More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_1098 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008578  Acel_1098  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 171 aa  348  2e-95  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7490  hypothetical protein  50.59 
 
 		 190 aa  172  9.999999999999999e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0307768  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7500  hypothetical protein  50.59 
 
 		 190 aa  172  1.9999999999999998e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18960  transcriptional regulator  34.46 
 
 		 181 aa  84.7  6e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0870752  normal  0.777873 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1607  transcriptional regulator, MarR family  32 
 
 		 142 aa  66.2  0.0000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2483  transcriptional regulator, MarR family  35.64 
 
 		 156 aa  65.5  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.758038  normal  0.560924 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2628  transcriptional regulator, MarR family  31.2 
 
 		 142 aa  64.7  0.0000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00233343  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1026  MarR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 163 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1482  MarR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 163 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.914228  normal  0.421582 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3655  MarR family transcriptional regulator  33.59 
 
 		 163 aa  63.2  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00553213  normal  0.217217 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1506  MarR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 163 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1428  MarR family transcriptional regulator  28.91 
 
 		 164 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.256408 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4647  MarR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 163 aa  62.4  0.000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.167247  normal  0.261087 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06856  hypothetical protein  32.74 
 
 		 142 aa  62.4  0.000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1106  MarR family transcriptional regulator  32.8 
 
 		 185 aa  62  0.000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.106479 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0942  MarR family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 164 aa  62  0.000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.388439 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1388  MarR family transcriptional regulator  28.91 
 
 		 164 aa  62  0.000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1865  transcriptional regulator, MarR family  30.5 
 
 		 177 aa  61.6  0.000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.281666  normal  0.52003 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06990  transcriptional regulator  34.55 
 
 		 188 aa  61.2  0.000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.606707  normal  0.0260883 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2950  transcriptional regulator, MarR family  35.16 
 
 		 149 aa  60.1  0.00000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0401  transcriptional regulator, MarR family  35.16 
 
 		 156 aa  60.5  0.00000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0083  MarR family transcriptional regulator  36.19 
 
 		 176 aa  60.5  0.00000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.645413  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0519  transcriptional regulator, MarR family  33.07 
 
 		 157 aa  60.8  0.00000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2581  MarR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 167 aa  60.5  0.00000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.562153 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0474  transcriptional regulator, MarR family  33.68 
 
 		 155 aa  60.5  0.00000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1828  MarR family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 153 aa  60.1  0.00000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0229599 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1670  transcriptional regulator, MarR family  36.9 
 
 		 161 aa  59.7  0.00000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.428433  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4256  MarR family transcriptional regulator  32 
 
 		 166 aa  59.3  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.973283 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0169  MarR family transcriptional regulator  27.34 
 
 		 165 aa  58.9  0.00000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00968003  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0997  MarR family transcriptional regulator  27.34 
 
 		 165 aa  58.9  0.00000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1769  MarR family transcriptional regulator  27.34 
 
 		 165 aa  58.9  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.238439  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1055  MarR family transcriptional regulator  27.34 
 
 		 165 aa  58.9  0.00000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.283145  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1922  MarR family transcriptional regulator  27.34 
 
 		 165 aa  58.9  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.236753  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4766  transcriptional regulator, MarR family  31.15 
 
 		 166 aa  59.3  0.00000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.462626  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1749  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 164 aa  58.9  0.00000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0321002 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1501  MarR family transcriptional regulator  27.34 
 
 		 165 aa  58.9  0.00000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.340787  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1746  MarR family transcriptional regulator  27.34 
 
 		 165 aa  58.9  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0867491  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2958  transcriptional regulator, MarR family  39.13 
 
 		 155 aa  58.9  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000649784  normal  0.827828 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1196  MarR family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 155 aa  58.5  0.00000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2558  MarR family transcriptional regulator  27.34 
 
 		 165 aa  58.5  0.00000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0129  MarR family transcriptional regulator  36.26 
 
 		 154 aa  58.5  0.00000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0483  MarR family transcriptional regulator  32.63 
 
 		 151 aa  58.2  0.00000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0397178 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2703  MarR family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 137 aa  58.5  0.00000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1723  MarR family transcriptional regulator  29.69 
 
 		 171 aa  58.5  0.00000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0630  transcriptional regulator, TrmB  26.77 
 
 		 147 aa  58.2  0.00000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00979398  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2043  MarR family transcriptional regulator  31.34 
 
 		 212 aa  57.8  0.00000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.756399  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1561  MarR family transcriptional regulator  31.34 
 
 		 212 aa  57.8  0.00000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.175593  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2106  MarR family transcriptional regulator  31.34 
 
 		 212 aa  57.8  0.00000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.187591  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0722  MarR family transcriptional regulator  31.34 
 
