More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_2057 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001800  Ssol_2057  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 
153 aa  301  3.0000000000000004e-81  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.240684  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1251  MarR family transcriptional regulator  31.25 
 
 
148 aa  71.2  0.000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1388  transcriptional regulator, MarR family  31.25 
 
 
148 aa  71.6  0.000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3956  transcriptional regulator, MarR family  31.25 
 
 
148 aa  71.6  0.000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.410327 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1279  MarR family transcriptional regulator  34.75 
 
 
150 aa  70.5  0.000000000008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1975  MarR family transcriptional regulator  30.87 
 
 
155 aa  70.5  0.000000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0153804  normal  0.896313 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1450  MarR family transcriptional regulator  35.16 
 
 
148 aa  70.1  0.00000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1253  MarR family transcriptional regulator  35.16 
 
 
148 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1226  MarR family transcriptional regulator  35.16 
 
 
148 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.194022  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1228  MarR family transcriptional regulator  35.16 
 
 
148 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3416  transcriptional regulator, MarR family  31.86 
 
 
162 aa  69.7  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.765754  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1491  transcriptional regulator, MarR family  35.16 
 
 
148 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3070  transcriptional regulator, MarR family  31.86 
 
 
162 aa  69.7  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1352  MarR family transcriptional regulator  35.16 
 
 
148 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1425  transcriptional regulator, MarR family  35.16 
 
 
148 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000689424 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1940  transcriptional regulator, MarR family  36.96 
 
 
159 aa  68.9  0.00000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1060  MarR family transcriptional regulator  39.29 
 
 
162 aa  68.9  0.00000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3100  transcriptional regulator, MarR family  32.77 
 
 
170 aa  68.2  0.00000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000355326  hitchhiker  0.00000930656 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0855  transcriptional regulator, MarR family  31.09 
 
 
147 aa  67  0.00000000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34890  transcriptional regulator  38.38 
 
 
156 aa  67  0.00000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.7983  normal  0.264104 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0557  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 
152 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000149259  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1844  MarR family transcriptional regulator  34.15 
 
 
141 aa  65.1  0.0000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3139  putative transcription regulator protein  29.2 
 
 
159 aa  64.7  0.0000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0730  MarR family transcriptional regulator  29.32 
 
 
152 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.378661  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4318  MarR family transcriptional regulator  35.71 
 
 
157 aa  65.1  0.0000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.250936  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1028  transcriptional regulator, MarR family  31.03 
 
 
178 aa  64.7  0.0000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1750  transcriptional regulator, MarR family  35.71 
 
 
149 aa  64.7  0.0000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0791  transcriptional regulator, MarR family  29.32 
 
 
152 aa  64.7  0.0000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000107079  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0629  MarR family transcriptional regulator  29.32 
 
 
152 aa  63.9  0.0000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000383532  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0572  MarR family transcriptional regulator  29.32 
 
 
152 aa  63.9  0.0000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000763093  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0662  MarR family transcriptional regulator  29.32 
 
 
152 aa  63.9  0.0000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000590636  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0719  transcriptional regulator, MarR family  29.32 
 
 
152 aa  63.9  0.0000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.5947e-17 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2958  transcriptional regulator, MarR family  40.23 
 
 
155 aa  63.9  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000649784  normal  0.827828 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3643  transcriptional regulator, MarR family protein  32.23 
 
 
163 aa  63.9  0.0000000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0097  transcriptional regulator, MarR family  34.91 
 
 
152 aa  63.5  0.0000000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4616  transcriptional regulator, MarR family  30.65 
 
 
176 aa  63.5  0.0000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.172446  hitchhiker  0.00038288 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0694  transcriptional regulator, MarR family  29.32 
 
 
152 aa  63.5  0.000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00121928  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4644  transcriptional regulator, MarR family  29.32 
 
 
152 aa  63.5  0.000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000297134  unclonable  1.87332e-26 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6082  transcriptional regulator, MarR family  31.93 
 
 
167 aa  63.2  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.352412  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0573  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 
152 aa  62.4  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.588346  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28520  transcriptional regulator  31.78 
 
 
166 aa  62.8  0.000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.11244 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1911  transcriptional regulator, MarR family  31.68 
 
 
164 aa  62.8  0.000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0505  MarR family transcriptional regulator  31.62 
 
 
148 aa  62.8  0.000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0766  transcriptional regulator, TrmB  28.23 
 
 
140 aa  62.8  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.151681  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0362  transcriptional regulator, MarR family  31.58 
 
 
177 aa  62.8  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4151  transcriptional regulator, MarR family  28.57 
 
 
151 aa  61.6  0.000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00180525  hitchhiker  0.000000202401 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0493  MarR family transcriptional regulator  31.62 
 
 
148 aa  62  0.000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2761  MarR family transcriptional regulator  39.13 
 
 
165 aa  62  0.000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2839  MarR family transcriptional regulator  39.13 
 
 
158 aa  62  0.000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2651  MarR family transcriptional regulator  37.65 
 
 
156 aa  62  0.000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2937  MarR family transcriptional regulator  39.13 
 
 
165 aa  62  0.000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2362  MarR family transcriptional regulator  30.7 
 
