More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_3873 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_3873  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  100 
 
 
141 aa  274  2e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0504878 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1742  MarR family transcriptional regulator  56.2 
 
 
149 aa  156  8e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1207  transcriptional regulator, MarR family  59.85 
 
 
146 aa  152  2e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000193075 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3415  MarR family transcriptional regulator  58.87 
 
 
149 aa  149  2e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0058743 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1936  transcriptional regulator, MarR family  58.27 
 
 
155 aa  148  3e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.13089 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1134  MarR family transcriptional regulator  59.12 
 
 
144 aa  147  5e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3189  regulatory protein, MarR  57.86 
 
 
144 aa  145  2.0000000000000003e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.637369 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0108  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  56.83 
 
 
152 aa  145  2.0000000000000003e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.879191 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2251  MarR family transcriptional regulator  53.62 
 
 
145 aa  139  9.999999999999999e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.344689  normal  0.255238 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3619  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  51.8 
 
 
162 aa  139  9.999999999999999e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3331  MarR family transcriptional regulator  51.45 
 
 
155 aa  138  3e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.376124  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0880  regulatory protein, MarR  52.55 
 
 
162 aa  137  4.999999999999999e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1966  transcriptional regulator, MarR family  53.28 
 
 
151 aa  136  7.999999999999999e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000123545  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1768  transcriptional regulator, MarR family  50.39 
 
 
157 aa  135  2e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0960  MarR family transcriptional regulator  53.73 
 
 
146 aa  135  2e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.305429  normal  0.461467 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4823  MarR family transcriptional regulator  49.65 
 
 
163 aa  135  2e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.477223  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5560  MarR family transcriptional regulator  52.52 
 
 
170 aa  132  9.999999999999999e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.813118  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2005  MarR family transcriptional regulator  47.48 
 
 
143 aa  132  1.9999999999999998e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3854  MarR family transcriptional regulator  51.52 
 
 
151 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.113287  normal  0.119098 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1910  MarR family transcriptional regulator  47.52 
 
 
159 aa  131  3e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.852737  normal  0.275089 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2845  transcriptional regulator, MarR family  49.28 
 
 
145 aa  131  3e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.648486  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1203  transcriptional regulator, TrmB  51.49 
 
 
146 aa  131  3e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.529625  normal  0.0362733 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27230  MarR family transcriptional regulator  50.39 
 
 
151 aa  131  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1176  transcriptional regulator, TrmB  51.49 
 
 
146 aa  130  5e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.713709  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1193  transcriptional regulator, TrmB  51.49 
 
 
146 aa  130  5e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5325  transcriptional regulator, MarR family  52.52 
 
 
147 aa  130  6e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2578  MarR family transcriptional regulator  50.71 
 
 
160 aa  130  7.999999999999999e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.856924  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2623  MarR family transcriptional regulator  50.71 
 
 
160 aa  130  7.999999999999999e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0922619  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1470  MarR family transcriptional regulator  50 
 
 
151 aa  129  9e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3626  regulatory protein, MarR  47.48 
 
 
157 aa  129  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.0000000021465  normal  0.0936579 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2842  MarR family transcriptional regulator  50.74 
 
 
150 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2617  MarR family transcriptional regulator  51.45 
 
 
160 aa  129  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.279233  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0057  MarR family transcriptional regulator  53.38 
 
 
185 aa  129  1.0000000000000001e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.584189  normal  0.103539 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0686  transcriptional regulator, MarR family  47.41 
 
 
155 aa  128  2.0000000000000002e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6797  transcriptional regulator, MarR family  50 
 
 
150 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000341321  decreased coverage  0.0000000109708 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0129  MarR family transcriptional regulator  48.53 
 
 
154 aa  129  2.0000000000000002e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0401  transcriptional regulator, MarR family  49.25 
 
 
156 aa  129  2.0000000000000002e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1524  MarR family transcriptional regulator  50.75 
 
 
149 aa  129  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.26569  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0232  MarR family transcriptional regulator  46.72 
 
 
152 aa  128  3e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0200  transcriptional regulator, MarR family  52.27 
 
 
159 aa  128  3e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3996  MarR family transcriptional regulator  48.2 
 
 
154 aa  127  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000674162  normal  0.401287 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4792  transcriptional regulator, MarR family  53.79 
 
 
147 aa  127  5.0000000000000004e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0729618  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4585  regulatory protein MarR  50.37 
 
 
159 aa  127  5.0000000000000004e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1860  MarR family transcriptional regulator  54.31 
 
 
151 aa  127  6e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1189  transcriptional regulator MarR family  51.82 
 
 
158 aa  127  6e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.622384  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3056  MarR family transcriptional regulator  47.89 
 
 
168 aa  127  7.000000000000001e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02614  putative transcription regulator protein  57.14 
 
 
153 aa  127  7.000000000000001e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.532202  normal  0.750512 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2306  putative transcriptional regulator  49.61 
 
 
151 aa  127  7.000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0623  MarR family transcriptional regulator  47.73 
 
