More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_2977 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_2977  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 		 158 aa  315  1e-85  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.688657  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3570  MarR family transcriptional regulator  41.13 
 
 		 171 aa  104  4e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.247728 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0223  transcriptional regulator, MarR family  40.85 
 
 		 169 aa  101  4e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.504687  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1996  transcriptional regulator, MarR family  41.18 
 
 		 172 aa  101  4e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1893  regulatory protein, MarR  40.44 
 
 		 172 aa  99  3e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.447554  normal  0.734981 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3429  transcriptional regulator MarR family  38.52 
 
 		 157 aa  98.2  4e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.905636  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7084  MarR family transcriptional regulator  39.6 
 
 		 170 aa  98.2  4e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0565  MarR family transcriptional regulator  40.88 
 
 		 193 aa  95.9  2e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3044  MarR family transcriptional regulator  39.42 
 
 		 165 aa  94.4  6e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0516  transcriptional regulator, MarR family  38.69 
 
 		 171 aa  93.2  1e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.398648 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0503  transcriptional regulator, MarR family  38.69 
 
 		 171 aa  93.2  1e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.554707 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0795  MarR family transcriptional regulator  39.31 
 
 		 179 aa  92.8  1e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0590  putative transcription regulator protein  39.58 
 
 		 178 aa  92.4  2e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3027  MarR family transcriptional regulator  36.89 
 
 		 163 aa  92.8  2e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.128021 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3763  MarR family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 154 aa  90.9  6e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.311442  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4809  transcriptional regulator, MarR family  35.38 
 
 		 161 aa  90.5  7e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.577759  normal  0.746027 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0284  MarR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 167 aa  89.7  1e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1134  MarR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 154 aa  89.7  1e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.168406  hitchhiker  0.0000997239 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4899  transcriptional regulator, MarR family  34.88 
 
 		 161 aa  88.6  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.529551  normal  0.428583 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3359  hydroxycinnamic acid degradation regulator, putative  32.89 
 
 		 156 aa  87.4  7e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1703  transcriptional regulator MarR family  32.61 
 
 		 172 aa  86.3  2e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.135356  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2399  MarR family transcriptional regulator  32.24 
 
 		 156 aa  85.5  3e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1828  MarR family transcriptional regulator  35.92 
 
 		 153 aa  83.6  0.000000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0229599 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6948  MarR family transcriptional regulator  38.4 
 
 		 159 aa  82.8  0.000000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.17806  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1089  MarR family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 161 aa  81.6  0.000000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2046  MarR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 156 aa  80.1  0.00000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5092  MarR family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 167 aa  79.3  0.00000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.636455 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7499  MarR family transcriptional regulator  35.88 
 
 		 169 aa  78.6  0.00000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.800614 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2856  transcriptional regulator, MarR family  36.09 
 
 		 193 aa  77.8  0.00000000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.115485 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3143  MarR family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 161 aa  77  0.0000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2729  regulatory protein, MarR  33.33 
 
 		 162 aa  74.7  0.0000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0376267  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0803  MarR family transcriptional regulator  30.07 
 
 		 157 aa  74.7  0.0000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14420  transcriptional regulator, MarR family  34.09 
 
 		 161 aa  74.7  0.0000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0823  transcriptional regulator, MarR family  34.92 
 
 		 150 aa  75.1  0.0000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3234  transcriptional regulator, MarR family  34.92 
 
 		 151 aa  75.1  0.0000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2271  MarR family transcriptional regulator  29.37 
 
 		 146 aa  74.3  0.0000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0738352 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3774  regulatory protein, MarR  33.58 
 
 		 177 aa  74.3  0.0000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2762  MarR family transcriptional regulator  36.09 
 
 		 184 aa  74.3  0.0000000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.351769  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4392  Transcriptional regulators-like protein  42.57 
 
 		 168 aa  73.9  0.0000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00709871  normal  0.0557169 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0263  MarR family transcriptional regulator  33.11 
 
 		 151 aa  73.6  0.0000000000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3487  MarR family transcriptional regulator  38.39 
 
 		 190 aa  73.2  0.000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.544367  normal  0.213963 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2945  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 162 aa  72.8  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.521959  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2958  transcriptional regulator, MarR family  30.15 
 
 		 155 aa  71.6  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000649784  normal  0.827828 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0934  MarR family transcriptional regulator  35.25 
 
 		 303 aa  71.6  0.000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0213342  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2197  MarR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 170 aa  71.2  0.000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0027451  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1546  MarR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 161 aa  71.2  0.000000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.22368  normal  0.197095 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1302  MarR family transcriptional regulator  35.78 
 
 		 154 aa  69.7  0.00000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.475565  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3119  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 151 aa  69.7  0.00000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0332666  normal  0.174429 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4283  transcriptional regulator, MarR family  34.38 
 
