More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_32610 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013521  Sked_32610  transcriptional regulator  100 
 
 
166 aa  323  9e-88  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0590673  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1966  transcriptional regulator, MarR family  58.11 
 
 
151 aa  174  6e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000123545  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2803  transcriptional regulator, MarR family  55.71 
 
 
170 aa  163  1.0000000000000001e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3865  MarR family transcriptional regulator  58.39 
 
 
148 aa  154  5.0000000000000005e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.115918  normal  0.0901138 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3738  transcriptional regulator, MarR family  53.52 
 
 
153 aa  147  5e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000310515  hitchhiker  0.00461263 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5382  transcriptional regulator, MarR family  55.07 
 
 
157 aa  147  5e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2578  MarR family transcriptional regulator  51.59 
 
 
160 aa  145  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.856924  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2623  MarR family transcriptional regulator  51.59 
 
 
160 aa  145  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0922619  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2617  MarR family transcriptional regulator  51.59 
 
 
160 aa  145  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.279233  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1910  MarR family transcriptional regulator  50 
 
 
159 aa  138  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.852737  normal  0.275089 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0880  regulatory protein, MarR  47.02 
 
 
162 aa  137  4.999999999999999e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0200  transcriptional regulator, MarR family  47.59 
 
 
159 aa  137  6e-32  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3311  MarR family transcriptional regulator  45.33 
 
 
165 aa  136  2e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4823  MarR family transcriptional regulator  48.12 
 
 
163 aa  134  5e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.477223  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0335  MarR family transcriptional regulator  46.05 
 
 
158 aa  134  7.000000000000001e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.663008  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0862  MarR family transcriptional regulator  46.05 
 
 
158 aa  134  7.000000000000001e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.182256  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3208  MarR family transcriptional regulator  44.67 
 
 
165 aa  134  7.000000000000001e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.469767 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0598  MarR family transcriptional regulator  48.57 
 
 
267 aa  134  8e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1679  MarR family transcriptional regulator  47.14 
 
 
150 aa  133  9.999999999999999e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0304  MarR family transcriptional regulator  47.14 
 
 
150 aa  133  9.999999999999999e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2422  MarR family transcriptional regulator  47.14 
 
 
150 aa  133  9.999999999999999e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.934023  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2559  transcriptional regulator  46.81 
 
 
150 aa  133  9.999999999999999e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.970675  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0815  MarR family transcriptional regulator  44 
 
 
165 aa  133  9.999999999999999e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000550088 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1483  MarR family transcriptional regulator  47.14 
 
 
150 aa  133  9.999999999999999e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.553037  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3291  MarR family transcriptional regulator  49.21 
 
 
152 aa  132  1.9999999999999998e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.570613  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0578  transcriptional regulator, MarR family protein  46.56 
 
 
163 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2313  MarR family transcriptional regulator  44.09 
 
 
147 aa  132  1.9999999999999998e-30  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.708353  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4585  regulatory protein MarR  48.91 
 
 
159 aa  131  3.9999999999999996e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0232  MarR family transcriptional regulator  42.25 
 
 
152 aa  131  3.9999999999999996e-30  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0628  MarR family transcriptional regulator  50 
 
 
144 aa  131  3.9999999999999996e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1189  transcriptional regulator MarR family  46.81 
 
 
158 aa  131  5e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.622384  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0799  MarR family transcriptional regulator  50.39 
 
 
161 aa  131  5e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0977  MarR family transcriptional regulator  44 
 
 
165 aa  130  1.0000000000000001e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0830  MarR family transcriptional regulator  46.21 
 
 
151 aa  130  1.0000000000000001e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0886  MarR family transcriptional regulator  45.45 
 
 
151 aa  129  2.0000000000000002e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1936  transcriptional regulator, MarR family  46.81 
 
 
155 aa  129  2.0000000000000002e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.13089 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3331  MarR family transcriptional regulator  39.46 
 
 
155 aa  127  6e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.376124  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0866  MarR family transcriptional regulator  48.15 
 
 
165 aa  127  8.000000000000001e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3426  transcriptional regulator, MarR family  48.15 
 
 
165 aa  127  8.000000000000001e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5560  MarR family transcriptional regulator  50.4 
 
 
170 aa  126  1.0000000000000001e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.813118  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3498  MarR family transcriptional regulator  48.15 
 
 
165 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001045  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  42.65 
 
 
152 aa  126  1.0000000000000001e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04763  hypothetical protein  42.65 
 
 
143 aa  126  2.0000000000000002e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3621  MarR family transcriptional regulator  47.41 
 
 
165 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.597701 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0686  transcriptional regulator, MarR family  42.66 
 
 
155 aa  125  3e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3161  regulatory protein, MarR  47.73 
 
 
158 aa  125  3e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0336123  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0050  transcriptional regulator, MarR family  47.33 
 
 
164 aa  125  3e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00479818 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5144  MarR family transcriptional regulator  42.95 
 
 
156 aa  124  5e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0835  transcriptional regulator, MarR family protein  43.75 
 
 
150 aa  124  7e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0549  MarR family transcriptional regulator  43.97 
 
 
167 aa  124  7e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2251  MarR family transcriptional regulator  42.54 
 
