More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_1637 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_1637  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 		 158 aa  317  3.9999999999999996e-86  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.615997 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0811  transcriptional regulator, MarR family  50.34 
 
 		 149 aa  144  5e-34  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.770437  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0317  transcriptional regulator, MarR family  36.76 
 
 		 146 aa  88.2  4e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1651  transcriptional regulator, MarR family  36.84 
 
 		 140 aa  80.1  0.00000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  8.20136e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1642  transcriptional regulator, MarR family  34.86 
 
 		 150 aa  77.4  0.00000000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0131  transcriptional regulator, MarR family  34.78 
 
 		 156 aa  75.5  0.0000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000555257  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1287  MarR family transcriptional regulator  31.62 
 
 		 168 aa  70.9  0.000000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0105  transcriptional regulator, MarR family  32.41 
 
 		 149 aa  70.1  0.00000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.983875 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2913  MarR family transcriptional regulator  35.19 
 
 		 145 aa  69.7  0.00000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5540  transcriptional regulator, MarR family  32.26 
 
 		 148 aa  70.1  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.971707 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0111  transcriptional regulator, MarR family  38.18 
 
 		 147 aa  68.6  0.00000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2795  transcriptional regulator, MarR family  37.61 
 
 		 141 aa  68.2  0.00000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0598  MarR family transcriptional regulator  47.06 
 
 		 159 aa  65.5  0.0000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1130  MarR family transcriptional regulator  32.33 
 
 		 148 aa  65.1  0.0000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4070  MarR family transcriptional regulator  30.08 
 
 		 185 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2891  transcriptional regulator, MarR family  34.92 
 
 		 143 aa  63.5  0.000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.749218  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0360  MarR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 141 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5793  transcriptional regulator, MarR family  29.03 
 
 		 186 aa  61.2  0.000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1511  transcriptional regulator, MarR family  30.71 
 
 		 175 aa  61.2  0.000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0795  MarR family transcriptional regulator  30.97 
 
 		 179 aa  60.5  0.000000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1546  MarR family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 161 aa  59.7  0.00000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.22368  normal  0.197095 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3363  transcriptional regulator, MarR family  28.86 
 
 		 154 aa  60.1  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.7144  hitchhiker  0.007363 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0200  MarR family transcriptional regulator  37.23 
 
 		 150 aa  60.5  0.00000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.834737 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0579  MarR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 148 aa  60.5  0.00000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.14462  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2898  transcriptional regulator, TrmB  29.66 
 
 		 155 aa  59.7  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.334267  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3893  transcriptional regulator, MarR family  29.93 
 
 		 149 aa  59.7  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.12829  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1607  transcriptional regulator, MarR family  33.03 
 
 		 142 aa  59.7  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0196  MarR family transcriptional regulator  37.23 
 
 		 150 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.149236  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1448  transcriptional regulator, MarR family  29.57 
 
 		 144 aa  59.7  0.00000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.165175  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2977  transcriptional regulator, MarR family  31.58 
 
 		 158 aa  59.3  0.00000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.688657  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2628  transcriptional regulator, MarR family  33.96 
 
 		 142 aa  59.3  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00233343  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0269  MarR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 138 aa  59.3  0.00000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3216  transcriptional regulator, MarR family  29.25 
 
 		 139 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0175  MarR family transcriptional regulator  37.23 
 
 		 150 aa  58.9  0.00000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3538  MarR family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 153 aa  58.9  0.00000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4102  transcriptional regulator, MarR family  31.19 
 
 		 138 aa  58.9  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2632  MarR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 161 aa  58.9  0.00000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.256033  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3487  MarR family transcriptional regulator  29.1 
 
 		 190 aa  58.5  0.00000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.544367  normal  0.213963 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0660  MarR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 175 aa  58.5  0.00000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.327844  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0962  MarR family transcriptional regulator  26.35 
 
 		 165 aa  58.2  0.00000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.100112  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1483  MarR family transcriptional regulator  31.53 
 
 		 149 aa  58.2  0.00000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.715105  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1107  MarR family transcriptional regulator  30.33 
 
 		 145 aa  58.2  0.00000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4422  transcriptional regulator, MarR family  30.28 
 
 		 138 aa  57.8  0.00000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0096  MarR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 141 aa  57.8  0.00000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2958  transcriptional regulator, MarR family  31 
 
 		 155 aa  57.8  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000649784  normal  0.827828 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2920  MarR family transcriptional regulator  28.85 
 
 		 139 aa  57.4  0.00000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1634  transcriptional regulator, MarR family  38.24 
 
 		 140 aa  57.4  0.00000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0355019  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0617  MarR family transcriptional regulator  34.19 
 
 		 162 aa  57.8  0.00000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3249  transcriptional regulator, MarR family  28.85 
 
 		 139 aa  57  0.00000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.490647  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2992  MarR family transcriptional regulator  28.85 
 
 		 139 aa  57  0.00000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2980  MarR family transcriptional regulator  28.3 
 