 
173 aa  61.2  0.000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.438216  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1991  transcriptional regulator, MarR family  31.54 
 
 
156 aa  61.2  0.000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.505264  normal  0.471645 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3336  MarR family transcriptional regulator  34.58 
 
 
166 aa  60.8  0.000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.470257 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0803  transcriptional regulator, MarR family protein  33.33 
 
 
148 aa  60.8  0.000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0325  MarR family transcriptional regulator  32.38 
 
 
150 aa  60.5  0.000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3333  MarR family transcriptional regulator  33.65 
 
 
174 aa  60.5  0.000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2611  transcriptional regulator, MarR family  35.78 
 
 
160 aa  60.5  0.000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.0000000000027069  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2620  transcriptional regulator, MarR family  33.06 
 
 
165 aa  60.5  0.000000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000454878  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8410  putative transcriptional regulator protein, MarR family  30.37 
 
 
163 aa  59.7  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.410665  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0576  MarR family transcriptional regulator  33.08 
 
 
155 aa  60.1  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5619  transcriptional regulator, MarR family  35.92 
 
 
134 aa  60.1  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.966893  hitchhiker  0.00498521 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0799  MarR family transcriptional regulator  33.64 
 
 
161 aa  59.7  0.00000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3299  transcriptional regulator, MarR family  30.36 
 
 
151 aa  60.1  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.416393  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3655  MarR family transcriptional regulator  33.6 
 
 
163 aa  60.1  0.00000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00553213  normal  0.217217 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1193  MarR family transcriptional regulator  38.71 
 
 
157 aa  59.7  0.00000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0667234  hitchhiker  0.0000268164 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0726  regulatory protein MarR  30 
 
 
147 aa  58.9  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0710  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 
147 aa  58.9  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2639  transcriptional regulator, MarR family  31.18 
 
 
150 aa  59.3  0.00000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0705  MarR family transcriptional regulator  29.93 
 
 
156 aa  59.3  0.00000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.186956  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0576  transcriptional regulator, TrmB  29.17 
 
 
158 aa  58.5  0.00000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0950259  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4214  transcriptional regulator, MarR family  44.93 
 
 
139 aa  58.5  0.00000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000392908  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4191  transcriptional regulator, MarR family  44.93 
 
 
139 aa  58.9  0.00000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0975535  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1046  transcriptional regulator, MarR family  44.93 
 
 
139 aa  58.9  0.00000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.965341  hitchhiker  0.00043703 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1032  MarR family transcriptional regulator  39.29 
 
 
143 aa  58.5  0.00000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.119572  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0731  transcriptional regulator, MarR family  30 
 
 
156 aa  58.5  0.00000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000118752  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6943  MarR family transcriptional regulator  32.46 
 
 
148 aa  58.9  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1724  transcriptional regulator, MarR family  30.66 
 
 
159 aa  58.5  0.00000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.118404  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3645  MarR family transcriptional regulator  27.35 
 
 
160 aa  58.2  0.00000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.610446  normal  0.0262882 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0573  MarR family transcriptional regulator  32.29 
 
 
151 aa  58.2  0.00000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.256198  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01812  transcriptional regulator, MarR family protein  34.04 
 
 
158 aa  58.2  0.00000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000102979  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3272  MarR family transcriptional regulator  31.09 
 
 
154 aa  58.5  0.00000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2322  transcriptional regulator, TrmB  34.82 
 
 
174 aa  57.8  0.00000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1721  transcriptional regulator, MarR family  33.04 
 
 
160 aa  57.4  0.00000007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.410028  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1216  transcriptional regulator, MarR family  36.99 
 
 
149 aa  57.4  0.00000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.298093  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01430  transcriptional regulator  31.78 
 
 
161 aa  57.4  0.00000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3912  MarR family transcriptional regulator  43.48 
 
 
150 aa  57.4  0.00000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0139173  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2780  MarR family transcriptional regulator  42.86 
 
 
139 aa  57.4  0.00000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00474606  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1641  transcriptional regulator, MarR family  35 
 
 
157 aa  57.4  0.00000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.176874  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4150  MarR family transcriptional regulator  43.48 
 
 
139 aa  57  0.00000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00563558  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4103  transcriptional regulator, MarR family  43.48 
 
 
139 aa  57.4  0.00000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.6454e-44 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3822  MarR family transcriptional regulator  43.48 
 
 
139 aa  57.4  0.00000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000229198  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3838  MarR family transcriptional regulator  43.48 
 
 
139 aa  57  0.00000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000189375  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2543  transcriptional regulator, TrmB  26.87 
 
 
144 aa  57.4  0.00000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.751029  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2581  MarR family transcriptional regulator  30.77 
 
 
167 aa  57.4  0.00000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.562153 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2595  regulatory protein MarR  26.87 
 
 
144 aa  57.4  0.00000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.660325  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5382  transcriptional regulator, MarR family  30.97 
 
 
157 aa  57  0.0000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7275  MarR family transcriptional regulator  29.23 
 
 
151 aa  56.2  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.430156  normal  0.0802572 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4303  MarR family transcriptional regulator  43.48 
 
 
150 aa  57  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0482862  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1470  MarR family transcriptional regulator  30.34 
 
 
151 aa  57  0.0000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>