More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_6943 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_6943  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 148 aa  301  1.0000000000000001e-81  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1911  transcriptional regulator, MarR family  41.18 
 
 		 164 aa  89.4  1e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2232  transcriptional regulator, MarR family  40.58 
 
 		 151 aa  89.4  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00982992  hitchhiker  0.00000264817 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1483  MarR family transcriptional regulator  37.59 
 
 		 149 aa  84.7  4e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.715105  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4525  MarR family transcriptional regulator  42.48 
 
 		 160 aa  80.5  0.000000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.209955  normal  0.318258 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0696  transcriptional regulator, MarR family  40.37 
 
 		 143 aa  80.1  0.00000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.218758  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0289  transcriptional regulator, MarR family  37.5 
 
 		 158 aa  77  0.00000000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.660944 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4960  MarR family transcriptional regulator  41.9 
 
 		 167 aa  75.9  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0298636  normal  0.832443 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2628  transcriptional regulator, MarR family  36.84 
 
 		 142 aa  75.5  0.0000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00233343  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8631  Transcriptional regulators-like protein  39.17 
 
 		 287 aa  75.1  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2033  MarR family transcriptional regulator  41.09 
 
 		 303 aa  75.1  0.0000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.368826 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1607  transcriptional regulator, MarR family  36.84 
 
 		 142 aa  75.1  0.0000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2703  MarR family transcriptional regulator  36.09 
 
 		 137 aa  74.3  0.0000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1312  transcriptional regulator, MarR family  39.42 
 
 		 164 aa  72  0.000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.230395  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6941  transcriptional regulator, MarR family  36.84 
 
 		 151 aa  71.6  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.853349  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3320  hypothetical protein  45.05 
 
 		 151 aa  71.2  0.000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0293206  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5066  transcriptional regulator, MarR family  34.33 
 
 		 149 aa  71.2  0.000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.850935  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3774  regulatory protein, MarR  34.38 
 
 		 177 aa  68.9  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2317  MarR family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 150 aa  69.3  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3155  hypothetical protein  36.75 
 
 		 292 aa  68.9  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.107679  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4156  MarR family transcriptional regulator  37.07 
 
 		 150 aa  68.2  0.00000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.331896  normal  0.584748 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6813  hypothetical protein  36.52 
 
 		 152 aa  67.8  0.00000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.611714  normal  0.242939 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1929  transcriptional regulator, MarR family  36.43 
 
 		 149 aa  67  0.00000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3989  MarR family transcriptional regulator  36.61 
 
 		 158 aa  66.2  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.552919  normal  0.811497 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1828  MarR family transcriptional regulator  37.29 
 
 		 153 aa  66.2  0.0000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0229599 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6003  MarR family transcriptional regulator  43.64 
 
 		 244 aa  66.2  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.14161 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4592  transcriptional regulator, MarR family  47.47 
 
 		 152 aa  65.1  0.0000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0409464  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2593  transcriptional regulator, MarR family  39.83 
 
 		 148 aa  64.7  0.0000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3696  MarR family transcriptional regulator  37.63 
 
 		 151 aa  64.3  0.0000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.134225  normal  0.172711 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4392  Transcriptional regulators-like protein  37.5 
 
 		 168 aa  63.9  0.0000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00709871  normal  0.0557169 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3429  transcriptional regulator MarR family  32.52 
 
 		 157 aa  63.5  0.0000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.905636  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1249  transcriptional regulator, MarR family  31.58 
 
 		 155 aa  63.5  0.000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.193511  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1065  MarR family transcriptional regulator  31.34 
 
 		 189 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0841827  normal  0.196346 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7614  transcriptional regulator, MarR family  36.04 
 
 		 157 aa  63.2  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.647741  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2538  transcriptional regulator, MarR family  38.61 
 
 		 154 aa  62.4  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.474386  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2137  MarR family transcriptional regulator  31.5 
 
 		 158 aa  62.8  0.000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0755454 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2197  MarR family transcriptional regulator  33.93 
 
 		 170 aa  62.8  0.000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0027451  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0269  MarR family transcriptional regulator  27.82 
 
 		 138 aa  62  0.000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0651  MarR family transcriptional regulator  29.1 
 
 		 172 aa  62.4  0.000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2313  MarR family transcriptional regulator  30.83 
 
 		 157 aa  62  0.000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0630  MarR family transcriptional regulator  42.59 
 
 		 194 aa  61.6  0.000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2977  transcriptional regulator, MarR family  43.33 
 
 		 158 aa  61.6  0.000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.688657  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1068  transcriptional regulator, MarR family  34.04 
 
 		 164 aa  61.6  0.000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.388349  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1140  regulatory protein MarR  32.28 
 
 		 144 aa  61.6  0.000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.104952  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3073  MarR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 170 aa  61.6  0.000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2856  MarR family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 201 aa  61.6  0.000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.843332 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0861  MarR family transcriptional regulator  33.94 
 