 		 139 aa  57  0.00000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.134372  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1828  MarR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 153 aa  57.4  0.00000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0229599 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3220  MarR family transcriptional regulator  28.85 
 
 		 139 aa  57  0.00000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3228  transcriptional regulator, MarR family  28.85 
 
 		 139 aa  57  0.00000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0731  transcriptional regulator, MarR family  28.57 
 
 		 156 aa  57  0.00000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000118752  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0761  MarR family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 145 aa  56.6  0.0000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0154826  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7636  MarR family transcriptional regulator  30.7 
 
 		 159 aa  57  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.582154 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6147  MarR family transcriptional regulator  30.91 
 
 		 159 aa  57  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.676081  normal  0.847722 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0709  MarR family transcriptional regulator  39.58 
 
 		 146 aa  57  0.0000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.699549  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7166  transcriptional regulator, MarR family  29.32 
 
 		 187 aa  57  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.567049  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3000  MarR family transcriptional regulator  35.2 
 
 		 145 aa  57  0.0000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5052  MarR family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 150 aa  57  0.0000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0113  MarR family transcriptional regulator  29.09 
 
 		 141 aa  56.6  0.0000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.51786  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3774  regulatory protein, MarR  26.76 
 
 		 177 aa  55.8  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3105  transcriptional regulator, MarR family  28.86 
 
 		 154 aa  56.2  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0272572 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1307  MarR family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 159 aa  56.2  0.0000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.702718  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003355  MarR family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 150 aa  55.1  0.0000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00113981  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0023  transcriptional regulator, TrmB  30.36 
 
 		 151 aa  55.5  0.0000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1511  MarR family transcriptional regulator  33.01 
 
 		 159 aa  55.5  0.0000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5688  transcriptional regulator  28.57 
 
 		 154 aa  55.5  0.0000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.153344  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1344  MarR family transcriptional regulator  29.46 
 
 		 165 aa  55.1  0.0000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3617  transcriptional regulator, MarR family  31.58 
 
 		 150 aa  55.1  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.821242  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0280  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 186 aa  55.1  0.0000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0300  transcriptional regulator MarR family  29.66 
 
 		 149 aa  55.1  0.0000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0802  MarR family transcriptional regulator  24.66 
 
 		 160 aa  55.1  0.0000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0707582  normal  0.338446 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2703  MarR family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 137 aa  54.7  0.0000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43770  putative transcriptional regulator  30.84 
 
 		 140 aa  54.7  0.0000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3377  regulatory protein, MarR  31.58 
 
 		 150 aa  54.3  0.0000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0974589  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0546  MarR family transcriptional regulator  33.7 
 
 		 172 aa  54.3  0.0000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2271  MarR family transcriptional regulator  25.17 
 
 		 146 aa  54.7  0.0000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0738352 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5651  MarR family transcriptional regulator  33.7 
 
 		 172 aa  54.3  0.0000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0956535  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3671  putative transcriptional regulator  32.69 
 
 		 140 aa  54.7  0.0000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.249648  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2764  transcriptional regulator, MarR family  30.28 
 
 		 199 aa  54.3  0.0000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0619086  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0786  MarR family transcriptional regulator  30.97 
 
 		 155 aa  54.3  0.0000007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0555365  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3655  MarR family transcriptional regulator  39.36 
 
 		 163 aa  53.9  0.0000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00553213  normal  0.217217 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2070  transcriptional regulator MarR  28.7 
 
 		 151 aa  53.9  0.0000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.317078 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1651  MarR family transcriptional regulator  33.7 
 
 		 172 aa  53.9  0.0000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.902908  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1677  MarR family transcriptional regulator  33.7 
 
 		 172 aa  53.9  0.0000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1702  MarR family transcriptional regulator  33.7 
 
 		 172 aa  53.9  0.0000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.00165311  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0628  MarR family transcriptional regulator  33.7 
 
 		 172 aa  53.9  0.0000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.382396  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6318  transcriptional regulator, MarR family  26.72 
 
 		 145 aa  53.9  0.0000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3061  MarR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 159 aa  53.9  0.0000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0537  MarR family transcriptional regulator  33.7 
 
 		 172 aa  53.9  0.0000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.075487  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1796  MarR family transcriptional regulator  30.33 
 
 		 191 aa  53.1  0.000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.630858  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2084  transcriptional regulator, MarR family  30.28 
 
 		 147 aa  53.5  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3330  transcription repressor  34.12 
 
 		 151 aa  53.5  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0423629  normal  0.0632269 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0488  MarR family transcriptional regulator  31.86 
 
 		 160 aa  53.5  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.123923  normal  0.124611 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1449  MarR family transcriptional regulator  24.31 
 
 		 152 aa  53.5  0.000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0111  MarR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 142 aa  53.5  0.000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.238503  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2127  MarR family transcriptional regulator  35.78 
 
 		 145 aa  53.1  0.000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>