More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_04763 on replicon NC_009784
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009784  VIBHAR_04763  hypothetical protein  100 
 
 		 143 aa  290  5e-78  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001045  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  97.2 
 
 		 152 aa  281  2.0000000000000002e-75  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0232  MarR family transcriptional regulator  71.01 
 
 		 152 aa  203  6e-52  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0799  MarR family transcriptional regulator  68.66 
 
 		 161 aa  191  3e-48  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3056  MarR family transcriptional regulator  68.35 
 
 		 168 aa  190  7e-48  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0815  MarR family transcriptional regulator  65.47 
 
 		 165 aa  189  1e-47  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000550088 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0578  transcriptional regulator, MarR family protein  64.08 
 
 		 163 aa  188  2e-47  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3208  MarR family transcriptional regulator  66.19 
 
 		 165 aa  187  2.9999999999999997e-47  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.469767 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3331  MarR family transcriptional regulator  64.96 
 
 		 155 aa  186  1e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.376124  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3621  MarR family transcriptional regulator  66.19 
 
 		 165 aa  186  1e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.597701 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0866  MarR family transcriptional regulator  66.19 
 
 		 165 aa  185  2e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0977  MarR family transcriptional regulator  65.47 
 
 		 165 aa  185  2e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3426  transcriptional regulator, MarR family  66.19 
 
 		 165 aa  185  2e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3498  MarR family transcriptional regulator  66.19 
 
 		 165 aa  185  2e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3311  MarR family transcriptional regulator  64.03 
 
 		 165 aa  185  2e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0835  transcriptional regulator, MarR family protein  60.28 
 
 		 150 aa  183  8e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0934  MarR family transcriptional regulator  63.31 
 
 		 163 aa  181  4.0000000000000006e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0628  MarR family transcriptional regulator  64.93 
 
 		 144 aa  177  4e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2313  MarR family transcriptional regulator  56.03 
 
 		 147 aa  174  3e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.708353  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3161  regulatory protein, MarR  64.12 
 
 		 158 aa  169  1e-41  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0336123  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2661  MarR family transcriptional regulator  51.8 
 
 		 145 aa  150  4e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00131118  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00880  transcriptional regulator, MarR family  53.9 
 
 		 148 aa  150  5e-36  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1742  MarR family transcriptional regulator  51.08 
 
 		 149 aa  149  2e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3668  transcriptional regulator, MarR family  51.43 
 
 		 147 aa  145  1.0000000000000001e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.400003  normal  0.620653 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4745  transcriptional regulator, MarR family  51.43 
 
 		 147 aa  145  1.0000000000000001e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.427221 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0886  MarR family transcriptional regulator  50.71 
 
 		 151 aa  144  4.0000000000000006e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3291  MarR family transcriptional regulator  50 
 
 		 152 aa  144  4.0000000000000006e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.570613  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0830  MarR family transcriptional regulator  50.71 
 
 		 151 aa  144  5e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0129  MarR family transcriptional regulator  52.86 
 
 		 154 aa  143  9e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2231  MarR family transcriptional regulator  50.37 
 
 		 150 aa  142  1e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.106154  normal  0.474897 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2137  transcriptional regulator, MarR family  46.76 
 
 		 154 aa  143  1e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.727084 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0623  MarR family transcriptional regulator  52.27 
 
 		 151 aa  143  1e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5144  MarR family transcriptional regulator  49.65 
 
 		 156 aa  142  1e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2174  regulatory protein MarR  46.76 
 
 		 154 aa  141  3e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.363681 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20780  transcriptional regulator, MarR family  50.35 
 
 		 152 aa  140  4e-33  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4966  transcriptional regulator, MarR family  53.44 
 
 		 153 aa  140  4e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.345847  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2452  transcriptional regulator, MarR family  46.76 
 
 		 154 aa  141  4e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.126734  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1768  transcriptional regulator, MarR family  51.54 
 
 		 157 aa  140  5e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3662  MarR family transcriptional regulator  50.37 
 
 		 150 aa  140  5e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.485543  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4499  MarR family transcriptional regulator  50.37 
 
 		 150 aa  140  5e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.148368  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3865  MarR family transcriptional regulator  50.37 
 
 		 150 aa  140  5e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0792032  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1306  MarR family transcriptional regulator  55.65 
 
 		 149 aa  140  6e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.335381  normal  0.344824 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3762  MarR family transcriptional regulator  52.42 
 
 		 150 aa  140  7e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.425599  hitchhiker  0.00135953 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3233  MarR family transcriptional regulator  49.63 
 
 		 150 aa  140  8e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.550723  normal  0.0343876 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2251  MarR family transcriptional regulator  48.94 
 
 		 145 aa  139  9.999999999999999e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.344689  normal  0.255238 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1770  MarR family transcriptional regulator  51.45 
 
 		 155 aa  139  9.999999999999999e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4880  MarR family transcriptional regulator  50.37 
 
 		 157 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.368926  hitchhiker  0.00140951 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0861  transcriptional regulator, MarR family  56.45 
 
 		 161 aa  138  3e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.440211 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1208  MarR family transcriptional regulator  49.61 
 
