More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_2578 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008146  Mmcs_2578  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 160 aa  315  2e-85  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.856924  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2623  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 160 aa  315  2e-85  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0922619  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2617  MarR family transcriptional regulator  98.12 
 
 		 160 aa  310  5.999999999999999e-84  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.279233  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1910  MarR family transcriptional regulator  72.15 
 
 		 159 aa  226  1e-58  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.852737  normal  0.275089 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4823  MarR family transcriptional regulator  70.81 
 
 		 163 aa  225  2e-58  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.477223  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0200  transcriptional regulator, MarR family  66.46 
 
 		 159 aa  205  3e-52  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4585  regulatory protein MarR  67.35 
 
 		 159 aa  185  3e-46  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1966  transcriptional regulator, MarR family  58.06 
 
 		 151 aa  172  1.9999999999999998e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000123545  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3738  transcriptional regulator, MarR family  60.54 
 
 		 153 aa  166  2e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000310515  hitchhiker  0.00461263 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3865  MarR family transcriptional regulator  62.76 
 
 		 148 aa  165  2.9999999999999998e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.115918  normal  0.0901138 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5382  transcriptional regulator, MarR family  61.22 
 
 		 157 aa  165  2.9999999999999998e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2803  transcriptional regulator, MarR family  59.03 
 
 		 170 aa  162  2.0000000000000002e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0880  regulatory protein, MarR  52.2 
 
 		 162 aa  152  2e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32610  transcriptional regulator  53.02 
 
 		 166 aa  145  3e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0590673  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0549  MarR family transcriptional regulator  50.65 
 
 		 167 aa  143  9e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0686  transcriptional regulator, MarR family  47.47 
 
 		 155 aa  140  9e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1134  MarR family transcriptional regulator  52.9 
 
 		 144 aa  136  8.999999999999999e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1742  MarR family transcriptional regulator  47.55 
 
 		 149 aa  134  7.000000000000001e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0799  MarR family transcriptional regulator  46.88 
 
 		 161 aa  132  9.999999999999999e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1207  transcriptional regulator, MarR family  53.62 
 
 		 146 aa  133  9.999999999999999e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000193075 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0578  transcriptional regulator, MarR family protein  45.89 
 
 		 163 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0108  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  49.37 
 
 		 152 aa  132  1.9999999999999998e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.879191 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3873  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  50.71 
 
 		 141 aa  130  9e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0504878 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1910  MarR family transcriptional regulator  46.21 
 
 		 152 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0578168  normal  0.331204 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2330  MarR family transcriptional regulator  49.26 
 
 		 163 aa  128  3e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.282714  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27530  MarR family transcriptional regulator  49.26 
 
 		 163 aa  128  3e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.037283 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1306  MarR family transcriptional regulator  48.3 
 
 		 149 aa  127  4.0000000000000003e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.335381  normal  0.344824 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3498  MarR family transcriptional regulator  49.65 
 
 		 165 aa  127  5.0000000000000004e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3426  transcriptional regulator, MarR family  49.65 
 
 		 165 aa  127  6e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0866  MarR family transcriptional regulator  49.65 
 
 		 165 aa  127  6e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3621  MarR family transcriptional regulator  48.94 
 
 		 165 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.597701 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0960  MarR family transcriptional regulator  51.41 
 
 		 146 aa  125  3e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.305429  normal  0.461467 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3189  regulatory protein, MarR  50.74 
 
 		 144 aa  124  4.0000000000000003e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.637369 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1936  transcriptional regulator, MarR family  47.26 
 
 		 155 aa  124  4.0000000000000003e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.13089 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3056  MarR family transcriptional regulator  48.91 
 
 		 168 aa  124  6e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4585  transcriptional regulator, MarR family  47.15 
 
 		 150 aa  124  6e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0628  MarR family transcriptional regulator  50.75 
 
 		 144 aa  124  7e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0835  transcriptional regulator, MarR family protein  47.1 
 
 		 150 aa  123  9e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1189  transcriptional regulator MarR family  48.57 
 
 		 158 aa  123  9e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.622384  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3415  MarR family transcriptional regulator  50 
 
 		 149 aa  122  1e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0058743 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03887  transcriptional regulator MarR family  47.89 
 
 		 152 aa  123  1e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0649  transcriptional regulator, MarR family  46.34 
 
 		 150 aa  122  2e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4312  MarR family transcriptional regulator  40.67 
 
 		 150 aa  122  2e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21070  transcriptional regulator  51.11 
 
 		 143 aa  122  2e-27  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001045  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  44.22 
 
 		 152 aa  122  2e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4364  MarR family transcriptional regulator  45.53 
 
 		 150 aa  121  4e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4200  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  45.53 
 
 		 150 aa  121  4e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4211  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  45.53 
 
 		 150 aa  121  4e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.151141  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4792  transcriptional regulator, MarR family  48.87 
 
 		 147 aa  121  4e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0729618  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4603  transcriptional regulator, MarR family  45.53 
 
 		 150 aa  121  4e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.221434  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4699  MarR family transcriptional regulator  45.53 
 
 		 150 aa  121  4e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06220  transcriptional regulator, MarR family  49.3 
 
