More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_2174 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011369  Rleg2_2174  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 		 165 aa  334  2.9999999999999997e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.789823  normal  0.527206 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2456  transcriptional regulator, MarR family  80.36 
 
 		 168 aa  277  5e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.768302  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1219  MarR family transcriptional regulator  61.84 
 
 		 151 aa  189  1e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.318492  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1698  MarR family transcriptional regulator  61.84 
 
 		 151 aa  189  1e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.547698  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5662  MarR family transcriptional regulator  65.25 
 
 		 153 aa  188  2.9999999999999997e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.49927  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4137  transcriptional regulator, MarR family  61.49 
 
 		 153 aa  187  5e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1671  MarR family transcriptional regulator  61.18 
 
 		 151 aa  187  7e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.787972  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4873  MarR family transcriptional regulator  58.06 
 
 		 151 aa  181  4.0000000000000006e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.846475  normal  0.145685 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1608  MarR family transcriptional regulator  60 
 
 		 151 aa  177  5.999999999999999e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.457422  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1631  MarR family transcriptional regulator  59.31 
 
 		 151 aa  175  2e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.813551 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1547  MarR family transcriptional regulator  61.94 
 
 		 148 aa  175  3e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.187738 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0061  MarR family transcriptional regulator  51.88 
 
 		 171 aa  138  3e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.310818 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2956  MarR family transcriptional regulator  51.77 
 
 		 153 aa  136  1e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.119179 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2845  transcriptional regulator, MarR family  48.25 
 
 		 145 aa  130  9e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.648486  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4271  MarR family transcriptional regulator  47.59 
 
 		 156 aa  130  1.0000000000000001e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0653897  normal  0.661065 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2280  MarR family transcriptional regulator  54.87 
 
 		 170 aa  126  1.0000000000000001e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.421231  normal  0.627337 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0474  transcriptional regulator, MarR family  48.39 
 
 		 155 aa  125  2.0000000000000002e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2325  transcriptional regulator, MarR family  46.48 
 
 		 162 aa  125  3e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0434242 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4966  transcriptional regulator, MarR family  49.28 
 
 		 153 aa  124  6e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.345847  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0483  MarR family transcriptional regulator  50.37 
 
 		 151 aa  124  8.000000000000001e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0397178 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0057  MarR family transcriptional regulator  60.64 
 
 		 185 aa  122  2e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.584189  normal  0.103539 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2483  transcriptional regulator, MarR family  43.45 
 
 		 156 aa  121  3e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.758038  normal  0.560924 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1670  transcriptional regulator, MarR family  55.56 
 
 		 161 aa  122  3e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.428433  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0576  transcriptional regulator, TrmB  48.87 
 
 		 158 aa  121  4e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0950259  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4256  MarR family transcriptional regulator  42.76 
 
 		 166 aa  121  5e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.973283 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3178  MarR family transcriptional regulator  44.3 
 
 		 154 aa  120  6e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.137994  normal  0.81725 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2738  transcriptional regulator, MarR family  47.45 
 
 		 156 aa  120  9.999999999999999e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.708856 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0623  MarR family transcriptional regulator  57.41 
 
 		 151 aa  119  9.999999999999999e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2251  MarR family transcriptional regulator  48.51 
 
 		 145 aa  119  1.9999999999999998e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.344689  normal  0.255238 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3291  MarR family transcriptional regulator  57.14 
 
 		 152 aa  118  3e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.570613  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1641  transcriptional regulator, MarR family  49.14 
 
 		 157 aa  117  7e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.176874  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0830  MarR family transcriptional regulator  58.16 
 
 		 151 aa  116  9.999999999999999e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0519  transcriptional regulator, MarR family  52.29 
 
 		 157 aa  117  9.999999999999999e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0886  MarR family transcriptional regulator  58.16 
 
 		 151 aa  116  1.9999999999999998e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0573  MarR family transcriptional regulator  55.32 
 
 		 151 aa  115  1.9999999999999998e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.256198  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4766  transcriptional regulator, MarR family  50.48 
 
 		 166 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.462626  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3619  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  58.51 
 
 		 162 aa  115  3e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3240  MarR family transcriptional regulator  42.68 
 
 		 158 aa  114  3.9999999999999997e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.715513  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3444  transcriptional regulator, MarR family  51.4 
 
 		 153 aa  114  5e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1196  MarR family transcriptional regulator  53.47 
 
 		 155 aa  114  5e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0926  transcriptional regulator, MarR family  41.77 
 
 		 158 aa  114  6e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.493079  normal  0.487426 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3097  transcriptional regulator, MarR family  51.4 
 
 		 153 aa  114  6e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5560  MarR family transcriptional regulator  55 
 
 		 170 aa  114  7.999999999999999e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.813118  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3114  transcriptional regulator, MarR family  48.28 
 
 		 145 aa  114  8.999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1742  MarR family transcriptional regulator  48.72 
 
 		 149 aa  113  1.0000000000000001e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1189  transcriptional regulator MarR family  46.46 
 
 		 158 aa  112  2.0000000000000002e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.622384  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0108  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  44.12 
 
 		 152 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.879191 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4792  transcriptional regulator, MarR family  50.44 
 
 		 147 aa  112  2.0000000000000002e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0729618  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2950  transcriptional regulator, MarR family  44.85 
 