 
145 aa  124  8.000000000000001e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.344689  normal  0.255238 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2306  putative transcriptional regulator  45.45 
 
 
151 aa  123  1e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2325  transcriptional regulator, MarR family  45.11 
 
 
162 aa  123  1e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0434242 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1176  transcriptional regulator, TrmB  44.7 
 
 
146 aa  123  1e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.713709  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3056  MarR family transcriptional regulator  47.69 
 
 
168 aa  123  1e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1193  transcriptional regulator, TrmB  44.7 
 
 
146 aa  123  1e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1524  MarR family transcriptional regulator  44.85 
 
 
149 aa  123  1e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.26569  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1742  MarR family transcriptional regulator  44.06 
 
 
149 aa  122  2e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3619  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  44.37 
 
 
162 aa  122  2e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0108  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  47.79 
 
 
152 aa  122  2e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.879191 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1203  transcriptional regulator, TrmB  44.7 
 
 
146 aa  122  3e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.529625  normal  0.0362733 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2629  MarR family transcriptional regulator  39.24 
 
 
160 aa  122  3e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.8863  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27230  MarR family transcriptional regulator  45.45 
 
 
151 aa  122  3e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4966  transcriptional regulator, MarR family  44.3 
 
 
153 aa  121  4e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.345847  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0576  transcriptional regulator, TrmB  42.11 
 
 
158 aa  120  6e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0950259  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3189  regulatory protein, MarR  47.37 
 
 
144 aa  120  6e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.637369 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1196  MarR family transcriptional regulator  48.48 
 
 
155 aa  120  6e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1768  transcriptional regulator, MarR family  40.62 
 
 
157 aa  120  7e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1207  transcriptional regulator, MarR family  48.18 
 
 
146 aa  120  8e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000193075 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0813  transcriptional regulator, MarR family  43.7 
 
 
159 aa  120  8e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.800363  normal  0.25148 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4271  MarR family transcriptional regulator  44.06 
 
 
156 aa  119  9.999999999999999e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0653897  normal  0.661065 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3762  MarR family transcriptional regulator  44.85 
 
 
150 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.425599  hitchhiker  0.00135953 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4880  MarR family transcriptional regulator  44.12 
 
 
157 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.368926  hitchhiker  0.00140951 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3233  MarR family transcriptional regulator  44.85 
 
 
150 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.550723  normal  0.0343876 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3662  MarR family transcriptional regulator  44.85 
 
 
150 aa  118  3e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.485543  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2231  MarR family transcriptional regulator  44.12 
 
 
150 aa  119  3e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.106154  normal  0.474897 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0926  transcriptional regulator, MarR family  42.22 
 
 
158 aa  118  3e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.493079  normal  0.487426 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4499  MarR family transcriptional regulator  44.85 
 
 
150 aa  118  3e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.148368  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0061  MarR family transcriptional regulator  40.74 
 
 
171 aa  118  3e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.310818 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3865  MarR family transcriptional regulator  44.85 
 
 
150 aa  118  3e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0792032  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0483  MarR family transcriptional regulator  48.03 
 
 
151 aa  118  3e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0397178 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1134  MarR family transcriptional regulator  48.12 
 
 
144 aa  118  3.9999999999999996e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2005  MarR family transcriptional regulator  41.18 
 
 
143 aa  117  4.9999999999999996e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3626  regulatory protein, MarR  38.24 
 
 
157 aa  118  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.0000000021465  normal  0.0936579 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2842  MarR family transcriptional regulator  43.61 
 
 
150 aa  117  4.9999999999999996e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4256  MarR family transcriptional regulator  43.05 
 
 
166 aa  117  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.973283 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0474  transcriptional regulator, MarR family  48.03 
 
 
155 aa  118  4.9999999999999996e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4635  MarR family transcriptional regulator  45.52 
 
 
153 aa  117  6e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.472747  normal  0.0529683 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0934  MarR family transcriptional regulator  40.62 
 
 
163 aa  117  7e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03887  transcriptional regulator MarR family  40.85 
 
 
152 aa  117  7e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2137  transcriptional regulator, MarR family  39.46 
 
 
154 aa  117  7e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.727084 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3854  MarR family transcriptional regulator  39.58 
 
 
151 aa  117  7e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.113287  normal  0.119098 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1470  MarR family transcriptional regulator  41.91 
 
 
151 aa  117  7e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2452  transcriptional regulator, MarR family  39.22 
 
 
154 aa  117  7e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.126734  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4766  transcriptional regulator, MarR family  40.88 
 
 
166 aa  117  7.999999999999999e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.462626  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1068  MarR family transcriptional regulator  43.17 
 
 
147 aa  117  7.999999999999999e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0886  transcriptional regulator, MarR family  46.51 
 
 
161 aa  117  9e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.541526  normal  0.759862 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2174  regulatory protein MarR  39.22 
 
 
154 aa  117  9e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.363681 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1306  MarR family transcriptional regulator  44.53 
 
 
149 aa  116  9.999999999999999e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.335381  normal  0.344824 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3415  MarR family transcriptional regulator  45.26 
 
 
149 aa  116  9.999999999999999e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0058743 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>