More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SaurJH9_2543 on replicon NC_009487
Organism: Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009632  SaurJH1_2595  regulatory protein MarR  100 
 
 
144 aa  296  5e-80  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.660325  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2543  transcriptional regulator, TrmB  100 
 
 
144 aa  296  5e-80  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.751029  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1251  MarR family transcriptional regulator  48.12 
 
 
148 aa  127  4.0000000000000003e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1388  transcriptional regulator, MarR family  47.37 
 
 
148 aa  125  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3956  transcriptional regulator, MarR family  47.37 
 
 
148 aa  125  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.410327 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1450  MarR family transcriptional regulator  46.62 
 
 
148 aa  124  5e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1253  MarR family transcriptional regulator  46.62 
 
 
148 aa  124  5e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1226  MarR family transcriptional regulator  46.62 
 
 
148 aa  124  5e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.194022  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1228  MarR family transcriptional regulator  46.62 
 
 
148 aa  124  5e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1352  MarR family transcriptional regulator  46.62 
 
 
148 aa  124  5e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1425  transcriptional regulator, MarR family  46.62 
 
 
148 aa  124  5e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000689424 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1491  transcriptional regulator, MarR family  45.86 
 
 
148 aa  122  1e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0362  MarR family transcriptional regulator  44.76 
 
 
147 aa  120  7e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1060  MarR family transcriptional regulator  45.11 
 
 
162 aa  117  4.9999999999999996e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2084  transcriptional regulator, MarR family  44.93 
 
 
147 aa  117  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0855  transcriptional regulator, MarR family  43.44 
 
 
147 aa  115  1.9999999999999998e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1750  transcriptional regulator, MarR family  42.62 
 
 
149 aa  114  6e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1844  MarR family transcriptional regulator  38.79 
 
 
141 aa  95.9  2e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1679  transcriptional regulator, TrmB  31.62 
 
 
141 aa  85.9  2e-16  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.995926  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0791  MarR family transcriptional regulator  34.62 
 
 
147 aa  84.3  5e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0942  MarR family transcriptional regulator  29.85 
 
 
164 aa  83.6  8e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.388439 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1910  MarR family transcriptional regulator  34.11 
 
 
141 aa  81.3  0.000000000000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1567  transcriptional regulator, MarR family  33.04 
 
 
141 aa  77.8  0.00000000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1387  transcriptional regulator, MarR family  33.93 
 
 
142 aa  72.4  0.000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1523  MarR family transcriptional regulator  31.78 
 
 
137 aa  70.5  0.000000000007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3065  transcriptional regulator, MarR family  27.82 
 
 
147 aa  67.8  0.00000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0826002 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1937  MarR family transcriptional regulator  34.91 
 
 
141 aa  66.6  0.0000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0024671  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2196  MarR family transcriptional regulator  28.85 
 
 
146 aa  65.5  0.0000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3013  putative MarR-family regulatory protein  30.83 
 
 
154 aa  63.5  0.0000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.102255  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2376  transcriptional regulator, MarR family  39.47 
 
 
170 aa  63.2  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.0000000679791  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1208  transcriptional regulator, MarR family  27.07 
 
 
147 aa  63.2  0.000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00251951  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0731  transcriptional regulator, MarR family  25 
 
 
156 aa  62.4  0.000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000118752  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2619  transcriptional regulator, MarR family  25.37 
 
 
167 aa  61.6  0.000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2651  transcriptional regulator, MarR family  30.22 
 
 
160 aa  61.6  0.000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3566  MarR family transcriptional regulator  31.06 
 
 
164 aa  60.8  0.000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1483  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 
149 aa  60.1  0.00000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.715105  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3506  transcriptional regulator, MarR family  29.09 
 
 
164 aa  59.7  0.00000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.719145  normal  0.764643 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0015  transcriptional regulator, TrmB  27.72 
 
 
145 aa  58.9  0.00000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0473427  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0118  transcriptional regulator, MarR family  33.01 
 
 
164 aa  58.5  0.00000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.466512  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2057  transcriptional regulator, MarR family  26.87 
 
 
153 aa  57.4  0.00000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.240684  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0557  MarR family transcriptional regulator  28.79 
 
 
152 aa  57.4  0.00000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000149259  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0350  transcriptional regulator, MarR family  32.14 
 
 
149 aa  57.4  0.00000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0878  transcriptional regulator, MarR family  31.19 
 
 
163 aa  57  0.00000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1439  transcriptional regulator, MarR family  28.71 
 
 
140 aa  56.2  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.207252  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14940  transcriptional regulator, MarR family  31.78 
 
 
182 aa  56.6  0.0000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3904  transcriptional regulator, MarR family  28.71 
 
 
139 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1309  MarR family transcriptional regulator  29.7 
 
 
139 aa  56.6  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3450  MarR family transcriptional regulator  30.83 
 
 
151 aa  55.8  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4236  transcriptional regulator, MarR family  35.11 
 
 
137 aa  55.8  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1315  MarR family transcriptional regulator  23.7 
 
 
149 aa  55.8  0.0000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.146285  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1506  MarR family transcriptional regulator  29 
 
