		 150 aa  135  2e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.106154  normal  0.474897 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2562  MarR family transcriptional regulator  48.51 
 
 		 156 aa  134  3.0000000000000003e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2137  transcriptional regulator, MarR family  50 
 
 		 154 aa  134  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.727084 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1196  MarR family transcriptional regulator  51.52 
 
 		 155 aa  134  3.0000000000000003e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0057  MarR family transcriptional regulator  49.29 
 
 		 185 aa  134  3.0000000000000003e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.584189  normal  0.103539 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2950  transcriptional regulator, MarR family  48.89 
 
 		 149 aa  134  4e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4312  MarR family transcriptional regulator  43.97 
 
 		 150 aa  134  5e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0335  MarR family transcriptional regulator  49.61 
 
 		 158 aa  133  7.000000000000001e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.663008  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0862  MarR family transcriptional regulator  49.61 
 
 		 158 aa  133  7.000000000000001e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.182256  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2559  transcriptional regulator  49.61 
 
 		 150 aa  133  7.000000000000001e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.970675  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15300  transcriptional regulator, MarR family  51.11 
 
 		 162 aa  133  7.000000000000001e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.408936  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5144  MarR family transcriptional regulator  48.36 
 
 		 156 aa  133  7.000000000000001e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2422  MarR family transcriptional regulator  49.61 
 
 		 150 aa  133  9e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.934023  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1679  MarR family transcriptional regulator  49.61 
 
 		 150 aa  133  9e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0304  MarR family transcriptional regulator  49.61 
 
 		 150 aa  133  9e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0623  MarR family transcriptional regulator  52.27 
 
 		 151 aa  133  9e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1483  MarR family transcriptional regulator  49.61 
 
 		 150 aa  133  9e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.553037  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2005  MarR family transcriptional regulator  49.65 
 
 		 143 aa  132  9.999999999999999e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0108  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  56.48 
 
 		 152 aa  132  9.999999999999999e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.879191 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0401  transcriptional regulator, MarR family  50.78 
 
 		 156 aa  133  9.999999999999999e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1470  MarR family transcriptional regulator  48.51 
 
 		 151 aa  132  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3980  MarR family transcriptional regulator  47.92 
 
 		 153 aa  131  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.436486  normal  0.638371 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1203  transcriptional regulator, TrmB  50 
 
 		 146 aa  132  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.529625  normal  0.0362733 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2174  regulatory protein MarR  48.31 
 
 		 154 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.363681 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27230  MarR family transcriptional regulator  51.59 
 
 		 151 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2452  transcriptional regulator, MarR family  48.31 
 
 		 154 aa  131  3e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.126734  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0573  MarR family transcriptional regulator  48.89 
 
 		 151 aa  131  3e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.256198  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1176  transcriptional regulator, TrmB  50 
 
 		 146 aa  131  3e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.713709  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1193  transcriptional regulator, TrmB  50 
 
 		 146 aa  131  3e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2845  transcriptional regulator, MarR family  55.45 
 
 		 145 aa  131  3e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.648486  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0598  MarR family transcriptional regulator  49.61 
 
 		 267 aa  130  6e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0474  transcriptional regulator, MarR family  56.41 
 
 		 155 aa  130  6e-30  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2325  transcriptional regulator, MarR family  54.7 
 
 		 162 aa  130  6e-30  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0434242 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4585  transcriptional regulator, MarR family  44.85 
 
 		 150 aa  130  6e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3854  MarR family transcriptional regulator  47.76 
 
 		 151 aa  130  6.999999999999999e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.113287  normal  0.119098 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0519  transcriptional regulator, MarR family  50.81 
 
 		 157 aa  129  9e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1808  MarR family transcriptional regulator  48.33 
 
 		 159 aa  129  1.0000000000000001e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4966  transcriptional regulator, MarR family  48.57 
 
 		 153 aa  129  1.0000000000000001e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.345847  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0483  MarR family transcriptional regulator  58.33 
 
 		 151 aa  129  1.0000000000000001e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0397178 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2661  MarR family transcriptional regulator  49.12 
 
 		 145 aa  129  1.0000000000000001e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00131118  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1910  MarR family transcriptional regulator  51.56 
 
 		 152 aa  129  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0578168  normal  0.331204 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4745  transcriptional regulator, MarR family  50 
 
 		 147 aa  129  2.0000000000000002e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.427221 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4558  MarR family transcriptional regulator  44.78 
 
 		 150 aa  128  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3668  transcriptional regulator, MarR family  50 
 
 		 147 aa  129  2.0000000000000002e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.400003  normal  0.620653 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1189  transcriptional regulator MarR family  46.27 
 
 		 158 aa  129  2.0000000000000002e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.622384  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4271  MarR family transcriptional regulator  57.55 
 
 		 156 aa  129  2.0000000000000002e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0653897  normal  0.661065 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>