More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_0818 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_0818  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 		 147 aa  296  6e-80  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3139  transcriptional regulator, MarR family  74.83 
 
 		 183 aa  221  2e-57  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5817  MarR family transcriptional regulator  76.81 
 
 		 146 aa  219  9.999999999999999e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.127726 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2472  MarR family transcriptional regulator  63.5 
 
 		 147 aa  185  2e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.161606  normal  0.735248 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2768  MarR family transcriptional regulator  61.43 
 
 		 143 aa  172  9.999999999999999e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1306  MarR family transcriptional regulator  56.25 
 
 		 149 aa  139  9.999999999999999e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.335381  normal  0.344824 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5560  MarR family transcriptional regulator  52 
 
 		 170 aa  126  9.000000000000001e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.813118  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0021  MarR family transcriptional regulator  55.36 
 
 		 178 aa  126  1.0000000000000001e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3668  transcriptional regulator, MarR family  55.36 
 
 		 147 aa  125  2.0000000000000002e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.400003  normal  0.620653 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1189  transcriptional regulator MarR family  50.39 
 
 		 158 aa  125  2.0000000000000002e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.622384  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4745  transcriptional regulator, MarR family  55.36 
 
 		 147 aa  125  2.0000000000000002e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.427221 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3619  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  50.4 
 
 		 162 aa  123  9e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4792  transcriptional regulator, MarR family  50.4 
 
 		 147 aa  120  4e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0729618  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2174  regulatory protein MarR  45.24 
 
 		 154 aa  119  9.999999999999999e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.363681 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5144  MarR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 156 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2452  transcriptional regulator, MarR family  45.24 
 
 		 154 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.126734  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1203  transcriptional regulator, TrmB  50.39 
 
 		 146 aa  119  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.529625  normal  0.0362733 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0483  MarR family transcriptional regulator  51.52 
 
 		 151 aa  118  1.9999999999999998e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0397178 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0830  MarR family transcriptional regulator  45.65 
 
 		 151 aa  118  3e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2137  transcriptional regulator, MarR family  44.44 
 
 		 154 aa  118  3e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.727084 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1176  transcriptional regulator, TrmB  50.39 
 
 		 146 aa  117  4.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.713709  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1193  transcriptional regulator, TrmB  50.39 
 
 		 146 aa  117  4.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0474  transcriptional regulator, MarR family  51.52 
 
 		 155 aa  117  6e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03887  transcriptional regulator MarR family  47.33 
 
 		 152 aa  117  6e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0886  MarR family transcriptional regulator  45.65 
 
 		 151 aa  117  7e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0960  MarR family transcriptional regulator  47.73 
 
 		 146 aa  116  9e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.305429  normal  0.461467 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3291  MarR family transcriptional regulator  47.58 
 
 		 152 aa  115  9.999999999999999e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.570613  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1134  MarR family transcriptional regulator  48.8 
 
 		 144 aa  116  9.999999999999999e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4766  transcriptional regulator, MarR family  45.31 
 
 		 166 aa  116  9.999999999999999e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.462626  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0108  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  53.77 
 
 		 152 aa  115  1.9999999999999998e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.879191 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4966  transcriptional regulator, MarR family  46.76 
 
 		 153 aa  115  1.9999999999999998e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.345847  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1207  transcriptional regulator, MarR family  48.03 
 
 		 146 aa  115  1.9999999999999998e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000193075 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3141  transcriptional regulator, MarR family  48.39 
 
 		 146 aa  115  1.9999999999999998e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.566984  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4271  MarR family transcriptional regulator  47.01 
 
 		 156 aa  115  1.9999999999999998e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0653897  normal  0.661065 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1113  transcriptional regulator, TrmB  46.09 
 
 		 167 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1808  MarR family transcriptional regulator  49.54 
 
 		 159 aa  115  3e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4256  MarR family transcriptional regulator  46.09 
 
 		 166 aa  114  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.973283 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2151  MarR family transcriptional regulator  44.53 
 
 		 153 aa  113  8.999999999999998e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.680053 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0057  MarR family transcriptional regulator  48.03 
 
 		 185 aa  113  1.0000000000000001e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.584189  normal  0.103539 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0576  transcriptional regulator, TrmB  42.97 
 
 		 158 aa  113  1.0000000000000001e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0950259  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2251  MarR family transcriptional regulator  45.31 
 
 		 145 aa  112  2.0000000000000002e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.344689  normal  0.255238 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0623  MarR family transcriptional regulator  53.98 
 
 		 151 aa  112  2.0000000000000002e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1196  MarR family transcriptional regulator  48.8 
 
 		 155 aa  112  2.0000000000000002e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15300  transcriptional regulator, MarR family  48.03 
 
 		 162 aa  111  3e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.408936  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2325  transcriptional regulator, MarR family  44.88 
 
 		 162 aa  111  4.0000000000000004e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0434242 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2950  transcriptional regulator, MarR family  49.62 
 
 		 149 aa  110  5e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0050  transcriptional regulator, MarR family  48.39 
 
 		 164 aa  110  5e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00479818 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1328  transcriptional regulator, MarR family  48.39 
 
 		 149 aa  110  6e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2842  MarR family transcriptional regulator  47.01 
 
