209 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B1065 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007952  Bxe_B1065  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 189 aa  379  1e-104  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0841827  normal  0.196346 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3774  regulatory protein, MarR  49.08 
 
 		 177 aa  136  1e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4545  MarR family transcriptional regulator  46.72 
 
 		 188 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.257542 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0651  MarR family transcriptional regulator  44.53 
 
 		 172 aa  115  3.9999999999999997e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5827  MarR family transcriptional regulator  47.37 
 
 		 176 aa  112  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000586451 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5701  MarR family transcriptional regulator  46.03 
 
 		 184 aa  108  6e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0574544  normal  0.0180901 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4283  transcriptional regulator, MarR family  36.75 
 
 		 176 aa  107  1e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1051  MarR family transcriptional regulator  43.18 
 
 		 151 aa  105  3e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00706994  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3042  MarR family transcriptional regulator  42.76 
 
 		 174 aa  103  2e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.125227  hitchhiker  0.00142823 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7499  MarR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 169 aa  96.3  3e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.800614 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3704  MarR family transcriptional regulator  39.33 
 
 		 178 aa  95.1  6e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0457412  normal  0.0618466 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3143  MarR family transcriptional regulator  39.19 
 
 		 161 aa  94.4  9e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3234  transcriptional regulator, MarR family  37.86 
 
 		 151 aa  93.2  2e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0823  transcriptional regulator, MarR family  37.32 
 
 		 150 aa  92.8  3e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3487  MarR family transcriptional regulator  35.93 
 
 		 190 aa  91.7  5e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.544367  normal  0.213963 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6873  MarR family transcriptional regulator  34.9 
 
 		 159 aa  90.1  1e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3696  MarR family transcriptional regulator  40 
 
 		 151 aa  87.4  1e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.134225  normal  0.172711 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3564  MarR family transcriptional regulator  35.86 
 
 		 172 aa  86.7  2e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2129  MarR family transcriptional regulator  36.17 
 
 		 148 aa  85.9  4e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0697643  normal  0.94503 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1353  MarR family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 157 aa  82  0.000000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5695  transcriptional regulator, MarR family  35.17 
 
 		 155 aa  81.3  0.000000000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2929  MarR family transcriptional regulator  33.8 
 
 		 315 aa  80.5  0.00000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0675184  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1828  MarR family transcriptional regulator  35.25 
 
 		 153 aa  79.3  0.00000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0229599 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3946  MarR family transcriptional regulator  33.09 
 
 		 158 aa  78.2  0.00000000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.364439 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1891  MarR family transcriptional regulator  33.09 
 
 		 158 aa  78.2  0.00000000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.784898  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6047  transcriptional regulator, MarR family  35.07 
 
 		 160 aa  77.8  0.00000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.332223  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3581  MarR family transcriptional regulator  32.12 
 
 		 158 aa  76.6  0.0000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.703984 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2197  MarR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 170 aa  75.5  0.0000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0027451  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4219  MarR family transcriptional regulator  35.66 
 
 		 180 aa  73.9  0.000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.260034 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1249  transcriptional regulator, MarR family  37.59 
 
 		 155 aa  72.4  0.000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.193511  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0934  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 303 aa  72  0.000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0213342  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2313  MarR family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 157 aa  70.9  0.00000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5066  transcriptional regulator, MarR family  31.01 
 
 		 149 aa  70.1  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.850935  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2137  MarR family transcriptional regulator  29.71 
 
 		 158 aa  69.3  0.00000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0755454 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5123  MarR family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 179 aa  68.9  0.00000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.126201  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5030  MarR family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 162 aa  68.6  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.942025 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3922  MarR family transcriptional regulator  33.61 
 
 		 152 aa  67.8  0.00000000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0462082  normal  0.0695872 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0421  MarR family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 162 aa  67.8  0.00000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.799944  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0279  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 158 aa  67.8  0.00000000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.468058  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4156  MarR family transcriptional regulator  37.76 
 
 		 150 aa  67.8  0.00000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.331896  normal  0.584748 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3125  MarR family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 162 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0374972  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5242  MarR family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 162 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1859  MarR family transcriptional regulator  33.61 
 
 		 154 aa  67.4  0.0000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4858  MarR family transcriptional regulator  32.28 
 
 		 195 aa  66.6  0.0000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.375603  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4590  MarR family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 185 aa  65.5  0.0000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.777081  normal  0.899831 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2508  MarR family transcriptional regulator  30.94 
 
 		 158 aa  65.5  0.0000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.132261  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1546  MarR family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 161 aa  65.5  0.0000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.22368  normal  0.197095 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0598  MarR family transcriptional regulator  33.59 
 
 		 159 aa  64.3  0.000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0283  transcriptional regulator, MarR family  36.8 
 
 		 157 aa  64.3  0.000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.34751  hitchhiker  0.000254243 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6943  MarR family transcriptional regulator  31.34 
 
 		 148 aa  63.2  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5689  MarR family transcriptional regulator  33.1 
 