 		 169 aa  121  4e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4554  transcriptional regulator, MarR family  45.53 
 
 		 150 aa  121  5e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1203  transcriptional regulator, TrmB  45.32 
 
 		 146 aa  120  6e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.529625  normal  0.0362733 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0129  MarR family transcriptional regulator  48.91 
 
 		 154 aa  120  6e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0934  MarR family transcriptional regulator  47.29 
 
 		 163 aa  120  7e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3980  MarR family transcriptional regulator  45.32 
 
 		 153 aa  120  8e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.436486  normal  0.638371 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3161  regulatory protein, MarR  47.89 
 
 		 158 aa  120  8e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0336123  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4880  MarR family transcriptional regulator  45.71 
 
 		 157 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.368926  hitchhiker  0.00140951 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3854  MarR family transcriptional regulator  41.83 
 
 		 151 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.113287  normal  0.119098 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4558  MarR family transcriptional regulator  44.72 
 
 		 150 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3668  transcriptional regulator, MarR family  47.29 
 
 		 147 aa  119  1.9999999999999998e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.400003  normal  0.620653 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4745  transcriptional regulator, MarR family  47.29 
 
 		 147 aa  119  1.9999999999999998e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.427221 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1176  transcriptional regulator, TrmB  45.32 
 
 		 146 aa  119  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.713709  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1193  transcriptional regulator, TrmB  45.32 
 
 		 146 aa  119  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04763  hypothetical protein  45.07 
 
 		 143 aa  118  3e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0815  MarR family transcriptional regulator  45.71 
 
 		 165 aa  118  3e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000550088 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0232  MarR family transcriptional regulator  45.27 
 
 		 152 aa  118  3.9999999999999996e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1470  MarR family transcriptional regulator  41.83 
 
 		 151 aa  117  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0050  transcriptional regulator, MarR family  47.22 
 
 		 164 aa  117  4.9999999999999996e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00479818 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4499  MarR family transcriptional regulator  45 
 
 		 150 aa  117  7e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.148368  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3662  MarR family transcriptional regulator  45 
 
 		 150 aa  117  7e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.485543  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3865  MarR family transcriptional regulator  45 
 
 		 150 aa  117  7e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0792032  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4256  MarR family transcriptional regulator  44.52 
 
 		 166 aa  117  7.999999999999999e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.973283 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2325  transcriptional regulator, MarR family  47.83 
 
 		 162 aa  117  9e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0434242 
 
 
-
 
NC_003296  RS02614  putative transcription regulator protein  47.65 
 
 		 153 aa  116  9.999999999999999e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.532202  normal  0.750512 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2452  transcriptional regulator, MarR family  42.18 
 
 		 154 aa  116  9.999999999999999e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.126734  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5560  MarR family transcriptional regulator  43.14 
 
 		 170 aa  116  9.999999999999999e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.813118  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1113  transcriptional regulator, TrmB  43.57 
 
 		 167 aa  116  9.999999999999999e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2174  regulatory protein MarR  45.38 
 
 		 154 aa  116  9.999999999999999e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.363681 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3311  MarR family transcriptional regulator  46.97 
 
 		 165 aa  116  9.999999999999999e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20780  transcriptional regulator, MarR family  45.16 
 
 		 152 aa  115  1.9999999999999998e-25  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2231  MarR family transcriptional regulator  45 
 
 		 150 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.106154  normal  0.474897 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3331  MarR family transcriptional regulator  42.38 
 
 		 155 aa  115  3e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.376124  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0977  MarR family transcriptional regulator  48.46 
 
 		 165 aa  115  3e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1770  MarR family transcriptional regulator  52.94 
 
 		 155 aa  115  3e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2137  transcriptional regulator, MarR family  43.85 
 
 		 154 aa  115  3e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.727084 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2251  MarR family transcriptional regulator  45.32 
 
 		 145 aa  115  3e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.344689  normal  0.255238 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3208  MarR family transcriptional regulator  46.21 
 
 		 165 aa  115  3e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.469767 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0057  MarR family transcriptional regulator  49.63 
 
 		 185 aa  115  3e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.584189  normal  0.103539 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2151  MarR family transcriptional regulator  44.78 
 
 		 153 aa  114  5e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.680053 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0133  regulatory protein MarR  51.08 
 
 		 168 aa  114  5e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6797  transcriptional regulator, MarR family  45.65 
 
 		 150 aa  114  6e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000341321  decreased coverage  0.0000000109708 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3619  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  41.77 
 
 		 162 aa  114  6e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1328  transcriptional regulator, MarR family  45.59 
 
 		 149 aa  114  6e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1860  MarR family transcriptional regulator  44.7 
 
 		 151 aa  114  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3233  MarR family transcriptional regulator  44.29 
 
 		 150 aa  114  6.9999999999999995e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.550723  normal  0.0343876 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0401  transcriptional regulator, MarR family  49.17 
 
 		 156 aa  114  7.999999999999999e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3762  MarR family transcriptional regulator  43.05 
 
 		 150 aa  114  7.999999999999999e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.425599  hitchhiker  0.00135953 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2313  MarR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 147 aa  113  8.999999999999998e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.708353  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>