More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_5827 on replicon NC_010510
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010510  Mrad2831_5827  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 176 aa  340  5e-93  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000586451 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5701  MarR family transcriptional regulator  68.66 
 
 		 184 aa  184  7e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0574544  normal  0.0180901 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0651  MarR family transcriptional regulator  60.14 
 
 		 172 aa  173  9.999999999999999e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4545  MarR family transcriptional regulator  44.93 
 
 		 188 aa  119  3e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.257542 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1065  MarR family transcriptional regulator  44.9 
 
 		 189 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0841827  normal  0.196346 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3774  regulatory protein, MarR  37.8 
 
 		 177 aa  106  1e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0823  transcriptional regulator, MarR family  39.86 
 
 		 150 aa  106  2e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3234  transcriptional regulator, MarR family  39.86 
 
 		 151 aa  106  2e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1051  MarR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 151 aa  104  7e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00706994  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6873  MarR family transcriptional regulator  37.59 
 
 		 159 aa  98.2  5e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4283  transcriptional regulator, MarR family  32.12 
 
 		 176 aa  95.1  5e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3042  MarR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 174 aa  94.7  6e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.125227  hitchhiker  0.00142823 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2129  MarR family transcriptional regulator  37.06 
 
 		 148 aa  93.2  2e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0697643  normal  0.94503 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3564  MarR family transcriptional regulator  49.45 
 
 		 172 aa  92  4e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5689  MarR family transcriptional regulator  44.6 
 
 		 150 aa  91.7  5e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0868849  normal  0.757777 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3487  MarR family transcriptional regulator  41.26 
 
 		 190 aa  91.7  5e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.544367  normal  0.213963 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3143  MarR family transcriptional regulator  35.77 
 
 		 161 aa  91.7  6e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2137  MarR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 158 aa  89  3e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0755454 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7499  MarR family transcriptional regulator  36.92 
 
 		 169 aa  88.2  6e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.800614 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3946  MarR family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 158 aa  87  1e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.364439 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1891  MarR family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 158 aa  87  1e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.784898  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2929  MarR family transcriptional regulator  36 
 
 		 315 aa  87  1e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0675184  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2313  MarR family transcriptional regulator  33.96 
 
 		 157 aa  86.7  2e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0598  MarR family transcriptional regulator  36.15 
 
 		 159 aa  84.7  6e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1828  MarR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 153 aa  84.3  8e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0229599 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1634  transcriptional regulator, MarR family  37.9 
 
 		 140 aa  84  0.000000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0355019  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1249  transcriptional regulator, MarR family  39.85 
 
 		 155 aa  83.2  0.000000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.193511  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3581  MarR family transcriptional regulator  35.25 
 
 		 158 aa  82.4  0.000000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.703984 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2197  MarR family transcriptional regulator  42.48 
 
 		 170 aa  82  0.000000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0027451  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1353  MarR family transcriptional regulator  37.16 
 
 		 157 aa  80.5  0.00000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1546  MarR family transcriptional regulator  39.23 
 
 		 161 aa  79.3  0.00000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.22368  normal  0.197095 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2508  MarR family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 158 aa  78.2  0.00000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.132261  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3704  MarR family transcriptional regulator  40.44 
 
 		 178 aa  77.8  0.00000000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0457412  normal  0.0618466 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3696  MarR family transcriptional regulator  41.44 
 
 		 151 aa  78.2  0.00000000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.134225  normal  0.172711 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0279  MarR family transcriptional regulator  36.99 
 
 		 158 aa  77.8  0.00000000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.468058  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1985  MarR family transcriptional regulator  39.1 
 
 		 154 aa  77.8  0.00000000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0411716  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4590  MarR family transcriptional regulator  35.76 
 
 		 185 aa  77.4  0.00000000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.777081  normal  0.899831 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0660  MarR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 175 aa  77.4  0.0000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.327844  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5123  MarR family transcriptional regulator  35.76 
 
 		 179 aa  77  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.126201  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2628  transcriptional regulator, MarR family  37.01 
 
 		 142 aa  76.6  0.0000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00233343  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1859  MarR family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 154 aa  76.3  0.0000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1607  transcriptional regulator, MarR family  37.01 
 
 		 142 aa  75.9  0.0000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3922  MarR family transcriptional regulator  32.41 
 
 		 152 aa  75.5  0.0000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0462082  normal  0.0695872 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0421  MarR family transcriptional regulator  38.73 
 
 		 162 aa  74.7  0.0000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.799944  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6047  transcriptional regulator, MarR family  33.58 
 
 		 160 aa  73.6  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.332223  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0283  transcriptional regulator, MarR family  42.54 
 
 		 157 aa  72  0.000000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.34751  hitchhiker  0.000254243 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5030  MarR family transcriptional regulator  38.03 
 
 		 162 aa  71.2  0.000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.942025 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3125  MarR family transcriptional regulator  38.03 
 
