More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_1306 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_1306  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 149 aa  291  3e-78  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.335381  normal  0.344824 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3668  transcriptional regulator, MarR family  60.45 
 
 		 147 aa  159  1e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.400003  normal  0.620653 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4745  transcriptional regulator, MarR family  60.45 
 
 		 147 aa  159  1e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.427221 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5560  MarR family transcriptional regulator  57.53 
 
 		 170 aa  156  8e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.813118  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0021  MarR family transcriptional regulator  60.71 
 
 		 178 aa  154  4e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3291  MarR family transcriptional regulator  55.22 
 
 		 152 aa  153  9e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.570613  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3619  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  55.17 
 
 		 162 aa  152  2e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4766  transcriptional regulator, MarR family  55.17 
 
 		 166 aa  149  1e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.462626  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0960  MarR family transcriptional regulator  60.77 
 
 		 146 aa  148  2e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.305429  normal  0.461467 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0061  MarR family transcriptional regulator  56.82 
 
 		 171 aa  147  4e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.310818 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0830  MarR family transcriptional regulator  57.72 
 
 		 151 aa  145  1.0000000000000001e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0886  MarR family transcriptional regulator  58.54 
 
 		 151 aa  146  1.0000000000000001e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4792  transcriptional regulator, MarR family  57.81 
 
 		 147 aa  145  1.0000000000000001e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0729618  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03887  transcriptional regulator MarR family  55.94 
 
 		 152 aa  144  5e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001045  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  54.55 
 
 		 152 aa  144  6e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1203  transcriptional regulator, TrmB  56.82 
 
 		 146 aa  143  7.0000000000000006e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.529625  normal  0.0362733 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1134  MarR family transcriptional regulator  56.3 
 
 		 144 aa  143  7.0000000000000006e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0519  transcriptional regulator, MarR family  56.72 
 
 		 157 aa  143  9e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4271  MarR family transcriptional regulator  53.29 
 
 		 156 aa  142  1e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0653897  normal  0.661065 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4256  MarR family transcriptional regulator  56.06 
 
 		 166 aa  142  2e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.973283 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0623  MarR family transcriptional regulator  55.1 
 
 		 151 aa  142  2e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1328  transcriptional regulator, MarR family  55.64 
 
 		 149 aa  142  2e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1176  transcriptional regulator, TrmB  56.82 
 
 		 146 aa  142  2e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.713709  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1196  MarR family transcriptional regulator  56.16 
 
 		 155 aa  142  2e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0474  transcriptional regulator, MarR family  54.11 
 
 		 155 aa  142  2e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1193  transcriptional regulator, TrmB  56.82 
 
 		 146 aa  142  2e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0129  MarR family transcriptional regulator  53.52 
 
 		 154 aa  141  3e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2313  MarR family transcriptional regulator  50.4 
 
 		 147 aa  141  3e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.708353  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0815  MarR family transcriptional regulator  51.8 
 
 		 165 aa  140  5e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000550088 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3208  MarR family transcriptional regulator  52.52 
 
 		 165 aa  140  5e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.469767 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0483  MarR family transcriptional regulator  59.85 
 
 		 151 aa  140  5e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0397178 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2950  transcriptional regulator, MarR family  55.22 
 
 		 149 aa  140  6e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04763  hypothetical protein  55.65 
 
 		 143 aa  140  6e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1641  transcriptional regulator, MarR family  52.63 
 
 		 157 aa  139  9e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.176874  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2251  MarR family transcriptional regulator  53.57 
 
 		 145 aa  139  9.999999999999999e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.344689  normal  0.255238 
 
 
-
 
NC_003296  RS00814  putative transcription regulator protein  60.45 
 
 		 147 aa  139  9.999999999999999e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.335151  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0818  transcriptional regulator, MarR family  56.25 
 
 		 147 aa  139  9.999999999999999e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5817  MarR family transcriptional regulator  54.96 
 
 		 146 aa  139  1.9999999999999998e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.127726 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2325  transcriptional regulator, MarR family  53.49 
 
 		 162 aa  138  1.9999999999999998e-32  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0434242 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0866  MarR family transcriptional regulator  52.21 
 
 		 165 aa  138  3e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0628  MarR family transcriptional regulator  52.34 
 
 		 144 aa  138  3e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3426  transcriptional regulator, MarR family  52.21 
 
 		 165 aa  138  3e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2330  MarR family transcriptional regulator  53.59 
 
 		 163 aa  137  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.282714  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3311  MarR family transcriptional regulator  48.92 
 
 		 165 aa  137  3.9999999999999997e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2452  transcriptional regulator, MarR family  50.34 
 
 		 154 aa  137  4.999999999999999e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.126734  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0977  MarR family transcriptional regulator  53.73 
 
 		 165 aa  137  4.999999999999999e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0519  MarR family transcriptional regulator  55.28 
 
 		 150 aa  137  4.999999999999999e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00587381 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2174  regulatory protein MarR  50.34 
 
 		 154 aa  137  4.999999999999999e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.363681 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4410  MarR family transcriptional regulator  52.31 
 
 		 176 aa  137  4.999999999999999e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0578  transcriptional regulator, MarR family protein  51.97 
 
 		 163 aa  137  4.999999999999999e-32  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3498  MarR family transcriptional regulator  54.76 
 
