More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_1342 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011831  Cagg_1342  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 		 156 aa  303  4.0000000000000004e-82  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000398816 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3184  transcriptional regulator, MarR family  46.61 
 
 		 162 aa  99.4  2e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.824605 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1483  MarR family transcriptional regulator  43.4 
 
 		 149 aa  75.5  0.0000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.715105  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2628  transcriptional regulator, MarR family  37.23 
 
 		 142 aa  72.4  0.000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00233343  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1425  transcriptional regulator, MarR family  33.91 
 
 		 148 aa  72  0.000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000689424 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1253  MarR family transcriptional regulator  33.91 
 
 		 148 aa  72  0.000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1226  MarR family transcriptional regulator  33.91 
 
 		 148 aa  72  0.000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.194022  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1228  MarR family transcriptional regulator  33.91 
 
 		 148 aa  72  0.000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1352  MarR family transcriptional regulator  33.91 
 
 		 148 aa  72  0.000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1450  MarR family transcriptional regulator  33.91 
 
 		 148 aa  71.2  0.000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1251  MarR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 148 aa  71.6  0.000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1607  transcriptional regulator, MarR family  42.06 
 
 		 142 aa  71.6  0.000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1634  transcriptional regulator, MarR family  36.36 
 
 		 140 aa  71.2  0.000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0355019  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3404  transcriptional regulator, MarR family  35.65 
 
 		 120 aa  70.5  0.000000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0218  MarR family transcriptional regulator  28.26 
 
 		 143 aa  70.5  0.000000000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1491  transcriptional regulator, MarR family  33.04 
 
 		 148 aa  70.5  0.000000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1388  transcriptional regulator, MarR family  33.04 
 
 		 148 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3956  transcriptional regulator, MarR family  33.04 
 
 		 148 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.410327 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0220  MarR family transcriptional regulator  27.54 
 
 		 143 aa  68.2  0.00000000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1059  transcriptional regulator, TrmB  38.26 
 
 		 153 aa  67.4  0.00000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0495893  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0731  transcriptional regulator, MarR family  43.62 
 
 		 156 aa  67  0.00000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000118752  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3022  transcriptional regulator, TrmB  37.38 
 
 		 157 aa  67  0.00000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.195041  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0121  MarR family transcriptional regulator  36.15 
 
 		 169 aa  67  0.00000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.273573  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2703  MarR family transcriptional regulator  39.62 
 
 		 137 aa  67  0.00000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2113  MarR family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 162 aa  67  0.0000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.553961 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0783  MarR family transcriptional regulator  27.34 
 
 		 158 aa  66.2  0.0000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1525  transcriptional regulator, MarR family  39.5 
 
 		 156 aa  66.2  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1060  MarR family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 162 aa  65.5  0.0000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1724  transcriptional regulator, MarR family  37.5 
 
 		 159 aa  66.2  0.0000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.118404  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06856  hypothetical protein  35.48 
 
 		 142 aa  65.5  0.0000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0855  transcriptional regulator, MarR family  30.89 
 
 		 147 aa  64.3  0.0000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4242  MarR family transcriptional regulator  40.95 
 
 		 172 aa  63.9  0.0000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.594533  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5531  transcriptional regulator, TrmB  34.82 
 
 		 158 aa  63.5  0.000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.412859  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5248  MarR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 151 aa  62.4  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.282441  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5336  MarR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 151 aa  62.4  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.293186 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5627  MarR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 151 aa  62.4  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.281141  normal  0.686349 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9024  Transcriptional regulators-like protein  39.78 
 
 		 154 aa  62  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0330  MarR family transcriptional regulator  47.3 
 
 		 173 aa  61.6  0.000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0730  MarR family transcriptional regulator  37.74 
 
 		 152 aa  61.2  0.000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.378661  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0573  MarR family transcriptional regulator  37.74 
 
 		 152 aa  61.6  0.000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.588346  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0576  MarR family transcriptional regulator  36.79 
 
 		 155 aa  61.6  0.000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0629  MarR family transcriptional regulator  37.74 
 
 		 152 aa  61.2  0.000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000383532  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0572  MarR family transcriptional regulator  37.74 
 
 		 152 aa  61.2  0.000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000763093  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0662  MarR family transcriptional regulator  37.74 
 
 		 152 aa  61.2  0.000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000590636  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0719  transcriptional regulator, MarR family  37.74 
 
 		 152 aa  61.2  0.000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.5947e-17 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7275  MarR family transcriptional regulator  42.72 
 
 		 151 aa  60.8  0.000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.430156  normal  0.0802572 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0694  transcriptional regulator, MarR family  37.74 
 
 		 152 aa  60.8  0.000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00121928  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0942  MarR family transcriptional regulator  38.76 
 
