More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_5325 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_5325  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 		 147 aa  291  2e-78  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3415  MarR family transcriptional regulator  61.07 
 
 		 149 aa  177  4.999999999999999e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0058743 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1134  MarR family transcriptional regulator  61.97 
 
 		 144 aa  176  7e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3189  regulatory protein, MarR  59.44 
 
 		 144 aa  166  1e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.637369 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1207  transcriptional regulator, MarR family  56.74 
 
 		 146 aa  162  2.0000000000000002e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000193075 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0960  MarR family transcriptional regulator  57.25 
 
 		 146 aa  158  2e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.305429  normal  0.461467 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3619  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  54.93 
 
 		 162 aa  154  3e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1742  MarR family transcriptional regulator  52.52 
 
 		 149 aa  154  4e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2251  MarR family transcriptional regulator  53.24 
 
 		 145 aa  148  2e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.344689  normal  0.255238 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1203  transcriptional regulator, TrmB  54.35 
 
 		 146 aa  148  3e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.529625  normal  0.0362733 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3668  transcriptional regulator, MarR family  49.66 
 
 		 147 aa  147  4e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.400003  normal  0.620653 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4745  transcriptional regulator, MarR family  49.66 
 
 		 147 aa  147  4e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.427221 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1176  transcriptional regulator, TrmB  53.62 
 
 		 146 aa  145  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.713709  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1193  transcriptional regulator, TrmB  53.62 
 
 		 146 aa  145  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0830  MarR family transcriptional regulator  51.05 
 
 		 151 aa  144  4.0000000000000006e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0886  MarR family transcriptional regulator  51.05 
 
 		 151 aa  143  8.000000000000001e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3873  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  52.52 
 
 		 141 aa  143  9e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0504878 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0573  MarR family transcriptional regulator  54.07 
 
 		 151 aa  142  1e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.256198  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3291  MarR family transcriptional regulator  52.45 
 
 		 152 aa  142  1e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.570613  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0623  MarR family transcriptional regulator  54.55 
 
 		 151 aa  142  2e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4256  MarR family transcriptional regulator  49.64 
 
 		 166 aa  142  2e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.973283 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5560  MarR family transcriptional regulator  54.96 
 
 		 170 aa  141  3e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.813118  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1306  MarR family transcriptional regulator  54.48 
 
 		 149 aa  141  3e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.335381  normal  0.344824 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4966  transcriptional regulator, MarR family  50 
 
 		 153 aa  141  3e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.345847  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0057  MarR family transcriptional regulator  55.3 
 
 		 185 aa  140  4e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.584189  normal  0.103539 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4766  transcriptional regulator, MarR family  48.94 
 
 		 166 aa  140  6e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.462626  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3240  MarR family transcriptional regulator  50.36 
 
 		 158 aa  140  8e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.715513  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4792  transcriptional regulator, MarR family  49.64 
 
 		 147 aa  140  8e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0729618  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0483  MarR family transcriptional regulator  55.47 
 
 		 151 aa  140  8e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0397178 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1328  transcriptional regulator, MarR family  51.77 
 
 		 149 aa  139  9.999999999999999e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0474  transcriptional regulator, MarR family  54.74 
 
 		 155 aa  139  9.999999999999999e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2174  regulatory protein MarR  51.45 
 
 		 154 aa  138  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.363681 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2452  transcriptional regulator, MarR family  49.65 
 
 		 154 aa  139  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.126734  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2483  transcriptional regulator, MarR family  45.89 
 
 		 156 aa  138  3e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.758038  normal  0.560924 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4585  regulatory protein MarR  52.21 
 
 		 159 aa  138  3e-32  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0401  transcriptional regulator, MarR family  51.8 
 
 		 156 aa  138  3e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03887  transcriptional regulator MarR family  50 
 
 		 152 aa  138  3e-32  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2738  transcriptional regulator, MarR family  45.71 
 
 		 156 aa  137  3.9999999999999997e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.708856 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1196  MarR family transcriptional regulator  53.68 
 
 		 155 aa  136  7e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0200  transcriptional regulator, MarR family  52.21 
 
 		 159 aa  137  7e-32  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0021  MarR family transcriptional regulator  52.99 
 
 		 178 aa  135  1e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1936  transcriptional regulator, MarR family  49.66 
 
 		 155 aa  136  1e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.13089 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2137  transcriptional regulator, MarR family  48.59 
 
 		 154 aa  136  1e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.727084 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2928  MarR family transcriptional regulator  47.18 
 
 		 143 aa  135  1e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.442252 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1470  MarR family transcriptional regulator  52.17 
 
 		 151 aa  135  1e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0519  transcriptional regulator, MarR family  53.03 
 
 		 157 aa  135  1e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4271  MarR family transcriptional regulator  52.59 
 
 		 156 aa  136  1e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0653897  normal  0.661065 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1189  transcriptional regulator MarR family  49.29 
 
 		 158 aa  135  2e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.622384  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0576  transcriptional regulator, TrmB  48.53 
 
 		 158 aa  135  2e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0950259  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0519  MarR family transcriptional regulator  54.84 
 
 		 150 aa  135  2e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00587381 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2950  transcriptional regulator, MarR family  50.35 
 