 		 157 aa  60.8  0.000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0942  MarR family transcriptional regulator  38.54 
 
 		 164 aa  60.8  0.000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.388439 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43770  putative transcriptional regulator  31.34 
 
 		 140 aa  60.8  0.000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3143  MarR family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 161 aa  60.8  0.000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6047  transcriptional regulator, MarR family  30.16 
 
 		 160 aa  60.8  0.000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.332223  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0598  MarR family transcriptional regulator  32.09 
 
 		 159 aa  60.5  0.000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3570  MarR family transcriptional regulator  40.24 
 
 		 171 aa  60.5  0.000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.247728 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2992  MarR family transcriptional regulator  26.98 
 
 		 139 aa  60.1  0.00000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2980  MarR family transcriptional regulator  26.98 
 
 		 139 aa  59.7  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.134372  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3228  transcriptional regulator, MarR family  26.98 
 
 		 139 aa  60.1  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3220  MarR family transcriptional regulator  26.98 
 
 		 139 aa  60.1  0.00000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1723  MarR family transcriptional regulator  31.48 
 
 		 171 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2077  MarR family transcriptional regulator  30.08 
 
 		 157 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1893  regulatory protein, MarR  40.7 
 
 		 172 aa  60.1  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.447554  normal  0.734981 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1972  transcriptional regulator, MarR family  36.21 
 
 		 159 aa  59.7  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.276082  normal  0.475947 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1388  MarR family transcriptional regulator  27.7 
 
 		 164 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2920  MarR family transcriptional regulator  26.15 
 
 		 139 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3109  MarR family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 154 aa  59.3  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  hitchhiker  0.0089778  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0049  MarR family transcriptional regulator  28.99 
 
 		 162 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1985  MarR family transcriptional regulator  30.15 
 
 		 154 aa  59.3  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0411716  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0934  MarR family transcriptional regulator  33.07 
 
 		 303 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0213342  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1134  MarR family transcriptional regulator  40.96 
 
 		 154 aa  59.3  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.168406  hitchhiker  0.0000997239 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0022  MarR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 162 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0694337  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2643  MarR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 211 aa  58.9  0.00000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1428  MarR family transcriptional regulator  28.15 
 
 		 164 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.256408 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0048  MarR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 162 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.407046  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2082  MarR family transcriptional regulator  33.57 
 
 		 158 aa  59.3  0.00000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2632  MarR family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 161 aa  58.9  0.00000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.256033  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0067  MarR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 162 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3838  MarR family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 154 aa  59.3  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2057  transcriptional regulator, MarR family  32.46 
 
 		 153 aa  58.9  0.00000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.240684  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5227  MarR family transcriptional regulator  35.35 
 
 		 149 aa  58.2  0.00000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.651457 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06856  hypothetical protein  30.77 
 
 		 142 aa  58.5  0.00000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1346  MarR family transcriptional regulator  35.35 
 
 		 149 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0685392  normal  0.0717875 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4545  MarR family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 188 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.257542 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0603  MarR family transcriptional regulator  33.06 
 
 		 155 aa  58.5  0.00000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.125253  normal  0.477496 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1966  transcriptional regulator, MarR family  32.04 
 
 		 151 aa  58.2  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000123545  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1949  MarR family transcriptional regulator  35.35 
 
 		 149 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0745921  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3645  MarR family transcriptional regulator  29.06 
 
 		 160 aa  58.2  0.00000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.610446  normal  0.0262882 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1659  MarR family transcriptional regulator  36 
 
 		 153 aa  58.2  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2856  transcriptional regulator, MarR family  35.48 
 
 		 193 aa  58.2  0.00000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.115485 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6153  MarR family transcriptional regulator  35.35 
 
 		 149 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.834602  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2532  transcriptional regulator, MarR family  31.78 
 
 		 166 aa  58.2  0.00000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.162999 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3216  transcriptional regulator, MarR family  26.19 
 
 		 139 aa  58.2  0.00000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1926  MarR family transcriptional regulator  35.35 
 
 		 149 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.609155  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1729  regulatory protein, MarR  31.34 
 
 		 162 aa  57.8  0.00000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4647  MarR family transcriptional regulator  28.15 
 
 		 163 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.167247  normal  0.261087 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3249  transcriptional regulator, MarR family  26.19 
 
 		 139 aa  57.4  0.00000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.490647  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1026  MarR family transcriptional regulator  28.15 
 
 		 163 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1482  MarR family transcriptional regulator  28.15 
 
 		 163 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.914228  normal  0.421582 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1506  MarR family transcriptional regulator  28.15 
 
 		 163 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3581  MarR family transcriptional regulator  30.71 
 
 		 158 aa  57.4  0.00000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.703984 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0038  MarR family transcriptional regulator  29.71 
 
 		 162 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1914  MarR family transcriptional regulator  34.34 
 
 		 149 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.202978  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>