More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_4330 on replicon NC_008061
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008061  Bcen_4330  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 148 aa  303  7e-82  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.28808  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4036  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 148 aa  303  7e-82  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0500935  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3489  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 148 aa  303  7e-82  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000483469 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4553  MarR family transcriptional regulator  94.52 
 
 		 161 aa  287  4e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.561632 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2508  MarR family transcriptional regulator  69.44 
 
 		 158 aa  213  7e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.132261  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1859  MarR family transcriptional regulator  60.28 
 
 		 154 aa  178  2e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2313  MarR family transcriptional regulator  55.94 
 
 		 157 aa  174  5e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3581  MarR family transcriptional regulator  56.74 
 
 		 158 aa  171  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.703984 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3922  MarR family transcriptional regulator  56.85 
 
 		 152 aa  170  5.999999999999999e-42  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0462082  normal  0.0695872 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3946  MarR family transcriptional regulator  56.03 
 
 		 158 aa  170  6.999999999999999e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.364439 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1891  MarR family transcriptional regulator  56.03 
 
 		 158 aa  170  6.999999999999999e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.784898  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2137  MarR family transcriptional regulator  57.45 
 
 		 158 aa  167  3e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0755454 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6047  transcriptional regulator, MarR family  50.69 
 
 		 160 aa  148  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.332223  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4219  MarR family transcriptional regulator  44.03 
 
 		 180 aa  107  7.000000000000001e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.260034 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1659  MarR family transcriptional regulator  41.43 
 
 		 153 aa  105  2e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2432  MarR family transcriptional regulator  40.44 
 
 		 174 aa  104  5e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6031  transcriptional regulator, MarR family  38.06 
 
 		 159 aa  97.4  6e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43770  putative transcriptional regulator  37.41 
 
 		 140 aa  90.9  5e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3671  putative transcriptional regulator  38.71 
 
 		 140 aa  83.6  9e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.249648  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1985  MarR family transcriptional regulator  35.07 
 
 		 154 aa  81.6  0.000000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0411716  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1249  transcriptional regulator, MarR family  33.58 
 
 		 155 aa  81.6  0.000000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.193511  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0823  transcriptional regulator, MarR family  32.09 
 
 		 150 aa  77.8  0.00000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3234  transcriptional regulator, MarR family  32.09 
 
 		 151 aa  77.8  0.00000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2703  MarR family transcriptional regulator  33.08 
 
 		 137 aa  71.2  0.000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2129  MarR family transcriptional regulator  36.69 
 
 		 148 aa  70.9  0.000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0697643  normal  0.94503 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1634  transcriptional regulator, MarR family  29.77 
 
 		 140 aa  68.6  0.00000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0355019  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5723  transcriptional regulator, MarR family  30.6 
 
 		 150 aa  68.2  0.00000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2632  MarR family transcriptional regulator  32.09 
 
 		 161 aa  68.2  0.00000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.256033  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3661  MarR family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 172 aa  68.2  0.00000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.185456  normal  0.0917972 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2856  MarR family transcriptional regulator  32.19 
 
 		 201 aa  67.4  0.00000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.843332 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3487  MarR family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 190 aa  67.4  0.00000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.544367  normal  0.213963 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1483  MarR family transcriptional regulator  30.6 
 
 		 149 aa  66.2  0.0000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.715105  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1607  transcriptional regulator, MarR family  32.33 
 
 		 142 aa  66.6  0.0000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01489  DNA-binding transcriptional repressor of multiple antibiotic resistance  25.87 
 
 		 144 aa  65.9  0.0000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0776568  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2116  transcriptional regulator, MarR family  25.87 
 
 		 144 aa  65.9  0.0000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000643944  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3041  transcriptional regulator HosA  29.92 
 
 		 134 aa  65.5  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2628  transcriptional regulator, MarR family  31.16 
 
 		 142 aa  66.2  0.0000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00233343  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3109  transcriptional regulator HosA  29.92 
 
 		 134 aa  65.5  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01500  hypothetical protein  25.87 
 
 		 144 aa  65.9  0.0000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.101748  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3229  transcriptional regulator HosA  29.92 
 
 		 134 aa  65.5  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.880017  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3125  transcriptional regulator HosA  29.92 
 
 		 134 aa  65.5  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0371002 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5827  MarR family transcriptional regulator  31.85 
 
 		 176 aa  66.2  0.0000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000586451 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3070  transcriptional regulator HosA  29.92 
 
 		 134 aa  65.5  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.739807 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0598  MarR family transcriptional regulator  30.94 
 
 		 159 aa  65.5  0.0000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1353  MarR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 157 aa  64.7  0.0000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6873  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 159 aa  64.7  0.0000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1612  DNA-binding transcriptional repressor MarR  25.87 
 
 		 144 aa  63.9  0.0000000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1675  DNA-binding transcriptional repressor MarR  25.87 
 
 		 144 aa  63.9  0.0000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1640  DNA-binding transcriptional repressor MarR  25.87 
 
 		 144 aa  63.9  0.0000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1732  DNA-binding transcriptional repressor MarR  25.87 
 