 		 149 aa  111  4.0000000000000004e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1328  transcriptional regulator, MarR family  44.12 
 
 		 149 aa  111  4.0000000000000004e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0519  MarR family transcriptional regulator  57.45 
 
 		 150 aa  111  5e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00587381 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1113  transcriptional regulator, TrmB  47.27 
 
 		 167 aa  111  5e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2928  MarR family transcriptional regulator  52.53 
 
 		 143 aa  110  1.0000000000000001e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.442252 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1306  MarR family transcriptional regulator  56.25 
 
 		 149 aa  110  1.0000000000000001e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.335381  normal  0.344824 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0401  transcriptional regulator, MarR family  55.21 
 
 		 156 aa  109  1.0000000000000001e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0813  transcriptional regulator, MarR family  41.77 
 
 		 159 aa  109  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.800363  normal  0.25148 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0129  MarR family transcriptional regulator  42.75 
 
 		 154 aa  109  2.0000000000000002e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3626  regulatory protein, MarR  42.18 
 
 		 157 aa  108  3e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.0000000021465  normal  0.0936579 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1176  transcriptional regulator, TrmB  44.85 
 
 		 146 aa  108  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.713709  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03887  transcriptional regulator MarR family  47.27 
 
 		 152 aa  108  4.0000000000000004e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1193  transcriptional regulator, TrmB  44.85 
 
 		 146 aa  108  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1203  transcriptional regulator, TrmB  44.85 
 
 		 146 aa  108  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.529625  normal  0.0362733 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0960  MarR family transcriptional regulator  50.5 
 
 		 146 aa  107  6e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.305429  normal  0.461467 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1808  MarR family transcriptional regulator  46.85 
 
 		 159 aa  107  8.000000000000001e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1910  MarR family transcriptional regulator  51.92 
 
 		 152 aa  105  3e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0578168  normal  0.331204 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00880  transcriptional regulator, MarR family  52.53 
 
 		 148 aa  105  3e-22  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5144  MarR family transcriptional regulator  48.11 
 
 		 156 aa  104  5e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3415  MarR family transcriptional regulator  44.19 
 
 		 149 aa  104  5e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0058743 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0925  regulatory protein MarR  48.67 
 
 		 195 aa  104  5e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.101489  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2151  MarR family transcriptional regulator  44.55 
 
 		 153 aa  104  5e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.680053 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0369  MarR family transcriptional regulator  54.26 
 
 		 155 aa  104  5e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1768  transcriptional regulator, MarR family  43.06 
 
 		 157 aa  104  6e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0886  transcriptional regulator, MarR family  48.67 
 
 		 161 aa  104  6e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.541526  normal  0.759862 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04763  hypothetical protein  40.58 
 
 		 143 aa  104  6e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0133  regulatory protein MarR  53.33 
 
 		 168 aa  103  7e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0705  MarR family transcriptional regulator  38.22 
 
 		 156 aa  103  8e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.186956  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0815  MarR family transcriptional regulator  52.04 
 
 		 165 aa  103  9e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000550088 
 
 
-
 
NC_003296  RS02614  putative transcription regulator protein  53.19 
 
 		 153 aa  103  1e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.532202  normal  0.750512 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0799  MarR family transcriptional regulator  47.06 
 
 		 161 aa  103  1e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1207  transcriptional regulator, MarR family  47.58 
 
 		 146 aa  103  1e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000193075 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0861  transcriptional regulator, MarR family  53.19 
 
 		 161 aa  103  1e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.440211 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2452  transcriptional regulator, MarR family  47.96 
 
 		 154 aa  102  2e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.126734  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001045  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  40.58 
 
 		 152 aa  102  2e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4410  MarR family transcriptional regulator  54.95 
 
 		 176 aa  102  2e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2842  MarR family transcriptional regulator  54.95 
 
 		 150 aa  102  2e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3597  MarR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 153 aa  102  2e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6797  transcriptional regulator, MarR family  54.95 
 
 		 150 aa  102  2e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000341321  decreased coverage  0.0000000109708 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2306  putative transcriptional regulator  42.76 
 
 		 151 aa  102  2e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4635  MarR family transcriptional regulator  45.67 
 
 		 153 aa  102  2e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.472747  normal  0.0529683 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0977  MarR family transcriptional regulator  52.04 
 
 		 165 aa  102  3e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27230  MarR family transcriptional regulator  42.76 
 
 		 151 aa  101  4e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3498  MarR family transcriptional regulator  53.68 
 
 		 165 aa  101  5e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4499  MarR family transcriptional regulator  52.08 
 
 		 150 aa  101  5e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.148368  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3662  MarR family transcriptional regulator  52.08 
 
 		 150 aa  101  5e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.485543  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3865  MarR family transcriptional regulator  52.08 
 
 		 150 aa  101  5e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0792032  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3426  transcriptional regulator, MarR family  53.68 
 
 		 165 aa  101  6e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3621  MarR family transcriptional regulator  53.68 
 
 		 165 aa  101  6e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.597701 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3056  MarR family transcriptional regulator  53.85 
 
 		 168 aa  100  6e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0866  MarR family transcriptional regulator  53.68 
 
 		 165 aa  101  6e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2842  MarR family transcriptional regulator  49.53 
 
 		 154 aa  100  7e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>