 		 176 aa  69.7  0.00000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2232  transcriptional regulator, MarR family  32.33 
 
 		 151 aa  70.5  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00982992  hitchhiker  0.00000264817 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6455  transcriptional regulator, MarR family  30 
 
 		 162 aa  68.9  0.00000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0324  transcriptional regulator, MarR family  29.1 
 
 		 150 aa  68.9  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.491291  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6943  MarR family transcriptional regulator  43.56 
 
 		 148 aa  68.6  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1409  MarR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 184 aa  68.2  0.00000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2628  transcriptional regulator, MarR family  31.25 
 
 		 142 aa  67.4  0.00000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00233343  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0651  MarR family transcriptional regulator  27.94 
 
 		 172 aa  67.4  0.00000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1307  MarR family transcriptional regulator  34.56 
 
 		 159 aa  67.4  0.00000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.702718  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2129  MarR family transcriptional regulator  32.06 
 
 		 148 aa  66.6  0.0000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0697643  normal  0.94503 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6384  MarR family transcriptional regulator  36.45 
 
 		 143 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0807  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 197 aa  66.6  0.0000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5827  MarR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 176 aa  65.9  0.0000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000586451 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4545  MarR family transcriptional regulator  35.4 
 
 		 188 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.257542 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1607  transcriptional regulator, MarR family  32.74 
 
 		 142 aa  65.9  0.0000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1051  MarR family transcriptional regulator  35.45 
 
 		 151 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00706994  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1714  transcriptional regulator, MarR family  32.33 
 
 		 157 aa  65.9  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00901457 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6607  MarR family transcriptional regulator  31.09 
 
 		 329 aa  65.1  0.0000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.542838  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4525  MarR family transcriptional regulator  42.71 
 
 		 160 aa  65.1  0.0000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.209955  normal  0.318258 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1634  transcriptional regulator, MarR family  32.81 
 
 		 140 aa  64.7  0.0000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0355019  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1353  MarR family transcriptional regulator  32.82 
 
 		 157 aa  65.1  0.0000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0603  MarR family transcriptional regulator  32.37 
 
 		 155 aa  65.1  0.0000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.125253  normal  0.477496 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2136  MarR family transcriptional regulator  33.06 
 
 		 142 aa  64.3  0.0000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00095835 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2149  MarR family transcriptional regulator  33.06 
 
 		 142 aa  64.3  0.0000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0269  MarR family transcriptional regulator  28.79 
 
 		 138 aa  64.3  0.0000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2195  MarR family transcriptional regulator  33.06 
 
 		 142 aa  64.3  0.0000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0273493 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4315  MarR family transcriptional regulator  32.03 
 
 		 193 aa  63.9  0.0000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4536  MarR family transcriptional regulator  33.91 
 
 		 166 aa  63.9  0.0000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.018511  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6873  MarR family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 159 aa  63.9  0.0000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3696  MarR family transcriptional regulator  36.28 
 
 		 151 aa  63.2  0.000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.134225  normal  0.172711 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0660  MarR family transcriptional regulator  31.85 
 
 		 175 aa  63.5  0.000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.327844  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3216  transcriptional regulator, MarR family  27.27 
 
 		 139 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0811  transcriptional regulator, MarR family  28.46 
 
 		 149 aa  63.2  0.000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.770437  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2466  Transcriptional regulators-like protein  39.33 
 
 		 145 aa  63.5  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0564534  normal  0.0878491 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1723  MarR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 171 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4647  MarR family transcriptional regulator  30.46 
 
 		 163 aa  62  0.000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.167247  normal  0.261087 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2856  MarR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 201 aa  62.4  0.000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.843332 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2992  MarR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 139 aa  61.6  0.000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2980  MarR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 139 aa  61.6  0.000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.134372  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2920  MarR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 139 aa  61.6  0.000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3228  transcriptional regulator, MarR family  27.27 
 
 		 139 aa  61.6  0.000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3220  MarR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 139 aa  61.6  0.000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2703  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 137 aa  61.6  0.000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1143  MarR family transcriptional regulator  28.69 
 
 		 205 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06856  hypothetical protein  27.13 
 
 		 142 aa  61.2  0.000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2558  MarR family transcriptional regulator  28.21 
 
 		 165 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3908  transcriptional regulator, TrmB  31.37 
 
 		 148 aa  60.8  0.000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1026  MarR family transcriptional regulator  36.04 
 
 		 163 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2929  MarR family transcriptional regulator  36.21 
 
 		 315 aa  60.8  0.000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0675184  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1506  MarR family transcriptional regulator  36.04 
 
 		 163 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5701  MarR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 184 aa  61.2  0.000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0574544  normal  0.0180901 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3825  MarR family transcriptional regulator  42.16 
 
 		 161 aa  60.8  0.000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>