More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_0855 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012793  GWCH70_0855  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 		 147 aa  298  1e-80  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1750  transcriptional regulator, MarR family  86.01 
 
 		 149 aa  257  3e-68  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1491  transcriptional regulator, MarR family  65.69 
 
 		 148 aa  187  4e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1253  MarR family transcriptional regulator  65.69 
 
 		 148 aa  187  4e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1226  MarR family transcriptional regulator  65.69 
 
 		 148 aa  187  4e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.194022  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1228  MarR family transcriptional regulator  65.69 
 
 		 148 aa  187  4e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1352  MarR family transcriptional regulator  65.69 
 
 		 148 aa  187  4e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1425  transcriptional regulator, MarR family  65.69 
 
 		 148 aa  187  4e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000689424 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1450  MarR family transcriptional regulator  65.69 
 
 		 148 aa  187  5.999999999999999e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1251  MarR family transcriptional regulator  64.23 
 
 		 148 aa  184  3e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1388  transcriptional regulator, MarR family  64.23 
 
 		 148 aa  184  4e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3956  transcriptional regulator, MarR family  64.23 
 
 		 148 aa  184  4e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.410327 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1060  MarR family transcriptional regulator  61.76 
 
 		 162 aa  177  4e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0362  MarR family transcriptional regulator  55.86 
 
 		 147 aa  166  1e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2084  transcriptional regulator, MarR family  56.25 
 
 		 147 aa  165  2e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1844  MarR family transcriptional regulator  44.8 
 
 		 141 aa  122  1e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2595  regulatory protein MarR  43.44 
 
 		 144 aa  115  1.9999999999999998e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.660325  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2543  transcriptional regulator, TrmB  43.44 
 
 		 144 aa  115  1.9999999999999998e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.751029  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0942  MarR family transcriptional regulator  42.54 
 
 		 164 aa  108  4.0000000000000004e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.388439 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1910  MarR family transcriptional regulator  36.64 
 
 		 141 aa  103  6e-22  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3065  transcriptional regulator, MarR family  38.3 
 
 		 147 aa  91.3  4e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0826002 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1679  transcriptional regulator, TrmB  36.23 
 
 		 141 aa  89  2e-17  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.995926  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1208  transcriptional regulator, MarR family  38.3 
 
 		 147 aa  87.8  5e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00251951  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0791  MarR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 147 aa  87.8  5e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1315  MarR family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 149 aa  87  7e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.146285  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3450  MarR family transcriptional regulator  39.1 
 
 		 151 aa  81.3  0.000000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1279  MarR family transcriptional regulator  32.12 
 
 		 150 aa  74.7  0.0000000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1567  transcriptional regulator, MarR family  35.4 
 
 		 141 aa  75.1  0.0000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0390  transcriptional regulator, MarR family  32.03 
 
 		 165 aa  74.7  0.0000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.471092  normal  0.0364487 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0194  hypothetical protein  31.62 
 
 		 161 aa  72.4  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3336  MarR family transcriptional regulator  32.54 
 
 		 166 aa  71.6  0.000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.470257 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1384  MarR family transcriptional regulator  35.19 
 
 		 198 aa  71.2  0.000000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25260  transcriptional regulator  30.95 
 
 		 163 aa  71.2  0.000000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.113734  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1400  MarR family transcriptional regulator  35.19 
 
 		 212 aa  70.9  0.000000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0121  MarR family transcriptional regulator  28.91 
 
 		 169 aa  70.5  0.000000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.273573  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1423  MarR family transcriptional regulator  35.19 
 
 		 191 aa  70.5  0.000000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2954  transcriptional regulator, MarR family  35.19 
 
 		 191 aa  70.5  0.000000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.237643  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5658  putative transcriptional regulator, MarR family  32.41 
 
 		 170 aa  70.1  0.000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.401607  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2484  transcriptional regulator, MarR family  34.43 
 
 		 163 aa  70.1  0.00000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.105548  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1582  MarR family transcriptional regulator  36 
 
 		 179 aa  68.2  0.00000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0030  MarR family transcriptional regulator  28.91 
 
 		 233 aa  68.6  0.00000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2691  MarR family transcriptional regulator  34.58 
 
 		 178 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00759324 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2859  MarR family transcriptional regulator  35 
 
 		 197 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.195549 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2759  MarR family transcriptional regulator  35 
 
 		 178 aa  68.2  0.00000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2996  transcriptional repressor MprA  32.46 
 
 		 176 aa  67.4  0.00000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0026916 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2961  transcriptional repressor MprA  32.46 
 
 		 176 aa  67.4  0.00000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0125645 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3013  transcriptional repressor MprA  32.46 
 
 		 176 aa  67.4  0.00000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00073704 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0731  transcriptional regulator, MarR family  28.1 
 
 		 156 aa  67  0.00000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000118752  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3119  transcriptional repressor MprA  32.46 
 
 		 176 aa  67  0.00000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0399537 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2930  transcriptional repressor MprA  32.46 
 