 		 149 aa  134  4e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1641  transcriptional regulator, MarR family  50.78 
 
 		 157 aa  133  6.0000000000000005e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.176874  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1770  MarR family transcriptional regulator  50.68 
 
 		 155 aa  134  6.0000000000000005e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3141  transcriptional regulator, MarR family  45.26 
 
 		 146 aa  133  7.000000000000001e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.566984  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04763  hypothetical protein  46.76 
 
 		 143 aa  133  8e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27230  MarR family transcriptional regulator  45.71 
 
 		 151 aa  133  9.999999999999999e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2629  MarR family transcriptional regulator  50.38 
 
 		 160 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.8863  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1032  MarR family transcriptional regulator  44.7 
 
 		 143 aa  131  1.9999999999999998e-30  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.119572  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2751  transcriptional regulator, MarR family  52.52 
 
 		 141 aa  132  1.9999999999999998e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.290738  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2617  MarR family transcriptional regulator  48.3 
 
 		 160 aa  130  5e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.279233  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5144  MarR family transcriptional regulator  48.95 
 
 		 156 aa  130  5e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3854  MarR family transcriptional regulator  46.81 
 
 		 151 aa  130  5e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.113287  normal  0.119098 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6797  transcriptional regulator, MarR family  50.37 
 
 		 150 aa  130  5e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000341321  decreased coverage  0.0000000109708 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0129  MarR family transcriptional regulator  51.94 
 
 		 154 aa  130  6e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2325  transcriptional regulator, MarR family  49.29 
 
 		 162 aa  130  6e-30  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0434242 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3178  MarR family transcriptional regulator  47.37 
 
 		 154 aa  130  6e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.137994  normal  0.81725 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0050  transcriptional regulator, MarR family  47.79 
 
 		 164 aa  130  7.999999999999999e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00479818 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1208  MarR family transcriptional regulator  44.7 
 
 		 143 aa  130  7.999999999999999e-30  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0011677  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3738  transcriptional regulator, MarR family  51.49 
 
 		 153 aa  129  9e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000310515  hitchhiker  0.00461263 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0598  MarR family transcriptional regulator  48 
 
 		 267 aa  130  9e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001045  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  45 
 
 		 152 aa  130  9e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2472  MarR family transcriptional regulator  50.77 
 
 		 147 aa  129  1.0000000000000001e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.161606  normal  0.735248 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0926  transcriptional regulator, MarR family  47.73 
 
 		 158 aa  129  1.0000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.493079  normal  0.487426 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1435  MarR family transcriptional regulator  53.33 
 
 		 151 aa  129  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.209441 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0880  regulatory protein, MarR  45.14 
 
 		 162 aa  129  2.0000000000000002e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4585  transcriptional regulator, MarR family  40.85 
 
 		 150 aa  128  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2578  MarR family transcriptional regulator  47.62 
 
 		 160 aa  129  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.856924  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2306  putative transcriptional regulator  45 
 
 		 151 aa  128  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2623  MarR family transcriptional regulator  47.62 
 
 		 160 aa  129  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0922619  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1768  transcriptional regulator, MarR family  45.32 
 
 		 157 aa  128  3e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4364  MarR family transcriptional regulator  40.85 
 
 		 150 aa  128  3e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4200  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  40.85 
 
 		 150 aa  128  3e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4211  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  40.85 
 
 		 150 aa  128  3e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.151141  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4699  MarR family transcriptional regulator  40.85 
 
 		 150 aa  128  3e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4554  transcriptional regulator, MarR family  40.28 
 
 		 150 aa  128  3e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4603  transcriptional regulator, MarR family  40.85 
 
 		 150 aa  128  3e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.221434  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0649  transcriptional regulator, MarR family  40.85 
 
 		 150 aa  128  3e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2151  MarR family transcriptional regulator  50.78 
 
 		 153 aa  127  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.680053 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2803  transcriptional regulator, MarR family  46.67 
 
 		 170 aa  127  4.0000000000000003e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4410  MarR family transcriptional regulator  51.18 
 
 		 176 aa  127  4.0000000000000003e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0108  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  47.14 
 
 		 152 aa  127  4.0000000000000003e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.879191 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0925  regulatory protein MarR  46.81 
 
 		 195 aa  127  5.0000000000000004e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.101489  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0886  transcriptional regulator, MarR family  46.81 
 
 		 161 aa  127  5.0000000000000004e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.541526  normal  0.759862 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4823  MarR family transcriptional regulator  44.83 
 
 		 163 aa  127  5.0000000000000004e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.477223  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1860  MarR family transcriptional regulator  52.5 
 
 		 151 aa  127  6e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0628  MarR family transcriptional regulator  50.77 
 
 		 144 aa  127  6e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1524  MarR family transcriptional regulator  48.53 
 
 		 149 aa  127  6e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.26569  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2842  MarR family transcriptional regulator  48.89 
 
 		 150 aa  127  7.000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1910  MarR family transcriptional regulator  44.14 
 
 		 159 aa  127  7.000000000000001e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.852737  normal  0.275089 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4558  MarR family transcriptional regulator  39.58 
 
 		 150 aa  126  9.000000000000001e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>