More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SaurJH1_2828 on replicon NC_009619
Organism: Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009619  SaurJH1_2828  regulatory protein MarR  100 
 
 
139 aa  280  4.0000000000000003e-75  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2750  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 
139 aa  280  4.0000000000000003e-75  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.395044  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0269  MarR family transcriptional regulator  34.81 
 
 
138 aa  94.7  4e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1454  MarR family transcriptional regulator  29.23 
 
 
166 aa  85.5  2e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0425619  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0598  MarR family transcriptional regulator  32.09 
 
 
159 aa  84  6e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2628  transcriptional regulator, MarR family  29.63 
 
 
142 aa  77.4  0.00000000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00233343  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1607  transcriptional regulator, MarR family  29.63 
 
 
142 aa  77.4  0.00000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3139  putative transcription regulator protein  23.88 
 
 
159 aa  70.9  0.000000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0150  MarR family transcriptional regulator  32.82 
 
 
154 aa  70.1  0.000000000008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0208553  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1483  MarR family transcriptional regulator  28.36 
 
 
149 aa  67.4  0.00000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.715105  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1975  MarR family transcriptional regulator  26.4 
 
 
155 aa  66.6  0.0000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0153804  normal  0.896313 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2133  MarR family transcriptional regulator  27.2 
 
 
137 aa  66.2  0.0000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2703  MarR family transcriptional regulator  24.44 
 
 
137 aa  64.7  0.0000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0969  transcriptional regulator, MarR family  28.79 
 
 
171 aa  64.7  0.0000000004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000000635233  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1620  MarR family transcriptional regulator  25.98 
 
 
140 aa  64.7  0.0000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000664296  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3416  transcriptional regulator, MarR family  22.39 
 
 
162 aa  64.3  0.0000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.765754  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3070  transcriptional regulator, MarR family  22.39 
 
 
162 aa  64.3  0.0000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2958  transcriptional regulator, MarR family  26.92 
 
 
155 aa  63.5  0.0000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000649784  normal  0.827828 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6455  transcriptional regulator, MarR family  27.07 
 
 
162 aa  63.5  0.0000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3884  putative transcriptional regulator  25.19 
 
 
177 aa  62.4  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0683  MarR family transcriptional regulator  25.58 
 
 
146 aa  62.4  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.836687 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2739  transcriptional regulator, MarR family  26.52 
 
 
157 aa  62  0.000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.340689  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2920  MarR family transcriptional regulator  23.02 
 
 
139 aa  61.2  0.000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1729  regulatory protein, MarR  30.28 
 
 
162 aa  61.2  0.000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3216  transcriptional regulator, MarR family  23.02 
 
 
139 aa  60.8  0.000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2980  MarR family transcriptional regulator  22.3 
 
 
139 aa  60.1  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.134372  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2561  MarR family transcriptional regulator  29.01 
 
 
150 aa  60.1  0.00000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3249  transcriptional regulator, MarR family  22.3 
 
 
139 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.490647  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3228  transcriptional regulator, MarR family  22.3 
 
 
139 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2992  MarR family transcriptional regulator  22.3 
 
 
139 aa  59.3  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3220  MarR family transcriptional regulator  22.3 
 
 
139 aa  59.3  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2498  transcriptional regulator, MarR family  23.7 
 
 
153 aa  58.9  0.00000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.447141 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2632  MarR family transcriptional regulator  23.85 
 
 
161 aa  59.3  0.00000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.256033  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3749  multiple antibiotic resistance protein MarR, putative  31.25 
 
 
162 aa  58.2  0.00000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.17828  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1651  transcriptional regulator, MarR family  33.67 
 
 
140 aa  58.2  0.00000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  8.20136e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2795  transcriptional regulator, MarR family  28.68 
 
 
141 aa  58.2  0.00000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1130  MarR family transcriptional regulator  28.68 
 
 
148 aa  58.2  0.00000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0761  MarR family transcriptional regulator  25.78 
 
 
145 aa  57.8  0.00000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0154826  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0325  MarR family transcriptional regulator  30.85 
 
 
150 aa  57.8  0.00000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5835  transcriptional regulator, MarR family  24.17 
 
 
144 aa  57.4  0.00000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2640  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
154 aa  57.4  0.00000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1634  transcriptional regulator, MarR family  20.77 
 
 
140 aa  57  0.00000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0355019  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0847  transcriptional regulator, MarR family  27.21 
 
 
147 aa  57.4  0.00000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2913  MarR family transcriptional regulator  28.03 
 
 
145 aa  57  0.00000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2838  transcriptional regulator, MarR family  24 
 
 
140 aa  57  0.00000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1249  transcriptional regulator, MarR family  18.8 
 
 
155 aa  56.6  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.193511  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0409  MarR family transcriptional regulator  28.35 
 
 
153 aa  56.6  0.0000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1149  transcriptional regulator, MarR family  29.59 
 
 
167 aa  56.6  0.0000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.332522  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1306  MarR family transcriptional regulator  29.9 
 
 
149 aa  55.8  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.335381  normal  0.344824 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00880  transcriptional regulator, MarR family  27.01 
 