 
151 aa  126  8.000000000000001e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1196  MarR family transcriptional regulator  52.5 
 
 
155 aa  126  1.0000000000000001e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001045  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  52.38 
 
 
152 aa  126  1.0000000000000001e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1435  MarR family transcriptional regulator  53.45 
 
 
151 aa  125  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.209441 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0549  MarR family transcriptional regulator  47.86 
 
 
167 aa  126  1.0000000000000001e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1328  transcriptional regulator, MarR family  47.76 
 
 
149 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04763  hypothetical protein  52.38 
 
 
143 aa  125  2.0000000000000002e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0519  MarR family transcriptional regulator  50.85 
 
 
150 aa  125  2.0000000000000002e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00587381 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2803  transcriptional regulator, MarR family  50.74 
 
 
170 aa  125  2.0000000000000002e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0061  MarR family transcriptional regulator  49.29 
 
 
171 aa  124  3e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.310818 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3662  MarR family transcriptional regulator  48.91 
 
 
150 aa  124  4.0000000000000003e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.485543  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0977  MarR family transcriptional regulator  48.23 
 
 
165 aa  124  4.0000000000000003e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0576  transcriptional regulator, TrmB  50.38 
 
 
158 aa  124  4.0000000000000003e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0950259  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0573  MarR family transcriptional regulator  48.55 
 
 
151 aa  124  4.0000000000000003e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.256198  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4499  MarR family transcriptional regulator  48.91 
 
 
150 aa  124  4.0000000000000003e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.148368  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3865  MarR family transcriptional regulator  48.91 
 
 
150 aa  124  4.0000000000000003e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0792032  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1641  transcriptional regulator, MarR family  53.12 
 
 
157 aa  124  5e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.176874  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06220  transcriptional regulator, MarR family  51.47 
 
 
169 aa  124  5e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1208  MarR family transcriptional regulator  45.52 
 
 
143 aa  124  5e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0011677  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0815  MarR family transcriptional regulator  56.48 
 
 
165 aa  124  6e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000550088 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0050  transcriptional regulator, MarR family  54.55 
 
 
164 aa  123  7e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00479818 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1032  MarR family transcriptional regulator  44.78 
 
 
143 aa  123  7e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.119572  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2950  transcriptional regulator, MarR family  47.76 
 
 
149 aa  123  9e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0649  transcriptional regulator, MarR family  48.74 
 
 
150 aa  122  1e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4364  MarR family transcriptional regulator  48.74 
 
 
150 aa  122  1e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4200  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  48.74 
 
 
150 aa  122  1e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4211  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  48.74 
 
 
150 aa  122  1e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.151141  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4699  MarR family transcriptional regulator  48.74 
 
 
150 aa  122  1e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3738  transcriptional regulator, MarR family  51.13 
 
 
153 aa  123  1e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000310515  hitchhiker  0.00461263 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2738  transcriptional regulator, MarR family  50 
 
 
156 aa  123  1e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.708856 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4554  transcriptional regulator, MarR family  48.74 
 
 
150 aa  122  1e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4558  MarR family transcriptional regulator  48.74 
 
 
150 aa  122  2e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2629  MarR family transcriptional regulator  43.88 
 
 
160 aa  122  2e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.8863  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1113  transcriptional regulator, TrmB  50 
 
 
167 aa  122  2e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4603  transcriptional regulator, MarR family  48.74 
 
 
150 aa  122  2e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.221434  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3291  MarR family transcriptional regulator  45.99 
 
 
152 aa  122  2e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.570613  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0926  transcriptional regulator, MarR family  47.83 
 
 
158 aa  122  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.493079  normal  0.487426 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4585  transcriptional regulator, MarR family  47.9 
 
 
150 aa  121  3e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4410  MarR family transcriptional regulator  52.21 
 
 
176 aa  121  3e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3762  MarR family transcriptional regulator  47.45 
 
 
150 aa  121  3e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.425599  hitchhiker  0.00135953 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1770  MarR family transcriptional regulator  50.35 
 
 
155 aa  121  3e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0886  MarR family transcriptional regulator  49.23 
 
 
151 aa  121  4e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3498  MarR family transcriptional regulator  47.52 
 
 
165 aa  121  4e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0866  MarR family transcriptional regulator  47.52 
 
 
165 aa  121  4e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2231  MarR family transcriptional regulator  47.45 
 
 
150 aa  121  4e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.106154  normal  0.474897 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0021  MarR family transcriptional regulator  51.82 
 
 
178 aa  121  4e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0835  transcriptional regulator, MarR family protein  48 
 
 
150 aa  121  4e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27530  MarR family transcriptional regulator  52.27 
 
 
163 aa  121  4e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.037283 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4312  MarR family transcriptional regulator  48.74 
 
 
150 aa  121  4e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3426  transcriptional regulator, MarR family  47.52 
 
 
165 aa  121  4e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0830  MarR family transcriptional regulator  49.23 
 
 
151 aa  120  5e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2661  MarR family transcriptional regulator  42.65 
 
 
145 aa  120  5e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00131118  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>