 		 143 aa  138  3e-32  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0011677  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1032  MarR family transcriptional regulator  49.61 
 
 		 143 aa  138  3e-32  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.119572  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2950  transcriptional regulator, MarR family  50.38 
 
 		 149 aa  137  3e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0573  MarR family transcriptional regulator  53.08 
 
 		 151 aa  137  3.9999999999999997e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.256198  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0021  MarR family transcriptional regulator  49.65 
 
 		 178 aa  137  4.999999999999999e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1328  transcriptional regulator, MarR family  49.62 
 
 		 149 aa  137  4.999999999999999e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4766  transcriptional regulator, MarR family  55.75 
 
 		 166 aa  137  4.999999999999999e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.462626  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3626  regulatory protein, MarR  50.79 
 
 		 157 aa  137  6e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.0000000021465  normal  0.0936579 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0960  MarR family transcriptional regulator  52.76 
 
 		 146 aa  137  6e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.305429  normal  0.461467 
 
 
-
 
NC_003296  RS00814  putative transcription regulator protein  51.8 
 
 		 147 aa  136  1e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.335151  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3619  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  51.18 
 
 		 162 aa  135  1e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1196  MarR family transcriptional regulator  50.35 
 
 		 155 aa  136  1e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03887  transcriptional regulator MarR family  54.26 
 
 		 152 aa  135  1e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0886  transcriptional regulator, MarR family  51.43 
 
 		 161 aa  135  2e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.541526  normal  0.759862 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5560  MarR family transcriptional regulator  53.28 
 
 		 170 aa  135  2e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.813118  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0108  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  54.76 
 
 		 152 aa  135  2e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.879191 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0969  transcriptional regulator, MarR family  49.28 
 
 		 171 aa  135  2e-31  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000000635233  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0925  regulatory protein MarR  51.43 
 
 		 195 aa  135  2e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.101489  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4256  MarR family transcriptional regulator  54.87 
 
 		 166 aa  134  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.973283 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1966  transcriptional regulator, MarR family  52.8 
 
 		 151 aa  135  3.0000000000000003e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000123545  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4410  MarR family transcriptional regulator  46.38 
 
 		 176 aa  134  3.0000000000000003e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0649  transcriptional regulator, MarR family  53.51 
 
 		 150 aa  134  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0576  transcriptional regulator, TrmB  51.94 
 
 		 158 aa  134  4e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0950259  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0401  transcriptional regulator, MarR family  51.16 
 
 		 156 aa  134  5e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3141  transcriptional regulator, MarR family  50.72 
 
 		 146 aa  134  5e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.566984  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0598  MarR family transcriptional regulator  51.18 
 
 		 267 aa  134  5e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1641  transcriptional regulator, MarR family  52.34 
 
 		 157 aa  134  6.0000000000000005e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.176874  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4585  transcriptional regulator, MarR family  52.63 
 
 		 150 aa  133  8e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06220  transcriptional regulator, MarR family  49.29 
 
 		 169 aa  133  8e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0483  MarR family transcriptional regulator  56.52 
 
 		 151 aa  133  9e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0397178 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1203  transcriptional regulator, TrmB  49.26 
 
 		 146 aa  132  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.529625  normal  0.0362733 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2845  transcriptional regulator, MarR family  48.89 
 
 		 145 aa  133  9.999999999999999e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.648486  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0474  transcriptional regulator, MarR family  55.65 
 
 		 155 aa  132  9.999999999999999e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3444  transcriptional regulator, MarR family  51.8 
 
 		 153 aa  132  9.999999999999999e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4364  MarR family transcriptional regulator  51.75 
 
 		 150 aa  132  1.9999999999999998e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4200  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  51.75 
 
 		 150 aa  132  1.9999999999999998e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4211  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  51.75 
 
 		 150 aa  132  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.151141  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0304  MarR family transcriptional regulator  49.61 
 
 		 150 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2422  MarR family transcriptional regulator  49.61 
 
 		 150 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.934023  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0862  MarR family transcriptional regulator  49.61 
 
 		 158 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.182256  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2559  transcriptional regulator  49.61 
 
 		 150 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.970675  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4554  transcriptional regulator, MarR family  51.75 
 
 		 150 aa  132  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1483  MarR family transcriptional regulator  49.61 
 
 		 150 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.553037  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4699  MarR family transcriptional regulator  51.75 
 
 		 150 aa  132  1.9999999999999998e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0335  MarR family transcriptional regulator  49.61 
 
 		 158 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.663008  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1679  MarR family transcriptional regulator  49.61 
 
 		 150 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4558  MarR family transcriptional regulator  51.75 
 
 		 150 aa  131  3e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1435  MarR family transcriptional regulator  53.51 
 
 		 151 aa  131  3e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.209441 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2306  putative transcriptional regulator  46.56 
 
 		 151 aa  131  3e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1176  transcriptional regulator, TrmB  51.59 
 
 		 146 aa  131  3e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.713709  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27230  MarR family transcriptional regulator  47.33 
 
 		 151 aa  131  3e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1193  transcriptional regulator, TrmB  51.59 
 
 		 146 aa  131  3e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>