More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_1911 on replicon NC_013526
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013526  Tter_1911  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 
164 aa  317  6e-86  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6943  MarR family transcriptional regulator  43.18 
 
 
148 aa  102  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0289  transcriptional regulator, MarR family  43.41 
 
 
158 aa  95.5  3e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.660944 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3320  hypothetical protein  38.06 
 
 
151 aa  84.3  7e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0293206  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1312  transcriptional regulator, MarR family  39.69 
 
 
164 aa  83.6  0.000000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.230395  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2225  MarR family transcriptional regulator  40 
 
 
162 aa  80.9  0.000000000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.582013 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3230  MarR family transcriptional regulator  37.23 
 
 
163 aa  77  0.00000000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.9526  normal  0.272965 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2232  transcriptional regulator, MarR family  38.58 
 
 
151 aa  76.3  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00982992  hitchhiker  0.00000264817 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0067  MarR family transcriptional regulator  37.69 
 
 
162 aa  73.9  0.0000000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0022  MarR family transcriptional regulator  37.69 
 
 
162 aa  73.9  0.0000000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0694337  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0048  MarR family transcriptional regulator  37.69 
 
 
162 aa  73.9  0.0000000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.407046  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0047  MarR family transcriptional regulator  36.23 
 
 
162 aa  73.9  0.0000000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0038  MarR family transcriptional regulator  36.23 
 
 
162 aa  73.9  0.0000000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1950  transcriptional regulator, MarR family  40.14 
 
 
152 aa  73.6  0.000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.146852  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1483  MarR family transcriptional regulator  34.75 
 
 
149 aa  73.2  0.000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.715105  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0049  MarR family transcriptional regulator  34.62 
 
 
162 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9043  hypothetical protein  37.34 
 
 
159 aa  72.8  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4146  regulatory protein MarR  40.46 
 
 
153 aa  72  0.000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.355726  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6813  hypothetical protein  35.2 
 
 
152 aa  70.9  0.000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.611714  normal  0.242939 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2033  MarR family transcriptional regulator  39.69 
 
 
303 aa  69.3  0.00000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.368826 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4525  MarR family transcriptional regulator  41.18 
 
 
160 aa  69.7  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.209955  normal  0.318258 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4392  Transcriptional regulators-like protein  39.02 
 
 
168 aa  67.8  0.00000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00709871  normal  0.0557169 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5066  transcriptional regulator, MarR family  34.35 
 
 
149 aa  67.8  0.00000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.850935  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8231  transcriptional regulator, MarR family  32.7 
 
 
167 aa  67.8  0.00000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4156  MarR family transcriptional regulator  32.06 
 
 
150 aa  67.4  0.00000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.331896  normal  0.584748 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2317  MarR family transcriptional regulator  31.08 
 
 
150 aa  67  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2992  MarR family transcriptional regulator  28.35 
 
 
139 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7084  MarR family transcriptional regulator  34.38 
 
 
170 aa  66.6  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3220  MarR family transcriptional regulator  28.35 
 
 
139 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3249  transcriptional regulator, MarR family  28.35 
 
 
139 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.490647  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2703  MarR family transcriptional regulator  31.58 
 
 
137 aa  66.2  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3228  transcriptional regulator, MarR family  28.35 
 
 
139 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2980  MarR family transcriptional regulator  28.35 
 
 
139 aa  65.5  0.0000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.134372  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3570  MarR family transcriptional regulator  35.71 
 
 
171 aa  65.5  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.247728 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1972  transcriptional regulator, MarR family  34.65 
 
 
159 aa  65.5  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.276082  normal  0.475947 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2920  MarR family transcriptional regulator  28.35 
 
 
139 aa  65.1  0.0000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3216  transcriptional regulator, MarR family  28.35 
 
 
139 aa  65.1  0.0000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3564  MarR family transcriptional regulator  36.13 
 
 
155 aa  65.1  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.7607  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3834  transcriptional regulator, MarR family  39.29 
 
 
175 aa  64.7  0.0000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1723  MarR family transcriptional regulator  32.58 
 
 
171 aa  64.7  0.0000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3363  transcriptional regulator, MarR family  34.65 
 
 
154 aa  64.3  0.0000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.7144  hitchhiker  0.007363 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0560  transcriptional regulator, MarR family  37.04 
 
 
162 aa  63.9  0.0000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0517108 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2814  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 
172 aa  63.9  0.0000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.388946 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2057  transcriptional regulator, MarR family  30.97 
 
 
153 aa  63.5  0.000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.240684  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3950  transcriptional regulator, MarR family  32.17 
 
 
180 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.703331 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3956  MarR family transcriptional regulator  35.29 
 
 
158 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.210234 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43770  putative transcriptional regulator  34.65 
 
 
140 aa  63.5  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0021  MarR family transcriptional regulator  34.56 
 
 
181 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.487256  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4487  MarR family transcriptional regulator  32.31 
 