 		 176 aa  67.4  0.00000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2057  transcriptional regulator, MarR family  31.09 
 
 		 153 aa  67  0.00000000008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.240684  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1112  MarR family transcriptional regulator  31.67 
 
 		 140 aa  67  0.00000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0269  MarR family transcriptional regulator  31.3 
 
 		 138 aa  66.6  0.0000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1523  MarR family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 137 aa  66.6  0.0000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1531  transcriptional regulator, TrmB  26.96 
 
 		 141 aa  65.9  0.0000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.02316  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4259  transcriptional regulator, MarR family  36.17 
 
 		 137 aa  65.9  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2531  MarR family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 173 aa  65.9  0.0000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1937  MarR family transcriptional regulator  31.13 
 
 		 141 aa  65.5  0.0000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0024671  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0991  transcriptional regulator, MarR family  30.88 
 
 		 166 aa  65.9  0.0000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4243  putative transcriptional regulator, MarR family  31.01 
 
 		 171 aa  65.1  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0515432 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1387  transcriptional regulator, MarR family  31.86 
 
 		 142 aa  65.1  0.0000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4191  transcriptional regulator, MarR family  36.73 
 
 		 139 aa  65.5  0.0000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0975535  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2391  MarR family transcriptional regulator  32.79 
 
 		 164 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.631724  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0859  transcriptional repressor MprA  29.82 
 
 		 170 aa  65.1  0.0000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3404  transcriptional regulator, MarR family  29.82 
 
 		 120 aa  65.1  0.0000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3912  MarR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 150 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0139173  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02539  DNA-binding transcriptional repressor of microcin B17 synthesis and multidrug efflux  31.58 
 
 		 176 aa  64.3  0.0000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1000  transcriptional regulator, MarR family  31.58 
 
 		 176 aa  64.3  0.0000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.944613  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02504  hypothetical protein  31.58 
 
 		 176 aa  64.3  0.0000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1023  transcriptional repressor MprA  31.58 
 
 		 176 aa  64.3  0.0000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0388425 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2820  transcriptional repressor MprA  31.58 
 
 		 176 aa  64.3  0.0000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2806  transcriptional repressor MprA  31.58 
 
 		 176 aa  64.3  0.0000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00193858  hitchhiker  0.00916443 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4236  transcriptional regulator, MarR family  34.74 
 
 		 137 aa  64.3  0.0000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3192  transcriptional repressor MprA  31.58 
 
 		 176 aa  64.3  0.0000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.885571  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1342  transcriptional regulator, MarR family  30.89 
 
 		 156 aa  64.3  0.0000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000398816 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4150  MarR family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 139 aa  63.9  0.0000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00563558  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3838  MarR family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 139 aa  63.9  0.0000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000189375  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1311  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 192 aa  63.9  0.0000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1956  transcriptional regulator  25.9 
 
 		 154 aa  63.9  0.0000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.720732 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4214  transcriptional regulator, MarR family  34.65 
 
 		 139 aa  63.5  0.0000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000392908  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1046  transcriptional regulator, MarR family  34.65 
 
 		 139 aa  63.9  0.0000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.965341  hitchhiker  0.00043703 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1949  transcriptional regulator, MarR family  31.62 
 
 		 166 aa  63.5  0.0000000009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3162  transcriptional repressor MprA  30.7 
 
 		 176 aa  63.2  0.000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2059  regulatory protein, MarR  38.27 
 
 		 166 aa  63.2  0.000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0666418  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5089  MarR family transcriptional regulator  27.94 
 
 		 145 aa  63.2  0.000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.104919  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0783  MarR family transcriptional regulator  26.56 
 
 		 158 aa  63.2  0.000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3991  MarR family transcriptional regulator  33.66 
 
 		 150 aa  62.4  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00156132  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3822  MarR family transcriptional regulator  33.66 
 
 		 139 aa  62.4  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000229198  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3429  transcriptional regulator MarR family  30.84 
 
 		 157 aa  62.4  0.000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.905636  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2967  transcriptional repressor MprA  31.58 
 
 		 176 aa  62.4  0.000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.771263  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3928  transcriptional repressor MprA  30.7 
 
 		 176 aa  62.4  0.000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.500125 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2891  transcriptional regulator, MarR family  28.83 
 
 		 143 aa  62.8  0.000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.749218  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4303  MarR family transcriptional regulator  33.66 
 
 		 150 aa  62.4  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0482862  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1439  transcriptional regulator, MarR family  31.68 
 
 		 140 aa  62  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.207252  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1651  MarR family transcriptional regulator  27.82 
 
 		 172 aa  62.4  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.902908  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3305  MarR family transcriptional regulator  28.46 
 
 		 136 aa  62.4  0.000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0122445  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02201  hypothetical protein  32.81 
 
 		 160 aa  62  0.000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3566  MarR family transcriptional regulator  29.58 
 
 		 164 aa  62  0.000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1702  MarR family transcriptional regulator  27.82 
 
 		 172 aa  62.4  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.00165311  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1309  MarR family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 139 aa  62.4  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>