More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BcerKBAB4_1309 on replicon NC_010184
Organism: Bacillus weihenstephanensis KBAB4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010184  BcerKBAB4_1309  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 
139 aa  280  3.0000000000000004e-75  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3904  transcriptional regulator, MarR family  95.68 
 
 
139 aa  270  3e-72  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1477  transcriptional regulator, MarR family  95.68 
 
 
139 aa  270  5.000000000000001e-72  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1545  transcriptional regulator, MarR family  95.68 
 
 
139 aa  270  5.000000000000001e-72  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00793933  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1439  transcriptional regulator, MarR family  94.96 
 
 
140 aa  270  7e-72  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.207252  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1112  MarR family transcriptional regulator  88.49 
 
 
140 aa  254  3e-67  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1506  MarR family transcriptional regulator  95.42 
 
 
131 aa  254  4e-67  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1299  MarR family transcriptional regulator  95.42 
 
 
131 aa  254  4e-67  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.541752  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1272  MarR family transcriptional regulator  95.42 
 
 
131 aa  254  4e-67  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.610251  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1273  MarR family transcriptional regulator  95.42 
 
 
131 aa  254  4e-67  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.071067  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1406  MarR family transcriptional regulator  95.42 
 
 
131 aa  254  4e-67  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4103  transcriptional regulator, MarR family  46.76 
 
 
139 aa  135  1e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.6454e-44 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3822  MarR family transcriptional regulator  46.76 
 
 
139 aa  135  1e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000229198  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4150  MarR family transcriptional regulator  46.76 
 
 
139 aa  135  2e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00563558  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3838  MarR family transcriptional regulator  46.76 
 
 
139 aa  135  2e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000189375  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3991  MarR family transcriptional regulator  46.04 
 
 
150 aa  134  6.0000000000000005e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00156132  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4303  MarR family transcriptional regulator  46.04 
 
 
150 aa  134  6.0000000000000005e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0482862  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4214  transcriptional regulator, MarR family  46.04 
 
 
139 aa  133  8e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000392908  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3912  MarR family transcriptional regulator  47.01 
 
 
150 aa  133  9.999999999999999e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0139173  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1046  transcriptional regulator, MarR family  45.32 
 
 
139 aa  132  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.965341  hitchhiker  0.00043703 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4191  transcriptional regulator, MarR family  47.01 
 
 
139 aa  132  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0975535  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2780  MarR family transcriptional regulator  43.88 
 
 
139 aa  130  6.999999999999999e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00474606  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0325  MarR family transcriptional regulator  30.15 
 
 
150 aa  74.3  0.0000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0097  transcriptional regulator, MarR family  37.63 
 
 
152 aa  73.2  0.000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4151  transcriptional regulator, MarR family  29.37 
 
 
151 aa  68.2  0.00000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00180525  hitchhiker  0.000000202401 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0493  MarR family transcriptional regulator  32.86 
 
 
148 aa  67.4  0.00000000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0505  MarR family transcriptional regulator  32.61 
 
 
148 aa  66.6  0.0000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2639  transcriptional regulator, MarR family  33.66 
 
 
150 aa  64.3  0.0000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1190  transcriptional regulator, MarR family  29.92 
 
 
148 aa  63.2  0.000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0855  transcriptional regulator, MarR family  31.68 
 
 
147 aa  62.4  0.000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0201  transcriptional regulator, MarR family  32.65 
 
 
149 aa  62.8  0.000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000347267  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1388  transcriptional regulator, MarR family  31 
 
 
148 aa  62.8  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2101  MarR family transcriptional regulator  27.54 
 
 
163 aa  62.4  0.000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0043362  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3956  transcriptional regulator, MarR family  31 
 
 
148 aa  62.8  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.410327 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0362  MarR family transcriptional regulator  32.12 
 
 
147 aa  62  0.000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0719  transcriptional regulator, MarR family  25.93 
 
 
142 aa  61.2  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0806783  normal  0.0372337 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0691  transcriptional regulator, MarR family  25.93 
 
 
142 aa  60.8  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0747  MarR family transcriptional regulator  23.88 
 
 
145 aa  60.8  0.000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0576  MarR family transcriptional regulator  31.13 
 
 
155 aa  60.5  0.000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1251  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 
148 aa  60.5  0.000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1750  transcriptional regulator, MarR family  27.5 
 
 
149 aa  60.1  0.00000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1450  MarR family transcriptional regulator  29 
 
 
148 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1253  MarR family transcriptional regulator  29 
 
 
148 aa  58.9  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1226  MarR family transcriptional regulator  29 
 
 
148 aa  58.9  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.194022  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1228  MarR family transcriptional regulator  29 
 
 
148 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2620  transcriptional regulator, MarR family  29.29 
 
 
165 aa  59.3  0.00000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000454878  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1352  MarR family transcriptional regulator  29 
 
 
148 aa  58.9  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2446  transcriptional regulator, MarR family  32.41 
 
 
146 aa  59.3  0.00000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1425  transcriptional regulator, MarR family  29 
 
 
148 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000689424 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1060  MarR family transcriptional regulator  29 
 
