More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_3240 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007778  RPB_3240  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 
158 aa  319  9.999999999999999e-87  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.715513  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3178  MarR family transcriptional regulator  80.38 
 
 
154 aa  259  6.999999999999999e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.137994  normal  0.81725 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2483  transcriptional regulator, MarR family  64.08 
 
 
156 aa  193  6e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.758038  normal  0.560924 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2738  transcriptional regulator, MarR family  62.68 
 
 
156 aa  191  3e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.708856 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0061  MarR family transcriptional regulator  50.99 
 
 
171 aa  156  1e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.310818 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1670  transcriptional regulator, MarR family  50 
 
 
161 aa  153  7e-37  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.428433  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0474  transcriptional regulator, MarR family  51.32 
 
 
155 aa  149  2e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0483  MarR family transcriptional regulator  53.52 
 
 
151 aa  149  2e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0397178 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2845  transcriptional regulator, MarR family  48.15 
 
 
145 aa  145  2.0000000000000003e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.648486  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0519  transcriptional regulator, MarR family  52.7 
 
 
157 aa  144  4.0000000000000006e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4256  MarR family transcriptional regulator  47.06 
 
 
166 aa  141  3e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.973283 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0623  MarR family transcriptional regulator  47.95 
 
 
151 aa  141  4e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2137  transcriptional regulator, MarR family  44.08 
 
 
154 aa  140  9e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.727084 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4966  transcriptional regulator, MarR family  51.13 
 
 
153 aa  139  9.999999999999999e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.345847  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2174  regulatory protein MarR  44.74 
 
 
154 aa  139  9.999999999999999e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.363681 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2452  transcriptional regulator, MarR family  44.74 
 
 
154 aa  139  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.126734  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0573  MarR family transcriptional regulator  52.27 
 
 
151 aa  138  1.9999999999999998e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.256198  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2251  MarR family transcriptional regulator  49.26 
 
 
145 aa  139  1.9999999999999998e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.344689  normal  0.255238 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0401  transcriptional regulator, MarR family  48.99 
 
 
156 aa  138  3e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3141  transcriptional regulator, MarR family  47.76 
 
 
146 aa  138  3e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.566984  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4766  transcriptional regulator, MarR family  48.15 
 
 
166 aa  137  6e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.462626  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0108  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  55.83 
 
 
152 aa  137  7e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.879191 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0519  MarR family transcriptional regulator  55.74 
 
 
150 aa  137  7e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00587381 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0830  MarR family transcriptional regulator  49.63 
 
 
151 aa  136  8.999999999999999e-32  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1196  MarR family transcriptional regulator  48.97 
 
 
155 aa  137  8.999999999999999e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1742  MarR family transcriptional regulator  51.61 
 
 
149 aa  136  8.999999999999999e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4271  MarR family transcriptional regulator  47.48 
 
 
156 aa  136  1e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0653897  normal  0.661065 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0886  MarR family transcriptional regulator  49.63 
 
 
151 aa  135  2e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1328  transcriptional regulator, MarR family  52.31 
 
 
149 aa  135  2e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0057  MarR family transcriptional regulator  50.37 
 
 
185 aa  135  2e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.584189  normal  0.103539 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27230  MarR family transcriptional regulator  45.83 
 
 
151 aa  135  2e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5144  MarR family transcriptional regulator  46.94 
 
 
156 aa  135  2e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3291  MarR family transcriptional regulator  49.26 
 
 
152 aa  135  2e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.570613  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3426  transcriptional regulator, MarR family  50.37 
 
 
165 aa  135  3.0000000000000003e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2950  transcriptional regulator, MarR family  52.31 
 
 
149 aa  135  3.0000000000000003e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0866  MarR family transcriptional regulator  50.37 
 
 
165 aa  135  3.0000000000000003e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4792  transcriptional regulator, MarR family  49.65 
 
 
147 aa  135  3.0000000000000003e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0729618  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3498  MarR family transcriptional regulator  50.37 
 
 
165 aa  135  3.0000000000000003e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0129  MarR family transcriptional regulator  52.59 
 
 
154 aa  134  4e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1113  transcriptional regulator, TrmB  47.66 
 
 
167 aa  133  8e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0576  transcriptional regulator, TrmB  44.74 
 
 
158 aa  133  9.999999999999999e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0950259  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2956  MarR family transcriptional regulator  49.24 
 
 
153 aa  132  9.999999999999999e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.119179 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3621  MarR family transcriptional regulator  49.63 
 
 
165 aa  133  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.597701 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3668  transcriptional regulator, MarR family  51.54 
 
 
147 aa  132  1.9999999999999998e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.400003  normal  0.620653 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1641  transcriptional regulator, MarR family  49.26 
 
 
157 aa  132  1.9999999999999998e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.176874  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0815  MarR family transcriptional regulator  48.15 
 
 
165 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000550088 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3311  MarR family transcriptional regulator  47.41 
 
 
165 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4745  transcriptional regulator, MarR family  51.54 
 
 
147 aa  132  1.9999999999999998e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.427221 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2928  MarR family transcriptional regulator  46.43 
 
 
143 aa  131  3e-30  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.442252 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4137  transcriptional regulator, MarR family  46.1 
 
