More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_0747 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_0747  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 145 aa  293  5e-79  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2101  MarR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 163 aa  76.6  0.0000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0043362  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3912  MarR family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 150 aa  73.9  0.0000000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0139173  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0325  MarR family transcriptional regulator  29.32 
 
 		 150 aa  73.6  0.0000000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4191  transcriptional regulator, MarR family  34.31 
 
 		 139 aa  72.8  0.000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0975535  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1046  transcriptional regulator, MarR family  34.31 
 
 		 139 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.965341  hitchhiker  0.00043703 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4214  transcriptional regulator, MarR family  34.31 
 
 		 139 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000392908  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4150  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 139 aa  71.6  0.000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00563558  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2639  transcriptional regulator, MarR family  31.4 
 
 		 150 aa  72  0.000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3838  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 139 aa  71.6  0.000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000189375  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1295  putative transcription regulator protein  36.11 
 
 		 147 aa  71.6  0.000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.260048  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3991  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 150 aa  71.2  0.000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00156132  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3822  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 139 aa  71.2  0.000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000229198  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4103  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 139 aa  71.2  0.000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.6454e-44 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4303  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 150 aa  71.2  0.000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0482862  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1125  transcriptional regulator, MarR family  36.45 
 
 		 172 aa  71.6  0.000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.416342 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1940  transcriptional regulator, MarR family  35.42 
 
 		 159 aa  70.9  0.000000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2839  MarR family transcriptional regulator  32.87 
 
 		 158 aa  70.1  0.000000000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1216  transcriptional regulator, MarR family  36.19 
 
 		 149 aa  68.9  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.298093  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2761  MarR family transcriptional regulator  32.87 
 
 		 165 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2780  MarR family transcriptional regulator  25.95 
 
 		 139 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00474606  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2937  MarR family transcriptional regulator  32.87 
 
 		 165 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0576  MarR family transcriptional regulator  30.36 
 
 		 155 aa  68.2  0.00000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1453  transcriptional regulator, MarR family  32.35 
 
 		 143 aa  68.2  0.00000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3299  transcriptional regulator, MarR family  32.67 
 
 		 151 aa  67.4  0.00000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.416393  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1112  MarR family transcriptional regulator  25.37 
 
 		 140 aa  65.5  0.0000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1245  MarR family transcriptional regulator  31.47 
 
 		 158 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0097  transcriptional regulator, MarR family  28.97 
 
 		 152 aa  65.5  0.0000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3032  transcriptional regulator, MarR family  32.17 
 
 		 158 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0797104  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0557  MarR family transcriptional regulator  30.36 
 
 		 152 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000149259  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1318  MarR family transcriptional regulator  32.17 
 
 		 158 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1354  MarR family transcriptional regulator  32.17 
 
 		 158 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2362  MarR family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 173 aa  64.3  0.0000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.438216  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1328  MarR family transcriptional regulator  32.17 
 
 		 158 aa  64.3  0.0000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0613  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 		 150 aa  64.3  0.0000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.31364  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3272  MarR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 154 aa  63.9  0.0000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0573  MarR family transcriptional regulator  31.73 
 
 		 152 aa  63.5  0.0000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.588346  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1506  MarR family transcriptional regulator  24.78 
 
 		 131 aa  62.8  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1299  MarR family transcriptional regulator  24.78 
 
 		 131 aa  62.8  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.541752  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1272  MarR family transcriptional regulator  24.78 
 
 		 131 aa  62.8  0.000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.610251  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1273  MarR family transcriptional regulator  24.78 
 
 		 131 aa  62.8  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.071067  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1081  transcriptional regulator, MarR family  33.02 
 
 		 166 aa  63.2  0.000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00103663 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1406  MarR family transcriptional regulator  24.78 
 
 		 131 aa  62.8  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1545  transcriptional regulator, MarR family  24.63 
 
 		 139 aa  62.8  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00793933  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1477  transcriptional regulator, MarR family  24.63 
 
 		 139 aa  62.8  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2414  regulatory protein, MarR  32.69 
 
 		 176 aa  62.8  0.000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.86423  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0730  MarR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 152 aa  62  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.378661  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1055  MarR family transcriptional regulator  35.24 
 
 		 165 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.283145  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0997  MarR family transcriptional regulator  35.24 
 
 		 165 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0791  transcriptional regulator, MarR family  30.77 
 
 		 152 aa  62.8  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000107079  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1769  MarR family transcriptional regulator  35.24 
 
 		 165 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.238439  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1746  MarR family transcriptional regulator  35.24 
 
 		 165 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0867491  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1922  MarR family transcriptional regulator  35.24 
 
 		 165 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.236753  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0169  MarR family transcriptional regulator  35.24 
 