 		 165 aa  137  4.999999999999999e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0401  transcriptional regulator, MarR family  52.45 
 
 		 156 aa  137  6e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27530  MarR family transcriptional regulator  53.59 
 
 		 163 aa  137  6e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.037283 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1113  transcriptional regulator, TrmB  53.33 
 
 		 167 aa  137  7e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3139  transcriptional regulator, MarR family  53.91 
 
 		 183 aa  136  8.999999999999999e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3056  MarR family transcriptional regulator  53.33 
 
 		 168 aa  136  8.999999999999999e-32  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1910  MarR family transcriptional regulator  60.66 
 
 		 152 aa  135  1e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0578168  normal  0.331204 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3621  MarR family transcriptional regulator  51.47 
 
 		 165 aa  136  1e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.597701 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0835  transcriptional regulator, MarR family protein  51.59 
 
 		 150 aa  135  2e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0200  transcriptional regulator, MarR family  53.91 
 
 		 159 aa  135  2e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6797  transcriptional regulator, MarR family  60.36 
 
 		 150 aa  135  2e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000341321  decreased coverage  0.0000000109708 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2845  transcriptional regulator, MarR family  58.33 
 
 		 145 aa  135  2e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.648486  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2137  transcriptional regulator, MarR family  48.28 
 
 		 154 aa  135  2e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.727084 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2472  MarR family transcriptional regulator  49.61 
 
 		 147 aa  135  2e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.161606  normal  0.735248 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5144  MarR family transcriptional regulator  53.15 
 
 		 156 aa  135  2e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1207  transcriptional regulator, MarR family  55.22 
 
 		 146 aa  134  3.0000000000000003e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000193075 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1742  MarR family transcriptional regulator  52.27 
 
 		 149 aa  134  4e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3444  transcriptional regulator, MarR family  56.06 
 
 		 153 aa  134  4e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3980  MarR family transcriptional regulator  54.42 
 
 		 153 aa  134  4e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.436486  normal  0.638371 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3097  transcriptional regulator, MarR family  56.06 
 
 		 153 aa  134  4e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4966  transcriptional regulator, MarR family  52.38 
 
 		 153 aa  134  5e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.345847  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3161  regulatory protein, MarR  54.84 
 
 		 158 aa  134  5e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0336123  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3141  transcriptional regulator, MarR family  54.81 
 
 		 146 aa  134  6.0000000000000005e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.566984  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2956  MarR family transcriptional regulator  51.39 
 
 		 153 aa  133  9e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.119179 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3331  MarR family transcriptional regulator  50 
 
 		 155 aa  132  9.999999999999999e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.376124  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2738  transcriptional regulator, MarR family  53.85 
 
 		 156 aa  131  1.9999999999999998e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.708856 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0880  regulatory protein, MarR  48.63 
 
 		 162 aa  132  1.9999999999999998e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0232  MarR family transcriptional regulator  49.65 
 
 		 152 aa  132  1.9999999999999998e-30  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1189  transcriptional regulator MarR family  52.27 
 
 		 158 aa  132  1.9999999999999998e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.622384  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2842  MarR family transcriptional regulator  59.46 
 
 		 150 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0799  MarR family transcriptional regulator  51.59 
 
 		 161 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0934  MarR family transcriptional regulator  51.59 
 
 		 163 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2151  MarR family transcriptional regulator  50.75 
 
 		 153 aa  131  3e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.680053 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2617  MarR family transcriptional regulator  49.66 
 
 		 160 aa  131  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.279233  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0573  MarR family transcriptional regulator  49.66 
 
 		 151 aa  131  3.9999999999999996e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.256198  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0050  transcriptional regulator, MarR family  55 
 
 		 164 aa  131  3.9999999999999996e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00479818 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1768  transcriptional regulator, MarR family  48.97 
 
 		 157 aa  130  6e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0813  transcriptional regulator, MarR family  49.25 
 
 		 159 aa  130  6e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.800363  normal  0.25148 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0576  transcriptional regulator, TrmB  46.26 
 
 		 158 aa  130  6.999999999999999e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0950259  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0926  transcriptional regulator, MarR family  45.58 
 
 		 158 aa  129  9e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.493079  normal  0.487426 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1770  MarR family transcriptional regulator  54.23 
 
 		 155 aa  129  9e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0057  MarR family transcriptional regulator  61.32 
 
 		 185 aa  129  1.0000000000000001e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.584189  normal  0.103539 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1670  transcriptional regulator, MarR family  58.18 
 
 		 161 aa  129  2.0000000000000002e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.428433  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3996  MarR family transcriptional regulator  48.25 
 
 		 154 aa  128  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000674162  normal  0.401287 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2306  putative transcriptional regulator  51.11 
 
 		 151 aa  128  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20780  transcriptional regulator, MarR family  46.58 
 
 		 152 aa  128  2.0000000000000002e-29  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0649  transcriptional regulator, MarR family  49.59 
 
 		 150 aa  128  3e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2578  MarR family transcriptional regulator  48.3 
 
 		 160 aa  127  3e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.856924  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2623  MarR family transcriptional regulator  48.3 
 
 		 160 aa  127  3e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0922619  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4585  transcriptional regulator, MarR family  49.59 
 
 		 150 aa  127  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>