 		 150 aa  110  6e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6797  transcriptional regulator, MarR family  46.27 
 
 		 150 aa  110  9e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000341321  decreased coverage  0.0000000109708 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3161  regulatory protein, MarR  50 
 
 		 158 aa  109  1.0000000000000001e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0336123  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0578  transcriptional regulator, MarR family protein  45.53 
 
 		 163 aa  109  1.0000000000000001e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1641  transcriptional regulator, MarR family  44.27 
 
 		 157 aa  109  2.0000000000000002e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.176874  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2928  MarR family transcriptional regulator  42.19 
 
 		 143 aa  108  2.0000000000000002e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.442252 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1966  transcriptional regulator, MarR family  47.2 
 
 		 151 aa  108  3e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000123545  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3626  regulatory protein, MarR  42.47 
 
 		 157 aa  107  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.0000000021465  normal  0.0936579 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3592  MarR family transcriptional regulator  45.32 
 
 		 153 aa  107  4.0000000000000004e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.568766 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0926  transcriptional regulator, MarR family  43.2 
 
 		 158 aa  107  4.0000000000000004e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.493079  normal  0.487426 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27230  MarR family transcriptional regulator  47.54 
 
 		 151 aa  107  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2483  transcriptional regulator, MarR family  43.75 
 
 		 156 aa  107  4.0000000000000004e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.758038  normal  0.560924 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3189  regulatory protein, MarR  45.45 
 
 		 144 aa  107  4.0000000000000004e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.637369 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3498  MarR family transcriptional regulator  55.67 
 
 		 165 aa  107  5e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0866  MarR family transcriptional regulator  55.67 
 
 		 165 aa  107  5e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3426  transcriptional regulator, MarR family  55.67 
 
 		 165 aa  107  5e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21070  transcriptional regulator  52.34 
 
 		 143 aa  107  6e-23  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0813  transcriptional regulator, MarR family  44 
 
 		 159 aa  107  6e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.800363  normal  0.25148 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1910  MarR family transcriptional regulator  48.41 
 
 		 152 aa  107  6e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0578168  normal  0.331204 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3208  MarR family transcriptional regulator  52.58 
 
 		 165 aa  107  7.000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.469767 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3311  MarR family transcriptional regulator  52.58 
 
 		 165 aa  107  7.000000000000001e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0815  MarR family transcriptional regulator  52.58 
 
 		 165 aa  107  8.000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000550088 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0573  MarR family transcriptional regulator  50 
 
 		 151 aa  106  9.000000000000001e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.256198  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3331  MarR family transcriptional regulator  44.26 
 
 		 155 aa  106  1e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.376124  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4635  MarR family transcriptional regulator  47.58 
 
 		 153 aa  106  1e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.472747  normal  0.0529683 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2306  putative transcriptional regulator  47.54 
 
 		 151 aa  106  1e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0628  MarR family transcriptional regulator  47.5 
 
 		 144 aa  106  1e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4585  regulatory protein MarR  45.16 
 
 		 159 aa  106  1e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0977  MarR family transcriptional regulator  52.58 
 
 		 165 aa  105  2e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3415  MarR family transcriptional regulator  43.94 
 
 		 149 aa  105  2e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0058743 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0880  regulatory protein, MarR  42.86 
 
 		 162 aa  105  2e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0799  MarR family transcriptional regulator  49.56 
 
 		 161 aa  105  2e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2738  transcriptional regulator, MarR family  42.19 
 
 		 156 aa  105  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.708856 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0061  MarR family transcriptional regulator  44.03 
 
 		 171 aa  105  2e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.310818 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0200  transcriptional regulator, MarR family  47.17 
 
 		 159 aa  105  2e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3621  MarR family transcriptional regulator  54.64 
 
 		 165 aa  105  2e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.597701 
 
 
-
 
NC_003296  RS00814  putative transcription regulator protein  51.97 
 
 		 147 aa  104  3e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.335151  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4410  MarR family transcriptional regulator  44 
 
 		 176 aa  105  3e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0401  transcriptional regulator, MarR family  47.33 
 
 		 156 aa  104  3e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0835  transcriptional regulator, MarR family protein  40.58 
 
 		 150 aa  105  3e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0519  MarR family transcriptional regulator  44.74 
 
 		 150 aa  104  4e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00587381 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0129  MarR family transcriptional regulator  44.35 
 
 		 154 aa  104  4e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0519  transcriptional regulator, MarR family  45.16 
 
 		 157 aa  104  4e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1768  transcriptional regulator, MarR family  45.9 
 
 		 157 aa  104  5e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3240  MarR family transcriptional regulator  40.15 
 
 		 158 aa  104  5e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.715513  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1742  MarR family transcriptional regulator  47.79 
 
 		 149 aa  104  5e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4558  MarR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 150 aa  103  7e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32610  transcriptional regulator  44.44 
 
 		 166 aa  103  7e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0590673  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1470  MarR family transcriptional regulator  44.12 
 
 		 151 aa  103  7e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2661  MarR family transcriptional regulator  41.59 
 
 		 145 aa  103  7e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00131118  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2842  MarR family transcriptional regulator  44.8 
 
 		 154 aa  103  8e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3980  MarR family transcriptional regulator  44.06 
 
 		 153 aa  103  8e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.436486  normal  0.638371 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>