 
153 aa  131  3.9999999999999996e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3208  MarR family transcriptional regulator  48.15 
 
 
165 aa  131  3.9999999999999996e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.469767 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2280  MarR family transcriptional regulator  51.75 
 
 
170 aa  131  3.9999999999999996e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.421231  normal  0.627337 
 
 
-
 
NC_003296  RS02614  putative transcription regulator protein  50.77 
 
 
153 aa  130  6e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.532202  normal  0.750512 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3056  MarR family transcriptional regulator  51.91 
 
 
168 aa  130  6e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0050  transcriptional regulator, MarR family  48.18 
 
 
164 aa  130  6.999999999999999e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00479818 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2306  putative transcriptional regulator  44.44 
 
 
151 aa  130  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2151  MarR family transcriptional regulator  46.88 
 
 
153 aa  129  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.680053 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1219  MarR family transcriptional regulator  43.45 
 
 
151 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.318492  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1134  MarR family transcriptional regulator  46.72 
 
 
144 aa  129  1.0000000000000001e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1698  MarR family transcriptional regulator  43.45 
 
 
151 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.547698  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5560  MarR family transcriptional regulator  51.49 
 
 
170 aa  129  2.0000000000000002e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.813118  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5662  MarR family transcriptional regulator  43.38 
 
 
153 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.49927  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3619  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  49.62 
 
 
162 aa  129  2.0000000000000002e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0925  regulatory protein MarR  47.89 
 
 
195 aa  128  3e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.101489  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2325  transcriptional regulator, MarR family  45.26 
 
 
162 aa  128  3e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0434242 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0977  MarR family transcriptional regulator  47.41 
 
 
165 aa  127  4.0000000000000003e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3114  transcriptional regulator, MarR family  48.15 
 
 
145 aa  127  5.0000000000000004e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3444  transcriptional regulator, MarR family  49.25 
 
 
153 aa  127  6e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1189  transcriptional regulator MarR family  48.85 
 
 
158 aa  127  7.000000000000001e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.622384  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0886  transcriptional regulator, MarR family  48.91 
 
 
161 aa  127  7.000000000000001e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.541526  normal  0.759862 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1671  MarR family transcriptional regulator  43.06 
 
 
151 aa  127  7.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.787972  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3097  transcriptional regulator, MarR family  48.89 
 
 
153 aa  127  8.000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1768  transcriptional regulator, MarR family  44.44 
 
 
157 aa  127  8.000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03887  transcriptional regulator MarR family  51.49 
 
 
152 aa  127  8.000000000000001e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5325  transcriptional regulator, MarR family  50.36 
 
 
147 aa  126  9.000000000000001e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1207  transcriptional regulator, MarR family  46.38 
 
 
146 aa  126  1.0000000000000001e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000193075 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04763  hypothetical protein  48.51 
 
 
143 aa  126  1.0000000000000001e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1808  MarR family transcriptional regulator  46.53 
 
 
159 aa  125  2.0000000000000002e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1608  MarR family transcriptional regulator  43.26 
 
 
151 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.457422  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15300  transcriptional regulator, MarR family  45.19 
 
 
162 aa  124  5e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.408936  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0861  transcriptional regulator, MarR family  45.89 
 
 
161 aa  124  5e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.440211 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1306  MarR family transcriptional regulator  61.39 
 
 
149 aa  124  7e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.335381  normal  0.344824 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001045  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  47.41 
 
 
152 aa  123  8.000000000000001e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3233  MarR family transcriptional regulator  54.46 
 
 
150 aa  124  8.000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.550723  normal  0.0343876 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0813  transcriptional regulator, MarR family  43.66 
 
 
159 aa  123  9e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.800363  normal  0.25148 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4873  MarR family transcriptional regulator  42.25 
 
 
151 aa  123  1e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.846475  normal  0.145685 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3662  MarR family transcriptional regulator  53.57 
 
 
150 aa  123  1e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.485543  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1631  MarR family transcriptional regulator  42.55 
 
 
151 aa  123  1e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.813551 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4499  MarR family transcriptional regulator  53.57 
 
 
150 aa  123  1e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.148368  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3865  MarR family transcriptional regulator  53.57 
 
 
150 aa  123  1e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0792032  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0628  MarR family transcriptional regulator  54.31 
 
 
144 aa  122  1e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3597  MarR family transcriptional regulator  44.62 
 
 
153 aa  122  2e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3626  regulatory protein, MarR  42.96 
 
 
157 aa  122  2e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.0000000021465  normal  0.0936579 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3762  MarR family transcriptional regulator  53.57 
 
 
150 aa  122  2e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.425599  hitchhiker  0.00135953 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0926  transcriptional regulator, MarR family  40.43 
 
 
158 aa  122  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.493079  normal  0.487426 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0960  MarR family transcriptional regulator  45.32 
 
 
146 aa  122  2e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.305429  normal  0.461467 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0578  transcriptional regulator, MarR family protein  54.05 
 
 
163 aa  122  2e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4880  MarR family transcriptional regulator  54.46 
 
 
157 aa  122  2e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.368926  hitchhiker  0.00140951 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0799  MarR family transcriptional regulator  55.86 
 
 
161 aa  122  2e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1470  MarR family transcriptional regulator  43.7 
 
 
151 aa  121  3e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>