More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_1546 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_1546  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 161 aa  320  6e-87  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.22368  normal  0.197095 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3487  MarR family transcriptional regulator  53.96 
 
 		 190 aa  139  1.9999999999999998e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.544367  normal  0.213963 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0660  MarR family transcriptional regulator  48.55 
 
 		 175 aa  121  3e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.327844  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5689  MarR family transcriptional regulator  48.92 
 
 		 150 aa  115  1.9999999999999998e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0868849  normal  0.757777 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7499  MarR family transcriptional regulator  42.67 
 
 		 169 aa  112  3e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.800614 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3234  transcriptional regulator, MarR family  41.29 
 
 		 151 aa  108  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0823  transcriptional regulator, MarR family  43.48 
 
 		 150 aa  107  5e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1828  MarR family transcriptional regulator  44.27 
 
 		 153 aa  105  4e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0229599 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3143  MarR family transcriptional regulator  42.76 
 
 		 161 aa  103  1e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6873  MarR family transcriptional regulator  41.3 
 
 		 159 aa  102  2e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3704  MarR family transcriptional regulator  44.7 
 
 		 178 aa  99.8  2e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0457412  normal  0.0618466 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2129  MarR family transcriptional regulator  43.7 
 
 		 148 aa  97.4  8e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0697643  normal  0.94503 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5695  transcriptional regulator, MarR family  38.56 
 
 		 155 aa  96.3  1e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5030  MarR family transcriptional regulator  41.14 
 
 		 162 aa  94.4  6e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.942025 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3125  MarR family transcriptional regulator  40.51 
 
 		 162 aa  91.7  4e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0374972  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5242  MarR family transcriptional regulator  40.51 
 
 		 162 aa  91.7  4e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1353  MarR family transcriptional regulator  40.27 
 
 		 157 aa  90.5  9e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0421  MarR family transcriptional regulator  40.51 
 
 		 162 aa  89.7  1e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.799944  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4590  MarR family transcriptional regulator  40.51 
 
 		 185 aa  90.1  1e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.777081  normal  0.899831 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3774  regulatory protein, MarR  36.88 
 
 		 177 aa  89.4  2e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5123  MarR family transcriptional regulator  40.51 
 
 		 179 aa  89  2e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.126201  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0279  MarR family transcriptional regulator  40.77 
 
 		 158 aa  89.4  2e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.468058  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6482  MarR family transcriptional regulator  36.6 
 
 		 172 aa  82.8  0.000000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.618469  normal  0.143744 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4545  MarR family transcriptional regulator  35.07 
 
 		 188 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.257542 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2929  MarR family transcriptional regulator  38.28 
 
 		 315 aa  80.5  0.00000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0675184  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5827  MarR family transcriptional regulator  39.23 
 
 		 176 aa  79.3  0.00000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000586451 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0934  MarR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 303 aa  77.8  0.00000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0213342  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0651  MarR family transcriptional regulator  34.03 
 
 		 172 aa  76.6  0.0000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0598  MarR family transcriptional regulator  32.41 
 
 		 159 aa  75.9  0.0000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3564  MarR family transcriptional regulator  35 
 
 		 172 aa  75.5  0.0000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3042  MarR family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 174 aa  73.6  0.000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.125227  hitchhiker  0.00142823 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5701  MarR family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 184 aa  72.4  0.000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0574544  normal  0.0180901 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4283  transcriptional regulator, MarR family  32.37 
 
 		 176 aa  72  0.000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3696  MarR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 151 aa  72  0.000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.134225  normal  0.172711 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3109  transcriptional regulator HosA  32.59 
 
 		 134 aa  70.9  0.000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1634  transcriptional regulator, MarR family  30.83 
 
 		 140 aa  70.5  0.00000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0355019  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1985  MarR family transcriptional regulator  39.85 
 
 		 154 aa  70.5  0.00000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0411716  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3070  transcriptional regulator HosA  31.85 
 
 		 134 aa  68.9  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.739807 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3125  transcriptional regulator HosA  31.85 
 
 		 134 aa  68.9  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0371002 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3041  transcriptional regulator HosA  31.85 
 
 		 134 aa  68.9  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2628  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 142 aa  69.3  0.00000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00233343  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3229  transcriptional regulator HosA  31.85 
 
 		 134 aa  68.9  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.880017  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6384  MarR family transcriptional regulator  38.58 
 
 		 143 aa  68.9  0.00000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1051  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 151 aa  68.6  0.00000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00706994  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1607  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 142 aa  68.6  0.00000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2977  transcriptional regulator, MarR family  35.65 
 
 		 158 aa  68.2  0.00000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.688657  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0223  transcriptional regulator, MarR family  35.43 
 
 		 169 aa  67.4  0.00000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.504687  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2016  MarR family transcriptional regulator  33.6 
 
 		 167 aa  67  0.00000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.908198 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0312  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 146 aa  67  0.0000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2271  MarR family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 146 aa  66.2  0.0000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0738352 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2197  MarR family transcriptional regulator  36.27 
 
