More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_1985 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_1985  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 154 aa  304  3e-82  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0411716  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1249  transcriptional regulator, MarR family  84.52 
 
 		 155 aa  252  1.0000000000000001e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.193511  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6047  transcriptional regulator, MarR family  41.48 
 
 		 160 aa  108  3e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.332223  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1659  MarR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 153 aa  108  4.0000000000000004e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4219  MarR family transcriptional regulator  44.78 
 
 		 180 aa  107  4.0000000000000004e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.260034 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6031  transcriptional regulator, MarR family  44.78 
 
 		 159 aa  103  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43770  putative transcriptional regulator  43.28 
 
 		 140 aa  102  2e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2137  MarR family transcriptional regulator  39.55 
 
 		 158 aa  100  5e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0755454 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2432  MarR family transcriptional regulator  42.65 
 
 		 174 aa  100  8e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3671  putative transcriptional regulator  43.09 
 
 		 140 aa  95.5  3e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.249648  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3581  MarR family transcriptional regulator  38.06 
 
 		 158 aa  95.5  3e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.703984 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3946  MarR family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 158 aa  93.6  8e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.364439 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1891  MarR family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 158 aa  93.6  8e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.784898  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2508  MarR family transcriptional regulator  36.3 
 
 		 158 aa  90.1  1e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.132261  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3922  MarR family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 152 aa  88.2  3e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0462082  normal  0.0695872 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2313  MarR family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 157 aa  87.8  5e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1483  MarR family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 149 aa  85.9  2e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.715105  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4553  MarR family transcriptional regulator  36.57 
 
 		 161 aa  84  7e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.561632 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3774  regulatory protein, MarR  40.94 
 
 		 177 aa  82.4  0.000000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3489  MarR family transcriptional regulator  35.07 
 
 		 148 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000483469 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4330  MarR family transcriptional regulator  35.07 
 
 		 148 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.28808  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4036  MarR family transcriptional regulator  35.07 
 
 		 148 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0500935  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1607  transcriptional regulator, MarR family  35.61 
 
 		 142 aa  81.6  0.000000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2632  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 161 aa  81.3  0.000000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.256033  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2703  MarR family transcriptional regulator  35.94 
 
 		 137 aa  80.1  0.00000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2628  transcriptional regulator, MarR family  34.85 
 
 		 142 aa  79.7  0.00000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00233343  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3661  MarR family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 172 aa  79.7  0.00000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.185456  normal  0.0917972 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0598  MarR family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 159 aa  79.3  0.00000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2129  MarR family transcriptional regulator  39.55 
 
 		 148 aa  78.2  0.00000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0697643  normal  0.94503 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5827  MarR family transcriptional regulator  39.1 
 
 		 176 aa  77.8  0.00000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000586451 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1634  transcriptional regulator, MarR family  32.58 
 
 		 140 aa  77.8  0.00000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0355019  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3564  MarR family transcriptional regulator  39.66 
 
 		 172 aa  75.5  0.0000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3143  MarR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 161 aa  74.7  0.0000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0651  MarR family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 172 aa  74.7  0.0000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1859  MarR family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 154 aa  73.9  0.0000000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5701  MarR family transcriptional regulator  34.75 
 
 		 184 aa  71.2  0.000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0574544  normal  0.0180901 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7499  MarR family transcriptional regulator  35.43 
 
 		 169 aa  70.5  0.000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.800614 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1546  MarR family transcriptional regulator  39.85 
 
 		 161 aa  70.5  0.000000000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.22368  normal  0.197095 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4545  MarR family transcriptional regulator  35.34 
 
 		 188 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.257542 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2469  transcriptional regulator, MarR family  32.82 
 
 		 150 aa  68.9  0.00000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1828  MarR family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 153 aa  69.7  0.00000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0229599 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3487  MarR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 190 aa  68.9  0.00000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.544367  normal  0.213963 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2838  transcriptional regulator, MarR family  32.32 
 
 		 140 aa  68.9  0.00000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6203  regulatory protein, MarR  30.14 
 
 		 150 aa  68.2  0.00000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.187647  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0823  transcriptional regulator, MarR family  34.65 
 
 		 150 aa  68.2  0.00000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3234  transcriptional regulator, MarR family  34.65 
 
 		 151 aa  67.8  0.00000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3119  MarR family transcriptional regulator  33.81 
 
 		 151 aa  67.4  0.00000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0332666  normal  0.174429 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6384  MarR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 143 aa  67  0.00000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2197  MarR family transcriptional regulator  32 
 
