More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_2751 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_2751  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 		 141 aa  281  2.0000000000000002e-75  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.290738  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4271  MarR family transcriptional regulator  56.3 
 
 		 156 aa  130  5e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0653897  normal  0.661065 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2251  MarR family transcriptional regulator  50.4 
 
 		 145 aa  129  1.0000000000000001e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.344689  normal  0.255238 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2174  regulatory protein MarR  50.4 
 
 		 154 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.363681 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1203  transcriptional regulator, TrmB  50.76 
 
 		 146 aa  128  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.529625  normal  0.0362733 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2452  transcriptional regulator, MarR family  50.4 
 
 		 154 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.126734  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2137  transcriptional regulator, MarR family  50.4 
 
 		 154 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.727084 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1134  MarR family transcriptional regulator  52.63 
 
 		 144 aa  127  7.000000000000001e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0934  MarR family transcriptional regulator  47.73 
 
 		 163 aa  126  8.000000000000001e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0232  MarR family transcriptional regulator  48.09 
 
 		 152 aa  126  1.0000000000000001e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1176  transcriptional regulator, TrmB  50 
 
 		 146 aa  126  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.713709  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3415  MarR family transcriptional regulator  51.43 
 
 		 149 aa  126  1.0000000000000001e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0058743 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0799  MarR family transcriptional regulator  48.48 
 
 		 161 aa  126  1.0000000000000001e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1193  transcriptional regulator, TrmB  50 
 
 		 146 aa  126  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3189  regulatory protein, MarR  52.63 
 
 		 144 aa  125  2.0000000000000002e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.637369 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0483  MarR family transcriptional regulator  54.17 
 
 		 151 aa  125  2.0000000000000002e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0397178 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0474  transcriptional regulator, MarR family  53.33 
 
 		 155 aa  124  3e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0573  MarR family transcriptional regulator  56.48 
 
 		 151 aa  124  3e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.256198  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04763  hypothetical protein  45.86 
 
 		 143 aa  124  4.0000000000000003e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0960  MarR family transcriptional regulator  51.2 
 
 		 146 aa  124  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.305429  normal  0.461467 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1207  transcriptional regulator, MarR family  49.62 
 
 		 146 aa  122  1e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000193075 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1196  MarR family transcriptional regulator  58.59 
 
 		 155 aa  122  1e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1808  MarR family transcriptional regulator  54.13 
 
 		 159 aa  123  1e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1742  MarR family transcriptional regulator  44.85 
 
 		 149 aa  122  2e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1524  MarR family transcriptional regulator  48.87 
 
 		 149 aa  122  2e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.26569  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001045  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  45.11 
 
 		 152 aa  121  3e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5560  MarR family transcriptional regulator  59 
 
 		 170 aa  121  4e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.813118  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4256  MarR family transcriptional regulator  47.73 
 
 		 166 aa  120  5e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.973283 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0519  transcriptional regulator, MarR family  54.13 
 
 		 157 aa  120  5e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0401  transcriptional regulator, MarR family  55.05 
 
 		 156 aa  120  6e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4585  transcriptional regulator, MarR family  42.02 
 
 		 150 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4364  MarR family transcriptional regulator  42.02 
 
 		 150 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4200  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  42.02 
 
 		 150 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4211  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  42.02 
 
 		 150 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.151141  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4966  transcriptional regulator, MarR family  56.19 
 
 		 153 aa  119  1.9999999999999998e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.345847  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4554  transcriptional regulator, MarR family  42.02 
 
 		 150 aa  118  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4699  MarR family transcriptional regulator  42.02 
 
 		 150 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1435  MarR family transcriptional regulator  50.93 
 
 		 151 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.209441 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0649  transcriptional regulator, MarR family  42.02 
 
 		 150 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3161  regulatory protein, MarR  49.24 
 
 		 158 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0336123  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4603  transcriptional regulator, MarR family  42.02 
 
 		 150 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.221434  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2629  MarR family transcriptional regulator  44.53 
 
 		 160 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.8863  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4766  transcriptional regulator, MarR family  47.2 
 
 		 166 aa  118  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.462626  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0129  MarR family transcriptional regulator  50.82 
 
 		 154 aa  118  3e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0628  MarR family transcriptional regulator  48.48 
 
 		 144 aa  118  3e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1113  transcriptional regulator, TrmB  47.73 
 
 		 167 aa  118  3e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1189  transcriptional regulator MarR family  48.41 
 
 		 158 aa  118  3e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.622384  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0057  MarR family transcriptional regulator  54.31 
 
 		 185 aa  118  3e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.584189  normal  0.103539 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4312  MarR family transcriptional regulator  49.49 
 
 		 150 aa  117  3.9999999999999996e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4558  MarR family transcriptional regulator  42.02 
 
 		 150 aa  117  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2151  MarR family transcriptional regulator  48.39 
 
 		 153 aa  118  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.680053 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5144  MarR family transcriptional regulator  48.06 
 