 		 170 aa  66.2  0.0000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0027451  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3946  MarR family transcriptional regulator  31.47 
 
 		 158 aa  65.1  0.0000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.364439 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0330  MarR family transcriptional regulator  32.59 
 
 		 141 aa  65.1  0.0000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1065  MarR family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 189 aa  65.5  0.0000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0841827  normal  0.196346 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1891  MarR family transcriptional regulator  31.47 
 
 		 158 aa  65.1  0.0000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.784898  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2856  MarR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 201 aa  65.1  0.0000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.843332 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5092  MarR family transcriptional regulator  37.86 
 
 		 167 aa  64.7  0.0000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.636455 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2703  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 137 aa  64.3  0.0000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3041  MarR family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 135 aa  63.5  0.000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2632  MarR family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 161 aa  62.8  0.000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.256033  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3581  MarR family transcriptional regulator  32 
 
 		 158 aa  62.8  0.000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.703984 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1625  MarR family transcriptional regulator  27.54 
 
 		 156 aa  62.4  0.000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2137  MarR family transcriptional regulator  33.58 
 
 		 158 aa  61.6  0.000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0755454 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3991  transcriptional regulator, MarR family  30.4 
 
 		 135 aa  61.2  0.000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1537  transcriptional regulator, MarR family  30.97 
 
 		 144 aa  61.2  0.000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.510368  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0131  transcriptional regulator, MarR family  27.82 
 
 		 156 aa  61.2  0.000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000555257  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2865  MarR family transcriptional regulator  30.4 
 
 		 135 aa  60.5  0.000000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1409  MarR family transcriptional regulator  30.22 
 
 		 184 aa  60.5  0.000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1637  transcriptional regulator, MarR family  28.95 
 
 		 158 aa  59.7  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.615997 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1249  transcriptional regulator, MarR family  36.09 
 
 		 155 aa  60.5  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.193511  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1722  MarR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 183 aa  60.5  0.00000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2432  MarR family transcriptional regulator  33.08 
 
 		 174 aa  59.3  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6948  MarR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 159 aa  59.3  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.17806  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0263  MarR family transcriptional regulator  33.11 
 
 		 151 aa  59.3  0.00000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1929  transcriptional regulator, MarR family  31.58 
 
 		 149 aa  59.3  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3119  MarR family transcriptional regulator  33.06 
 
 		 151 aa  58.9  0.00000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0332666  normal  0.174429 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4899  transcriptional regulator, MarR family  30.23 
 
 		 161 aa  58.9  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.529551  normal  0.428583 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3246  MarR family transcriptional regulator  27.01 
 
 		 147 aa  58.5  0.00000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3611  MarR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 160 aa  57.8  0.00000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000472192 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1655  transcriptional regulator, MarR family  30 
 
 		 155 aa  57.8  0.00000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2508  MarR family transcriptional regulator  29.08 
 
 		 158 aa  57.4  0.00000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.132261  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0022  transcriptional regulator, MarR family  27.82 
 
 		 146 aa  57.4  0.00000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3893  transcriptional regulator, MarR family  26.83 
 
 		 149 aa  56.6  0.0000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.12829  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0803  MarR family transcriptional regulator  30.4 
 
 		 157 aa  57  0.0000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0835  transcriptional regulator, MarR family protein  33.03 
 
 		 150 aa  57  0.0000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0799  MarR family transcriptional regulator  31.47 
 
 		 161 aa  55.8  0.0000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0802  MarR family transcriptional regulator  33.66 
 
 		 160 aa  56.6  0.0000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0707582  normal  0.338446 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2762  MarR family transcriptional regulator  32.46 
 
 		 184 aa  56.2  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.351769  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4809  transcriptional regulator, MarR family  30.23 
 
 		 161 aa  56.2  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.577759  normal  0.746027 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0284  MarR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 167 aa  56.6  0.0000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4794  putative MarR family transcriptional regulator  33 
 
 		 152 aa  56.2  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.717119  normal  0.755619 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0696  transcriptional regulator, MarR family  34.29 
 
 		 143 aa  55.8  0.0000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.218758  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5296  transcriptional regulator MarR family  34.74 
 
 		 149 aa  56.6  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2795  transcriptional regulator, MarR family  29.81 
 
 		 141 aa  56.2  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1483  MarR family transcriptional regulator  36.7 
 
 		 149 aa  55.5  0.0000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.715105  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1975  MarR family transcriptional regulator  29.37 
 
 		 155 aa  55.5  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0153804  normal  0.896313 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5688  transcriptional regulator  30.59 
 
 		 154 aa  55.8  0.0000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.153344  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1302  MarR family transcriptional regulator  28.91 
 
 		 154 aa  55.1  0.0000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.475565  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5772  MarR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 159 aa  55.1  0.0000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.94508 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4933  MarR family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 157 aa  55.1  0.0000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>