 		 162 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0374972  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5242  MarR family transcriptional regulator  38.03 
 
 		 162 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0934  MarR family transcriptional regulator  35.61 
 
 		 303 aa  69.7  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0213342  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5695  transcriptional regulator, MarR family  32 
 
 		 155 aa  68.9  0.00000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0330  MarR family transcriptional regulator  33.83 
 
 		 141 aa  67  0.0000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6482  MarR family transcriptional regulator  32.33 
 
 		 172 aa  67  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.618469  normal  0.143744 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1483  MarR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 149 aa  66.6  0.0000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.715105  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3489  MarR family transcriptional regulator  31.85 
 
 		 148 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000483469 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4330  MarR family transcriptional regulator  31.85 
 
 		 148 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.28808  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4036  MarR family transcriptional regulator  31.85 
 
 		 148 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0500935  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2703  MarR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 137 aa  65.9  0.0000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3216  transcriptional regulator, MarR family  27.48 
 
 		 139 aa  65.1  0.0000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0269  MarR family transcriptional regulator  32.06 
 
 		 138 aa  64.7  0.0000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2632  MarR family transcriptional regulator  33.06 
 
 		 161 aa  64.7  0.0000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.256033  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2432  MarR family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 174 aa  63.5  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6384  MarR family transcriptional regulator  32.09 
 
 		 143 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2992  MarR family transcriptional regulator  28.35 
 
 		 139 aa  62.4  0.000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4553  MarR family transcriptional regulator  30.14 
 
 		 161 aa  62.8  0.000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.561632 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2977  transcriptional regulator, MarR family  31.4 
 
 		 158 aa  62.4  0.000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.688657  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3220  MarR family transcriptional regulator  28.35 
 
 		 139 aa  62.4  0.000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3249  transcriptional regulator, MarR family  28.35 
 
 		 139 aa  62.4  0.000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.490647  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3228  transcriptional regulator, MarR family  28.35 
 
 		 139 aa  62.4  0.000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2980  MarR family transcriptional regulator  28.35 
 
 		 139 aa  62  0.000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.134372  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4858  MarR family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 195 aa  61.6  0.000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.375603  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6031  transcriptional regulator, MarR family  31.13 
 
 		 159 aa  61.2  0.000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2856  MarR family transcriptional regulator  29.71 
 
 		 201 aa  61.2  0.000000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.843332 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4219  MarR family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 180 aa  60.8  0.000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.260034 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2920  MarR family transcriptional regulator  27.56 
 
 		 139 aa  60.8  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0986  MarR family transcriptional regulator  39.62 
 
 		 155 aa  59.7  0.00000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3564  MarR family transcriptional regulator  38.39 
 
 		 155 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.7607  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0807  MarR family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 197 aa  59.3  0.00000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2559  MarR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 155 aa  58.2  0.00000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0263  MarR family transcriptional regulator  31.5 
 
 		 151 aa  58.2  0.00000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43770  putative transcriptional regulator  34.09 
 
 		 140 aa  58.2  0.00000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3956  MarR family transcriptional regulator  40.82 
 
 		 158 aa  57.8  0.00000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.210234 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7614  transcriptional regulator, MarR family  31.3 
 
 		 157 aa  57.8  0.00000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.647741  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4156  MarR family transcriptional regulator  33.55 
 
 		 150 aa  57  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.331896  normal  0.584748 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4647  MarR family transcriptional regulator  27.86 
 
 		 163 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.167247  normal  0.261087 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3119  MarR family transcriptional regulator  32.31 
 
 		 151 aa  56.2  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0332666  normal  0.174429 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1026  MarR family transcriptional regulator  28.06 
 
 		 163 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1482  MarR family transcriptional regulator  28.06 
 
 		 163 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.914228  normal  0.421582 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5112  MarR family transcriptional regulator  39.8 
 
 		 155 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.522104  normal  0.0529869 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1506  MarR family transcriptional regulator  28.06 
 
 		 163 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1281  MarR family transcriptional regulator  39.09 
 
 		 134 aa  55.8  0.0000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.781724  normal  0.841925 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1409  MarR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 184 aa  55.8  0.0000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1659  MarR family transcriptional regulator  31.85 
 
 		 153 aa  55.5  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6455  transcriptional regulator, MarR family  30.6 
 
 		 162 aa  54.7  0.0000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1683  MarR family transcriptional regulator  37.17 
 
 		 134 aa  54.3  0.0000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.857494 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4960  MarR family transcriptional regulator  29.92 
 
 		 167 aa  54.7  0.0000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0298636  normal  0.832443 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1995  MarR family transcriptional regulator  32.03 
 
 		 158 aa  54.3  0.0000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.911966  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6388  transcriptional regulator, MarR family  31.13 
 
 		 149 aa  54.3  0.0000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2116  MarR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 138 aa  53.9  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1241  MarR family transcriptional regulator  37.27 
 
 		 134 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.248752  normal  0.852338 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>