 
180 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000975501  hitchhiker  0.000429514 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6941  transcriptional regulator, MarR family  39.23 
 
 
151 aa  62.8  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.853349  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1703  transcriptional regulator MarR family  33.08 
 
 
172 aa  62  0.000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.135356  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3105  transcriptional regulator, MarR family  33.07 
 
 
154 aa  62.4  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0272572 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4687  hypothetical protein  33.82 
 
 
161 aa  62.4  0.000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00000161275  normal  0.469864 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4395  MarR family transcriptional regulator  34.69 
 
 
139 aa  62  0.000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7614  transcriptional regulator, MarR family  37.38 
 
 
157 aa  62.4  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.647741  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8631  Transcriptional regulators-like protein  34.59 
 
 
287 aa  62.4  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1140  regulatory protein MarR  34.92 
 
 
144 aa  61.6  0.000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.104952  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1634  transcriptional regulator, MarR family  29.23 
 
 
140 aa  61.6  0.000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0355019  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0234  MarR family protein  33.85 
 
 
177 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2558  MarR family transcriptional regulator  30.43 
 
 
165 aa  62  0.000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5112  MarR family transcriptional regulator  34.45 
 
 
155 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.522104  normal  0.0529869 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1601  MarR family transcriptional regulator  30.66 
 
 
145 aa  62  0.000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2676  MarR family transcriptional regulator  33.85 
 
 
165 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0699601  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2282  transcriptional regulator, MarR family  34.04 
 
 
152 aa  61.6  0.000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000450533 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1607  transcriptional regulator, MarR family  28.26 
 
 
142 aa  61.6  0.000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0022  MarR family transcriptional regulator  33.85 
 
 
165 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.278494  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0022  MarR family transcriptional regulator  33.85 
 
 
165 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1996  transcriptional regulator, MarR family  35.16 
 
 
172 aa  61.2  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3504  MarR family transcriptional regulator  33.85 
 
 
165 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1876  MarR family transcriptional regulator  33.85 
 
 
165 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2628  transcriptional regulator, MarR family  28.57 
 
 
142 aa  61.2  0.000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00233343  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0942  MarR family transcriptional regulator  34.82 
 
 
164 aa  61.2  0.000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.388439 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0855  transcriptional regulator, MarR family  28.91 
 
 
147 aa  61.2  0.000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06310  transcriptional regulator  38.32 
 
 
169 aa  61.2  0.000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0861  MarR family transcriptional regulator  30.77 
 
 
157 aa  60.8  0.000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2841  transcriptional regulator, MarR family  35.88 
 
 
153 aa  61.2  0.000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3429  transcriptional regulator MarR family  32.06 
 
 
157 aa  60.8  0.000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.905636  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1428  MarR family transcriptional regulator  34.09 
 
 
164 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.256408 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1638  transcriptional regulator, MarR family  29.63 
 
 
171 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00207859 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1746  MarR family transcriptional regulator  31.65 
 
 
165 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0867491  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1055  MarR family transcriptional regulator  31.65 
 
 
165 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.283145  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4960  MarR family transcriptional regulator  34.55 
 
 
167 aa  60.1  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0298636  normal  0.832443 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1922  MarR family transcriptional regulator  31.65 
 
 
165 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.236753  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3109  MarR family transcriptional regulator  38.3 
 
 
154 aa  60.1  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  hitchhiker  0.0089778  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4023  MarR family transcriptional regulator  28.78 
 
 
145 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.709779  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2559  MarR family transcriptional regulator  34.75 
 
 
155 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1750  transcriptional regulator, MarR family  28.91 
 
 
149 aa  60.5  0.00000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1769  MarR family transcriptional regulator  31.65 
 
 
165 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.238439  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3989  MarR family transcriptional regulator  36.07 
 
 
158 aa  60.1  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.552919  normal  0.811497 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0997  MarR family transcriptional regulator  31.65 
 
 
165 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2077  MarR family transcriptional regulator  31.72 
 
 
157 aa  60.5  0.00000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3838  MarR family transcriptional regulator  38.3 
 
 
154 aa  60.1  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1501  MarR family transcriptional regulator  31.65 
 
 
165 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.340787  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0169  MarR family transcriptional regulator  31.65 
 
 
165 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00968003  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2812  MarR family transcriptional regulator  32.09 
 
 
137 aa  59.3  0.00000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0746607  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2934  Transcriptional regulator protein  32.28 
 
 
158 aa  59.3  0.00000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1975  MarR family transcriptional regulator  29.46 
 
 
155 aa  59.7  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0153804  normal  0.896313 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3645  MarR family transcriptional regulator  31.45 
 
 
160 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.610446  normal  0.0262882 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2372  MarR family transcriptional regulator  31.72 
 
 
157 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2856  transcriptional regulator, MarR family  37.04 
 
 
193 aa  59.3  0.00000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.115485 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>