 		 212 aa  57.8  0.00000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5157  transcriptional regulator, MarR family  37.63 
 
 		 165 aa  57.4  0.00000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.14169  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2193  MarR family transcriptional regulator  31.34 
 
 		 212 aa  57.8  0.00000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.255124  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4271  MarR family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 156 aa  57.4  0.00000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0653897  normal  0.661065 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1454  MarR family transcriptional regulator  34.74 
 
 		 166 aa  57  0.0000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0425619  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0902  MarR family transcriptional regulator  41.77 
 
 		 165 aa  57  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1808  MarR family transcriptional regulator  30.08 
 
 		 159 aa  57  0.0000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0519  MarR family transcriptional regulator  32.97 
 
 		 150 aa  57  0.0000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00587381 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1328  transcriptional regulator, MarR family  29.23 
 
 		 149 aa  57.4  0.0000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1302  MarR family transcriptional regulator  27.61 
 
 		 154 aa  55.8  0.0000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.475565  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1638  transcriptional regulator, MarR family  30.69 
 
 		 171 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00207859 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4762  transcriptional regulator, MarR family  37.21 
 
 		 166 aa  55.8  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1985  MarR family transcriptional regulator  31.62 
 
 		 154 aa  55.8  0.0000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0411716  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0799  MarR family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 161 aa  55.8  0.0000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0886  MarR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 151 aa  55.5  0.0000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5662  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 153 aa  55.1  0.0000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.49927  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2731  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 148 aa  55.1  0.0000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0830  MarR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 151 aa  55.1  0.0000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3804  MarR family transcriptional regulator  30.07 
 
 		 185 aa  54.7  0.0000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.546626 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3922  MarR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 152 aa  54.7  0.0000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0462082  normal  0.0695872 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0600  MarR family transcriptional regulator  29.85 
 
 		 212 aa  54.3  0.0000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.582812  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04763  hypothetical protein  32.35 
 
 		 143 aa  54.3  0.0000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1387  transcriptional regulator, MarR family  30.28 
 
 		 142 aa  53.9  0.0000009  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2470  transcriptional regulator, TrmB  26.45 
 
 		 162 aa  54.3  0.0000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06220  transcriptional regulator, MarR family  33.73 
 
 		 169 aa  54.3  0.0000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2313  MarR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 147 aa  54.3  0.0000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.708353  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2022  transcriptional regulator, MarR family  28.3 
 
 		 156 aa  53.5  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.216819  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2325  transcriptional regulator, MarR family  35.8 
 
 		 162 aa  53.5  0.000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0434242 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00880  transcriptional regulator, MarR family  34.74 
 
 		 148 aa  53.5  0.000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0105  transcriptional regulator, MarR family  31.58 
 
 		 149 aa  53.5  0.000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.983875 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4212  MarR family transcriptional regulator  27.4 
 
 		 191 aa  53.1  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.526532  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2814  MarR family transcriptional regulator  24.82 
 
 		 172 aa  53.1  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.388946 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4116  transcriptional regulator, MarR family  36.36 
 
 		 149 aa  52.4  0.000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2977  transcriptional regulator, MarR family  30.61 
 
 		 158 aa  52.8  0.000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.688657  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0934  MarR family transcriptional regulator  29.66 
 
 		 163 aa  52.4  0.000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3161  regulatory protein, MarR  31.96 
 
 		 158 aa  52  0.000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0336123  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3793  regulatory protein MarR  36.36 
 
 		 149 aa  52.4  0.000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.280773  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0815  MarR family transcriptional regulator  32.63 
 
 		 165 aa  52.4  0.000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000550088 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0803  transcriptional regulator, MarR family protein  30.68 
 
 		 148 aa  52.4  0.000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2842  MarR family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 154 aa  51.6  0.000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3956  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 158 aa  51.6  0.000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.210234 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0628  MarR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 144 aa  52  0.000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4137  transcriptional regulator, MarR family  30.77 
 
 		 153 aa  51.6  0.000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1409  MarR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 184 aa  51.6  0.000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2559  MarR family transcriptional regulator  31.5 
 
 		 155 aa  51.2  0.000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001045  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  31.37 
 
 		 152 aa  51.2  0.000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3291  MarR family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 152 aa  51.6  0.000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.570613  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3311  MarR family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 165 aa  51.2  0.000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1313  regulatory protein MarR  28.37 
 
 		 165 aa  51.6  0.000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2531  MarR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 173 aa  51.2  0.000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0840  transcriptional regulator, MarR family  31.68 
 
 		 140 aa  51.2  0.000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.779945  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3051  transcriptional regulator, MarR family  28.57 
 
 		 137 aa  51.2  0.000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.193524  hitchhiker  0.00149188 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>