More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_3139 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012912  Dd1591_3139  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 		 183 aa  379  1e-104  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0818  transcriptional regulator, MarR family  74.83 
 
 		 147 aa  221  3e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5817  MarR family transcriptional regulator  70.29 
 
 		 146 aa  202  2e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.127726 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2472  MarR family transcriptional regulator  62.41 
 
 		 147 aa  181  6e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.161606  normal  0.735248 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2768  MarR family transcriptional regulator  59.86 
 
 		 143 aa  169  2e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1306  MarR family transcriptional regulator  53.91 
 
 		 149 aa  136  1e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.335381  normal  0.344824 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0576  transcriptional regulator, TrmB  44.2 
 
 		 158 aa  126  2.0000000000000002e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0950259  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1134  MarR family transcriptional regulator  48.8 
 
 		 144 aa  121  5e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4766  transcriptional regulator, MarR family  46.38 
 
 		 166 aa  121  6e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.462626  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5560  MarR family transcriptional regulator  49.61 
 
 		 170 aa  120  9e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.813118  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4256  MarR family transcriptional regulator  44.29 
 
 		 166 aa  119  3e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.973283 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1189  transcriptional regulator MarR family  48.12 
 
 		 158 aa  118  3.9999999999999996e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.622384  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0623  MarR family transcriptional regulator  49.23 
 
 		 151 aa  118  4.9999999999999996e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1207  transcriptional regulator, MarR family  47.24 
 
 		 146 aa  117  9.999999999999999e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000193075 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4271  MarR family transcriptional regulator  47.41 
 
 		 156 aa  117  9.999999999999999e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0653897  normal  0.661065 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3291  MarR family transcriptional regulator  50.83 
 
 		 152 aa  116  1.9999999999999998e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.570613  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0108  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  45 
 
 		 152 aa  116  1.9999999999999998e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.879191 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1670  transcriptional regulator, MarR family  46.83 
 
 		 161 aa  115  1.9999999999999998e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.428433  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0960  MarR family transcriptional regulator  45.8 
 
 		 146 aa  115  3e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.305429  normal  0.461467 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3668  transcriptional regulator, MarR family  46.46 
 
 		 147 aa  115  3e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.400003  normal  0.620653 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4966  transcriptional regulator, MarR family  48.39 
 
 		 153 aa  115  3e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.345847  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4745  transcriptional regulator, MarR family  46.46 
 
 		 147 aa  115  3e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.427221 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3619  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  48.03 
 
 		 162 aa  114  6.9999999999999995e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4792  transcriptional regulator, MarR family  47.2 
 
 		 147 aa  114  1.0000000000000001e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0729618  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2174  regulatory protein MarR  43.08 
 
 		 154 aa  113  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.363681 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0886  MarR family transcriptional regulator  46.09 
 
 		 151 aa  113  2.0000000000000002e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5144  MarR family transcriptional regulator  46.09 
 
 		 156 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2452  transcriptional regulator, MarR family  43.08 
 
 		 154 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.126734  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0474  transcriptional regulator, MarR family  46.92 
 
 		 155 aa  112  3e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0830  MarR family transcriptional regulator  45.31 
 
 		 151 aa  112  3e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0483  MarR family transcriptional regulator  47.69 
 
 		 151 aa  112  3e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0397178 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2137  transcriptional regulator, MarR family  41.54 
 
 		 154 aa  111  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.727084 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0021  MarR family transcriptional regulator  44.88 
 
 		 178 aa  111  5e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1196  MarR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 155 aa  111  5e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1742  MarR family transcriptional regulator  45.97 
 
 		 149 aa  111  6e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2251  MarR family transcriptional regulator  47.33 
 
 		 145 aa  111  7.000000000000001e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.344689  normal  0.255238 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0926  transcriptional regulator, MarR family  40.6 
 
 		 158 aa  110  8.000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.493079  normal  0.487426 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1113  transcriptional regulator, TrmB  45.6 
 
 		 167 aa  110  8.000000000000001e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0813  transcriptional regulator, MarR family  41.35 
 
 		 159 aa  110  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.800363  normal  0.25148 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0057  MarR family transcriptional regulator  46.4 
 
 		 185 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.584189  normal  0.103539 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1641  transcriptional regulator, MarR family  45.6 
 
 		 157 aa  110  1.0000000000000001e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.176874  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2151  MarR family transcriptional regulator  42.97 
 
 		 153 aa  109  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.680053 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1203  transcriptional regulator, TrmB  47.97 
 
 		 146 aa  108  3e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.529625  normal  0.0362733 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1328  transcriptional regulator, MarR family  48.12 
 
 		 149 aa  109  3e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2845  transcriptional regulator, MarR family  44.03 
 
 		 145 aa  108  4.0000000000000004e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.648486  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2950  transcriptional regulator, MarR family  47.37 
 
 		 149 aa  108  6e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03887  transcriptional regulator MarR family  41.98 
 
 		 152 aa  107  9.000000000000001e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0573  MarR family transcriptional regulator  40 
 