 
131 aa  55.1  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1299  MarR family transcriptional regulator  29 
 
 
131 aa  55.1  0.0000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.541752  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1272  MarR family transcriptional regulator  29 
 
 
131 aa  55.1  0.0000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.610251  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1273  MarR family transcriptional regulator  29 
 
 
131 aa  55.1  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.071067  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1545  transcriptional regulator, MarR family  29 
 
 
139 aa  55.5  0.0000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00793933  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1406  MarR family transcriptional regulator  29 
 
 
131 aa  55.1  0.0000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0847  transcriptional regulator, MarR family  22.76 
 
 
147 aa  55.1  0.0000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2143  regulatory protein, MarR  25.23 
 
 
214 aa  55.5  0.0000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1477  transcriptional regulator, MarR family  29 
 
 
139 aa  55.5  0.0000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3728  transcriptional regulator, MarR family  29.91 
 
 
161 aa  55.1  0.0000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2058  MarR family transcriptional regulator  25.41 
 
 
159 aa  54.7  0.0000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000115689  normal  0.149195 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1028  MarR family transcriptional regulator  21.68 
 
 
146 aa  54.3  0.0000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.663158  hitchhiker  0.00390139 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1677  MarR family transcriptional regulator  24.37 
 
 
172 aa  54.3  0.0000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1702  MarR family transcriptional regulator  24.37 
 
 
172 aa  54.3  0.0000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.00165311  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1651  MarR family transcriptional regulator  24.37 
 
 
172 aa  54.3  0.0000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.902908  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0533  MarR family transcriptional regulator  28.18 
 
 
165 aa  54.3  0.0000006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4242  MarR family transcriptional regulator  24.63 
 
 
172 aa  54.3  0.0000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.594533  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1037  transcriptional regulator, MarR family  27.73 
 
 
174 aa  54.3  0.0000006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1696  MarR family transcriptional regulator  29.7 
 
 
163 aa  53.9  0.0000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0269  MarR family transcriptional regulator  28.87 
 
 
138 aa  53.9  0.0000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3404  transcriptional regulator, MarR family  29.59 
 
 
120 aa  53.9  0.0000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5651  MarR family transcriptional regulator  24.37 
 
 
172 aa  53.9  0.0000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0956535  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0546  MarR family transcriptional regulator  24.37 
 
 
172 aa  53.9  0.0000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4259  transcriptional regulator, MarR family  34.04 
 
 
137 aa  53.9  0.0000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4179  transcriptional regulator, MarR family  30.08 
 
 
166 aa  53.1  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.483943  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1502  MarR family transcriptional regulator  25.18 
 
 
163 aa  53.1  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.33868  normal  0.755413 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1235  MarR family transcriptional regulator  23.81 
 
 
144 aa  53.5  0.000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.236148  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1531  transcriptional regulator, TrmB  29.63 
 
 
141 aa  53.1  0.000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.02316  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0111  MarR family transcriptional regulator  26.97 
 
 
142 aa  53.1  0.000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.238503  n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5446  MarR family transcriptional regulator  25 
 
 
219 aa  52.8  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  normal  0.668367 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0110  MarR family transcriptional regulator  25.84 
 
 
142 aa  53.1  0.000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1911  transcriptional regulator, MarR family  25.89 
 
 
164 aa  53.1  0.000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3051  transcriptional regulator, MarR family  25 
 
 
137 aa  52.8  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.193524  hitchhiker  0.00149188 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2703  MarR family transcriptional regulator  28.07 
 
 
137 aa  53.5  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3927  MarR family transcriptional regulator  28.04 
 
 
159 aa  52.8  0.000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5843  MarR family transcriptional regulator  25 
 
 
200 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0628  MarR family transcriptional regulator  24.37 
 
 
172 aa  53.5  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.382396  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0537  MarR family transcriptional regulator  24.37 
 
 
172 aa  53.5  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.075487  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3804  MarR family transcriptional regulator  24.29 
 
 
185 aa  53.1  0.000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.546626 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0572  MarR family transcriptional regulator  27.27 
 
 
152 aa  52.4  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000763093  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0662  MarR family transcriptional regulator  27.27 
 
 
152 aa  52.4  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000590636  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1112  MarR family transcriptional regulator  27.72 
 
 
140 aa  52.4  0.000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4581  transcriptional regulator, MarR family  30.77 
 
 
128 aa  52.8  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.308908 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0719  transcriptional regulator, MarR family  27.27 
 
 
152 aa  52.4  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.5947e-17 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1155  MarR family transcriptional regulator  26.19 
 
 
163 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1940  transcriptional regulator, MarR family  26.67 
 
 
159 aa  52.8  0.000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2001  MarR family transcriptional regulator  32.26 
 
 
197 aa  52.4  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.803243  normal  0.0833293 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4644  transcriptional regulator, MarR family  28.03 
 
 
152 aa  52.8  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000297134  unclonable  1.87332e-26 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1172  MarR family transcriptional regulator  26.19 
 
 
163 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.247959 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1182  MarR family transcriptional regulator  26.19 
 
 
163 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.937624  normal  0.0261601 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>