 		 156 aa  117  6e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4137  transcriptional regulator, MarR family  50.43 
 
 		 153 aa  117  6e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3141  transcriptional regulator, MarR family  46.4 
 
 		 146 aa  117  6e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.566984  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0886  transcriptional regulator, MarR family  48.44 
 
 		 161 aa  116  9.999999999999999e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.541526  normal  0.759862 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3854  MarR family transcriptional regulator  50 
 
 		 151 aa  116  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.113287  normal  0.119098 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5662  MarR family transcriptional regulator  47.83 
 
 		 153 aa  115  9.999999999999999e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.49927  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2231  MarR family transcriptional regulator  47.66 
 
 		 150 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.106154  normal  0.474897 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0519  MarR family transcriptional regulator  50.91 
 
 		 150 aa  116  9.999999999999999e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00587381 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3619  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  57 
 
 		 162 aa  116  9.999999999999999e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0578  transcriptional regulator, MarR family protein  44.7 
 
 		 163 aa  115  9.999999999999999e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0835  transcriptional regulator, MarR family protein  45.45 
 
 		 150 aa  116  9.999999999999999e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1860  MarR family transcriptional regulator  50 
 
 		 151 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0925  regulatory protein MarR  48.44 
 
 		 195 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.101489  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06220  transcriptional regulator, MarR family  48.48 
 
 		 169 aa  115  1.9999999999999998e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1671  MarR family transcriptional regulator  49.57 
 
 		 151 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.787972  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2306  putative transcriptional regulator  44 
 
 		 151 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5325  transcriptional regulator, MarR family  52.52 
 
 		 147 aa  115  1.9999999999999998e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1641  transcriptional regulator, MarR family  50.46 
 
 		 157 aa  115  1.9999999999999998e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.176874  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1219  MarR family transcriptional regulator  49.57 
 
 		 151 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.318492  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1032  MarR family transcriptional regulator  48.15 
 
 		 143 aa  115  1.9999999999999998e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.119572  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1328  transcriptional regulator, MarR family  51.38 
 
 		 149 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2950  transcriptional regulator, MarR family  51.38 
 
 		 149 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1698  MarR family transcriptional regulator  49.57 
 
 		 151 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.547698  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1770  MarR family transcriptional regulator  48.44 
 
 		 155 aa  115  1.9999999999999998e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0861  transcriptional regulator, MarR family  46.92 
 
 		 161 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.440211 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4873  MarR family transcriptional regulator  48.7 
 
 		 151 aa  115  3e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.846475  normal  0.145685 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15300  transcriptional regulator, MarR family  45.31 
 
 		 162 aa  114  3e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.408936  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20780  transcriptional regulator, MarR family  43.18 
 
 		 152 aa  114  3.9999999999999997e-25  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4792  transcriptional regulator, MarR family  51.82 
 
 		 147 aa  114  3.9999999999999997e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0729618  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03887  transcriptional regulator MarR family  54.13 
 
 		 152 aa  114  3.9999999999999997e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1910  MarR family transcriptional regulator  50.88 
 
 		 152 aa  114  5e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0578168  normal  0.331204 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1208  MarR family transcriptional regulator  48.15 
 
 		 143 aa  114  5e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0011677  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0108  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  52.38 
 
 		 152 aa  114  5e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.879191 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1768  transcriptional regulator, MarR family  48.11 
 
 		 157 aa  114  6e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0021  MarR family transcriptional regulator  48.78 
 
 		 178 aa  114  6e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0576  transcriptional regulator, TrmB  44.6 
 
 		 158 aa  114  6e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0950259  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4499  MarR family transcriptional regulator  45.31 
 
 		 150 aa  114  6.9999999999999995e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.148368  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3662  MarR family transcriptional regulator  45.31 
 
 		 150 aa  114  6.9999999999999995e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.485543  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27230  MarR family transcriptional regulator  44 
 
 		 151 aa  113  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3865  MarR family transcriptional regulator  45.31 
 
 		 150 aa  114  6.9999999999999995e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0792032  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1470  MarR family transcriptional regulator  49.07 
 
 		 151 aa  113  8.999999999999998e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2325  transcriptional regulator, MarR family  44.36 
 
 		 162 aa  113  8.999999999999998e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0434242 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0623  MarR family transcriptional regulator  50.94 
 
 		 151 aa  113  8.999999999999998e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0969  transcriptional regulator, MarR family  43.94 
 
 		 171 aa  112  1.0000000000000001e-24  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000000635233  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3097  transcriptional regulator, MarR family  48.74 
 
 		 153 aa  112  1.0000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3597  MarR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 153 aa  112  1.0000000000000001e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1608  MarR family transcriptional regulator  47.83 
 
 		 151 aa  112  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.457422  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3444  transcriptional regulator, MarR family  48.74 
 
 		 153 aa  112  1.0000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3762  MarR family transcriptional regulator  45.31 
 
 		 150 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.425599  hitchhiker  0.00135953 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>