More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_1287 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_1287  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 168 aa  330  4e-90  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0105  transcriptional regulator, MarR family  34.51 
 
 		 149 aa  96.3  2e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.983875 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2795  transcriptional regulator, MarR family  35.46 
 
 		 141 aa  95.5  3e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1130  MarR family transcriptional regulator  34.27 
 
 		 148 aa  93.2  1e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1651  transcriptional regulator, MarR family  35.04 
 
 		 140 aa  93.2  2e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  8.20136e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3893  transcriptional regulator, MarR family  31.21 
 
 		 149 aa  92  3e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.12829  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1634  transcriptional regulator, MarR family  32.37 
 
 		 140 aa  81.3  0.000000000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0355019  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0131  transcriptional regulator, MarR family  27.27 
 
 		 156 aa  77.4  0.00000000000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000555257  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2628  transcriptional regulator, MarR family  32.85 
 
 		 142 aa  76.6  0.0000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00233343  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1607  transcriptional regulator, MarR family  32.85 
 
 		 142 aa  77  0.0000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0317  transcriptional regulator, MarR family  33.09 
 
 		 146 aa  76.3  0.0000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1642  transcriptional regulator, MarR family  33.82 
 
 		 150 aa  75.1  0.0000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0598  MarR family transcriptional regulator  29.58 
 
 		 159 aa  72.8  0.000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5540  transcriptional regulator, MarR family  34.15 
 
 		 148 aa  72.4  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.971707 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1483  MarR family transcriptional regulator  31.88 
 
 		 149 aa  71.6  0.000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.715105  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1637  transcriptional regulator, MarR family  31.62 
 
 		 158 aa  70.9  0.000000000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.615997 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3216  transcriptional regulator, MarR family  29.1 
 
 		 139 aa  70.1  0.00000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2703  MarR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 137 aa  69.7  0.00000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2632  MarR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 161 aa  69.3  0.00000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.256033  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2992  MarR family transcriptional regulator  29.1 
 
 		 139 aa  69.3  0.00000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3220  MarR family transcriptional regulator  29.1 
 
 		 139 aa  69.3  0.00000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3249  transcriptional regulator, MarR family  29.1 
 
 		 139 aa  68.9  0.00000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.490647  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3228  transcriptional regulator, MarR family  29.1 
 
 		 139 aa  69.3  0.00000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2891  transcriptional regulator, MarR family  30.33 
 
 		 143 aa  68.6  0.00000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.749218  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2920  MarR family transcriptional regulator  27.94 
 
 		 139 aa  68.2  0.00000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2980  MarR family transcriptional regulator  28.36 
 
 		 139 aa  67.8  0.00000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.134372  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0360  MarR family transcriptional regulator  28.67 
 
 		 141 aa  67.4  0.00000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3167  transcriptional regulator, putative  27.01 
 
 		 141 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.841227  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2913  MarR family transcriptional regulator  27.34 
 
 		 145 aa  67  0.0000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3933  transcriptional regulator, MarR family  31.71 
 
 		 144 aa  66.2  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6318  transcriptional regulator, MarR family  25.6 
 
 		 145 aa  63.9  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6388  transcriptional regulator, MarR family  31.11 
 
 		 149 aa  61.6  0.000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0811  transcriptional regulator, MarR family  28.45 
 
 		 149 aa  61.6  0.000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.770437  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06856  hypothetical protein  28.26 
 
 		 142 aa  61.2  0.000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1448  transcriptional regulator, MarR family  37.97 
 
 		 144 aa  60.5  0.00000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.165175  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2069  MarR family transcriptional regulator  25.93 
 
 		 138 aa  57.8  0.00000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.180128  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0111  transcriptional regulator, MarR family  27.14 
 
 		 147 aa  57  0.0000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2251  MarR family transcriptional regulator  27.61 
 
 		 145 aa  55.8  0.0000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.344689  normal  0.255238 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4809  MarR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 198 aa  55.8  0.0000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.752918  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2240  MarR family transcriptional regulator  28.15 
 
 		 157 aa  55.5  0.0000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1858  MarR family transcriptional regulator  25.35 
 
 		 168 aa  55.1  0.0000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0269  MarR family transcriptional regulator  24.09 
 
 		 138 aa  55.1  0.0000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2058  MarR family transcriptional regulator  22.22 
 
 		 159 aa  53.5  0.000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000115689  normal  0.149195 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2129  MarR family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 148 aa  53.5  0.000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0697643  normal  0.94503 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0359  transcriptional regulator, MarR family  26.52 
 
 		 141 aa  53.9  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000165316 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2167  transcriptional regulator, MarR family  25 
 
 		 161 aa  53.5  0.000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2483  transcriptional regulator, MarR family  25.17 
 
 		 156 aa  53.5  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.758038  normal  0.560924 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2478  MarR family transcriptional regulator  25.93 
 
 		 138 aa  53.1  0.000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.795114  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1975  MarR family transcriptional regulator  25.37 
 
 		 155 aa  53.1  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0153804  normal  0.896313 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2598  MarR family transcriptional regulator  25.93 
 
 		 138 aa  53.1  0.000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0212362 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1638  transcriptional regulator, MarR family  25.53 
 