 		 150 aa  63.5  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0868849  normal  0.757777 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3989  MarR family transcriptional regulator  31.93 
 
 		 158 aa  62.8  0.000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.552919  normal  0.811497 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1634  transcriptional regulator, MarR family  31.82 
 
 		 140 aa  62.4  0.000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0355019  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6482  MarR family transcriptional regulator  31.51 
 
 		 172 aa  61.6  0.000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.618469  normal  0.143744 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2432  MarR family transcriptional regulator  29.46 
 
 		 174 aa  61.2  0.000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0660  MarR family transcriptional regulator  32.82 
 
 		 175 aa  59.7  0.00000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.327844  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1929  transcriptional regulator, MarR family  33.59 
 
 		 149 aa  59.7  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1985  MarR family transcriptional regulator  34.06 
 
 		 154 aa  59.7  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0411716  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4960  MarR family transcriptional regulator  31.53 
 
 		 167 aa  59.3  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0298636  normal  0.832443 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43770  putative transcriptional regulator  31.54 
 
 		 140 aa  58.9  0.00000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6031  transcriptional regulator, MarR family  32.31 
 
 		 159 aa  58.5  0.00000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6813  hypothetical protein  29.06 
 
 		 152 aa  57.8  0.00000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.611714  normal  0.242939 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1143  MarR family transcriptional regulator  27.66 
 
 		 205 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0330  MarR family transcriptional regulator  30.15 
 
 		 141 aa  56.6  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4809  transcriptional regulator, MarR family  31.5 
 
 		 161 aa  57  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.577759  normal  0.746027 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6384  MarR family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 143 aa  57  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2856  MarR family transcriptional regulator  28.15 
 
 		 201 aa  56.6  0.0000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.843332 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1483  MarR family transcriptional regulator  32 
 
 		 149 aa  56.2  0.0000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.715105  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2033  MarR family transcriptional regulator  35.66 
 
 		 303 aa  56.2  0.0000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.368826 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3645  MarR family transcriptional regulator  33.94 
 
 		 160 aa  55.1  0.0000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.610446  normal  0.0262882 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7614  transcriptional regulator, MarR family  33 
 
 		 157 aa  54.7  0.0000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.647741  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3489  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 		 148 aa  55.1  0.0000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000483469 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4330  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 		 148 aa  55.1  0.0000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.28808  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4036  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 		 148 aa  55.1  0.0000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0500935  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4553  MarR family transcriptional regulator  30.33 
 
 		 161 aa  54.7  0.0000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.561632 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3671  putative transcriptional regulator  29.03 
 
 		 140 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.249648  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6069  transcriptional regulator, MarR family  29.46 
 
 		 146 aa  52.8  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.683287 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3570  MarR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 171 aa  52.8  0.000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.247728 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2703  MarR family transcriptional regulator  33.6 
 
 		 137 aa  52.8  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7084  MarR family transcriptional regulator  28.48 
 
 		 170 aa  52.8  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4899  transcriptional regulator, MarR family  28.57 
 
 		 161 aa  51.6  0.000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.529551  normal  0.428583 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3027  MarR family transcriptional regulator  28.45 
 
 		 163 aa  50.8  0.00001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.128021 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4592  transcriptional regulator, MarR family  39.39 
 
 		 152 aa  51.2  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0409464  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2538  transcriptional regulator, MarR family  29.58 
 
 		 154 aa  50.4  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.474386  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0223  transcriptional regulator, MarR family  32.03 
 
 		 169 aa  50.4  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.504687  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2232  transcriptional regulator, MarR family  29.1 
 
 		 151 aa  50.1  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00982992  hitchhiker  0.00000264817 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0269  MarR family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 138 aa  50.1  0.00002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2632  MarR family transcriptional regulator  29.92 
 
 		 161 aa  50.1  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.256033  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2136  MarR family transcriptional regulator  28.35 
 
 		 142 aa  49.7  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00095835 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1235  MarR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 144 aa  49.3  0.00003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.236148  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2149  MarR family transcriptional regulator  28.97 
 
 		 142 aa  49.3  0.00004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2195  MarR family transcriptional regulator  28.97 
 
 		 142 aa  49.3  0.00004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0273493 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1998  MarR family transcriptional regulator  30.16 
 
 		 154 aa  48.5  0.00005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1150  Transcriptional regulators-like protein  26.67 
 
 		 168 aa  48.5  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1729  regulatory protein, MarR  28.47 
 
 		 162 aa  48.5  0.00006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1140  regulatory protein MarR  26.23 
 
 		 144 aa  48.5  0.00006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.104952  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3763  MarR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 154 aa  48.5  0.00006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.311442  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06310  transcriptional regulator  33.01 
 
 		 169 aa  48.1  0.00007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3749  multiple antibiotic resistance protein MarR, putative  27.78 
 
 		 162 aa  47.4  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.17828  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5077  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 153 aa  47  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>