 
162 aa  58.5  0.00000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2110  regulatory protein, MarR  25.69 
 
 
163 aa  58.2  0.00000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.450646  normal  0.261342 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1031  transcriptional regulator, MarR family  27.27 
 
 
152 aa  58.2  0.00000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1491  transcriptional regulator, MarR family  28 
 
 
148 aa  57.8  0.00000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04050  transcriptional regulator, MarR family  27.84 
 
 
141 aa  57  0.00000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1844  MarR family transcriptional regulator  31.46 
 
 
141 aa  57.4  0.00000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0298  MarR family transcriptional regulator  30.69 
 
 
160 aa  57  0.00000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3004  repressor of mar (multiple antibiotic resistance) operon  27.93 
 
 
139 aa  57  0.00000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3064  transcriptional regulator  27.27 
 
 
159 aa  56.2  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0277554  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2543  transcriptional regulator, TrmB  29.7 
 
 
144 aa  56.6  0.0000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.751029  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06220  transcriptional regulator, MarR family  27.45 
 
 
169 aa  56.2  0.0000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2595  regulatory protein MarR  29.7 
 
 
144 aa  56.6  0.0000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.660325  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2057  transcriptional regulator, MarR family  37.5 
 
 
153 aa  55.5  0.0000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.240684  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0304  MarR family transcriptional regulator  29.7 
 
 
160 aa  55.8  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0286  MarR family transcriptional regulator  29.7 
 
 
160 aa  55.5  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0289  MarR family transcriptional regulator  29.7 
 
 
160 aa  56.2  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3645  MarR family transcriptional regulator  29.52 
 
 
160 aa  55.5  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.610446  normal  0.0262882 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0318  MarR family transcriptional regulator  29.7 
 
 
160 aa  55.8  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0350  transcriptional regulator, MarR family  29.7 
 
 
160 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1943  transcriptional regulator, MarR family protein  29.79 
 
 
161 aa  55.5  0.0000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.0012648  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0347  MarR family transcriptional regulator  29.7 
 
 
160 aa  55.5  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0364  transcriptional regulator, MarR family  29.7 
 
 
160 aa  55.1  0.0000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4956  transcriptional regulator, MarR family  29.7 
 
 
160 aa  55.5  0.0000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0391  transcriptional regulator, MarR family  29.7 
 
 
160 aa  55.5  0.0000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1940  transcriptional regulator, MarR family  36.11 
 
 
159 aa  55.1  0.0000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2352  transcriptional regulator, MarR family  27.55 
 
 
173 aa  55.5  0.0000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1696  MarR family transcriptional regulator  30.39 
 
 
163 aa  54.7  0.0000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1425  transcriptional regulator, MarR family  25.53 
 
 
144 aa  54.7  0.0000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000183879  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1451  MarR family transcriptional regulator  29.31 
 
 
161 aa  54.3  0.0000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1835  transcriptional regulator, TrmB  31.37 
 
 
146 aa  54.3  0.0000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0302316  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2752  MarR family transcriptional regulator  27.27 
 
 
159 aa  54.3  0.0000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0417987  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3111  MarR family transcriptional regulator  24 
 
 
142 aa  54.3  0.0000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0730  MarR family transcriptional regulator  29.25 
 
 
152 aa  53.5  0.0000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.378661  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01812  transcriptional regulator, MarR family protein  34.88 
 
 
158 aa  53.9  0.0000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000102979  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0283  transcriptional regulator, MarR family  29.67 
 
 
146 aa  53.9  0.0000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0629  MarR family transcriptional regulator  29.25 
 
 
152 aa  53.1  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000383532  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0719  transcriptional regulator, MarR family  29.25 
 
 
152 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.5947e-17 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0572  MarR family transcriptional regulator  29.25 
 
 
152 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000763093  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0791  transcriptional regulator, MarR family  29.25 
 
 
152 aa  53.5  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000107079  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3062  transcriptional regulator, MarR family  28.18 
 
 
173 aa  53.5  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.455637  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0662  MarR family transcriptional regulator  29.25 
 
 
152 aa  53.1  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000590636  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1419  transcriptional regulator, MarR family  27.37 
 
 
149 aa  52.8  0.000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000012413  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0731  transcriptional regulator, MarR family  30.67 
 
 
156 aa  53.1  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000118752  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1125  transcriptional regulator, MarR family  25.71 
 
 
172 aa  52.8  0.000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.416342 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0045  transcriptional regulator, MarR family  25 
 
 
142 aa  53.1  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.17709  normal  0.0234006 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4644  transcriptional regulator, MarR family  29.25 
 
 
152 aa  52.4  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000297134  unclonable  1.87332e-26 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2820  transcriptional repressor MprA  30.59 
 
 
176 aa  52.8  0.000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3928  transcriptional repressor MprA  30.59 
 
 
176 aa  52.8  0.000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.500125 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4687  hypothetical protein  40.51 
 
 
161 aa  52.8  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00000161275  normal  0.469864 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0557  MarR family transcriptional regulator  28.97 
 
 
152 aa  52.8  0.000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000149259  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0694  transcriptional regulator, MarR family  29.25 
 
 
152 aa  52  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00121928  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>