 		 164 aa  60.8  0.000000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.388439 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1454  MarR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 166 aa  60.8  0.000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0425619  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0992  MarR family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 148 aa  59.7  0.00000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0028906  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3051  transcriptional regulator, MarR family  32.67 
 
 		 137 aa  60.1  0.00000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.193524  hitchhiker  0.00149188 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0269  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 138 aa  60.1  0.00000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4644  transcriptional regulator, MarR family  36.79 
 
 		 152 aa  60.1  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000297134  unclonable  1.87332e-26 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0791  transcriptional regulator, MarR family  36.79 
 
 		 152 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000107079  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2129  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 148 aa  58.9  0.00000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0697643  normal  0.94503 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1726  transcriptional regulator, MarR family  39.58 
 
 		 144 aa  58.5  0.00000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.108071  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0503  transcriptional regulator, MarR family  35.9 
 
 		 171 aa  58.5  0.00000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.554707 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0791  MarR family transcriptional regulator  29.2 
 
 		 147 aa  58.5  0.00000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2619  transcriptional regulator, MarR family  34.35 
 
 		 167 aa  58.5  0.00000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0442  transcriptional regulator, MarR family  35.96 
 
 		 172 aa  58.5  0.00000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.798743  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1531  transcriptional regulator, TrmB  29.63 
 
 		 141 aa  57.8  0.00000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.02316  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3305  MarR family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 136 aa  58.2  0.00000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0122445  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4043  MarR family transcriptional regulator  32.52 
 
 		 326 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.529285 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4501  MarR family transcriptional regulator  32.52 
 
 		 336 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.795895  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4070  MarR family transcriptional regulator  33.66 
 
 		 185 aa  57  0.00000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0270  MarR family transcriptional regulator  35.4 
 
 		 142 aa  57  0.00000008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1208  transcriptional regulator, MarR family  37.82 
 
 		 147 aa  57  0.0000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00251951  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5961  transcriptional regulator, MarR family  35.71 
 
 		 142 aa  55.8  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1154  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 164 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.246648  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4422  transcriptional regulator, MarR family  38.16 
 
 		 138 aa  55.8  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2120  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 164 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.401109  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4054  MarR family transcriptional regulator  36.45 
 
 		 174 aa  55.8  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0613  MarR family transcriptional regulator  39.25 
 
 		 150 aa  55.8  0.0000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.31364  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1595  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 164 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000929046  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0255  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 164 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1958  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 164 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1975  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 164 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0792948  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0906  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 164 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.670814  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1750  transcriptional regulator, MarR family  30.08 
 
 		 149 aa  56.2  0.0000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3655  MarR family transcriptional regulator  39.02 
 
 		 163 aa  55.8  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00553213  normal  0.217217 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5035  transcriptional regulator, MarR family  34.59 
 
 		 140 aa  56.2  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.1398  normal  0.0159957 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0590  putative transcription regulator protein  36.97 
 
 		 178 aa  55.5  0.0000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2462  MarR family transcriptional regulator  24.8 
 
 		 138 aa  55.5  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0843644  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0524  multidrug resistance operon repressor MexR  36.27 
 
 		 147 aa  55.5  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.084309  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0254  transcriptional regulator, MarR family  35.43 
 
 		 166 aa  55.5  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3125  transcriptional regulator, TrmB  33.04 
 
 		 157 aa  55.5  0.0000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.402819 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4525  transcriptional regulator, MarR family  39.71 
 
 		 165 aa  55.1  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2725  putative transcription regulator protein  34.92 
 
 		 157 aa  55.1  0.0000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.612085  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3065  transcriptional regulator, MarR family  33.62 
 
 		 147 aa  55.1  0.0000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0826002 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2899  regulatory protein MarR  33.33 
 
 		 157 aa  55.1  0.0000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.1792  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0300  transcriptional regulator MarR family  35.06 
 
 		 149 aa  55.1  0.0000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4102  transcriptional regulator, MarR family  36.84 
 
 		 138 aa  54.7  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0802  MarR family transcriptional regulator  34.51 
 
 		 160 aa  54.7  0.0000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0707582  normal  0.338446 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0030  MarR family transcriptional regulator  35.2 
 
 		 233 aa  55.1  0.0000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4471  Transcriptional regulators-like protein  32.59 
 
 		 137 aa  54.7  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.155618  normal  0.207869 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2410  transcriptional regulator, MarR family  32.87 
 
 		 163 aa  54.7  0.0000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0478881  normal  0.0157959 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1845  transcriptional regulator, MarR family  30.3 
 
 		 157 aa  54.7  0.0000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.146036  normal  0.153387 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05520  multidrug resistance operon repressor MexR  36.27 
 
 		 147 aa  54.7  0.0000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3320  hypothetical protein  37.25 
 
 		 151 aa  54.7  0.0000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0293206  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0194  hypothetical protein  32.58 
 
 		 161 aa  54.7  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>