 		 144 aa  63.9  0.0000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2128  DNA-binding transcriptional repressor MarR  25.87 
 
 		 144 aa  63.9  0.0000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.318768  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2144  DNA-binding transcriptional repressor MarR  25.87 
 
 		 144 aa  63.9  0.0000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.517462  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3564  MarR family transcriptional regulator  36.89 
 
 		 172 aa  63.2  0.000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0651  MarR family transcriptional regulator  27.97 
 
 		 172 aa  63.2  0.000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1409  MarR family transcriptional regulator  34.86 
 
 		 184 aa  63.5  0.000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3041  MarR family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 135 aa  62.8  0.000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2197  MarR family transcriptional regulator  30.16 
 
 		 170 aa  62.4  0.000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0027451  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5695  transcriptional regulator, MarR family  29.5 
 
 		 155 aa  60.5  0.000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1143  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 205 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1692  DNA-binding transcriptional repressor MarR  25.17 
 
 		 144 aa  59.3  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1815  DNA-binding transcriptional repressor MarR  25.17 
 
 		 144 aa  59.3  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2795  transcriptional regulator, MarR family  22.79 
 
 		 141 aa  58.9  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1625  DNA-binding transcriptional repressor MarR  25.17 
 
 		 144 aa  59.3  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1650  DNA-binding transcriptional repressor MarR  25.17 
 
 		 144 aa  59.3  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0219827  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1633  DNA-binding transcriptional repressor MarR  25.17 
 
 		 144 aa  59.3  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.400135  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0283  transcriptional regulator, MarR family  32.85 
 
 		 157 aa  59.3  0.00000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.34751  hitchhiker  0.000254243 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7499  MarR family transcriptional regulator  27.74 
 
 		 169 aa  58.9  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.800614 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2865  MarR family transcriptional regulator  28.35 
 
 		 135 aa  58.9  0.00000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3143  MarR family transcriptional regulator  27.74 
 
 		 161 aa  59.3  0.00000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1998  DNA-binding transcriptional repressor MarR  23.78 
 
 		 144 aa  58.5  0.00000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0715691 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5701  MarR family transcriptional regulator  30.6 
 
 		 184 aa  58.5  0.00000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0574544  normal  0.0180901 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3991  transcriptional regulator, MarR family  28.35 
 
 		 135 aa  58.2  0.00000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4858  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 		 195 aa  57.4  0.00000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.375603  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06856  hypothetical protein  23.74 
 
 		 142 aa  57.8  0.00000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3956  MarR family transcriptional regulator  27.13 
 
 		 158 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.210234 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3893  transcriptional regulator, MarR family  30.33 
 
 		 149 aa  55.8  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.12829  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0390  transcriptional regulator, MarR family  30.08 
 
 		 165 aa  56.2  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.471092  normal  0.0364487 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3564  MarR family transcriptional regulator  27.13 
 
 		 155 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.7607  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0660  MarR family transcriptional regulator  30.83 
 
 		 175 aa  55.1  0.0000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.327844  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1065  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 		 189 aa  55.1  0.0000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0841827  normal  0.196346 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2559  MarR family transcriptional regulator  26.55 
 
 		 155 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1828  MarR family transcriptional regulator  27.41 
 
 		 153 aa  53.9  0.0000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0229599 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5112  MarR family transcriptional regulator  26.19 
 
 		 155 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.522104  normal  0.0529869 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0041  transcriptional regulator, MarR family  32.8 
 
 		 170 aa  52.8  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1113  transcriptional regulator, TrmB  32.5 
 
 		 191 aa  53.5  0.000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0934  MarR family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 303 aa  52.8  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0213342  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3140  transcriptional regulator, MarR family  29.5 
 
 		 158 aa  52.8  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.137854  normal  0.695529 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2214  MarR family transcriptional regulator  26.83 
 
 		 159 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.514813  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2885  MarR family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 156 aa  51.6  0.000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.311419  normal  0.195919 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0731  transcriptional regulator, MarR family  29.41 
 
 		 156 aa  52  0.000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000118752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3042  MarR family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 174 aa  51.6  0.000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.125227  hitchhiker  0.00142823 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5298  MarR family transcriptional regulator  25.2 
 
 		 155 aa  51.2  0.000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4395  MarR family transcriptional regulator  29.09 
 
 		 139 aa  51.2  0.000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1623  MarR family transcriptional regulator  28.83 
 
 		 145 aa  50.8  0.000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0513961  normal  0.0977166 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0279  MarR family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 165 aa  50.4  0.000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.159434  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3476  MarR family transcriptional regulator  25.2 
 
 		 155 aa  50.4  0.000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.125769  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3774  regulatory protein, MarR  26.52 
 
 		 177 aa  50.1  0.000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4545  MarR family transcriptional regulator  23.66 
 
 		 188 aa  49.7  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.257542 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0259  MarR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 144 aa  49.7  0.00001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6384  MarR family transcriptional regulator  26.56 
 
 		 143 aa  50.1  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>