 		 171 aa  52.8  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00207859 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1107  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 145 aa  52.8  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2485  MarR family transcriptional regulator  25.93 
 
 		 138 aa  53.1  0.000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1866  transcriptional regulator, MarR family  25.93 
 
 		 138 aa  53.1  0.000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0339276  hitchhiker  0.000000667119 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2294  transcriptional regulator, MarR family protein  23.13 
 
 		 139 aa  52.8  0.000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1552  MarR family transcriptional regulator  25 
 
 		 138 aa  52.8  0.000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1874  MarR family transcriptional regulator  26.87 
 
 		 139 aa  52.8  0.000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000119555 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001045  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  27.97 
 
 		 152 aa  52.4  0.000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2712  MarR family transcriptional regulator  26.4 
 
 		 147 aa  52.4  0.000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0271862 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1739  MarR family transcriptional regulator  25.56 
 
 		 143 aa  52.4  0.000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2640  MarR family transcriptional regulator  27.5 
 
 		 154 aa  52  0.000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1595  MarR family transcriptional regulator  25.56 
 
 		 143 aa  52  0.000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.156116  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1670  MarR family transcriptional regulator  25.56 
 
 		 143 aa  52  0.000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00529848 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3487  MarR family transcriptional regulator  23.91 
 
 		 190 aa  52  0.000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.544367  normal  0.213963 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1641  transcriptional regulator, MarR family  27.12 
 
 		 157 aa  51.6  0.000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.176874  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5827  MarR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 176 aa  51.6  0.000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000586451 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2958  transcriptional regulator, MarR family  25.69 
 
 		 155 aa  50.8  0.000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000649784  normal  0.827828 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2782  transcriptional regulator, MarR family  23.36 
 
 		 192 aa  50.8  0.000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00307717  normal  0.0921189 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4961  transcriptional regulator, MarR family  23.36 
 
 		 192 aa  50.8  0.000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0717313  normal  0.154952 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3065  transcriptional regulator, MarR family protein  25.53 
 
 		 140 aa  50.8  0.000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2046  MarR family transcriptional regulator  25.37 
 
 		 156 aa  50.8  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2546  MarR family transcriptional regulator  27.93 
 
 		 137 aa  50.1  0.00001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1555  MarR family transcriptional regulator  27.54 
 
 		 157 aa  50.4  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.709951  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0786  MarR family transcriptional regulator  35.58 
 
 		 155 aa  50.4  0.00001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0555365  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6455  transcriptional regulator, MarR family  25.23 
 
 		 162 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1245  transcriptional regulator, MarR family  31.87 
 
 		 176 aa  49.3  0.00002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.868936  normal  0.145982 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5361  MarR family transcriptional regulator  25 
 
 		 183 aa  49.7  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5701  MarR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 184 aa  50.1  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0574544  normal  0.0180901 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5793  transcriptional regulator, MarR family  30.43 
 
 		 186 aa  50.1  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3737  MarR family transcriptional regulator  29.09 
 
 		 159 aa  49.7  0.00002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0200  MarR family transcriptional regulator  25.85 
 
 		 150 aa  49.7  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.834737 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04763  hypothetical protein  27.27 
 
 		 143 aa  49.3  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4622  MarR family transcriptional regulator  27.19 
 
 		 174 aa  49.3  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3359  hydroxycinnamic acid degradation regulator, putative  23.88 
 
 		 156 aa  49.3  0.00003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0761  MarR family transcriptional regulator  27.88 
 
 		 145 aa  48.9  0.00003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0154826  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0709  MarR family transcriptional regulator  25 
 
 		 146 aa  49.3  0.00003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.699549  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0284  MarR family transcriptional regulator  24.63 
 
 		 167 aa  48.5  0.00004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1059  transcriptional regulator, TrmB  20.74 
 
 		 153 aa  48.5  0.00004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0495893  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0576  transcriptional regulator, TrmB  25 
 
 		 158 aa  48.5  0.00004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0950259  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1567  transcriptional regulator, MarR family  28.21 
 
 		 141 aa  48.9  0.00004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5052  MarR family transcriptional regulator  27.17 
 
 		 150 aa  48.5  0.00004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1342  transcriptional regulator, MarR family  30.56 
 
 		 156 aa  48.5  0.00004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000398816 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0196  MarR family transcriptional regulator  29.35 
 
 		 150 aa  48.5  0.00004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.149236  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0175  MarR family transcriptional regulator  29.35 
 
 		 150 aa  48.1  0.00005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00880  transcriptional regulator, MarR family  26.17 
 
 		 148 aa  48.5  0.00005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4102  transcriptional regulator, MarR family  23.17 
 
 		 138 aa  48.1  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0854  transcriptional regulator, TrmB  28.12 
 
 		 149 aa  47.8  0.00006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000000058861  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2923  MarR family transcriptional regulator  24.35 
 
 		 176 aa  48.1  0.00006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.560402 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3416  transcriptional regulator, MarR family  22.42 
 
 		 162 aa  47.8  0.00007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.765754  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1768  transcriptional regulator, MarR family  20 
 
 		 157 aa  47.8  0.00007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>