 		 165 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00968003  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1501  MarR family transcriptional regulator  35.24 
 
 		 165 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.340787  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1638  transcriptional regulator, MarR family  36.19 
 
 		 171 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00207859 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0719  transcriptional regulator, MarR family  30.77 
 
 		 152 aa  62  0.000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.5947e-17 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4151  transcriptional regulator, MarR family  25.6 
 
 		 151 aa  61.6  0.000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00180525  hitchhiker  0.000000202401 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0629  MarR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 152 aa  62  0.000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000383532  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0572  MarR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 152 aa  62  0.000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000763093  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0662  MarR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 152 aa  62  0.000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000590636  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2558  MarR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 165 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0694  transcriptional regulator, MarR family  30.77 
 
 		 152 aa  61.6  0.000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00121928  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1669  putative transcriptional regulator  30.11 
 
 		 157 aa  61.6  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.407714  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4644  transcriptional regulator, MarR family  30.77 
 
 		 152 aa  62  0.000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000297134  unclonable  1.87332e-26 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1439  transcriptional regulator, MarR family  24.78 
 
 		 140 aa  61.2  0.000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.207252  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3904  transcriptional regulator, MarR family  24.78 
 
 		 139 aa  61.2  0.000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3645  MarR family transcriptional regulator  35.24 
 
 		 160 aa  61.6  0.000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.610446  normal  0.0262882 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1388  MarR family transcriptional regulator  34.91 
 
 		 164 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1428  MarR family transcriptional regulator  34.91 
 
 		 164 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.256408 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1193  MarR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 157 aa  61.2  0.000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0667234  hitchhiker  0.0000268164 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1309  MarR family transcriptional regulator  23.88 
 
 		 139 aa  60.8  0.000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0617  MarR family transcriptional regulator  34.91 
 
 		 162 aa  60.8  0.000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2565  MarR family transcriptional regulator  32.03 
 
 		 176 aa  60.8  0.000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.137781  hitchhiker  0.0000747398 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1749  MarR family transcriptional regulator  35.85 
 
 		 164 aa  60.5  0.000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0321002 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1026  MarR family transcriptional regulator  34.91 
 
 		 163 aa  60.8  0.000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1482  MarR family transcriptional regulator  34.91 
 
 		 163 aa  60.5  0.000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.914228  normal  0.421582 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1506  MarR family transcriptional regulator  34.91 
 
 		 163 aa  60.8  0.000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19380  putative transcriptional regulator  29.03 
 
 		 157 aa  60.5  0.000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0892459  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4647  MarR family transcriptional regulator  34.91 
 
 		 163 aa  60.1  0.000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.167247  normal  0.261087 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4318  MarR family transcriptional regulator  35.51 
 
 		 157 aa  60.1  0.000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.250936  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2814  MarR family transcriptional regulator  36.19 
 
 		 172 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.388946 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1878  transcriptional regulator, MarR family  29.52 
 
 		 158 aa  59.7  0.00000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.147692  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2077  transcriptional regulator of MarR family protein  33.33 
 
 		 161 aa  58.9  0.00000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.323621  normal  0.679444 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1251  MarR family transcriptional regulator  27.93 
 
 		 148 aa  58.5  0.00000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1723  MarR family transcriptional regulator  35.24 
 
 		 171 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1956  transcriptional regulator  30.48 
 
 		 154 aa  58.5  0.00000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.720732 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1772  MarR family transcriptional regulator  30.7 
 
 		 160 aa  58.2  0.00000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1004  MarR family transcriptional regulator  30.83 
 
 		 157 aa  58.2  0.00000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.324282  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0877  MarR family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 159 aa  57.8  0.00000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.600163  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3133  transcriptional regulator, MarR family  32.38 
 
 		 153 aa  57.8  0.00000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4176  transcriptional regulator, MarR family  27.41 
 
 		 167 aa  57.8  0.00000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.462707 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0298  MarR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 160 aa  57.8  0.00000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3429  transcriptional regulator MarR family  40.54 
 
 		 157 aa  57.8  0.00000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.905636  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0776  transcriptional regulator, MarR family  31.19 
 
 		 187 aa  57.4  0.00000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.216692  normal  0.214261 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1991  transcriptional regulator, MarR family  30.89 
 
 		 156 aa  57.4  0.00000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.505264  normal  0.471645 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2500  MarR family transcriptional regulator  31.86 
 
 		 178 aa  57.4  0.00000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.129036  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1491  transcriptional regulator, MarR family  27.93 
 
 		 148 aa  57  0.00000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0201  transcriptional regulator, MarR family  27.83 
 
 		 149 aa  57  0.00000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000347267  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2322  transcriptional regulator, TrmB  35.24 
 
 		 174 aa  57  0.00000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>