 		 170 aa  67  0.00000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0027451  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0218  MarR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 143 aa  66.2  0.0000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3704  MarR family transcriptional regulator  37.12 
 
 		 178 aa  65.5  0.0000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0457412  normal  0.0618466 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2756  transcriptional regulator, MarR family  32.56 
 
 		 151 aa  65.9  0.0000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1353  MarR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 157 aa  65.9  0.0000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0220  MarR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 143 aa  65.9  0.0000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0435  MarR family transcriptional regulator  42.22 
 
 		 150 aa  64.7  0.0000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0263  MarR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 151 aa  64.3  0.0000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5695  transcriptional regulator, MarR family  35.34 
 
 		 155 aa  63.9  0.0000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4960  MarR family transcriptional regulator  36.79 
 
 		 167 aa  63.2  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0298636  normal  0.832443 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0269  MarR family transcriptional regulator  24.63 
 
 		 138 aa  63.2  0.000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2762  MarR family transcriptional regulator  33.6 
 
 		 184 aa  62.8  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.351769  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2019  transcriptional regulator, MarR family  30.6 
 
 		 145 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0237275 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2929  MarR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 315 aa  61.2  0.000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0675184  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2856  MarR family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 201 aa  61.6  0.000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.843332 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1051  MarR family transcriptional regulator  33.03 
 
 		 151 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00706994  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1143  MarR family transcriptional regulator  35 
 
 		 205 aa  60.8  0.000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3042  MarR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 174 aa  60.5  0.000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.125227  hitchhiker  0.00142823 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2133  MarR family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 137 aa  60.1  0.00000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1065  MarR family transcriptional regulator  34.06 
 
 		 189 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0841827  normal  0.196346 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1531  transcriptional regulator, TrmB  27.93 
 
 		 141 aa  59.3  0.00000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.02316  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1295  putative transcription regulator protein  33.86 
 
 		 147 aa  59.3  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.260048  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1723  MarR family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 171 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3320  hypothetical protein  33.33 
 
 		 151 aa  58.9  0.00000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0293206  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6943  MarR family transcriptional regulator  30.15 
 
 		 148 aa  59.3  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4024  MarR family transcriptional regulator  28.36 
 
 		 145 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4283  transcriptional regulator, MarR family  29.13 
 
 		 176 aa  58.5  0.00000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2271  MarR family transcriptional regulator  34.59 
 
 		 146 aa  58.9  0.00000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0738352 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0284  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 167 aa  58.5  0.00000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0279  MarR family transcriptional regulator  31.34 
 
 		 158 aa  57.8  0.00000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.468058  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1150  Transcriptional regulators-like protein  31.33 
 
 		 168 aa  57.4  0.00000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4687  hypothetical protein  27.69 
 
 		 161 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00000161275  normal  0.469864 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1060  MarR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 162 aa  57  0.00000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6873  MarR family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 159 aa  56.2  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0613  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 150 aa  56.6  0.0000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.31364  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0270  MarR family transcriptional regulator  26.95 
 
 		 142 aa  56.6  0.0000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4407  transcriptional regulator, MarR family  32.33 
 
 		 163 aa  56.6  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.102927  n/a   
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2750  MarR family transcriptional regulator  18.8 
 
 		 139 aa  56.2  0.0000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.395044  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1251  MarR family transcriptional regulator  24.8 
 
 		 148 aa  55.8  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0015  transcriptional regulator, TrmB  26.21 
 
 		 145 aa  55.5  0.0000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0473427  n/a   
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2828  regulatory protein MarR  18.8 
 
 		 139 aa  56.2  0.0000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2762  MarR family transcriptional regulator  25.9 
 
 		 142 aa  55.5  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1729  regulatory protein, MarR  28.12 
 
 		 162 aa  55.5  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1491  transcriptional regulator, MarR family  24.8 
 
 		 148 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1098  MarR family transcriptional regulator  31.62 
 
 		 171 aa  55.8  0.0000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1450  MarR family transcriptional regulator  24.8 
 
 		 148 aa  55.5  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6813  hypothetical protein  32.54 
 
 		 152 aa  55.5  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.611714  normal  0.242939 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2016  MarR family transcriptional regulator  31.62 
 
 		 167 aa  55.5  0.0000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.908198 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0421  MarR family transcriptional regulator  44.74 
 
 		 162 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.799944  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5123  MarR family transcriptional regulator  44.74 
 
 		 179 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.126201  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4590  MarR family transcriptional regulator  44.74 
 
 		 185 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.777081  normal  0.899831 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0603  MarR family transcriptional regulator  33.57 
 
 		 155 aa  55.5  0.0000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.125253  normal  0.477496 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>