More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_06856 on replicon NC_009784
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009784  VIBHAR_06856  hypothetical protein  100 
 
 
142 aa  291  2e-78  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2069  MarR family transcriptional regulator  36.09 
 
 
138 aa  107  7.000000000000001e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.180128  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1595  MarR family transcriptional regulator  34.59 
 
 
143 aa  103  6e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.156116  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1670  MarR family transcriptional regulator  34.59 
 
 
143 aa  103  6e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00529848 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2485  MarR family transcriptional regulator  33.83 
 
 
138 aa  103  1e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2478  MarR family transcriptional regulator  33.83 
 
 
138 aa  103  1e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.795114  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2598  MarR family transcriptional regulator  33.83 
 
 
138 aa  103  1e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0212362 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1866  transcriptional regulator, MarR family  33.83 
 
 
138 aa  103  1e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0339276  hitchhiker  0.000000667119 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1739  MarR family transcriptional regulator  33.83 
 
 
143 aa  103  1e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2240  MarR family transcriptional regulator  33.58 
 
 
157 aa  100  5e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2006  regulatory protein, MarR  34.85 
 
 
138 aa  100  6e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2294  transcriptional regulator, MarR family protein  34.09 
 
 
139 aa  100  6e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2640  MarR family transcriptional regulator  32.84 
 
 
154 aa  98.6  3e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1552  MarR family transcriptional regulator  33.08 
 
 
138 aa  97.1  7e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2712  MarR family transcriptional regulator  34.62 
 
 
147 aa  95.9  2e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0271862 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3737  MarR family transcriptional regulator  36.76 
 
 
159 aa  95.1  3e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1874  MarR family transcriptional regulator  33.85 
 
 
139 aa  95.1  3e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000000119555 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2546  MarR family transcriptional regulator  37.59 
 
 
137 aa  91.3  4e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2913  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
145 aa  89.4  2e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1483  MarR family transcriptional regulator  32.09 
 
 
149 aa  84.3  4e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.715105  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1607  transcriptional regulator, MarR family  32.56 
 
 
142 aa  84.7  4e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2628  transcriptional regulator, MarR family  32.56 
 
 
142 aa  84.7  4e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00233343  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1130  MarR family transcriptional regulator  32.37 
 
 
148 aa  83.2  0.000000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2703  MarR family transcriptional regulator  32.56 
 
 
137 aa  82.8  0.000000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0300  transcriptional regulator MarR family  28.57 
 
 
149 aa  81.3  0.000000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1975  MarR family transcriptional regulator  33.08 
 
 
155 aa  80.9  0.000000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0153804  normal  0.896313 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0269  MarR family transcriptional regulator  35.4 
 
 
138 aa  80.5  0.000000000000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2958  transcriptional regulator, MarR family  34.11 
 
 
155 aa  79.7  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000649784  normal  0.827828 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2891  transcriptional regulator, MarR family  35.78 
 
 
143 aa  79  0.00000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.749218  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1634  transcriptional regulator, MarR family  29.2 
 
 
140 aa  78.6  0.00000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0355019  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2795  transcriptional regulator, MarR family  27.54 
 
 
141 aa  77.4  0.00000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0113  MarR family transcriptional regulator  33.08 
 
 
141 aa  75.5  0.0000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.51786  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1441  MarR family transcriptional regulator  34.07 
 
 
147 aa  75.1  0.0000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.256486  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4054  MarR family transcriptional regulator  33.6 
 
 
174 aa  74.7  0.0000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2632  MarR family transcriptional regulator  29.93 
 
 
161 aa  74.7  0.0000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.256033  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1107  MarR family transcriptional regulator  33.63 
 
 
145 aa  72.8  0.000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1059  transcriptional regulator, TrmB  40.86 
 
 
153 aa  73.2  0.000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0495893  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2214  MarR family transcriptional regulator  29.71 
 
 
157 aa  73.6  0.000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.693341 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0105  transcriptional regulator, MarR family  30.66 
 
 
149 aa  72.4  0.000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.983875 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1651  transcriptional regulator, MarR family  30 
 
 
140 aa  72.4  0.000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  8.20136e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0598  MarR family transcriptional regulator  29.41 
 
 
159 aa  72.8  0.000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3382  MarR family transcriptional regulator  27.94 
 
 
147 aa  72  0.000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2127  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
145 aa  71.6  0.000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1828  MarR family transcriptional regulator  28.91 
 
 
153 aa  71.2  0.000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0229599 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1741  MarR family transcriptional regulator  30.53 
 
 
151 aa  70.5  0.000000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.15661  normal  0.360126 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5714  MarR family transcriptional regulator  32.84 
 
 
153 aa  70.5  0.000000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00966957 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4961  transcriptional regulator, MarR family  29.41 
 
 
192 aa  69.7  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0717313  normal  0.154952 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2782  transcriptional regulator, MarR family  29.41 
 
 
192 aa  69.7  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00307717  normal  0.0921189 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0579  MarR family transcriptional regulator  33.83 
 
 
148 aa  69.7  0.00000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.14462  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1379  transcriptional regulator, MarR family  32.59 
 
 
149 aa  69.7  0.00000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.92932 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1454  MarR family transcriptional regulator  28.15 
 