 		 151 aa  107  1e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.256198  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1176  transcriptional regulator, TrmB  47.97 
 
 		 146 aa  107  1e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.713709  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0061  MarR family transcriptional regulator  44.03 
 
 		 171 aa  107  1e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.310818 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1193  transcriptional regulator, TrmB  47.97 
 
 		 146 aa  107  1e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6797  transcriptional regulator, MarR family  43.07 
 
 		 150 aa  105  2e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000341321  decreased coverage  0.0000000109708 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0519  transcriptional regulator, MarR family  44.35 
 
 		 157 aa  105  3e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3097  transcriptional regulator, MarR family  42.36 
 
 		 153 aa  105  4e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3444  transcriptional regulator, MarR family  42.36 
 
 		 153 aa  105  4e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2928  MarR family transcriptional regulator  40.48 
 
 		 143 aa  105  4e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.442252 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3415  MarR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 149 aa  105  4e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0058743 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0129  MarR family transcriptional regulator  41.54 
 
 		 154 aa  105  4e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02614  putative transcription regulator protein  41.73 
 
 		 153 aa  104  5e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.532202  normal  0.750512 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2842  MarR family transcriptional regulator  43.07 
 
 		 150 aa  105  5e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3189  regulatory protein, MarR  43.75 
 
 		 144 aa  104  6e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.637369 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0401  transcriptional regulator, MarR family  46.4 
 
 		 156 aa  104  9e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0519  MarR family transcriptional regulator  42.5 
 
 		 150 aa  103  1e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00587381 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2956  MarR family transcriptional regulator  44.09 
 
 		 153 aa  103  2e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.119179 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2738  transcriptional regulator, MarR family  41.22 
 
 		 156 aa  102  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.708856 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1808  MarR family transcriptional regulator  41.22 
 
 		 159 aa  102  2e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1966  transcriptional regulator, MarR family  42.86 
 
 		 151 aa  102  3e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000123545  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15300  transcriptional regulator, MarR family  44.88 
 
 		 162 aa  102  3e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.408936  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0578  transcriptional regulator, MarR family protein  43.8 
 
 		 163 aa  102  3e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2325  transcriptional regulator, MarR family  38.52 
 
 		 162 aa  102  3e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0434242 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0815  MarR family transcriptional regulator  52.04 
 
 		 165 aa  102  4e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000550088 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2280  MarR family transcriptional regulator  46.03 
 
 		 170 aa  101  5e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.421231  normal  0.627337 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3240  MarR family transcriptional regulator  38.93 
 
 		 158 aa  101  6e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.715513  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1910  MarR family transcriptional regulator  44.19 
 
 		 152 aa  101  7e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0578168  normal  0.331204 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3311  MarR family transcriptional regulator  52.04 
 
 		 165 aa  101  7e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0598  MarR family transcriptional regulator  42.52 
 
 		 267 aa  100  9e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4558  MarR family transcriptional regulator  36.92 
 
 		 150 aa  100  1e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4603  transcriptional regulator, MarR family  36.92 
 
 		 150 aa  100  1e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.221434  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0977  MarR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 165 aa  100  1e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4364  MarR family transcriptional regulator  36.92 
 
 		 150 aa  100  1e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4200  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  36.92 
 
 		 150 aa  100  1e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4211  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  36.92 
 
 		 150 aa  100  1e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.151141  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4699  MarR family transcriptional regulator  36.92 
 
 		 150 aa  100  1e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2629  MarR family transcriptional regulator  42.52 
 
 		 160 aa  100  1e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.8863  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5325  transcriptional regulator, MarR family  44.2 
 
 		 147 aa  100  1e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4554  transcriptional regulator, MarR family  36.92 
 
 		 150 aa  100  1e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3208  MarR family transcriptional regulator  52.04 
 
 		 165 aa  100  1e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.469767 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27230  MarR family transcriptional regulator  41.98 
 
 		 151 aa  100  1e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0705  MarR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 156 aa  100  1e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.186956  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4880  MarR family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 157 aa  99.4  2e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.368926  hitchhiker  0.00140951 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1768  transcriptional regulator, MarR family  43.55 
 
 		 157 aa  100  2e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4410  MarR family transcriptional regulator  42.4 
 
 		 176 aa  99.8  2e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0886  transcriptional regulator, MarR family  39.86 
 
 		 161 aa  99.4  2e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.541526  normal  0.759862 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2559  transcriptional regulator  41.41 
 
 		 150 aa  99  3e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.970675  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00814  putative transcription regulator protein  48.03 
 
 		 147 aa  99  3e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.335151  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3626  regulatory protein, MarR  42.52 
 
 		 157 aa  99  3e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.0000000021465  normal  0.0936579 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0880  regulatory protein, MarR  42.4 
 
 		 162 aa  99  3e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2231  MarR family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 150 aa  99.4  3e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.106154  normal  0.474897 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4585  regulatory protein MarR  42.74 
 
 		 159 aa  99  3e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2422  MarR family transcriptional regulator  41.41 
 
 		 150 aa  99  4e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.934023  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>