 
148 aa  55.8  0.0000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1341  MarR family transcriptional regulator  23.26 
 
 
156 aa  56.2  0.0000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.116793  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0111  transcriptional regulator, MarR family  29.17 
 
 
147 aa  56.2  0.0000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1208  MarR family transcriptional regulator  29 
 
 
143 aa  55.8  0.0000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0011677  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0049  MarR family transcriptional regulator  20.9 
 
 
162 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1985  MarR family transcriptional regulator  18.8 
 
 
154 aa  56.2  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0411716  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1559  MarR family transcriptional regulator  26.79 
 
 
142 aa  56.2  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.184935 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1448  transcriptional regulator, MarR family  26.53 
 
 
144 aa  55.1  0.0000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.165175  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3000  MarR family transcriptional regulator  23.44 
 
 
145 aa  54.7  0.0000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1526  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 
143 aa  55.1  0.0000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.97312  normal  0.171281 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3121  transcriptional regulator, MarR family  21.37 
 
 
193 aa  54.7  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1032  MarR family transcriptional regulator  29 
 
 
143 aa  54.7  0.0000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.119572  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0709  MarR family transcriptional regulator  25 
 
 
146 aa  54.7  0.0000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.699549  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1068  MarR family transcriptional regulator  28.24 
 
 
147 aa  54.7  0.0000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3930  MarR family transcriptional regulator  29.17 
 
 
143 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.627094  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4436  MarR family transcriptional regulator  29.17 
 
 
143 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1601  MarR family transcriptional regulator  25.19 
 
 
145 aa  53.9  0.0000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7084  MarR family transcriptional regulator  30.19 
 
 
170 aa  53.9  0.0000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1595  MarR family transcriptional regulator  31.53 
 
 
143 aa  53.9  0.0000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.156116  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1670  MarR family transcriptional regulator  31.53 
 
 
143 aa  53.9  0.0000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00529848 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5817  MarR family transcriptional regulator  27.07 
 
 
146 aa  53.9  0.0000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.127726 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5869  MarR family transcriptional regulator  29.21 
 
 
143 aa  52.8  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.263359 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1295  putative transcription regulator protein  22.83 
 
 
147 aa  53.1  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.260048  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2043  transcriptional regulator, MarR family  21.17 
 
 
175 aa  53.1  0.000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.831784  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3645  MarR family transcriptional regulator  25.69 
 
 
160 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.610446  normal  0.0262882 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5172  transcriptional regulator, MarR family  30.38 
 
 
151 aa  52.4  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00668  transcriptional regulator MarR family  27.93 
 
 
166 aa  52.4  0.000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0861  MarR family transcriptional regulator  29.63 
 
 
157 aa  52.8  0.000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4328  MarR family transcriptional regulator  27.55 
 
 
143 aa  52.4  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3868  MarR family transcriptional regulator  27.55 
 
 
143 aa  52.4  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.334531 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1216  transcriptional regulator, MarR family  21.88 
 
 
149 aa  52.4  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.298093  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0651  MarR family transcriptional regulator  24.78 
 
 
172 aa  51.6  0.000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1125  transcriptional regulator, MarR family  21.88 
 
 
172 aa  51.6  0.000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.416342 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3922  MarR family transcriptional regulator  23.58 
 
 
152 aa  52  0.000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0462082  normal  0.0695872 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7578  transcriptional regulator, MarR family  37.93 
 
 
162 aa  52  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3570  MarR family transcriptional regulator  29.9 
 
 
171 aa  51.2  0.000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.247728 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1463  MarR family transcriptional regulator  27.27 
 
 
149 aa  51.6  0.000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2762  MarR family transcriptional regulator  25.41 
 
 
184 aa  51.6  0.000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.351769  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1739  MarR family transcriptional regulator  29.73 
 
 
143 aa  51.6  0.000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3146  MarR family protein  33.78 
 
 
162 aa  50.8  0.000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0129718  normal  0.0536373 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1506  MarR family transcriptional regulator  28.69 
 
 
131 aa  50.8  0.000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1299  MarR family transcriptional regulator  28.69 
 
 
131 aa  50.8  0.000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.541752  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1272  MarR family transcriptional regulator  28.69 
 
 
131 aa  50.8  0.000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.610251  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1859  MarR family transcriptional regulator  27.07 
 
 
154 aa  50.8  0.000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1273  MarR family transcriptional regulator  28.69 
 
 
131 aa  50.8  0.000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.071067  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1406  MarR family transcriptional regulator  28.69 
 
 
131 aa  50.8  0.000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06220  transcriptional regulator, MarR family  24.44 
 
 
169 aa  50.8  0.000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1578  MarR family transcriptional regulator  25.19 
 
 
141 aa  50.8  0.000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0267314 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2712  MarR family transcriptional regulator  28.83 
 
 
147 aa  50.4  0.000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0271862 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1477  transcriptional regulator, MarR family  28.69 
 
 
139 aa  50.4  0.000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1545  transcriptional regulator, MarR family  28.69 
 
 
139 aa  50.4  0.000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00793933  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>