 
166 aa  68.9  0.00000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0425619  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0135  MarR family transcriptional regulator  33.93 
 
 
149 aa  68.6  0.00000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0317  transcriptional regulator, MarR family  28.89 
 
 
146 aa  68.2  0.00000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1796  MarR family transcriptional regulator  31.86 
 
 
191 aa  68.2  0.00000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.630858  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0735  MarR family transcriptional regulator  30.77 
 
 
150 aa  67.8  0.00000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.711731  normal  0.77844 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2923  MarR family transcriptional regulator  31.82 
 
 
176 aa  67.4  0.00000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.560402 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0331  hypothetical protein  26.36 
 
 
165 aa  67  0.00000000007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3139  putative transcription regulator protein  29.93 
 
 
159 aa  66.2  0.0000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0158  transcriptional regulator, MarR family  30.47 
 
 
152 aa  66.6  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0107221 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4219  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 
180 aa  66.6  0.0000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.260034 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3416  transcriptional regulator, MarR family  28.47 
 
 
162 aa  65.9  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.765754  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1068  transcriptional regulator, MarR family  32.85 
 
 
164 aa  65.9  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.388349  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2920  MarR family transcriptional regulator  27.48 
 
 
139 aa  65.5  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4610  transcriptional regulator, MarR family  30.53 
 
 
148 aa  65.5  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.4763  normal  0.155158 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1729  MarR family transcriptional regulator  31.03 
 
 
177 aa  65.9  0.0000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.892869  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1511  MarR family transcriptional regulator  41.03 
 
 
159 aa  65.9  0.0000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3070  transcriptional regulator, MarR family  28.47 
 
 
162 aa  65.9  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4622  MarR family transcriptional regulator  28.46 
 
 
174 aa  66.2  0.0000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1847  MarR family transcriptional regulator  30.53 
 
 
178 aa  66.2  0.0000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.603807  normal  0.333569 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1342  transcriptional regulator, MarR family  35.48 
 
 
156 aa  65.1  0.0000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000398816 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1858  MarR family transcriptional regulator  27.27 
 
 
168 aa  65.5  0.0000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3249  transcriptional regulator, MarR family  27.48 
 
 
139 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.490647  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3216  transcriptional regulator, MarR family  27.48 
 
 
139 aa  65.1  0.0000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3363  transcriptional regulator, MarR family  34.15 
 
 
154 aa  64.7  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.7144  hitchhiker  0.007363 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3320  hypothetical protein  32.99 
 
 
151 aa  65.1  0.0000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0293206  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2980  MarR family transcriptional regulator  27.48 
 
 
139 aa  64.3  0.0000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.134372  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0164  transcriptional regulator, MarR family  28.12 
 
 
152 aa  64.3  0.0000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.906784 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2992  MarR family transcriptional regulator  27.48 
 
 
139 aa  63.9  0.0000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3228  transcriptional regulator, MarR family  27.48 
 
 
139 aa  63.9  0.0000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0131  transcriptional regulator, MarR family  31.07 
 
 
156 aa  64.3  0.0000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000555257  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3220  MarR family transcriptional regulator  27.48 
 
 
139 aa  63.9  0.0000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0409  MarR family transcriptional regulator  31.3 
 
 
153 aa  63.9  0.0000000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3105  transcriptional regulator, MarR family  34.15 
 
 
154 aa  63.9  0.0000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0272572 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1341  MarR family transcriptional regulator  24.63 
 
 
156 aa  63.5  0.0000000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.116793  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4285  transcriptional regulator, MarR family  33.06 
 
 
166 aa  63.9  0.0000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0811  transcriptional regulator, MarR family  29.41 
 
 
149 aa  63.9  0.0000000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.770437  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1655  transcriptional regulator, MarR family  25.56 
 
 
155 aa  63.5  0.0000000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1547  MarR family transcriptional regulator  35.54 
 
 
148 aa  63.5  0.0000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.187738 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1907  MarR family transcriptional regulator  28.16 
 
 
193 aa  63.2  0.000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.75839 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2587  MarR family transcriptional regulator  31 
 
 
142 aa  62.4  0.000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.443857  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0630  MarR family transcriptional regulator  35.79 
 
 
194 aa  62.4  0.000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0861  transcriptional regulator, MarR family  32.14 
 
 
161 aa  62.8  0.000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.440211 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1411  MarR family transcriptional regulator  25.93 
 
 
147 aa  62.4  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.168618  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3933  transcriptional regulator, MarR family  25.71 
 
 
144 aa  62.4  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2452  transcriptional regulator, MarR family  29.41 
 
 
154 aa  62.8  0.000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.126734  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1098  MarR family transcriptional regulator  32.74 
 
 
171 aa  62.4  0.000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0619  MarR family transcriptional regulator  30.22 
 
 
156 aa  62.4  0.000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5531  transcriptional regulator, TrmB  33.64 
 
 
158 aa  62  0.000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.412859  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5662  MarR family transcriptional regulator  33.87 
 
 
153 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.49927  normal 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5405  MarR family transcriptional regulator  29.23 
 
 
142 aa  62  0.000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.955747 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>